Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5786
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5786, 729 aa
1>>>pF1KB5786 729 - 729 aa - 729 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5953+/-0.00134; mu= -6.3883+/- 0.077
mean_var=292.6988+/-66.001, 0's: 0 Z-trim(107.8): 716 B-trim: 135 in 1/50
Lambda= 0.074966
statistics sampled from 8977 (9775) to 8977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 4.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 4762 529.7 5.9e-150
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 4007 448.1 2.3e-125
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 3997 447.0 4.8e-125
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 2805 318.1 3e-86
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 2791 316.6 8.6e-86
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 2709 307.7 3.9e-83
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 2709 307.7 4.2e-83
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 2574 293.1 1.1e-78
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 2574 293.1 1.1e-78
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 2569 292.6 1.6e-78
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 2453 280.0 8.6e-75
CCDS45167.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 659) 2314 265.0 2.7e-70
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 2272 260.4 6.7e-69
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 2265 259.7 1.2e-68
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 2201 252.8 1.4e-66
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 1879 218.0 4.4e-56
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 1265 151.7 6.7e-36
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 1226 147.5 1.2e-34
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 1206 145.2 4.2e-34
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1168 141.1 6.4e-33
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1168 141.1 6.4e-33
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 949 117.4 8.5e-26
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 919 114.1 7.2e-25
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 919 114.1 7.2e-25
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 919 114.1 7.7e-25
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 902 112.2 2.2e-24
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 893 111.2 4.4e-24
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 893 111.3 5.6e-24
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 886 110.5 8.4e-24
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 864 108.1 4.4e-23
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 855 107.0 6.2e-23
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 857 107.4 8.3e-23
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 849 106.5 1.3e-22
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 839 105.4 2.7e-22
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 785 99.6 1.5e-20
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 740 94.8 5.1e-19
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 716 92.1 2.7e-18
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 644 84.1 3.1e-16
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 645 84.3 3.7e-16
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 630 82.7 1.1e-15
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 633 83.1 1.3e-15
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 631 82.9 1.5e-15
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 600 79.3 8.6e-15
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 600 79.3 9e-15
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 600 79.4 9.4e-15
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 601 79.5 9.5e-15
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 601 79.5 9.7e-15
CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19 ( 273) 594 78.7 1.3e-14
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 605 80.2 1.6e-14
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 591 78.5 2.7e-14
>>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (729 aa)
initn: 4762 init1: 4762 opt: 4762 Z-score: 2805.7 bits: 529.7 E(32554): 5.9e-150
Smith-Waterman score: 4762; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 STNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 STNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 ANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIA
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SKIANELKL
:::::::::
CCDS41 SKIANELKL
>>CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (753 aa)
initn: 4748 init1: 3995 opt: 4007 Z-score: 2364.2 bits: 448.1 E(32554): 2.3e-125
Smith-Waterman score: 4704; 96.8% identity (96.8% similar) in 753 aa overlap (1-729:1-753)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB5 STNLFSKLTSKLTR------------------------SRNVSAEQKDENKEAKPRSLRF
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS45 STNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRF
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 TWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKL
670 680 690 700 710 720
700 710 720
pF1KB5 PRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
730 740 750
>>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (744 aa)
initn: 4748 init1: 3995 opt: 3997 Z-score: 2358.4 bits: 447.0 E(32554): 4.8e-125
Smith-Waterman score: 4722; 98.0% identity (98.0% similar) in 744 aa overlap (1-729:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
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CCDS45 STNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSS
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650 660 670 680 690 700
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGVR
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710 720
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CCDS45 FKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
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CCDS80 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS
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::::::: :::::.. :. ..: : :::.::.::.. :: ::::::::.. ::::.
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::.::::::. .: :..:...:.. .:: :.::.:..: .::::. :
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::::.. .::.:.. : . .: . ::.. . : :::::. :: : ::.
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:::: .:.:::.. .::: ::::..::::::. : :.... :. ::::: .:
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::::::::::::::::::.:..::::::::::::.:. : .:...:.:.:: :..::
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CCDS80 WEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL
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CCDS53 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKL
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CCDS53 FEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRD
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CCDS53 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS
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pF1KB5 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTL
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CCDS53 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTL
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CCDS53 EQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVM
300 310 320 330 340 350
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::::::: :::::.. :. ..: : :::.::.::.. :: ::::::::.. ::::.
CCDS53 ATYLLLGYKSSELEG-DT-----ITL-KPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRF
360 370 380 390 400
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::.: :::::. .: :..:...:.. .:: :.::.:..: .::::. :
CCDS53 SDQAAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAK-----VPASPLPGL--
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::::.. .::.:.. : . .: . ::.. . : :::::. :: : ::
CCDS53 --------ERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQAS-IQNGKD-STAP-QR
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.:::: .:.:::.. .::: ::::..::::::. : :.... :. ::::: .:
CCDS53 VPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPS-GH
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:: : .: ..:::.:::..: ::.: ..:.: .::::::
CCDS53 -----SQGRRGASGSIFSKFTSKFVR-RNLSFRFARRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRS
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:::::::::::::.:..::::::::::::.:. : .:...:.:.:: :..:::::::
CCDS53 LRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEV
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pF1KB5 CKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS53 CKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL
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CCDS12 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
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CCDS12 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
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:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
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240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS12 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
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pF1KB5 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS12 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
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360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
CCDS12 TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
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pF1KB5 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
.:::.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::
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420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::.
CCDS12 VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSS-
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:.: :: : : : : .: :. ::.. :::::: : :.::.. . :::::
CCDS12 GTPRVPPASPSS-HSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPA
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 SPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVS-AEQKDENKEAKPRSLRFTWSMK
::.:.:::.:: : : .::::.:::::::: ... ..... :. .. :: ...
CCDS12 SPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIR
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pF1KB5 TTSSM-DPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLS
. ... . ::. ..
CCDS12 SQTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
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pF1KB5 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQ--EVTSRTSRS-GARCRNSIASCADEQPHIGNYR
::.:: : :.:....: . :.::. . : .::: ::::::::::: .::::.::::
CCDS56 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
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pF1KB5 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS56 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 LFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHR
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CCDS56 LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
130 140 150 160 170 180
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pF1KB5 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS56 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS56 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
250 260 270 280 290 300
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pF1KB5 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS56 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
CCDS56 TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
370 380 390 400 410
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pF1KB5 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
.:::.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::
CCDS56 RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
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CCDS56 VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
480 490 500 510 520 530
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pF1KB5 PDQRTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPAS
. :.. :.::.. . .: :. ::.. :::::: : :.::.. . ::::::
CCDS56 TPRVPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 PSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKD-----------ENKEAKPR
:.:.:::.:: : : .::::.:::::::: :. .. :. ::
CCDS56 PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPR
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 SLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGD-GHAENLVQWEM
::: ::.: ::: : .: .:.. : : .: . ::: :.:: : : : ..:.
CCDS56 LLRFPWSVKLTSSRPPEALMAALRQATAAARCRCRQPQPFLLACLHGGAGGPEPLSHFEV
660 670 680 690 700 710
700 710 720
pF1KB5 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
:::.::: .: :: :.:..::..::......:.:.:.:
CCDS56 EVCQLPRPGLRGVLFRRVAGTALAFRTLVTRISNDLEL
720 730 740 750
>>CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (780 aa)
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:::.::::::.:: .:.: :: :.....:. :: : .:: ....::.:. :::..
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: ::::::::.::.:. ::: :.::::::: :::: ::. ..::::..:
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pF1KB5 -----------------------------------------TIPD----------QRTPV
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:: .::::.: :::: :::::..::::::: : ::::...:::::::: :::. ...
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::
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pF1KB5 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
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CCDS73 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
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pF1KB5 VKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIV
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CCDS73 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
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pF1KB5 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKR
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CCDS73 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
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pF1KB5 GTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYD
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CCDS73 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
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CCDS73 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLC-QRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQK
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 QRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKE--DGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPML
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CCDS73 QRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLV
420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 GNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGG-MTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENS--
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CCDS73 G----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERTT-DRYVALQNGKDSSLT
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pF1KB5 -----------------------------------------TIPD-----------QRTP
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CCDS73 EMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGSTTQRVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]