Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1333
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1333, 597 aa
  1>>>pF1KE1333 597 - 597 aa - 597 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9401+/-0.000845; mu= 16.0587+/- 0.051
 mean_var=96.3909+/-19.050, 0's: 0 Z-trim(109.6): 84  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.130634
 statistics sampled from 10885 (10973) to 10885 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1            ( 597) 4303 821.6       0
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1           ( 569)  776 156.9 6.5e-38
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1            (2039)  758 153.9 1.8e-36
CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1            (2489)  758 154.0 2.1e-36
CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1           ( 377)  638 130.8 3.2e-30
CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 384)  638 130.8 3.2e-30
CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 349)  632 129.6 6.6e-30
CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1           ( 362)  632 129.6 6.8e-30
CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 369)  632 129.6 6.9e-30
CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 392)  623 127.9 2.3e-29
CCDS1482.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 399)  623 127.9 2.4e-29
CCDS1484.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1            ( 355)  615 126.4 6.1e-29
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1             (1033)  550 114.5 6.9e-25
CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1           ( 381)  541 112.5   1e-24
CCDS44307.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1           ( 440)  541 112.5 1.1e-24
CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1           ( 444)  541 112.5 1.2e-24
CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1            ( 830)  541 112.7 1.9e-24
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1            (1092)  533 111.3 6.6e-24
CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1            ( 661)  462 97.8 4.8e-20
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1            ( 610)  434 92.5 1.7e-18
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17           ( 345)  428 91.1 2.4e-18
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3538)  422 90.8 3.3e-17
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3667)  422 90.8 3.3e-17
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3707)  422 90.8 3.4e-17
CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1            ( 449)  339 74.5 3.4e-13
CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1             (1231)  337 74.4 9.5e-13
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  323 72.1 1.4e-11
CCDS41471.1 SUSD4 gene_id:55061|Hs108|chr1         ( 490)  310 69.0 1.6e-11


>>CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1                 (597 aa)
 initn: 4303 init1: 4303 opt: 4303  Z-score: 4386.3  bits: 821.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4303; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 NGQVEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGQVEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 IRNGRHSGEENFYAYGFSVTYSCDPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKITCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IRNGRHSGEENFYAYGFSVTYSCDPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKITCR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 NLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 EALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRFSAICQGDGTWSPRTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRFSAICQGDGTWSPRTP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 SCGDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEIIYECDKGYILVGQAKLSCSYSHWSAPAPQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCGDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEIIYECDKGYILVGQAKLSCSYSHWSAPAPQC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 KALCRKPELVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KALCRKPELVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       
pF1KE1 ETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL
              550       560       570       580       590       

>>CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1                (569 aa)
 initn: 479 init1: 231 opt: 776  Z-score: 794.1  bits: 156.9 E(32554): 6.5e-38
Smith-Waterman score: 829; 28.9% identity (52.3% similar) in 574 aa overlap (21-553:3-557)

               10        20        30        40           50       
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAAL---LPAVLGNCGPPPTLS
                           :  :: .      :   :.:::   : .   .:. :  : 
CCDS44                   MAPPVRLERPFPSRRFPGLLLAALVLLLSSFSDQCNVPEWLP
                                 10        20        30        40  

        60        70        80        90       100        110      
pF1KE1 FAAPMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVY-NTFCIYKRCRHP
       :: : ..:  . .:  :: :.: : :::  :    .. : ... :.  .  :  : ::.:
CCDS44 FARPTNLT-DDFEFPIGTYLNYECRPGY--SGRPFSIICLKNSVWTSAKDKCKRKSCRNP
             50         60          70        80        90         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE1 GELRNGQVEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK
        .  ::....  :..: :::..:: .:. ::::... : ..   : :..  : :. . : 
CCDS44 PDPVNGMAHVIKDIQFRSQIKYSCPKGYRLIGSSSATCIISGNTVIWDNKTPVCDRIICG
     100       110       120       130       140       150         

        180        190       200             210       220         
pF1KE1 PPPDIRNGRHSG-EENFYAYGFSVTYSCD--PR----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP
        :: : ::  ..  .... ::  ::: :.   :    : :.:. :: :: ... .:.:  
CCDS44 LPPTIANGDFTSISREYFHYGSVVTYHCNLGSRGKKVFELVGEPSIYCTSKDDQVGIWSG
     160       170       180       190       200       210         

     230        240       250       260       270       280        
pF1KE1 SPPTCE-KITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWN
         : :     :  :.: .: .::    ... .... :.:: :: ..: : ..:.: .::.
CCDS44 PAPQCIIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFGMKGPSHVKCQALNKWE
     220       230       240       250       260       270         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE1 PSPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVIC
       :  :.:    :   ::. ::  :   :   .: .  :  . : :.:::       : . :
CCDS44 PELPSCS-RVCQPPPDVLHA--ERTQRD--KDNFSPGQEVFYSCEPGYD--LRGSTYLHC
     280        290         300         310       320         330  

      350        360         370       380       390       400     
pF1KE1 QKNLRWTPYQG-CEALCCPE--PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE----
         .  :.:    ::.  : .   .: ::..       : :  .   : ...: : :    
CCDS44 TPQGDWSPAAPRCEVKSCDDFLGQLPNGHVL-----FPLNLQL---GAKVDFVCDEGFQL
            340       350       360            370          380    

                410       420        430       440       450       
pF1KE1 ---TSRFSAICQGDGTWSPRTPSCG-DICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEIIYECDKG
          .. . ..   .. :.  .: :    :. ::  ..:  .  ..      .: : :  :
CCDS44 KGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCERKSCETPPVPVNGMVHVITDIHV-GSRINYSCTTG
          390       400       410       420       430        440   

       460       470           480         490        500       510
pF1KE1 YILVGQAKLSCSYS----HWSAPAPQCKAL-C-RKPELVNGRLS-VDKDQYVEPENVTIQ
       . :.:...  :  :    :::   : :. . :   : ..::: . .   .    ..:.  
CCDS44 HRLIGHSSAECILSGNTAHWSMKPPICQQIFCPNPPAILNGRHTGTPLGDIPYGKEVSYT
           450       460       470       480       490       500   

                    520           530       540       550          
pF1KE1 CDSG------YGVVGPQSITCS----GNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVL-TGKRLMQCL
       ::        ....: ..:  .    :: .:   .:.::  .  : ...: .::      
CCDS44 CDPHPDRGMTFNLIGESTIRRTSEPHGNGVWSSPAPRCELPVGAGSHDALIVGKFYEVFA
           510       520       530       540       550       560   

     560       570       580       590       
pF1KE1 PNPEDVKMALEVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL
                                             
CCDS44 EEFCHL                                
                                             

>>CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1                 (2039 aa)
 initn: 756 init1: 253 opt: 758  Z-score: 768.1  bits: 153.9 E(32554): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 882; 30.3% identity (54.9% similar) in 532 aa overlap (43-539:36-550)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK
                                     ::.. :.:. :  : :: : ..:  : .: 
CCDS44 PRSPEPVGPPAPGLPFCCGGSLLAVVVLLALPVAWGQCNAPEWLPFARPTNLT-DEFEFP
          10        20        30        40        50         60    

             80        90       100        110       120       130 
pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLS
        :: :.: : :::  :    .. : ... :.  .  :  : ::.: .  ::.:..   ..
CCDS44 IGTYLNYECRPGY--SGRPFSIICLKNSVWTGAKDRCRRKSCRNPPDPVNGMVHVIKGIQ
           70          80        90       100       110       120  

             140       150       160       170       180           
pF1KE1 FGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGE
       :::::..::..:. ::::... : ..   : :..  : :. . :  :: : ::    ...
CCDS44 FGSQIKYSCTKGYRLIGSSSATCIISGDTVIWDNETPICDRIPCGLPPTITNGDFISTNR
            130       140       150       160       170       180  

     190       200             210       220       230        240  
pF1KE1 ENFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKP
       :::. ::  ::: :.:       : :.:. :: :: ... .:.:    : :     :  :
CCDS44 ENFH-YGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPP
             190       200       210       220       230       240 

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINL
       .: .: .::    ... .... :.:: :::..:   ..:.: .::.:  :.:    :   
CCDS44 NVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPP
             250       260       270       280       290        300

            310       320       330       340       350        360 
pF1KE1 PDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CE
       ::. ::  :   :   .: .  :  . : :.:::       ... :  .  :.:    ::
CCDS44 PDVLHA--ERTQR--DKDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCE
                310         320       330         340       350    

             370       380       390       400              410    
pF1KE1 ALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE-------TSRFSAICQGDGT
       .  : .     :.. . :   :.:  .   : ...: : :       .. . ..   .. 
CCDS44 VKSCDDF---MGQLLNGRVLFPVNLQL---GAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESL
          360          370          380       390       400        

          420        430       440        450             460      
pF1KE1 WSPRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKL
       :.  .: : .: :  :: : .:..  .    : : . . : ::    .:  . :.:.. .
CCDS44 WNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTI
      410       420       430       440       450       460        

        470            480          490       500       510        
pF1KE1 SCSYSH-----WSAPAPQCKAL--CRKPE-LVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVV
        :. .      ::.:::.:  :  :. :. .. ..:... .    : ..... .      
CCDS44 RCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYY
      470       480       490       500       510       520        

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE1 G-PQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLE
       : : ::::  : .:      :.                                      
CCDS44 GRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLI
      530       540       550       560       570       580        

>--
 initn: 756 init1: 253 opt: 811  Z-score: 822.1  bits: 163.9 E(32554): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 875; 30.8% identity (55.8% similar) in 520 aa overlap (48-531:1394-1897)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE1 AAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGTTL
                                     :.:  :  . ::.:  : ... .: .::.:
CCDS44 GESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPT-IPINDFEFPVGTSL
          1370      1380      1390      1400       1410      1420  

        80        90       100        110       120       130      
pF1KE1 KYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQI
       .: : :::    .  ...:  .  :   .  :  : :  : :  ::.:.:.:: .::: .
CCDS44 NYECRPGYF--GKMFSISCLENLVWSSVEDNCRRKSCGPPPEPFNGMVHINTDTQFGSTV
           1430        1440      1450      1460      1470      1480

        140       150       160       170       180        190     
pF1KE1 EFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGR-HSGEENFYAY
       ..::.::: :::: .. : :.  .: :..  : :::..:.::: : ::  .:.... .  
CCDS44 NYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFYSNNRTSFHN
             1490      1500      1510      1520      1530      1540

         200             210       220       230        240        
pF1KE1 GFSVTYSC------DPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKPDVSHGE
       :  :::.:      .  : :.:. :: :: ... .:::   :: : . . :  :.: .. 
CCDS44 GTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRCISTNKCTAPEVENAI
             1550      1560      1570      1580      1590      1600

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE1 MVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHA
        : :   ...  . : :.:: :::. :: ...:.....:.:. : :    :   :.: :.
CCDS44 RVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPHCS-RVCQPPPEILHG
             1610      1620      1630      1640       1650         

      310       320       330       340       350        360       
pF1KE1 SWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEALCCPE
               ...: .  :  . : :.:.:       ... :  .  :.:    : .  : .
CCDS44 EHTL----SHQDNFSPGQEVFYSCEPSYD--LRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDD
    1660          1670      1680        1690      1700      1710   

       370       380       390       400           410          420
pF1KE1 PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF----SAICQGDGT---WSPRTP
            :.. . :   : :  .   : ..:: : :  :.    .. :   :    :.  .:
CCDS44 FL---GQLPHGRVLLPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGRSASHCVLAGMKALWNSSVP
             1720      1730         1740      1750      1760       

               430       440        450             460       470  
pF1KE1 SCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSCSYSH
        : .: :  :: : .:..  .   .. . .:: : ::    .:  . :.:.... :. . 
CCDS44 VCEQIFCPNPPAILNGRHTGTPFGDIPYGKEISYACDTHPDRGMTFNLIGESSIRCTSDP
      1770      1780      1790      1800      1810      1820       

                 480            490        500       510       520 
pF1KE1 -----WSAPAPQCK----ALC-RKPELVNGR-LSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQ
            ::.:::.:.    : : . :.. ::. ..   . :.   ...  :: :: .::  
CCDS44 QGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLYLPGMTISYICDPGYLLVGKG
      1830      1840      1850      1860      1870      1880       

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE1 SITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQL
        : :. .  :                                                  
CCDS44 FIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKVYHYGDYVTLKCEDGYTLEGS
      1890      1900      1910      1920      1930      1940       

>--
 initn: 515 init1: 208 opt: 598  Z-score: 605.1  bits: 123.8 E(32554): 2.2e-27
Smith-Waterman score: 749; 26.5% identity (53.7% similar) in 547 aa overlap (43-550:740-1262)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK
                                     ::.    : ::: .  :   .    .  :.
CCDS44 EVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ--RDKDNFS
     710       720       730       740       750       760         

             80        90       100        110        120       130
pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNT-FCIYKRCRH-PGELRNGQVEIKTDL
        :  . :.: :::   ... .. :. .:.:   .  :  : :    :.: ::.: . ..:
CCDS44 PGQEVFYSCEPGY-DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRVLFPVNL
       770       780        790       800       810       820      

              140       150       160       170       180       190
pF1KE1 SFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRHSGEE
       ..:....: :.::: : ::..: : .      :.  .: :: . :  :: : ::::.:. 
CCDS44 QLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKP
        830       840       850       860       870       880      

               200             210       220       230        240  
pF1KE1 -NFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKP
        . . .: .:.:.:::.      :.:.:...: :: . .  :::    : :  .  :. :
CCDS44 LEVFPFGKAVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAP
        890       900       910       920       930       940      

            250       260            270       280       290       
pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKD-----TIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPN
       :  :  . . .    : .:     .. ..:.  .  :  : : :  .  :.    .:. .
CCDS44 D--H-FLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYYGRPFS-ITCLDNLVWSSPKDVCKRK
           950       960       970       980        990      1000  

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 SCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNL-RWTP
       :: . ::  ..  ..       :. : :. . : :  :..      .  : . :  .:. 
CCDS44 SCKTPPDPVNGMVHVIT-----DIQV-GSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWST
           1010           1020       1030      1040      1050      

         360        370        380       390       400             
pF1KE1 YQG-CEALCCP-EPKLNNGE-ITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSR----F----
           :. . :   : . ::. :. .:..       . ::. ... :.  ::    :    
CCDS44 KPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN-------FHYGSVVTYRCNLGSRGRKVFELVG
       1060      1070      1080             1090      1100         

           410           420         430       440       450       
pF1KE1 --SAICQGD----GTWSPRTPSC--GDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEII-YECDK
         :  : ..    : ::  .:.:   . :. ::.. .:   ...   :  .:.. ..:. 
CCDS44 EPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCT-PPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQP
    1110      1120      1130       1140      1150      1160        

        460        470       480        490        500       510   
pF1KE1 GYILVGQAKLSC-SYSHWSAPAPQCKALCRKP-ELVNGRLSVD-KDQYVEPENVTIQCDS
       :... :  ...: . ..:    :.:. .:. : :...:. . . .:..   ..:  .:. 
CCDS44 GFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPEILHGEHTPSHQDNFSPGQEVFYSCEP
     1170      1180      1190      1200      1210      1220        

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE1 GYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYK
       :: . :  :. :. .  : ::.:.:  ..   :.. :                       
CCDS44 GYDLRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCAVKS---CDDFLGQLPHGRVLFPLNLQLGAKVSFV
     1230      1240      1250         1260      1270      1280     

           580       590                                           
pF1KE1 LSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL                                    
                                                                   
CCDS44 CDEGFRLKGSSVSHCVLVGMRSLWNNSVPVCEHIFCPNPPAILNGRHTGTPSGDIPYGKE
        1290      1300      1310      1320      1330      1340     

>--
 initn: 338 init1: 187 opt: 462  Z-score: 466.6  bits: 98.1 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 462; 35.6% identity (62.8% similar) in 188 aa overlap (111-289:552-738)

               90       100       110       120       130       140
pF1KE1 CLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQIEFSC
                                     : :. : .  ::.:.. ::.. ::.:..::
CCDS44 ECRPEYYGRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSC
             530       540       550       560       570       580 

              150       160       170       180         190        
pF1KE1 SEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEENFYAYGFS
       . :  ::: ....: ..  .. ::   : :. . :  :: : ::    ...:::. ::  
CCDS44 TTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNRENFH-YGSV
             590       600       610       620       630        640

      200             210       220       230        240       250 
pF1KE1 VTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDVSHGEMVS
       ::: :.:       : :.:. :: :: ... .:.:    : :     :  :.: .: .::
CCDS44 VTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVS
              650       660       670       680       690       700

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE1 GFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWE
           ... .... :.:: :::..:   ..:.: .::.:                      
CCDS44 DNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ
              710       720       730       740       750       760

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE1 TYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLN
                                                                   
CCDS44 RDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRV
              770       780       790       800       810       820

>>CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1                 (2489 aa)
 initn: 950 init1: 253 opt: 758  Z-score: 766.9  bits: 154.0 E(32554): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 882; 30.3% identity (54.9% similar) in 532 aa overlap (43-539:36-550)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK
                                     ::.. :.:. :  : :: : ..:  : .: 
CCDS44 PRSPEPVGPPAPGLPFCCGGSLLAVVVLLALPVAWGQCNAPEWLPFARPTNLT-DEFEFP
          10        20        30        40        50         60    

             80        90       100        110       120       130 
pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLS
        :: :.: : :::  :    .. : ... :.  .  :  : ::.: .  ::.:..   ..
CCDS44 IGTYLNYECRPGY--SGRPFSIICLKNSVWTGAKDRCRRKSCRNPPDPVNGMVHVIKGIQ
           70          80        90       100       110       120  

             140       150       160       170       180           
pF1KE1 FGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGE
       :::::..::..:. ::::... : ..   : :..  : :. . :  :: : ::    ...
CCDS44 FGSQIKYSCTKGYRLIGSSSATCIISGDTVIWDNETPICDRIPCGLPPTITNGDFISTNR
            130       140       150       160       170       180  

     190       200             210       220       230        240  
pF1KE1 ENFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKP
       :::. ::  ::: :.:       : :.:. :: :: ... .:.:    : :     :  :
CCDS44 ENFH-YGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPP
             190       200       210       220       230       240 

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINL
       .: .: .::    ... .... :.:: :::..:   ..:.: .::.:  :.:    :   
CCDS44 NVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPP
             250       260       270       280       290        300

            310       320       330       340       350        360 
pF1KE1 PDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CE
       ::. ::  :   :   .: .  :  . : :.:::       ... :  .  :.:    ::
CCDS44 PDVLHA--ERTQR--DKDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCE
                310         320       330         340       350    

             370       380       390       400              410    
pF1KE1 ALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE-------TSRFSAICQGDGT
       .  : .     :.. . :   :.:  .   : ...: : :       .. . ..   .. 
CCDS44 VKSCDDF---MGQLLNGRVLFPVNLQL---GAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESL
          360          370          380       390       400        

          420        430       440        450             460      
pF1KE1 WSPRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKL
       :.  .: : .: :  :: : .:..  .    : : . . : ::    .:  . :.:.. .
CCDS44 WNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTI
      410       420       430       440       450       460        

        470            480          490       500       510        
pF1KE1 SCSYSH-----WSAPAPQCKAL--CRKPE-LVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVV
        :. .      ::.:::.:  :  :. :. .. ..:... .    : ..... .      
CCDS44 RCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYY
      470       480       490       500       510       520        

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE1 G-PQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLE
       : : ::::  : .:      :.                                      
CCDS44 GRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLI
      530       540       550       560       570       580        

>--
 initn: 950 init1: 253 opt: 811  Z-score: 820.9  bits: 164.0 E(32554): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 875; 30.8% identity (55.8% similar) in 520 aa overlap (48-531:1844-2347)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE1 AAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGTTL
                                     :.:  :  . ::.:  : ... .: .::.:
CCDS44 GESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPT-IPINDFEFPVGTSL
          1820      1830      1840      1850       1860      1870  

        80        90       100        110       120       130      
pF1KE1 KYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQI
       .: : :::    .  ...:  .  :   .  :  : :  : :  ::.:.:.:: .::: .
CCDS44 NYECRPGYF--GKMFSISCLENLVWSSVEDNCRRKSCGPPPEPFNGMVHINTDTQFGSTV
           1880        1890      1900      1910      1920      1930

        140       150       160       170       180        190     
pF1KE1 EFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGR-HSGEENFYAY
       ..::.::: :::: .. : :.  .: :..  : :::..:.::: : ::  .:.... .  
CCDS44 NYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFYSNNRTSFHN
             1940      1950      1960      1970      1980      1990

         200             210       220       230        240        
pF1KE1 GFSVTYSC------DPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKPDVSHGE
       :  :::.:      .  : :.:. :: :: ... .:::   :: : . . :  :.: .. 
CCDS44 GTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRCISTNKCTAPEVENAI
             2000      2010      2020      2030      2040      2050

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE1 MVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHA
        : :   ...  . : :.:: :::. :: ...:.....:.:. : :    :   :.: :.
CCDS44 RVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPHCS-RVCQPPPEILHG
             2060      2070      2080      2090       2100         

      310       320       330       340       350        360       
pF1KE1 SWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEALCCPE
               ...: .  :  . : :.:.:       ... :  .  :.:    : .  : .
CCDS44 EHTL----SHQDNFSPGQEVFYSCEPSYD--LRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDD
    2110          2120      2130        2140      2150      2160   

       370       380       390       400           410          420
pF1KE1 PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF----SAICQGDGT---WSPRTP
            :.. . :   : :  .   : ..:: : :  :.    .. :   :    :.  .:
CCDS44 FL---GQLPHGRVLLPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGRSASHCVLAGMKALWNSSVP
             2170      2180         2190      2200      2210       

               430       440        450             460       470  
pF1KE1 SCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSCSYSH
        : .: :  :: : .:..  .   .. . .:: : ::    .:  . :.:.... :. . 
CCDS44 VCEQIFCPNPPAILNGRHTGTPFGDIPYGKEISYACDTHPDRGMTFNLIGESSIRCTSDP
      2220      2230      2240      2250      2260      2270       

                 480            490        500       510       520 
pF1KE1 -----WSAPAPQCK----ALC-RKPELVNGR-LSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQ
            ::.:::.:.    : : . :.. ::. ..   . :.   ...  :: :: .::  
CCDS44 QGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLYLPGMTISYICDPGYLLVGKG
      2280      2290      2300      2310      2320      2330       

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE1 SITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQL
        : :. .  :                                                  
CCDS44 FIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKVYHYGDYVTLKCEDGYTLEGS
      2340      2350      2360      2370      2380      2390       

>--
 initn: 359 init1: 185 opt: 773  Z-score: 782.1  bits: 156.8 E(32554): 3e-37
Smith-Waterman score: 773; 31.4% identity (53.6% similar) in 472 aa overlap (46-485:1389-1842)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KE1 KMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGT
                                     .::.:  :  . ::  .    . . :  ::
CCDS44 SFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAK-LKTQTNASDFPIGT
     1360      1370      1380      1390      1400       1410       

          80         90       100        110       120       130   
pF1KE1 TLKYTCLPGYV-RSHSTQTLTCNSDGEWVY-NTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFG
       .::: : : :  :  :   .:: ..  :   .  :  : :. : .  ::.:.. ::.. :
CCDS44 SLKYECRPEYYGRPFS---ITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVG
      1420      1430         1440      1450      1460      1470    

           140       150       160       170       180         190 
pF1KE1 SQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEEN
       :.:..::. :  ::: ....: ..   . ::   : :. . :  :: : ::    ...::
CCDS44 SRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN
         1480      1490      1500      1510      1520      1530    

             200             210       220       230        240    
pF1KE1 FYAYGFSVTYSCD--PR----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDV
       :. ::  ::: :.   :    : :.:. :: :: ... .:.:    : :     :  :.:
CCDS44 FH-YGSVVTYRCNLGSRGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNV
          1540      1550      1560      1570      1580      1590   

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE1 SHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPD
        .: .::    ... .... :.:: :::..:   ..:.: .::.:  :.:    :   :.
CCDS44 ENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPPPE
          1600      1610      1620      1630      1640       1650  

          310       320       330       340       350        360   
pF1KE1 IPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEAL
       : :.       :...: .  :  . : :.:::       ... :  .  :.:    : . 
CCDS44 ILHGE----HTPSHQDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCAVK
               1660      1670      1680        1690      1700      

           370       380       390       400           410         
pF1KE1 CCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF--SAI--CQGDGT---WS
        : .     :.. . :   : :  .   : ..:: : :  :.  :..  :   :    :.
CCDS44 SCDDFL---GQLPHGRVLFPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGSSVSHCVLVGMRSLWN
       1710         1720         1730      1740      1750      1760

        420        430       440        450             460        
pF1KE1 PRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSC
         .: :  : :  :: : .:..  . : .. . .:: : ::    .:  . :.:.. . :
CCDS44 NSVPVCEHIFCPNPPAILNGRHTGTPSGDIPYGKEISYTCDPHPDRGMTFNLIGESTIRC
             1770      1780      1790      1800      1810      1820

       470           480       490       500       510       520   
pF1KE1 -SYSH----WSAPAPQCKALCRKPELVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQSI
        :  :    ::.:::.:.   :                                      
CCDS44 TSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPTIPINDFEFPVGTSLNYECRPGY
             1830      1840      1850      1860      1870      1880

>--
 initn: 709 init1: 208 opt: 591  Z-score: 596.8  bits: 122.5 E(32554): 6.4e-27
Smith-Waterman score: 750; 26.6% identity (52.5% similar) in 556 aa overlap (43-555:740-1271)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK
                                     ::.    : ::: .  :        .  :.
CCDS44 EVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAE--RTQRDKDNFS
     710       720       730       740       750         760       

             80        90       100        110        120       130
pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNT-FCIYKRCRH-PGELRNGQVEIKTDL
        :  . :.: :::   ... .. :. .:.:   .  :  : :    :.: ::.: . ..:
CCDS44 PGQEVFYSCEPGY-DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRVLFPVNL
       770       780        790       800       810       820      

              140       150       160       170       180       190
pF1KE1 SFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRHSGEE
       ..:....: :.::: : ::..: : .      :.  .: :: . :  :: : ::::.:. 
CCDS44 QLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKP
        830       840       850       860       870       880      

               200             210       220       230        240  
pF1KE1 -NFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKP
        . . .: .:.:.:::.      :.:.:...: :: . .  :::    : :  .  :. :
CCDS44 LEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAP
        890       900       910       920       930       940      

            250       260            270       280       290       
pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKD-----TIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPN
       :  :  . . .    : .:     .. ..:.  .  :  : : :  .  :.    .:. .
CCDS44 D--H-FLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYYGRPFS-ITCLDNLVWSSPKDVCKRK
           950       960       970       980        990      1000  

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 SCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNL-RWTP
       :: . ::  ..  ..       :. : :. . : :  :..      .  : . :  .:. 
CCDS44 SCKTPPDPVNGMVHVIT-----DIQV-GSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWST
           1010           1020       1030      1040      1050      

         360        370        380       390       400             
pF1KE1 YQG-CEALCCP-EPKLNNGE-ITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETS----------
           :. . :   : . ::. :. .:..       . ::. ... :.  :          
CCDS44 KPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN-------FHYGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVG
       1060      1070      1080             1090      1100         

           410           420         430       440       450       
pF1KE1 RFSAICQGD----GTWSPRTPSC--GDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEII-YECDK
       . :  : ..    : ::  .:.:   . :. ::.. .:   ...   :  .:.. ..:. 
CCDS44 EPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCT-PPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQP
    1110      1120      1130       1140      1150      1160        

        460        470       480       490         500       510   
pF1KE1 GYILVGQAKLSC-SYSHWSAPAPQCKALCRKPELV--NGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDS
       :... :  ...: . ..:    :.:. .:. :  :    : . :::..   ..:  .:. 
CCDS44 GFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEVFYSCEP
     1170      1180      1190      1200      1210      1220        

           520       530       540           550       560         
pF1KE1 GYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCE----QVLTGKRLMQCLPNPEDVKMAL
       :: . :  :. :. .  : : .: :: ..   :.    :.:.:. :              
CCDS44 GYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKS---CDDFMGQLLNGRVLFPVNLQLGAKVDFV
     1230      1240      1250         1260      1270      1280     

     570       580       590                                       
pF1KE1 EVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL                                
                                                                   
CCDS44 CDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKA
        1290      1300      1310      1320      1330      1340     

>--
 initn: 338 init1: 187 opt: 462  Z-score: 465.4  bits: 98.2 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 462; 35.6% identity (62.8% similar) in 188 aa overlap (111-289:552-738)

               90       100       110       120       130       140
pF1KE1 CLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQIEFSC
                                     : :. : .  ::.:.. ::.. ::.:..::
CCDS44 ECRPEYYGRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSC
             530       540       550       560       570       580 

              150       160       170       180         190        
pF1KE1 SEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEENFYAYGFS
       . :  ::: ....: ..  .. ::   : :. . :  :: : ::    ...:::. ::  
CCDS44 TTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNRENFH-YGSV
             590       600       610       620       630        640

      200             210       220       230        240       250 
pF1KE1 VTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDVSHGEMVS
       ::: :.:       : :.:. :: :: ... .:.:    : :     :  :.: .: .::
CCDS44 VTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVS
              650       660       670       680       690       700

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE1 GFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWE
           ... .... :.:: :::..:   ..:.: .::.:                      
CCDS44 DNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ
              710       720       730       740       750       760

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE1 TYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLN
                                                                   
CCDS44 RDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRV
              770       780       790       800       810       820

>>CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                (377 aa)
 initn: 565 init1: 261 opt: 638  Z-score: 656.1  bits: 130.8 E(32554): 3.2e-30
Smith-Waterman score: 638; 36.7% identity (55.8% similar) in 308 aa overlap (21-317:10-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS31            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80          90       100         110      
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP
          :   .  .. :  . : :  ::  .   .:.:. :. .  :  : .  :  . : . 
CCDS31 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTI-CDRNHTWLPVSDDACYRETCPYI
            50        60        70         80        90       100  

        120        130       140       150       160       170     
pF1KE1 GELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKC
        .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : :
CCDS31 RDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLC
            110       120       130       140       150       160  

         180        190       200            210       220         
pF1KE1 KPPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP
        ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  
CCDS31 TPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSR
            170       180       190       200       210            

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE1 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNP
       . : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.:
CCDS31 AAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDP
      220       230       240       250       260       270        

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE1 SPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQ
         : :   :  .    : ::  . ::::                                
CCDS31 PVPKCLKVSTSSTTKSP-ASSASGPRPTYKPPVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVI
      280       290        300       310       320       330       

>>CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                 (384 aa)
 initn: 565 init1: 261 opt: 638  Z-score: 656.0  bits: 130.8 E(32554): 3.2e-30
Smith-Waterman score: 638; 36.7% identity (55.8% similar) in 308 aa overlap (21-317:10-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS14            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80          90       100         110      
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP
          :   .  .. :  . : :  ::  .   .:.:. :. .  :  : .  :  . : . 
CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTI-CDRNHTWLPVSDDACYRETCPYI
            50        60        70         80        90       100  

        120        130       140       150       160       170     
pF1KE1 GELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKC
        .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : :
CCDS14 RDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLC
            110       120       130       140       150       160  

         180        190       200            210       220         
pF1KE1 KPPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP
        ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  
CCDS14 TPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSR
            170       180       190       200       210            

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE1 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNP
       . : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.:
CCDS14 AAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDP
      220       230       240       250       260       270        

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE1 SPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQ
         : :   :  .    : ::  . ::::                                
CCDS14 PVPKCLKVSTSSTTKSP-ASSASGPRPTYKPPVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVI
      280       290        300       310       320       330       

>>CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                 (349 aa)
 initn: 565 init1: 261 opt: 632  Z-score: 650.4  bits: 129.6 E(32554): 6.6e-30
Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS14            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80        90        100         110       
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG
          :   .  .. :  . : :  ::       : : :. .  :  : .  :  . : .  
CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR
            50        60        70        80        90       100   

       120        130       140       150       160       170      
pF1KE1 ELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK
       .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : : 
CCDS14 DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCT
           110       120       130       140       150       160   

        180        190       200            210       220       230
pF1KE1 PPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPS
       ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  .
CCDS14 PPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSRA
           170       180       190       200       210             

              240       250       260       270       280       290
pF1KE1 PPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPS
        : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: 
CCDS14 APECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPP
     220       230       240       250       260       270         

              300       310            320       330       340     
pF1KE1 PPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKE-----DVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT
        : :  .   .    : ...  ::.: .      ::.:.....                 
CCDS14 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIGKQMVELNMPLTRL
     280       290        300       310       320       330        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF
                                                                   
CCDS14 NQPLQQSREAE                                                 
      340                                                          

>>CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                (362 aa)
 initn: 565 init1: 261 opt: 632  Z-score: 650.2  bits: 129.6 E(32554): 6.8e-30
Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS31            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80        90        100         110       
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG
          :   .  .. :  . : :  ::       : : :. .  :  : .  :  . : .  
CCDS31 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR
            50        60        70        80        90       100   

       120        130       140       150       160       170      
pF1KE1 ELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK
       .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : : 
CCDS31 DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCT
           110       120       130       140       150       160   

        180        190       200            210       220       230
pF1KE1 PPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPS
       ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  .
CCDS31 PPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSRA
           170       180       190       200       210             

              240       250       260       270       280       290
pF1KE1 PPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPS
        : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: 
CCDS31 APECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPP
     220       230       240       250       260       270         

              300       310            320       330       340     
pF1KE1 PPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKE-----DVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT
        : :  .   .    : ...  ::.: .      ::.:.....                 
CCDS31 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRY
     280       290        300       310       320       330        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF
                                                                   
CCDS31 LQRRKKKGTYLTDETHREVKFTSL                                    
      340       350       360                                      

>>CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                 (369 aa)
 initn: 565 init1: 261 opt: 632  Z-score: 650.1  bits: 129.6 E(32554): 6.9e-30
Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS14            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80        90        100         110       
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG
          :   .  .. :  . : :  ::       : : :. .  :  : .  :  . : .  
CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR
            50        60        70        80        90       100   

       120        130       140       150       160       170      
pF1KE1 ELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK
       .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : : 
CCDS14 DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCT
           110       120       130       140       150       160   

        180        190       200            210       220       230
pF1KE1 PPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPS
       ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  .
CCDS14 PPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSRA
           170       180       190       200       210             

              240       250       260       270       280       290
pF1KE1 PPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPS
        : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: 
CCDS14 APECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPP
     220       230       240       250       260       270         

              300       310            320       330       340     
pF1KE1 PPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKE-----DVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT
        : :  .   .    : ...  ::.: .      ::.:.....                 
CCDS14 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRY
     280       290        300       310       320       330        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF
                                                                   
CCDS14 LQRRKKKGKADGGAEYATYQTKSTTPAEQRG                             
      340       350       360                                      

>>CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1                 (392 aa)
 initn: 481 init1: 261 opt: 623  Z-score: 640.6  bits: 127.9 E(32554): 2.3e-29
Smith-Waterman score: 626; 35.7% identity (54.3% similar) in 322 aa overlap (21-317:10-320)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA
                           ::   :.    .:  :.:   :: .    :  :::  : :
CCDS14            MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA
                          10         20           30        40     

               70        80          90       100         110      
pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP
          :   .  .. :  . : :  ::  .   .:.:. :. .  :  : .  :  . : . 
CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTI-CDRNHTWLPVSDDACYRETCPYI
            50        60        70         80        90       100  

        120        130       140       150       160       170     
pF1KE1 GELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKC
        .  ::: :  .    :: :..: :.::..:::     ::..   . ::   : :: : :
CCDS14 RDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLC
            110       120       130       140       150       160  

         180        190       200            210       220         
pF1KE1 KPPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP
        ::: :.::.:. .: . . :  .:::::::      :::.:...: :  .:   .::  
CCDS14 TPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSR
            170       180       190       200       210            

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE1 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNP
       . : :. . :: : : .:...::::  . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.:
CCDS14 AAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDP
      220       230       240       250       260       270        

     290          300                  310       320       330     
pF1KE1 SPPACE---PNSCINLPDIPH-----------ASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPG
         : :    : :  . : . :           ::  . ::::                  
CCDS14 PVPKCLKVLPPSSTKPPALSHSVSTSSTTKSPASSASGPRPTYKPPVSNYPGYPKPEEGI
      280       290       300       310       320       330        

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE1 YKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEI
                                                                   
CCDS14 LDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRYLQRRKKKGTYLTDETHREVKFTSL      
      340       350       360       370       380       390        




597 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 00:40:35 2016 done: Mon Nov  7 00:40:35 2016
 Total Scan time:  3.330 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com