FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4567, 719 aa 1>>>pF1KE4567 719 - 719 aa - 719 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1636+/-0.000973; mu= 15.9657+/- 0.059 mean_var=85.6510+/-17.877, 0's: 0 Z-trim(106.4): 21 B-trim: 173 in 2/47 Lambda= 0.138582 statistics sampled from 8970 (8984) to 8970 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16 Scan time: 3.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 ( 719) 4855 981.0 0 CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 ( 704) 4585 927.1 0 CCDS7946.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 ( 750) 4457 901.5 0 CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 ( 735) 4187 847.5 0 CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11 ( 740) 3102 630.6 2.6e-180 CCDS53626.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 ( 442) 2350 480.1 3.1e-135 CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11 ( 707) 1564 323.1 9.3e-88 CCDS31604.1 NAALADL1 gene_id:10004|Hs108|chr11 ( 740) 1506 311.5 3e-84 CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7 ( 801) 596 129.6 1.9e-29 CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3 ( 679) 427 95.7 2.4e-19 CCDS3312.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3 ( 760) 427 95.8 2.7e-19 CCDS46960.1 NAALADL2 gene_id:254827|Hs108|chr3 ( 795) 333 77.0 1.3e-13 >>CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 (719 aa) initn: 4855 init1: 4855 opt: 4855 Z-score: 5244.9 bits: 981.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4855; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-719) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVI 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 YAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 YAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA 670 680 690 700 710 >>CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 (704 aa) initn: 4585 init1: 4585 opt: 4585 Z-score: 4953.3 bits: 927.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4585; 99.9% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (39-719:24-704) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 DSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE .::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MTAGSSYPLFLAAYACTGCLAERLGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNK 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 pF1KE4 YAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA 660 670 680 690 700 >>CCDS7946.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 (750 aa) initn: 4844 init1: 4454 opt: 4457 Z-score: 4814.6 bits: 901.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4780; 95.7% identity (95.9% similar) in 750 aa overlap (1-719:1-750) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS---- :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIV 610 620 630 640 650 660 660 670 680 pF1KE4 ---------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVD .:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 LRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVD 670 680 690 700 710 720 690 700 710 pF1KE4 PSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 PSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA 730 740 750 >>CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 (735 aa) initn: 4573 init1: 4183 opt: 4187 Z-score: 4523.0 bits: 847.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4510; 95.4% identity (95.6% similar) in 712 aa overlap (39-719:24-735) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 DSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE .::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MTAGSSYPLFLAAYACTGCLAERLGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 pF1KE4 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS------------ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 -------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEV .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEV 660 670 680 690 700 710 700 710 pF1KE4 KRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA :::::::::::::::::::::: CCDS53 KRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA 720 730 >>CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11 (740 aa) initn: 3362 init1: 3001 opt: 3102 Z-score: 3350.6 bits: 630.6 E(32554): 2.6e-180 Smith-Waterman score: 3326; 66.1% identity (86.3% similar) in 732 aa overlap (20-718:11-739) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKH-NMK :.: .: .::. ::.::. ::::: .:.:. . : ... CCDS82 MAESRGRLYLWMCLAA-ALAS--FLMGFMVGWFIKPLKETTTSVRYHQSIR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 -AFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLS ...:.::::::.:: .::..:::::::::: :::.::.:::.:::::..:.::::::: CCDS82 WKLVSEMKAENIKSFLRSFTKLPHLAGTEQNFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVN :::.:. :::::..: .:::.:: .:::: :::::..::::..::: :::::::::::: CCDS82 YPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPPDGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 YARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPG ::::::::::::.: :::.::::::::::.:::::::::.:::: :.:::::::::::: CCDS82 YARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKIFRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIG :. :: :::::: ..::::.::::::::::::::::.::..: . :.::.: ::::::: CCDS82 VQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPLTPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNV : ::. ::. .:: ::::.::.:.:.: :..::::::. : .::.::... :..:::::: CCDS82 YNDAEILLRYLGGIAPPDKSWKGALNVSYSIGPGFTGSDSFRKVRMHVYNINKITRIYNV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 IGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILF .::.::.:::::::::::::::::::.::: ::.::..::.:::: : ..::::::::.: CCDS82 VGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDPTSGVAVLQEIARSFGKLMSKGWRPRRTIIF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLT :::::::::::::::::::: ..::::..::::.:::::::::::::::::.:.::..:: CCDS82 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSIAYINSDSSIEGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLT 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 KELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYT ::. :::.:::.::::::: .:.:::: ...:::.:::::.:::..:::::::::::::: CCDS82 KEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENKNLPRINKLGSGSDFEAYFQRLGIASGRARYT 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 KNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCR :: .:.:.:.::.::..:::.::::::::: :: .:.:::.::..:.::..: ..::. . CCDS82 KNKKTDKYSSYPVYHTIYETFELVEKFYDPTFKKQLSVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQ 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 DYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS-- ::: .:..:: .::..: :: :.. ..:::::::::::::.: :: : .:: . : . CCDS82 DYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDHGVSFDSLFSAVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNP 590 600 610 620 630 640 660 670 680 pF1KE4 -----------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESK .:.:.:::::::::::::::::::.::::.: CCDS82 IAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKLFYRHIIFAPSSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENK 650 660 670 680 690 700 690 700 710 pF1KE4 VDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA .. :: :::..: .::::.:::: ::.:: CCDS82 ANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGTLKEVL 710 720 730 740 >>CCDS53626.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11 (442 aa) initn: 2737 init1: 2347 opt: 2350 Z-score: 2541.4 bits: 480.1 E(32554): 3.1e-135 Smith-Waterman score: 2673; 92.8% identity (93.0% similar) in 442 aa overlap (309-719:1-442) 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 YRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFS :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFS 10 20 30 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 TQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 TQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEI 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 VRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 VRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEG 100 110 120 130 140 150 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 NYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSG 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 NDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQ 220 230 240 250 260 270 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 VRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 VRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKN 280 290 300 310 320 330 640 650 660 pF1KE4 FTEIASKFSERLQDFDKS-------------------------------KHVIYAPSSHN :::::::::::::::::: .:::::::::: CCDS53 FTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHN 340 350 360 370 380 390 670 680 690 700 710 pF1KE4 KYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA 400 410 420 430 440 >>CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11 (707 aa) initn: 3218 init1: 1556 opt: 1564 Z-score: 1689.0 bits: 323.1 E(32554): 9.3e-88 Smith-Waterman score: 3103; 63.5% identity (82.5% similar) in 732 aa overlap (20-718:11-706) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKH-NMK :.: .: .::. ::.::. ::::: .:.:. . : ... CCDS73 MAESRGRLYLWMCLAA-ALAS--FLMGFMVGWFIKPLKETTTSVRYHQSIR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 -AFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLS ...:.::::::.:: .::..:::::::::: :::.::.:::.:::::..:.::::::: CCDS73 WKLVSEMKAENIKSFLRSFTKLPHLAGTEQNFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVN :::.:. :::::..: .:::.:: .:::: :::::..::::..::: :::::::::::: CCDS73 YPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPPDGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 YARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPG ::::::::::::.: :::.::::::::::.:::::::::.:::: :.:::::::::::: CCDS73 YARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKIFRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIG :. :: :::::: ..::::.::::::::::::::::.::..: . :.::.: ::::::: CCDS73 VQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPLTPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNV : ::. :: .::.::... :..:::::: CCDS73 YNDAEILL---------------------------------RKVRMHVYNINKITRIYNV 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 IGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILF .::.::.:::::::::::::::::::.::: ::.::..::.:::: : ..::::::::.: CCDS73 VGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDPTSGVAVLQEIARSFGKLMSKGWRPRRTIIF 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLT :::::::::::::::::::: ..::::..::::.:::::::::::::::::.:.::..:: CCDS73 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSIAYINSDSSIEGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLT 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 KELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYT ::. :::.:::.::::::: .:.:::: ...:::.:::::.:::..:::::::::::::: CCDS73 KEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENKNLPRINKLGSGSDFEAYFQRLGIASGRARYT 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 KNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCR :: .:.:.:.::.::..:::.::::::::: :: .:.:::.::..:.::..: ..::. . CCDS73 KNKKTDKYSSYPVYHTIYETFELVEKFYDPTFKKQLSVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQ 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 DYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS-- ::: .:..:: .::..: :: :.. ..:::::::::::::.: :: : .:: . : . CCDS73 DYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDHGVSFDSLFSAVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNP 560 570 580 590 600 610 660 670 680 pF1KE4 -----------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESK .:.:.:::::::::::::::::::.::::.: CCDS73 IAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKLFYRHIIFAPSSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENK 620 630 640 650 660 670 690 700 710 pF1KE4 VDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA .. :: :::..: .::::.:::: ::.:: CCDS73 ANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGTLKEVL 680 690 700 >>CCDS31604.1 NAALADL1 gene_id:10004|Hs108|chr11 (740 aa) initn: 952 init1: 535 opt: 1506 Z-score: 1626.1 bits: 311.5 E(32554): 3e-84 Smith-Waterman score: 1556; 36.4% identity (66.7% similar) in 751 aa overlap (19-719:2-738) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFL-LGFLFGWFIKSSNEATNITPK---- .: . .: :... .: ::...: : . .:....:. CCDS31 MQWTKVLGLGLGAAALLGLGIILGHFAIPK-KANSLAPQDLDL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 HNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWK--EFGLDSVELAHY . ... . .: :. :.. : .... ::::.. .. .:.. . ..:: : ::::.: . : CCDS31 EILETVMGQLDAHRIRENLRELSREPHLASSPRDEDLVQLLLQRWKDPESGLDSAEASTY 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGD .::::.:.. .:: ..:.. :. : . : : .. :.: :..:..:.: :.: CCDS31 EVLLSFPSQEQPNVVDIVGPTGGIIHSCHRTEENVTGEQGGPDVVQPYAAYAPSGTPQGL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPAD :::.: . ::: .:. . :. : :...::: : :: :. :: :. ::..:.:::: CCDS31 LVYANRGAEEDFKELQTQ-GIKLEGTIALTRYGGVGRGAKAVNAAKHGVAGVLVYTDPAD 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE4 YFAPGVKS----YPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGL . :..: .:..: :: .::.::. . :::::: :: ..: .:.. :. CCDS31 -INDGLSSPDETFPNSWYLPPSGVERGSYYEY--FGDPLTPYLPAVPSSFRVDLANVSGF 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFT--GNF-STQKVKMHI : ::..:::. ::. :: ...:. : ..:.:.: : .:::: :.: . ..:.. . CCDS31 PPIPTQPIGFQDARDLLCNLNGTLAP-ATWQGALGCHYRLGPGFRPDGDFPADSQVNVSV 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 HSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLK .. :. ::.: .::::::::::. :.:::::: :..::.::.::. :. : .::: CCDS31 YNRLELRNSSNVLGIIRGAVEPDRYVLYGNHRDSWVHGAVDPSSGTAVLLELSRVLGTLL 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 KEG-WRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVD :.: :::::.:.:::: ::::::.::::..:: :::: :::::.: :. .: ::::. CCDS31 KKGTWRPRRSIVFASWGAEEFGLIGSTEFTEEFFNKLQERTVAYINVDISVFANATLRVQ 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 CTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTK--KSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEV :: . :.: . :::..:: : :.:..: . . :: .. .: ...::.:.:. CCDS31 GTPPVQSVVFSATKEIRSPGPG--DLSIYDNWIRYFNRSSPVYGLVPSLGSLGAGSDYAP 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 FFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGM : . :::.: :: . .. :: ::....:.. :.:: :: :. : .::.. :.. CCDS31 FVHFLGISSMDIAYTYDRSKTSARIYPTYHTAFDTFDYVDKFLDPGFSSHQAVARTAGSV 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 VFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIA ...:..:. ::. ::. .::.. . . .. .. .:.:. : .::..: : CCDS31 ILRLSDSFFLPLKVSDYSETLRSF---LQAAQQDLGALLEQHSISLGPLVTAVEKFEAEA 580 590 600 610 620 630 650 660 670 pF1KE4 SKFSERLQDFDKSK---------------------------------HVIYAPSSHNKYA . ...:.. ..:.. ::..:: . . CCDS31 AALGQRISTLQKGSPDPLQVRMLNDQLMLLERTFLNPRAFPEERYYSHVLWAPRTGSVV- 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 pF1KE4 GESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA .:::. .: .. .. :.::.::.::. ... ....:: :: :: CCDS31 --TFPGLSNACSRARDTASGSEAWAEVQRQLSIVVTALEGAAATLRPVADL 700 710 720 730 740 >>CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7 (801 aa) initn: 669 init1: 352 opt: 596 Z-score: 642.3 bits: 129.6 E(32554): 1.9e-29 Smith-Waterman score: 880; 28.3% identity (60.5% similar) in 661 aa overlap (11-650:75-692) 10 20 30 pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFL-F :.: : .: ::.. : ::::.. : CCDS34 AETLAHFCPMELRGPEPLGSRPRQPNLIPWAAAGRRAAPYLVLTALLIFTGAFLLGYVAF 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KE4 -------GWFIKSSNEATNITPK---HNMKAFLDELKAE--------NIKKFLYNFTQIP : . .: .: : :. . . ..:.: .. . . . CCDS34 RGSCQACGDSVLVVSEDVNYEPDLDFHQGRLYWSDLQAMFLQFLGEGRLEDTIRQTSLRE 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 HLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNT ..::. :...:.. .. :: : . : :..:. .::: . ..: :. . CCDS34 RVAGSAGMAALTQDIRAALSRQKLDHVWTDTHYVGLQFPDPAHPNTLHWVDEAGKVGEQL 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 SLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIV : .: :. :.::. : :.:::..:.: ::. : : .. :... CCDS34 PLEDP---------DVYCPYSAI---GNVTGELVYAHYGRPEDLQDL-RARGVDPVGRLL 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 IARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNL ..: : . ..:: ::: ::.::..: .:::. .. : .: . . :.. .: CCDS34 LVRVGVISFAQKVTNAQDFGAQGVLIYPEPADF-----SQDPPKPSLSSQQAVYGHV-HL 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 NGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRG :.::: :::.:. . . .: . ::::::..::. :..::.:. : . :. :.: CCDS34 -GTGDPYTPGFPSFNQTQFPPVASS-GLPSIPAQPISADIASRLLRKLKGPVAPQE-WQG 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 SL-KVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDS :: ::..::: .... ... : : :..: ..: :::.::..:..::. CCDS34 SLLGSPYHLGPG-------PRLRLVVNNHRTSTPINNIFGCIEGRSEPDHYVVIGAQRDA 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 WVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSR : :. :.:.. :.::.:... ..:.::::..:: :::. .:: .::::: : CCDS34 WGPGAAKSAVGTAILLELVRTFSSMVSNGFRPRRSLLFISWDGGDFGSVGSTEWLEGYLS 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 LLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKK .:. ..:.:.. :... :. ... .::. ::.... :.. ::... :..:::. . CCDS34 VLHLKAVVYVSLDNAVLGDDKFHAKTSPLLTSLIESVLKQVDSPNHS--GQTLYEQVVFT 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 SPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYE .:: . . . .:. .: .: .:. . . . .. .. ::. :. .::: CCDS34 NPSWDAEVIRPLPMDSSAYSFTAF---VGVPAVEFSFMEDDQA-----YPFLHTKEDTYE 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 pF1KE4 LVEKFYDPMFK-YHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHP ..: . . .:::. : ....:... .::.: :. :. .. .. .: CCDS34 NLHKVLQGRLPAVAQAVAQLAGQLLIRLSHDRLLPLDFGRYGDVVLRHIGNLNEFS---- 610 620 630 640 650 660 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 QEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYD ..:. ..... ..:: .. . : :. ... CCDS34 GDLKARGLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRQEIYSSEERDERLTRMYNVRIMRVEFYFLSQY 670 680 690 700 710 720 680 690 700 710 pF1KE4 ALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA CCDS34 VSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSNSSGTPGATSSTGFQESRFRRQLALLTW 730 740 750 760 770 780 >>CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3 (679 aa) initn: 568 init1: 180 opt: 427 Z-score: 460.7 bits: 95.7 E(32554): 2.4e-19 Smith-Waterman score: 705; 26.6% identity (60.3% similar) in 610 aa overlap (55-660:47-589) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 ALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLA :.... :: . :.: . . .:. : CCDS82 CERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREA 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 GTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLF :.... .:: ...:..:: :..: .. : .. .... : . :....: .. : CCDS82 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVY---LV 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 EPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIAR : : :: :.: . : ::..:.. .:: .:. .:.:::.: CCDS82 ENPG-GY----------VAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDF----EDLYTPVNGSIVIVR 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 YGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGA ::. ..:: ::. .: ::..: : . . : :.. .: : .... :. CCDS82 AGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKF--PIVNA-----ELSFFG--HAHL----GT 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLK ::: :::.:. ... . ... :::.:::. :. :.::. .: :. : : :. . CCDS82 GDPYTPGFPSFNHT-QFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSD--WKTDST 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 VPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFG . .. ...::. . .. . .: :..:...: ::::.::..:..::.: : CCDS82 CRMVTSE-------SKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPG 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 GIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLK-KEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQ . :.:.. .... :. . :.:..: :.:.::::.: .:: .:.::: : :. CCDS82 AAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLH 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 ERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYE--SWTKKS .. .::: :... :. ...:. .::.:.:... ...: : :. ::. .:..: CCDS82 LKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHP---VTGQFLYQDSNWASK- 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 PSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETY-E . :: : :. :: . . .. . :: ....:: : CCDS82 ----------VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCED------TDYPYLGTTMDTYKE 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 LVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQ :.:.. . . : ..:.: : .:..:.... : .: . : : ... . .. CCDS82 LIERIPE-LNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLN----QYRA 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KE4 EMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDA ..: ...:.. :.:: .: . .:... . . .:. . . CCDS82 DIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYV 550 560 570 580 590 600 690 700 710 pF1KE4 LFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA CCDS82 SPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALS 610 620 630 640 650 660 719 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 15:16:53 2016 done: Mon Nov 7 15:16:54 2016 Total Scan time: 3.860 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]