FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5715, 631 aa 1>>>pF1KE5715 631 - 631 aa - 631 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6419+/-0.00141; mu= 5.9679+/- 0.085 mean_var=253.7812+/-51.628, 0's: 0 Z-trim(108.1): 159 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.080509 statistics sampled from 9835 (9994) to 9835 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16 Scan time: 3.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9311.1 PABPC3 gene_id:5042|Hs108|chr13 ( 631) 4146 495.5 8.8e-140 CCDS6289.1 PABPC1 gene_id:26986|Hs108|chr8 ( 636) 3818 457.4 2.6e-128 CCDS44114.1 PABPC4 gene_id:8761|Hs108|chr1 ( 631) 2941 355.6 1.2e-97 CCDS438.1 PABPC4 gene_id:8761|Hs108|chr1 ( 644) 2403 293.1 7.8e-79 CCDS44115.1 PABPC4 gene_id:8761|Hs108|chr1 ( 660) 2398 292.5 1.2e-78 CCDS42878.1 PABPC1L gene_id:80336|Hs108|chr20 ( 614) 2272 277.9 2.9e-74 CCDS14460.1 PABPC5 gene_id:140886|Hs108|chrX ( 382) 1509 189.0 9.8e-48 CCDS35334.1 PABPC1L2A gene_id:340529|Hs108|chrX ( 200) 965 125.6 6.6e-29 CCDS43972.1 PABPC1L2B gene_id:645974|Hs108|chrX ( 200) 965 125.6 6.6e-29 >>CCDS9311.1 PABPC3 gene_id:5042|Hs108|chr13 (631 aa) initn: 4146 init1: 4146 opt: 4146 Z-score: 2623.0 bits: 495.5 E(32554): 8.8e-140 Smith-Waterman score: 4146; 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CCDS44 AELGAKAKEFTNVYIKNFGEEVDDESLKELFSQFGKTLSVKVMRDPNGKSKGFGFVSYEK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRTFEQMKQDRITRYQVVNLYVKN ::::.:::.::::::..:: :.:::::::::::.:::: :::.::.::.::: ::::.:: CCDS44 HEDANKAVEEMNGKEISGKIIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LDDGIDDERLRKAFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVAT ::: ::::.::: :::::.:::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::.. CCDS44 LDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 KPLYVALAQRKEERQAYLTNEYMQRMASVRAVP-----NQRAPPSG-YFMTAVPQTQNHA ::::::::::::::.:.:::.::::.:..::.: :: : .: ::. ::::.:.. CCDS44 KPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRALPANAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRP 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KE5 AYYPPSQIARLRPSPRWTAQGARPHPFQNKPSAIRPGAPRVPFSTMRP-----ASSQVPR :: :.:.:..::.::: ::.::. ::. ::::: ..:: . . : :: .: CCDS44 PYYTPNQLAQMRPNPRWQ-QGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGNAPASRGLPT 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 VMSTQRVA-NTSTQTVGPRPAAAAAAAATPAVRTVPRYKYAAGVRNPQQHRNAQPQVTMQ .::::. :..:...:: ::.:::.: :.: ::::..::.: : :: . CCDS44 --TTQRVGVPTAVQNLAPR---AAVAAAAP--RAVAPYKYASSVRSP--HPAIQP-LQAP 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 QLAVHVQGQETLTASRLASAPPQKQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSEL : :::::::: :::: ::.::::.::::::::::::::.:: .::::::::::::::::: CCDS44 QPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSEL 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 LYMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAK-EATQK--AVNSATGVPTV :.::::::::::::::::::::::.:: ::.:: :: .:: CCDS44 LHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKVGAVAAATS 590 600 610 620 630 >>CCDS438.1 PABPC4 gene_id:8761|Hs108|chr1 (644 aa) initn: 2768 init1: 2159 opt: 2403 Z-score: 1528.8 bits: 293.1 E(32554): 7.8e-79 Smith-Waterman score: 2937; 71.7% identity (86.0% similar) in 650 aa overlap (1-626:1-643) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNPSTPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSNYAYVNFQ :: .. ::: ::::::::: ::::::::::::::::.::::.:::.:: : .::::::: CCDS43 MNAAASSYPMASLYVGDLHSDVTEAMLYEKFSPAGPVLSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 HTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNKALYDTVS . :::.::::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::::.::::::: : CCDS43 QPADAERALDTMNFDVIKGKPIRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLDKSIDNKALYDTFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQFKSRKERE ::::::::.:::::::::::.::::::.:::..::.:::::::: ::::::.:::::::: CCDS43 AFGNILSCKVVCDENGSKGYAFVHFETQEAADKAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKERE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AELGARAKEFPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFER :::::.:::: :::::::::..::: ::.::..:: .:::::: : .::::::::::.:. 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CCDS43 PYYTPNQLAQMRPNPRWQ-QGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGSECPDRLAMD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 ------TQRVANTSTQTVGPRPAA-------AAAAAATPAVRTVPRYKYAAGVRNPQQHR .:. . : :. : :.: ::.:::.: :.: ::::..::.: : CCDS43 FGGAGAAQQGLTDSCQS-GGVPTAVQNLAPRAAVAAAAP--RAVAPYKYASSVRSP--HP 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 NAQPQVTMQQLAVHVQGQETLTASRLASAPPQKQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGM :: . : :::::::: :::: ::.::::.::::::::::::::.:: .:::::::: CCDS43 AIQP-LQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGM 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 LLEIDNSELLYMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAK-EATQK--AVNSATGVPTV ::::::::::.::::::::::::::::::::::.:: ::.:: :: .:: CCDS43 LLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKVGAVAAATS 600 610 620 630 640 >>CCDS44115.1 PABPC4 gene_id:8761|Hs108|chr1 (660 aa) initn: 2768 init1: 2159 opt: 2398 Z-score: 1525.5 bits: 292.5 E(32554): 1.2e-78 Smith-Waterman score: 2907; 70.3% identity (83.8% similar) in 667 aa overlap (1-626:1-659) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNPSTPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSNYAYVNFQ :: .. ::: ::::::::: ::::::::::::::::.::::.:::.:: : .::::::: CCDS44 MNAAASSYPMASLYVGDLHSDVTEAMLYEKFSPAGPVLSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 HTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNKALYDTVS . :::.::::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::::.::::::: : CCDS44 QPADAERALDTMNFDVIKGKPIRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLDKSIDNKALYDTFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQFKSRKERE ::::::::.:::::::::::.::::::.:::..::.:::::::: ::::::.:::::::: CCDS44 AFGNILSCKVVCDENGSKGYAFVHFETQEAADKAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKERE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AELGARAKEFPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFER :::::.:::: :::::::::..::: ::.::..:: .:::::: : .::::::::::.:. CCDS44 AELGAKAKEFTNVYIKNFGEEVDDESLKELFSQFGKTLSVKVMRDPNGKSKGFGFVSYEK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRTFEQMKQDRITRYQVVNLYVKN ::::.:::.::::::..:: :.:::::::::::.:::: :::.::.::.::: ::::.:: CCDS44 HEDANKAVEEMNGKEISGKIIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LDDGIDDERLRKAFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVAT ::: ::::.::: :::::.:::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::.. CCDS44 LDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 KPLYVALAQRKEERQAYLTNEYMQRMASVRAVP-----NQRAPPSG-YFMTAVPQTQNHA ::::::::::::::.:.:::.::::.:..::.: :: : .: ::. ::::.:.. CCDS44 KPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRALPANAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRP 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KE5 AYYPPSQIARLRPSPRWTAQGARPHPFQNKPSAIRPGAPRVPFSTMRP-----ASSQVPR :: :.:.:..::.::: ::.::. ::. ::::: ..:: . . : :: .: CCDS44 PYYTPNQLAQMRPNPRWQ-QGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGNAPASRGLPT 430 440 450 460 470 470 480 490 500 pF1KE5 VMSTQRVAN--------------------TSTQTVGPRPAA-------AAAAAATPAVRT .::::.. :.. : :.: ::.:::.: :. CCDS44 --TTQRVGSECPDRLAMDFGGAGAAQQGLTDSCQSGGVPTAVQNLAPRAAVAAAAP--RA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 VPRYKYAAGVRNPQQHRNAQPQVTMQQLAVHVQGQETLTASRLASAPPQKQKQMLGERLF : ::::..::.: : :: . : :::::::: :::: ::.::::.:::::::::: CCDS44 VAPYKYASSVRSP--HPAIQP-LQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLF 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE5 PLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLYMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAK-EATQK- ::::.:: .::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:: ::.:: CCDS44 PLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKV 600 610 620 630 640 650 630 pF1KE5 -AVNSATGVPTV :: .:: CCDS44 GAVAAATS 660 >>CCDS42878.1 PABPC1L gene_id:80336|Hs108|chr20 (614 aa) initn: 2597 init1: 2018 opt: 2272 Z-score: 1446.8 bits: 277.9 E(32554): 2.9e-74 Smith-Waterman score: 2638; 66.1% identity (83.2% similar) in 625 aa overlap (1-616:1-607) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNPSTPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSNYAYVNFQ :: : .:: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::. : : .:::.::: CCDS42 MNASGSGYPLASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDVATRRSLGYAYINFQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 HTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNKALYDTVS . :::.:::::::...::.:.:::::::::.::::::::::.:::. ::.::::::: : CCDS42 QPADAERALDTMNFEMLKGQPIRIMWSQRDPGLRKSGVGNIFIKNLEDSIDNKALYDTFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQFKSRKERE .:::::::.:.:::.::.:.:::::::::::..::. ::::::: ::::::.::::.::: CCDS42 TFGNILSCKVACDEHGSRGFGFVHFETHEAAQQAINTMNGMLLNDRKVFVGHFKSRRERE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AELGARAKEFPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFER ::::::: :: :.:.::. :.:.. :.:::..:: :::::: :.::.:. ::::.::. CCDS42 AELGARALEFTNIYVKNLPVDVDEQGLQDLFSQFGKMLSVKVMRDNSGHSRCFGFVNFEK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRTFEQMKQDRITRYQVVNLYVKN ::.::::: .:::::..:. .:.:::::.::::.:::: ::::::::. ::: ::::::: CCDS42 HEEAQKAVVHMNGKEVSGRLLYAGRAQKRVERQNELKRRFEQMKQDRLRRYQGVNLYVKN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LDDGIDDERLRKAFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVAT :::.:::..::: :::.:.::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::.: CCDS42 LDDSIDDDKLRKEFSPYGVITSAKVMTEGGHSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 KPLYVALAQRKEERQAYLTNEYMQRMASVRAVPN----QRAPPSGYFMTAVPQTQNHAAY ::::::::::::::.: :::.::::....:.. : . ::.::. :.:: .::: CCDS42 KPLYVALAQRKEERKAILTNQYMQRLSTMRTLSNPLLGSFQQPSSYFLPAMPQPPAQAAY 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 YPPSQIARLRPSPRWTAQGARPHPFQNKPSAIRPGA-PRVP---FSTMRPASSQVPR-VM : . .. .:.::::.: :: . : .:: . :: : .:..: ::.:::: : CCDS42 YGCGPVTPTQPAPRWTSQPPRP----SCASMVRPPVVPRRPPAHISSVRQASTQVPRTVP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 STQRVANTSTQTVGPRPAAAAAAAATPAVRTVPRYKYAAGVRNPQQHRNAQPQVTMQQLA :::::: .:::.:: .... ::. .: .: :. .:. : CCDS42 HTQRVANIGTQTTGP----SGVGCCTPGRPLLPCKCSSA----------AHSTYRVQEPA 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 VHVQGQETLTASRLASAPPQKQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLYM ::. ::: :::: ::.:: ..::::.::::.:::. .: :::::::::::::::::: : CCDS42 VHIPGQEPLTASMLAAAPLHEQKQMIGERLYPLIHDVHTQLAGKITGMLLEIDNSELLLM 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 pF1KE5 LESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEATQKAVNSATGVPTV :::::::..:.:::::::::::: : CCDS42 LESPESLHAKIDEAVAVLQAHQAMEQPKAYMH 590 600 610 >>CCDS14460.1 PABPC5 gene_id:140886|Hs108|chrX (382 aa) initn: 1681 init1: 764 opt: 1509 Z-score: 970.4 bits: 189.0 E(32554): 9.8e-48 Smith-Waterman score: 1509; 61.1% identity (82.0% similar) in 373 aa overlap (2-371:7-379) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MNPS--TPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSN ::. .: :.:::::: ::::: :::.:: ::::. ::::: .: . . CCDS14 MGSGEPNPAGKKKKYLKAALYVGDLDPDVTEDMLYKKFRPAGPLRFTRICRDPVTRSPLG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YAYVNFQHTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNK :.::::. ::: ::.:::::.:.::: :.:::: : ::::::::::.:::::::.:. CCDS14 YGYVNFRFPADAEWALNTMNFDLINGKPFRLMWSQPDDRLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 ALYDTVSAFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQF ::. :::::::::.::::.::::::..:::.. ::.::: .:::. ::.:.:.::.: CCDS14 ALFYLFSAFGNILSCKVVCDDNGSKGYAYVHFDSLAAANRAIWHMNGVRLNNRQVYVGRF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KSRKEREAELGARAKE-FPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKG : .:: ::. .: . : ::..::.:.:.:::.::.:: ..::. ::::. : :::::: CCDS14 KFPEERAAEVRTRDRATFTNVFVKNIGDDIDDEKLKELFCEYGPTESVKVIRDASGKSKG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRTFEQMKQDRITRYQ :::: .: :: ::::: ...:: ..:: .::::::::.:: .::.: ::... . .: CCDS14 FGFVRYETHEAAQKAVLDLHGKSIDGKVLYVGRAQKKIERLAELRRRFERLRLKEKSRPP 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 VVNLYVKNLDDGIDDERLRKAFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTE : .:.::::. :.::.:.. :: ::.:. :::::: :..:::: ::::: ::::::: : CCDS14 GVPIYIKNLDETINDEKLKEEFSSFGSISRAKVMMEVGQGKGFGVVCFSSFEEATKAVDE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 MNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAYLTNEYMQRMASVRAVPNQRAPPSGYFMTAVPQTQN ::::::..:::.:.:.: . CCDS14 MNGRIVGSKPLHVTLGQARRRC 370 380 >>CCDS35334.1 PABPC1L2A gene_id:340529|Hs108|chrX (200 aa) initn: 1081 init1: 965 opt: 965 Z-score: 632.5 bits: 125.6 E(32554): 6.6e-29 Smith-Waterman score: 965; 73.3% identity (89.2% similar) in 195 aa overlap (11-205:2-196) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNPSTPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSNYAYVNFQ ::::::::::.:::::::::::::::::::::::: :: : .:::::.: CCDS35 MASLYVGDLHPEVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDKITRRSLGYAYVNYQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 HTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNKALYDTVS . ::..::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:.::: :.:.:::::. : CCDS35 QPVDAKRALETLNFDVIKGRPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLGKTIDNKALYNIFS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQFKSRKERE ::::::::.:.:::.: ::::::::. .:.::::: ::::.:: ::.:::.:::.:::: CCDS35 AFGNILSCKVACDEKGPKGYGFVHFQKQESAERAIDVMNGMFLNYRKIFVGRFKSHKERE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AELGARAKEFPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFER :: :: :.. .. .:.: :: :.: CCDS35 AERGAWARQSTSADVKDFEEDTDEEATLR 180 190 200 >>CCDS43972.1 PABPC1L2B gene_id:645974|Hs108|chrX (200 aa) initn: 1081 init1: 965 opt: 965 Z-score: 632.5 bits: 125.6 E(32554): 6.6e-29 Smith-Waterman score: 965; 73.3% identity (89.2% similar) in 195 aa overlap (11-205:2-196) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNPSTPSYPTASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDLITSGSSNYAYVNFQ ::::::::::.:::::::::::::::::::::::: :: : .:::::.: CCDS43 MASLYVGDLHPEVTEAMLYEKFSPAGPILSIRICRDKITRRSLGYAYVNYQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 HTKDAEHALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFVKNLDKSINNKALYDTVS . ::..::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:.::: :.:.:::::. : CCDS43 QPVDAKRALETLNFDVIKGRPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLGKTIDNKALYNIFS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AFGNILSCNVVCDENGSKGYGFVHFETHEAAERAIKKMNGMLLNGRKVFVGQFKSRKERE ::::::::.:.:::.: ::::::::. .:.::::: ::::.:: ::.:::.:::.:::: CCDS43 AFGNILSCKVACDEKGPKGYGFVHFQKQESAERAIDVMNGMFLNYRKIFVGRFKSHKERE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AELGARAKEFPNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFER :: :: :.. .. .:.: :: :.: CCDS43 AERGAWARQSTSADVKDFEEDTDEEATLR 180 190 200 631 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:23:59 2016 done: Tue Nov 8 04:23:59 2016 Total Scan time: 3.210 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]