FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4390, 412 aa 1>>>pF1KE4390 412 - 412 aa - 412 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3497+/-0.000909; mu= 16.4363+/- 0.054 mean_var=62.3710+/-12.633, 0's: 0 Z-trim(104.2): 29 B-trim: 426 in 1/51 Lambda= 0.162399 statistics sampled from 7772 (7796) to 7772 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 2669 634.2 6.8e-182 CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 2303 548.4 4.4e-156 CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 947 230.8 2e-60 CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 901 220.0 3.4e-57 CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 901 220.0 3.4e-57 CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 897 219.0 6.1e-57 CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 894 218.3 8.6e-57 CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 858 209.9 3.7e-54 CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 854 209.0 7e-54 CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 814 199.6 4.4e-51 CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 778 191.2 1.7e-48 CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 755 185.8 9.5e-47 CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 727 179.2 6.5e-45 CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 715 176.5 6.4e-44 CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 715 176.5 6.6e-44 CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 715 176.5 6.8e-44 CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 597 148.8 9.8e-36 CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 507 127.8 4.7e-29 CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 507 127.8 4.8e-29 CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 461 117.0 6.3e-26 >>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa) initn: 2669 init1: 2669 opt: 2669 Z-score: 3379.1 bits: 634.2 E(32554): 6.8e-182 Smith-Waterman score: 2669; 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CCDS76 PPHVSKSSQSEALLNITNNGIHFAPLQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSK 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 FPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNSLYLG . . .. . ::....: : ::.: ..:. ....::... ::..:. ..:.: CCDS76 MEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINT 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 PILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAW : : :..::: ... .:. .:.: : ::: : :::. : .: : ::: .::::.: : CCDS76 LIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMW 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 ITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFED :..: .:. .:.:..: .. :.:..::: :::: .:: :.:::.:.::: : ::. CCDS76 ISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFEN 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 CRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLT ..:. .:::. : :.: :. .:. ::::::.: ::.:: .: .. : ..:. :: : CCDS76 VKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLF 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 KLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQ .: .: ..: .: ::.:::::. :: : . :::::::.::: ::: : . . :. CCDS76 DFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIE 330 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 pF1KE4 ILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS .::.::. ..:.:...:::.: ::::.:.:: .:: :. : CCDS76 WMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY 390 400 410 420 430 >>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (421 aa) initn: 726 init1: 549 opt: 901 Z-score: 1140.3 bits: 220.0 E(32554): 3.4e-57 Smith-Waterman score: 904; 37.5% identity (66.7% similar) in 411 aa overlap (15-412:13-421) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK :.. ::. :: . : :. : .. . : : ::.. CCDS66 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFARE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS :..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: CCDS66 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC-- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTA ::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: : CCDS66 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 RAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKK . .:: ...:: : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:.: CCDS66 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTAL : ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.:: :: CCDS66 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRAL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 DCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAM : :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :.. CCDS66 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 AKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLL :: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . . CCDS66 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI 360 370 380 390 400 410 410 pF1KE4 RSYRS .:.. CCDS66 DKYKN 420 >>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (425 aa) initn: 726 init1: 549 opt: 901 Z-score: 1140.2 bits: 220.0 E(32554): 3.4e-57 Smith-Waterman score: 908; 37.2% identity (66.0% similar) in 427 aa overlap (1-412:1-425) 10 20 30 40 pF1KE4 MAAAL--LARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFA :::.. : : . :.. ::. :: . : :. : .. . : : :: CCDS44 MAAGFGRCCRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 EKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGC ..:..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: CCDS44 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ASTGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAAST ::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: CCDS44 --TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKT 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 TARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLG :. .:: ...:: : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .: CCDS44 KAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 KKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQT .:: ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.:: CCDS44 RKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQR 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 ALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEA ::: :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . : CCDS44 ALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 AMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGH ..:: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . CCDS44 SIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVARE 360 370 380 390 400 410 410 pF1KE4 LLRSYRS . .:.. CCDS44 HIDKYKN 420 >>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa) initn: 722 init1: 549 opt: 897 Z-score: 1135.8 bits: 219.0 E(32554): 6.1e-57 Smith-Waterman score: 897; 38.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (33-412:4-385) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDK :. : .. . : : ::..:..:.::. :: CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDK 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 EHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVN-NS .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: ::: ... :: CCDS65 TGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC--TGVQTAIEGNS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 LYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNG : ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: :. .:: ...:: CCDS65 LGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIING 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE4 TKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSST : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:.:: ..: : :.: CCDS65 QKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDT 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRM ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.:: ::: :..:: .: CCDS65 RGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERK 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 AFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATA .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :..:: :.. :. CCDS65 TFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQ 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . . .:.. CCDS65 LATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN 340 350 360 370 380 >>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa) initn: 850 init1: 756 opt: 894 Z-score: 1133.0 bits: 218.3 E(32554): 8.6e-57 Smith-Waterman score: 894; 44.1% identity (72.8% similar) in 331 aa overlap (80-410:1-330) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 EKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGC ....: : ::.: ..:. ....::... CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTT ::..:. ..:.: : : :..::: ... .:. .:.: : ::: : :::. : .: CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTR 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 ARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKED : ::: .::::.: ::..: .:. .:.:..: .. :.:..::: :::: .:: :. CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPEN 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 KLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDC :::.:.::: : ::. ..:. .:::. : :.: :. .:. ::::::.: ::.:: .: CCDS81 KLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDY 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 AVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAK .. : ..:. :: : .: .: ..: .: ::.:::::. :: : . :::::::.::: CCDS81 TIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASMAK 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRS ::: : . . :. .::.::. ..:.:...:::.: ::::.:.:: .:: :. CCDS81 YYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAE 270 280 290 300 310 320 410 pF1KE4 YRS : CCDS81 Y 330 >>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa) initn: 798 init1: 487 opt: 858 Z-score: 1085.7 bits: 209.9 E(32554): 3.7e-54 Smith-Waterman score: 858; 37.8% identity (70.5% similar) in 373 aa overlap (34-402:45-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 ALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKE : : ...: :: : ...: : : ..:. CCDS10 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HLFPAAQV--KKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNS . : . :..:.::.:.. .: . ::.:: :: ....::::::. ...:. ...... CCDS10 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 LYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNG : .. ... :.. ::. .. . ::. :: .:.:::. :::. . . :. .:. ..::: CCDS10 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 pF1KE4 TKAWITNAWEASAAVVFASTDRAL--QNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTA .: ::::. .:.. .:.:.:: : ...:.::.: ::.. .:: ::::.:::.: CCDS10 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 NLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMA .::::::.:: .:::. . : . :. ::. :. .:. ::. :..:: .. : . : : CCDS10 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAI :: . ..:..: :.::: : . : .. .: :. . :. : . : ..: :: . CCDS10 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAECATQV 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS . ..:: .:: ::....: : :::.. :: ::::..:::: CCDS10 ALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 380 390 400 410 420 >>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 (415 aa) initn: 737 init1: 318 opt: 854 Z-score: 1080.8 bits: 209.0 E(32554): 7e-54 Smith-Waterman score: 854; 36.9% identity (69.7% similar) in 396 aa overlap (15-408:21-414) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHT-IYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKEL :.: . :.: . : :. : : .. . .. ::: .:. CCDS84 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 FPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTG : :. :...:::. ..: . ::. .. . ..::.::. : .. .: .. ::.:: CCDS84 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAE . .:..: . : .::..::.. . :. . .:.. . :.:::.::::.. :.:. . CCDS84 AYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGI :: ..:::.::.:..: :.. ::. : :.:: ..: ::::..:::: :.: CCDS84 GDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGP-GPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGW 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 RGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNY .. : .::::: .: . .: :.:: ::.. :. :::.::: .:: :.... . .. CCDS84 NSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 AENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAM-LKDNKKPFIKEAAMAKLAA . : :: ::.. : .:: ::::: : .:::.. ::. :....: . .:::: : CCDS84 LNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS .. :: .::.:. ::.::. .. .... ::.:. .: ::..:..:..:. ::. CCDS84 TDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE 360 370 380 390 400 410 >>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa) initn: 798 init1: 487 opt: 814 Z-score: 1030.5 bits: 199.6 E(32554): 4.4e-51 Smith-Waterman score: 814; 39.0% identity (72.4% similar) in 333 aa overlap (72-402:55-387) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIA :..:.::.:.. .: . ::.:: :: .... CCDS53 AGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLV 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 MEEISRGCASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGS ::::::. ...:. ......: .. ... :.. ::. .. . ::. :: .:.:::. :: CCDS53 MEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGS 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 pF1KE4 DAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRAL--QNKSISAFLVPMPT :. . . :. .:. ..:::.: ::::. .:.. .:.:.:: : ...:.::.: CCDS53 DVVSMKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGM 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 PGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQA ::.. .:: ::::.:::.: .::::::.:: .:::. . : . :. ::. :. .:. CCDS53 PGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGP 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKK ::. :..:: .. : . : ::: . ..:..: :.::: : . : .. .: :. . CCDS53 LGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGH 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 PFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQR :. : . : ..: :: .. ..:: .:: ::....: : :::.. :: ::::..: CCDS53 CTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRR 330 340 350 360 370 380 400 410 pF1KE4 LVIAGHLLRSYRS ::: CCDS53 LVIGRAFNADFH 390 412 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 22:56:23 2016 done: Sat Nov 5 22:56:24 2016 Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]