FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2622, 349 aa 1>>>pF1KE2622 349 - 349 aa - 349 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9799+/-0.000989; mu= 7.6958+/- 0.059 mean_var=136.0524+/-27.355, 0's: 0 Z-trim(107.7): 135 B-trim: 5 in 1/53 Lambda= 0.109957 statistics sampled from 9601 (9760) to 9601 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 1.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12610.1 CEACAM8 gene_id:1088|Hs108|chr19 ( 349) 2327 380.9 8.6e-106 CCDS12585.1 CEACAM6 gene_id:4680|Hs108|chr19 ( 344) 1792 296.0 3e-80 CCDS54272.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 368) 1778 293.8 1.5e-79 CCDS54273.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 430) 1778 293.9 1.7e-79 CCDS46089.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 464) 1725 285.5 6e-77 CCDS12609.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 526) 1725 285.5 6.6e-77 CCDS54274.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 461) 1722 285.0 8.3e-77 CCDS77302.1 CEACAM5 gene_id:1048|Hs108|chr19 ( 701) 1614 268.0 1.6e-71 CCDS12584.1 CEACAM5 gene_id:1048|Hs108|chr19 ( 702) 1614 268.0 1.6e-71 CCDS77314.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 333) 1281 215.0 7.4e-56 CCDS33039.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 326) 1277 214.3 1.1e-55 CCDS12616.1 PSG2 gene_id:5670|Hs108|chr19 ( 335) 1274 213.8 1.6e-55 CCDS62695.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 326) 1270 213.2 2.4e-55 CCDS82360.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 326) 1262 211.9 5.9e-55 CCDS12617.1 PSG5 gene_id:5673|Hs108|chr19 ( 335) 1262 211.9 6e-55 CCDS12614.2 PSG11 gene_id:5680|Hs108|chr19 ( 335) 1255 210.8 1.3e-54 CCDS77312.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 333) 1242 208.8 5.4e-54 CCDS12583.1 CEACAM7 gene_id:1087|Hs108|chr19 ( 265) 1056 179.2 3.5e-45 CCDS12611.1 PSG3 gene_id:5671|Hs108|chr19 ( 428) 777 135.1 1.1e-31 CCDS77310.1 PSG7 gene_id:5676|Hs108|chr19 ( 297) 762 132.6 4.1e-31 CCDS46090.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 297) 752 131.0 1.2e-30 CCDS46091.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 419) 752 131.1 1.6e-30 CCDS33037.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 426) 744 129.9 3.9e-30 CCDS12613.1 PSG6 gene_id:5675|Hs108|chr19 ( 435) 742 129.5 5e-30 CCDS33038.1 PSG6 gene_id:5675|Hs108|chr19 ( 424) 740 129.2 6.1e-30 CCDS59392.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 417) 737 128.7 8.4e-30 CCDS54275.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 419) 734 128.3 1.2e-29 CCDS46093.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 419) 732 127.9 1.5e-29 CCDS12615.2 PSG11 gene_id:5680|Hs108|chr19 ( 213) 727 126.9 1.5e-29 CCDS12612.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 426) 729 127.5 2.1e-29 CCDS74380.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 428) 725 126.8 3.2e-29 CCDS12618.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 426) 713 124.9 1.2e-28 CCDS46087.1 CEACAM21 gene_id:90273|Hs108|chr19 ( 292) 683 120.0 2.4e-27 CCDS46086.1 CEACAM21 gene_id:90273|Hs108|chr19 ( 293) 678 119.3 4.2e-27 CCDS62685.1 CEACAM3 gene_id:1084|Hs108|chr19 ( 212) 651 114.9 6.4e-26 CCDS12586.2 CEACAM3 gene_id:1084|Hs108|chr19 ( 252) 651 114.9 7.3e-26 CCDS77311.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 240) 645 114.0 1.4e-25 CCDS54278.1 CEACAM16 gene_id:388551|Hs108|chr19 ( 425) 571 102.4 7.2e-22 CCDS33033.1 CEACAM4 gene_id:1089|Hs108|chr19 ( 244) 506 91.9 6e-19 CCDS74392.1 CEACAM20 gene_id:125931|Hs108|chr19 ( 584) 406 76.3 6.9e-14 CCDS74393.1 CEACAM20 gene_id:125931|Hs108|chr19 ( 596) 406 76.3 7.1e-14 >>CCDS12610.1 CEACAM8 gene_id:1088|Hs108|chr19 (349 aa) initn: 2327 init1: 2327 opt: 2327 Z-score: 2012.8 bits: 380.9 E(32554): 8.6e-106 Smith-Waterman score: 2327; 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