FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4472, 493 aa 1>>>pF1KE4472 493 - 493 aa - 493 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7549+/-0.00113; mu= 14.7631+/- 0.067 mean_var=56.5923+/-11.743, 0's: 0 Z-trim(100.6): 35 B-trim: 209 in 1/48 Lambda= 0.170489 statistics sampled from 6168 (6183) to 6168 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 2.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 493) 3175 789.6 0 CCDS67032.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 433) 1604 403.2 2.9e-112 CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 ( 487) 410 109.6 8.2e-24 CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 493) 367 99.0 1.3e-20 CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 ( 481) 341 92.6 1e-18 CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 405) 279 77.3 3.4e-14 CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 441) 253 70.9 3.1e-12 CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 398) 249 70.0 5.6e-12 CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 ( 507) 249 70.0 7.1e-12 >>CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 (493 aa) initn: 3175 init1: 3175 opt: 3175 Z-score: 4216.4 bits: 789.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3175; 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CCDS13 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAV----NPGVVVRISQKGLDYASQQGTAAL 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 QTAFQRASYPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSV : ..: . :: . . ::. .:......: .... :::. .: .. ::.:... CCDS13 QKELKRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANI 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VFKGTLKYGYTTAWWLGIDQSIDFEIDS---AIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFH ..: : . .: .. ..:. :.. . ::..... : ::. .: .. CCDS13 KISGKWK---AQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPT--SGKPTITCSSCSSHIN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KLLLHLQGEREPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI-NVISNIMADFVQTRAASILS .. .:.. . . ::. ::: . : .:. ...:.:... : .:. . . :: . CCDS13 SVHVHIS-KSKVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKI 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 DGDIGVDISLTGDPVITSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLL----GDSRMLYF :. :.. .:.. :. :. :. . ::.: .: . : : :.: .. . .::.:. CCDS13 DSVAGINYGLVAPPATTAETLDVQMKGEFYSEN--HHNP-PPFAPPVMEFPAAHDRMVYL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 WFSERVFHSLAKVAFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPS-Q .:. :.. . : . : : ..: : : : : : :.: .. ::. ::. . CCDS13 GLSDYFFNTAGLVYQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGT---FLPEVAKKFPNMK 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 AQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKK :. : :..: : :.. .: :. . :... . . . . ....: .. CCDS13 IQIHVSASTPPHLSVQPTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESN 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 KLFLSL-LDFQITPKTVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKG .: : :: . ::. : .:.... .. . .:.: .:. : : . CCDS13 RLVGELKLDRLLLELKHSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFP-LPTPAR 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE4 VSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS :.:.... . ...:::. : CCDS13 VQLYNVV---LQPHQNFLLFGADVVYK 470 480 >>CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (493 aa) initn: 208 init1: 99 opt: 367 Z-score: 483.7 bits: 99.0 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 382; 22.4% identity (55.1% similar) in 490 aa overlap (7-484:7-468) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI : ::::..::: : . :.:. :: ....: . .. .. . ::. CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCK------IRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT :.. :. :.. ......:...::.... . . ..: :.:. : :.. CCDS13 RGKE-----GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASL---G-LRFRRQL 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCD-SGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGW .:. : . ..... . .:. : .::.... .: : .. . : . CCDS13 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKK-- 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI----NVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLT . .....::. ....:. ::: . .:. : . : : .:. :. : .:.: :: CCDS13 VYDFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRS-SV--DELVGIDYSLM 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 GDPVITSSYLESHHKGHFI-YKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVA ::: ..: :. .: :. . . .:: . : : . ::.: ::: : : . CCDS13 KDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESY 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISC :. : :.: :.:: .. .:.. :.. . :. : .. .. : :. . CCDS13 FRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIVLLSPAVID---SPLKLELRVLAPPRCTI 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KE4 QNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLF--LSLLDFQITP . .:.... .. : . . ::: . .. : ... . : : :.: :.: CCDS13 KPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYS 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 KTVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITR . : : . .:. :..:. .:. .... . . .:... .. . .. CCDS13 NH-SALESLALIPLQAPLKTMLQ-IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNH 400 410 420 430 440 450 470 480 490 pF1KE4 DGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS ::: . :. : . : CCDS13 AGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 460 470 480 490 >>CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 (481 aa) initn: 170 init1: 70 opt: 341 Z-score: 449.4 bits: 92.6 E(32554): 1e-18 Smith-Waterman score: 341; 23.0% identity (55.3% similar) in 461 aa overlap (7-460:11-461) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRAS . :::: .. . :.. :.: ::: .: .: ..:. . : . CCDS13 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGAN--PGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 YPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKY ::.::. . .:. .: .:...: . : .. : ......::.. :. .: : CCDS13 LPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 GYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDS-GRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGER . .. .. :.: . ..:....: : .: :: . : .: .. . . ..:. CCDS13 RKS---FFKLQGSFDVSV-KGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEIN-VISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISL ::. .:: : : .. ::...::. :. .:. . ..:: .. :. .: :: CCDS13 --GWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 TGDPVITSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGD-SRMLYFWFSERVFHSLAKV . : :...:: ::.....: . : . .: . ..:.:: .:. ::.. . : CCDS13 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 AFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKIS ..: : .:. : . . : : .: . .. .. . : .: . ..: CCDS13 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 CQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPK : .: . . :.: ... . .. .:. . :: ::. .. : CCDS13 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 TVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRD :.. ..: ....:. .: . :. ..: : : : :.:.:. CCDS13 E-SKVGLFNAELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFP-LPLLKRVQLYDLGLQIHKDFL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 pF1KE4 GFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS CCDS13 FLGANVQYMRV 480 >>CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (405 aa) initn: 179 init1: 99 opt: 279 Z-score: 368.3 bits: 77.3 E(32554): 3.4e-14 Smith-Waterman score: 279; 21.9% identity (53.3% similar) in 383 aa overlap (114-484:11-380) 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 LSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQIN :.. .:. : . ..... . CCDS56 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASAEGVSIRTG 10 20 30 40 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 TQLTCD-SGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICK .:. : .::.... .: : .. . : . . .....::. ....:. ::: CCDS56 LELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKK--VYDFLSTFITSGMRFLLNQQICP 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 pF1KE4 EI----NVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTGDPVITSSYLESHHKGHFI-YKN . .:. : . : : .:. :. : .:.: :: ::: ..: :. .: :. . CCDS56 VLYHAGTVLLNSLLDTVPVRS-SV--DELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTE 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 VSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAFQDGRLMLSLMGD----EFKAVL . .:: . : : . ::.: ::: : : . :. : :.: :.:: .. .: CCDS56 RNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLL 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 ETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQ .. :.. . :. : .. .. : :. . . .:.... .. : . . ::: CCDS56 RATYFGSIVLLSPAVI---DSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 HSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLF--LSLLDFQITPKTVSNLTESSSESIQSFLQSMIT . .. : ... . : : :.: :.: . : : . .:. :..:. CCDS56 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNH-SALESLALIPLQAPLKTMLQ 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 AVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQS .:. .... . . .:... .. . .. ::: . :. : . : CCDS56 -IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKN 340 350 360 370 380 pF1KE4 LS CCDS56 RPADVRASTAPTPSTAAV 390 400 >>CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (441 aa) initn: 208 init1: 99 opt: 253 Z-score: 333.1 bits: 70.9 E(32554): 3.1e-12 Smith-Waterman score: 260; 21.3% identity (49.7% similar) in 489 aa overlap (7-484:7-416) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI : ::::..::: : . :.:. :: ....: . .. .. . ::. CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCK------IRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT :.. :. :.. ......:...::.... . . ..: :.:. .. . : CCDS13 RGKE-----GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY-- 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWI :.: . :: CCDS13 -WFLKV---YDF------------------------------------------------ 110 190 200 210 220 230 pF1KE4 KQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI----NVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTG ...::. ....:. ::: . .:. : . : : .:. :. : .:.: :: CCDS13 ---LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRS-SV--DELVGIDYSLMK 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DPVITSSYLESHHKGHFI-YKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAF ::: ..: :. .: :. . . .:: . : : . ::.: ::: : : . : CCDS13 DPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYF 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 QDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQ . : :.: :.:: .. .:.. :.. . :. : .. .. : :. . . CCDS13 RAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIVLLSPAVID---SPLKLELRVLAPPRCTIK 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 pF1KE4 NKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLF--LSLLDFQITPK .:.... .. : . . ::: . .. : ... . : : :.: :.: . CCDS13 PSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSN 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 TVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRD : : . .:. :..:. .:. .... . . .:... .. . .. CCDS13 H-SALESLALIPLQAPLKTMLQ-IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNHA 350 360 370 380 390 400 470 480 490 pF1KE4 GFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS ::: . :. : . : CCDS13 GFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 410 420 430 440 >>CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (398 aa) initn: 208 init1: 99 opt: 249 Z-score: 328.5 bits: 70.0 E(32554): 5.6e-12 Smith-Waterman score: 249; 23.4% identity (54.1% similar) in 316 aa overlap (180-484:69-373) 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 SGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI----N . .....::. ....:. ::: . . 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CCDS13 FKSASFAHFTAGVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIY--ILSQPFMVRIMAT 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 KMPKISCQ--NKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIV--TTVQASYSKKKLF- . : :. : : . . .:.: .. .: .. .: :.: :.: ..: CCDS13 EPPIINLQPGNFTLDIPASIM---MLTQP-KNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVC 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 -LSLLDFQIT-PKTVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVS ::: :... :. :: .. ....:.:.. .: . ..:. : : : . CCDS13 SLSLNRFRLALPE--SNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFP-LSNPHK-- 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 LFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS : ..: .: . .::::.. :. . CCDS13 -FLFVNSDIEVLEGFLLISTDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 460 470 480 490 500 493 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:54:10 2016 done: Sun Nov 6 00:54:11 2016 Total Scan time: 2.760 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]