FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5612, 511 aa 1>>>pF1KE5612 511 - 511 aa - 511 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1379+/-0.000904; mu= 18.8522+/- 0.054 mean_var=59.2333+/-11.880, 0's: 0 Z-trim(104.5): 25 B-trim: 7 in 1/49 Lambda= 0.166645 statistics sampled from 7924 (7936) to 7924 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16 Scan time: 2.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 511) 3499 849.8 0 CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 509) 3377 820.5 0 CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 ( 481) 1352 333.7 2.9e-91 CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 ( 473) 1157 286.8 3.7e-77 CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 435) 1130 280.3 3.1e-75 CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 417) 920 229.8 4.7e-60 CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 405) 772 194.2 2.4e-49 CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 253) 688 173.9 1.9e-43 CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 387) 674 170.6 2.8e-42 CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 176) 439 113.9 1.5e-25 CCDS56260.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 168) 356 94.0 1.4e-19 >>CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (511 aa) initn: 3499 init1: 3499 opt: 3499 Z-score: 4541.2 bits: 849.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3499; 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CCDS57 QVHLEKADQDINYYIPAEDFSGLAVIDWEYWRPQWARNWNSKDVYRQKSRKLISDMGKNV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCF : :. :: ::...: :. :::::: ::. ::::::.:::.:.. :.:.::: CCDS57 SATDIEYLAKVTFEESAKAFMKETIKLGIKSRPKGLWGYYLYPDCHNYNVYAPNYSGSCP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 NVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATL-YVRNRVREAIRVSKIPDAKSPL . :. ::..:::::: :.:::::: . . . : . . ::.:..:.: . . : CCDS57 EDEVLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYAL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYM :::.:::. . :. : :::...:: :.::..::::.:::::: ... : .: . ... CCDS57 PVFVYTRLGYRDEPLFFLSKQDLVSTIGESAALGAAGIVIWGDMNLTASKANCTKVKQFV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 ETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVR . :. :: ::: ::..:: ::...: :::: ::. .:::::: .. :. . :.:::. CCDS57 SSDLGSYIANVTRAAEVCSLHLCRNNGRCIRKMWNAPSYLHLNPASYHIEASEDGEFTVK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEP :: . :: ... : : ::. : :: .. ..: : CCDS57 GKASDTDLAVMADTFSCHCYQGY---EGADCREIKTADGCSGVSPSPGSLMTLCLLLLAS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 QIFYNASPSTLSATMFIWRLEVWDQGISRIGFF CCDS57 YRSIQL 480 >>CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 (473 aa) initn: 977 init1: 531 opt: 1157 Z-score: 1498.7 bits: 286.8 E(32554): 3.7e-77 Smith-Waterman score: 1157; 40.3% identity (71.8% similar) in 412 aa overlap (34-438:21-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGK . :. :::.. . ::. ::..:.. : . CCDS28 MRAGPGPTVTLALVLAVSWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDH . :::.. :. .:: . ..:..:::: :::: :: .:: .: .:.::.::..:: : CCDS28 LKVPLDLNAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDS-AGRSVHGGVPQNVSLWAH 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LDKAKKDITFYMPV-DNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLT .: . :. . .. :.::::::.:::.:.:::. ::::. : .:: ... . CCDS28 RKMLQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPD 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK--PGYNGSCFN . ...:. ::: :...:..::.. : .:: ::::.::::::::: : . .:.: : . CCDS28 RIVKQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPD 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE5 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLN-TQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLP ::. :::.:.::: :::::.::.::. : : . .: ::.::.::.. :. :: CCDS28 VEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 VFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYME :...:: ... . : ::. .:. :.::..::::.:...:: . : ..: : .:. CCDS28 VYVFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLT 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 TILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFA-IQLEKGGKFTVR .: ::..::. :...::.. :. .: :.:.: ..: .:::. ..: . . :. .: CCDS28 RLLVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLR 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 --GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETE :. . :..... .: :.:: CCDS28 PVGELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALA 410 420 430 440 450 460 >>CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (435 aa) initn: 894 init1: 601 opt: 1130 Z-score: 1464.2 bits: 280.3 E(32554): 3.1e-75 Smith-Waterman score: 1130; 41.6% identity (69.4% similar) in 421 aa overlap (29-438:5-421) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCC---LTL-----NFRAPPVIPNVPFLWA :.: : ::: .::.: ..:: :: . CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGP-LLPNRPFTTV 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 WNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNG ::: ...:: . .:.:.:. ...: . : .:::: ..:: ::: . :: : : CCDS28 WNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYY-TPTGEPVFG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNL-GMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIEL :.::. :: :: .. .:: .:. .. :.:::::: ::: :: :: ::.:..:: : CCDS28 GLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRAL 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK :: :. . .. :...:. :.. ... :..::. ::: :::.: ::::::. . . CCDS28 VQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 PGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYL-NTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSK :.:.:.: . .::.:.:::..: :::::::. . .. . .::..:: ::.::. CCDS28 PNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA- 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKS . . :::. :..: : : . .:: ::: ...::..: ::.:.:.: . :. .: CCDS28 VAAGDPNLPVLPYVQI-FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKES 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 CLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLE : . .::.: :.:.:.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.::: CCDS28 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KE5 KGG-KFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFL :: ...:: .::: :.. .: : :: CCDS28 PGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 400 410 420 430 >>CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (417 aa) initn: 677 init1: 301 opt: 920 Z-score: 1191.6 bits: 229.8 E(32554): 4.7e-60 Smith-Waterman score: 920; 39.3% identity (64.1% similar) in 379 aa overlap (28-403:9-384) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAP-PVIPNVPFLWAWNAPSEF :.. : :. : : .:. :: ::.:: CCDS28 MTTQLGPALVLGVALCLGCGQPLPQVPERPFSVLWNVPSAH 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 CLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKIS : ..: : .. ...:.. . ::..:::: ..:: :::. :.. :::::: . CCDS28 CEARFGVHLPLNALGIIANRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGP-RGTAHNGGIPQALP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQL :. :: : .: . : ::.::::: : :: :: . .:. : .:: .: CCDS28 LDRHLALAAYQIHHSLRPGFAGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNH-HYKKPGYNGSC . : :: ::.:.. .. .:..... :::. :::.: .: : : : .:.: : CCDS28 DPQEQLYKAYTGFEQAARALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASNYTGRC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPL . . :: .: ::: :.::.::::: . :. .::.:..::.::. . . :: CCDS28 HAATLARNTQLHWLWAASSALFPSIYLPPRLPPAHHQAFVRHRLEEAFRVALV-GHRHPL 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYM ::.::.:.. . .:::::.:: ..: ..::::.:.:.:: ::. : . : : .:. 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CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGP-LLPNRPFTTV 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 WNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNG ::: ...:: . .:.:.:. ...: . : .:::: ..:: ::: . :: : : CCDS28 WNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYY-TPTGEPVFG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNL-GMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIEL :.::. :: :: .. .:: .:. .. :.:::::: ::: :: :: ::.:..:: : CCDS28 GLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRAL 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK :: :. . .. :...:. :.. ... :..::. ::: :::.: ::::::. . . CCDS28 VQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 PGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYL-NTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSK :.:.:.: . .::.:.:::..: :::::::. . .. . .::..:: ::.::. CCDS28 PNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA- 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKS . . :::. :..: : : . .:: ..: CCDS28 VAAGDPNLPVLPYVQI-FYDTTNHFLP------------------------------LES 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 CLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLE : . .::.: :.:.:.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.::: CCDS28 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 pF1KE5 KGG-KFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFL :: ...:: .::: :.. .: : :: CCDS28 PGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 370 380 390 400 >>CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (253 aa) initn: 562 init1: 307 opt: 688 Z-score: 893.5 bits: 173.9 E(32554): 1.9e-43 Smith-Waterman score: 688; 43.3% identity (72.3% similar) in 238 aa overlap (203-438:4-239) 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 QQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKP :..::. ::: :::.: ::::::. . .: CCDS46 MAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSP 10 20 30 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 GYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYL-NTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKI .:.:.: . .::.:.:::..: :::::::. . .. . .::..:: ::.::. . CCDS46 NYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-V 40 50 60 70 80 90 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSC . :::. :..: : : . .:: ::: ...::..: ::.:.:.: . :. .:: CCDS46 AAGDPNLPVLPYVQI-FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESC 100 110 120 130 140 150 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEK . .::.: :.:.:.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.::: CCDS46 QAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTP 160 170 180 190 200 210 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 GG-KFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLK :: ...:: .::: :.. .: : :: CCDS46 GGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 220 230 240 250 >>CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (387 aa) initn: 546 init1: 301 opt: 674 Z-score: 872.5 bits: 170.6 E(32554): 2.8e-42 Smith-Waterman score: 753; 35.6% identity (58.0% similar) in 379 aa overlap (28-403:9-354) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAP-PVIPNVPFLWAWNAPSEF :.. : :. : : .:. :: ::.:: CCDS56 MTTQLGPALVLGVALCLGCGQPLPQVPERPFSVLWNVPSAH 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 CLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKIS : ..: : .. ...:.. . ::..:::: ..:: :::. :.. :::::: . CCDS56 CEARFGVHLPLNALGIIANRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGP-RGTAHNGGIPQALP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQL :. :: : .: . : ::.::::: : :: :: . .:. : .:: .: CCDS56 LDRHLALAAYQIHHSLRPGFAGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNH-HYKKPGYNGSC . : :: ::.:.. .. .:..... :::. :::.: .: : : : .:.: : CCDS56 DPQEQLYKAYTGFEQAARALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASNYTGRC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPL . . :: .: ::: :.::.::::: . :. .::.:..::.::. . . :: CCDS56 HAATLARNTQLHWLWAASSALFPSIYLPPRLPPAHHQAFVRHRLEEAFRVALV-GHRHPL 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYM ::.::.:.. . .::::.: : : .:. CCDS56 PVLAYVRLTHR-RSGRFLSQEE------------------------------CWHLHDYL 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 ETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSD-YLHLNPDNFAIQLEKGGKFTV :.::.:::: :: ::. :. .: : :.. .. . .::: :: CCDS56 VDTLGPYVINVTRAAMACSHQRCHGHGRCARRDPGQMEAFLHLWPDGSLGDWKSFSCHCY 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 RGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEE CCDS56 WGWAGPTCQEPRPGPKEAV 370 380 >>CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (176 aa) initn: 342 init1: 307 opt: 439 Z-score: 572.4 bits: 113.9 E(32554): 1.5e-25 Smith-Waterman score: 439; 42.1% identity (71.3% similar) in 164 aa overlap (276-438:1-162) 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 NDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTR .::..:: ::.::. . . :::. :.. CCDS46 MYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPVLPYVQ 10 20 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPY : : : . .:: ::: ...::..: ::.:.:.: . :. .:: . .::.: :.:. CCDS46 I-FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPF 30 40 50 60 70 80 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 IINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGG-KFTVRGKPTLE :.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.::: :: ...:: .:: CCDS46 ILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLE 90 100 110 120 130 140 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 DLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNA : :.. .: : :: CCDS46 DQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 150 160 170 511 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:08:51 2016 done: Tue Nov 8 05:08:52 2016 Total Scan time: 2.980 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]