FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1333, 597 aa 1>>>pF1KE1333 597 - 597 aa - 597 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9401+/-0.000845; mu= 16.0587+/- 0.051 mean_var=96.3909+/-19.050, 0's: 0 Z-trim(109.6): 84 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.130634 statistics sampled from 10885 (10973) to 10885 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 3.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 4303 821.6 0 CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 776 156.9 6.5e-38 CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 758 153.9 1.8e-36 CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489) 758 154.0 2.1e-36 CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 377) 638 130.8 3.2e-30 CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 384) 638 130.8 3.2e-30 CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 349) 632 129.6 6.6e-30 CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 362) 632 129.6 6.8e-30 CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 369) 632 129.6 6.9e-30 CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 392) 623 127.9 2.3e-29 CCDS1482.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 399) 623 127.9 2.4e-29 CCDS1484.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 355) 615 126.4 6.1e-29 CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 550 114.5 6.9e-25 CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 381) 541 112.5 1e-24 CCDS44307.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 440) 541 112.5 1.1e-24 CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 444) 541 112.5 1.2e-24 CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 ( 830) 541 112.7 1.9e-24 CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 533 111.3 6.6e-24 CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 462 97.8 4.8e-20 CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 434 92.5 1.7e-18 CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 428 91.1 2.4e-18 CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 422 90.8 3.3e-17 CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 422 90.8 3.3e-17 CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 422 90.8 3.4e-17 CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 ( 449) 339 74.5 3.4e-13 CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 337 74.4 9.5e-13 CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 323 72.1 1.4e-11 CCDS41471.1 SUSD4 gene_id:55061|Hs108|chr1 ( 490) 310 69.0 1.6e-11 >>CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 (597 aa) initn: 4303 init1: 4303 opt: 4303 Z-score: 4386.3 bits: 821.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4303; 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CCDS44 PAPQCIIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFGMKGPSHVKCQALNKWE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 PSPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVIC : :.: : ::. :: : : .: . : . : :.::: : . : CCDS44 PELPSCS-RVCQPPPDVLHA--ERTQRD--KDNFSPGQEVFYSCEPGYD--LRGSTYLHC 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 QKNLRWTPYQG-CEALCCPE--PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE---- . :.: ::. : . .: ::.. : : . : ...: : : CCDS44 TPQGDWSPAAPRCEVKSCDDFLGQLPNGHVL-----FPLNLQL---GAKVDFVCDEGFQL 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 pF1KE1 ---TSRFSAICQGDGTWSPRTPSCG-DICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEIIYECDKG .. . .. .. :. .: : :. :: ..: . .. .: : : : CCDS44 KGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCERKSCETPPVPVNGMVHVITDIHV-GSRINYSCTTG 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 YILVGQAKLSCSYS----HWSAPAPQCKAL-C-RKPELVNGRLS-VDKDQYVEPENVTIQ . :.:... : : ::: : :. . : : ..::: . . . ..:. CCDS44 HRLIGHSSAECILSGNTAHWSMKPPICQQIFCPNPPAILNGRHTGTPLGDIPYGKEVSYT 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 pF1KE1 CDSG------YGVVGPQSITCS----GNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVL-TGKRLMQCL :: ....: ..: . :: .: .:.:: . : ...: .:: CCDS44 CDPHPDRGMTFNLIGESTIRRTSEPHGNGVWSSPAPRCELPVGAGSHDALIVGKFYEVFA 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 pF1KE1 PNPEDVKMALEVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL CCDS44 EEFCHL >>CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039 aa) initn: 756 init1: 253 opt: 758 Z-score: 768.1 bits: 153.9 E(32554): 1.8e-36 Smith-Waterman score: 882; 30.3% identity (54.9% similar) in 532 aa overlap (43-539:36-550) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK ::.. :.:. : : :: : ..: : .: CCDS44 PRSPEPVGPPAPGLPFCCGGSLLAVVVLLALPVAWGQCNAPEWLPFARPTNLT-DEFEFP 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLS :: :.: : ::: : .. : ... :. . : : ::.: . ::.:.. .. CCDS44 IGTYLNYECRPGY--SGRPFSIICLKNSVWTGAKDRCRRKSCRNPPDPVNGMVHVIKGIQ 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 pF1KE1 FGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGE :::::..::..:. ::::... : .. : :.. : :. . : :: : :: ... CCDS44 FGSQIKYSCTKGYRLIGSSSATCIISGDTVIWDNETPICDRIPCGLPPTITNGDFISTNR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 ENFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKP :::. :: ::: :.: : :.:. :: :: ... .:.: : : : : CCDS44 ENFH-YGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINL .: .: .:: ... .... :.:: :::..: ..:.: .::.: :.: : CCDS44 NVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 PDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CE ::. :: : : .: . : . : :.::: ... : . :.: :: CCDS44 PDVLHA--ERTQR--DKDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCE 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE1 ALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE-------TSRFSAICQGDGT . : . :.. . : :.: . : ...: : : .. . .. .. CCDS44 VKSCDDF---MGQLLNGRVLFPVNLQL---GAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESL 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 WSPRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKL :. .: : .: : :: : .:.. . : : . . : :: .: . :.:.. . CCDS44 WNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTI 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 SCSYSH-----WSAPAPQCKAL--CRKPE-LVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVV :. . ::.:::.: : :. :. .. ..:... . : ..... . CCDS44 RCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYY 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 G-PQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLE : : :::: : .: :. CCDS44 GRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLI 530 540 550 560 570 580 >-- initn: 756 init1: 253 opt: 811 Z-score: 822.1 bits: 163.9 E(32554): 1.8e-39 Smith-Waterman score: 875; 30.8% identity (55.8% similar) in 520 aa overlap (48-531:1394-1897) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 AAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGTTL :.: : . ::.: : ... .: .::.: CCDS44 GESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPT-IPINDFEFPVGTSL 1370 1380 1390 1400 1410 1420 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 KYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQI .: : ::: . ...: . : . : : : : : ::.:.:.:: .::: . CCDS44 NYECRPGYF--GKMFSISCLENLVWSSVEDNCRRKSCGPPPEPFNGMVHINTDTQFGSTV 1430 1440 1450 1460 1470 1480 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 EFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGR-HSGEENFYAY ..::.::: :::: .. : :. .: :.. : :::..:.::: : :: .:.... . CCDS44 NYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFYSNNRTSFHN 1490 1500 1510 1520 1530 1540 200 210 220 230 240 pF1KE1 GFSVTYSC------DPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKPDVSHGE : :::.: . : :.:. :: :: ... .::: :: : . . : :.: .. CCDS44 GTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRCISTNKCTAPEVENAI 1550 1560 1570 1580 1590 1600 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 MVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHA : : ... . : :.:: :::. :: ...:.....:.:. : : : :.: :. CCDS44 RVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPHCS-RVCQPPPEILHG 1610 1620 1630 1640 1650 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEALCCPE ...: . : . : :.:.: ... : . :.: : . : . CCDS44 EHTL----SHQDNFSPGQEVFYSCEPSYD--LRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDD 1660 1670 1680 1690 1700 1710 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF----SAICQGDGT---WSPRTP :.. . : : : . : ..:: : : :. .. : : :. .: CCDS44 FL---GQLPHGRVLLPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGRSASHCVLAGMKALWNSSVP 1720 1730 1740 1750 1760 430 440 450 460 470 pF1KE1 SCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSCSYSH : .: : :: : .:.. . .. . .:: : :: .: . :.:.... :. . CCDS44 VCEQIFCPNPPAILNGRHTGTPFGDIPYGKEISYACDTHPDRGMTFNLIGESSIRCTSDP 1770 1780 1790 1800 1810 1820 480 490 500 510 520 pF1KE1 -----WSAPAPQCK----ALC-RKPELVNGR-LSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQ ::.:::.:. : : . :.. ::. .. . :. ... :: :: .:: CCDS44 QGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLYLPGMTISYICDPGYLLVGKG 1830 1840 1850 1860 1870 1880 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 SITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQL : :. . : CCDS44 FIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKVYHYGDYVTLKCEDGYTLEGS 1890 1900 1910 1920 1930 1940 >-- initn: 515 init1: 208 opt: 598 Z-score: 605.1 bits: 123.8 E(32554): 2.2e-27 Smith-Waterman score: 749; 26.5% identity (53.7% similar) in 547 aa overlap (43-550:740-1262) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK ::. : ::: . : . . :. CCDS44 EVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ--RDKDNFS 710 720 730 740 750 760 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNT-FCIYKRCRH-PGELRNGQVEIKTDL : . :.: ::: ... .. :. .:.: . : : : :.: ::.: . ..: CCDS44 PGQEVFYSCEPGY-DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRVLFPVNL 770 780 790 800 810 820 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 SFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRHSGEE ..:....: :.::: : ::..: : . :. .: :: . : :: : ::::.:. CCDS44 QLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKP 830 840 850 860 870 880 200 210 220 230 240 pF1KE1 -NFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKP . . .: .:.:.:::. :.:.:...: :: . . ::: : : . :. : CCDS44 LEVFPFGKAVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAP 890 900 910 920 930 940 250 260 270 280 290 pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKD-----TIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPN : : . . . : .: .. ..:. . : : : : . :. .:. . CCDS44 D--H-FLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYYGRPFS-ITCLDNLVWSSPKDVCKRK 950 960 970 980 990 1000 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 SCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNL-RWTP :: . :: .. .. :. : :. . : : :.. . : . : .:. CCDS44 SCKTPPDPVNGMVHVIT-----DIQV-GSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWST 1010 1020 1030 1040 1050 360 370 380 390 400 pF1KE1 YQG-CEALCCP-EPKLNNGE-ITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSR----F---- :. . : : . ::. :. .:.. . ::. ... :. :: : CCDS44 KPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN-------FHYGSVVTYRCNLGSRGRKVFELVG 1060 1070 1080 1090 1100 410 420 430 440 450 pF1KE1 --SAICQGD----GTWSPRTPSC--GDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEII-YECDK : : .. : :: .:.: . :. ::.. .: ... : .:.. ..:. CCDS44 EPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCT-PPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQP 1110 1120 1130 1140 1150 1160 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 GYILVGQAKLSC-SYSHWSAPAPQCKALCRKP-ELVNGRLSVD-KDQYVEPENVTIQCDS :... : ...: . ..: :.:. .:. : :...:. . . .:.. ..: .:. CCDS44 GFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPEILHGEHTPSHQDNFSPGQEVFYSCEP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 GYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYK :: . : :. :. . : ::.:.: .. :.. : CCDS44 GYDLRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCAVKS---CDDFLGQLPHGRVLFPLNLQLGAKVSFV 1230 1240 1250 1260 1270 1280 580 590 pF1KE1 LSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL CCDS44 CDEGFRLKGSSVSHCVLVGMRSLWNNSVPVCEHIFCPNPPAILNGRHTGTPSGDIPYGKE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 >-- initn: 338 init1: 187 opt: 462 Z-score: 466.6 bits: 98.1 E(32554): 1.1e-19 Smith-Waterman score: 462; 35.6% identity (62.8% similar) in 188 aa overlap (111-289:552-738) 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 CLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQIEFSC : :. : . ::.:.. ::.. ::.:..:: CCDS44 ECRPEYYGRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSC 530 540 550 560 570 580 150 160 170 180 190 pF1KE1 SEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEENFYAYGFS . : ::: ....: .. .. :: : :. . : :: : :: ...:::. :: CCDS44 TTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNRENFH-YGSV 590 600 610 620 630 640 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 VTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDVSHGEMVS ::: :.: : :.:. :: :: ... .:.: : : : :.: .: .:: CCDS44 VTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVS 650 660 670 680 690 700 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 GFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWE ... .... :.:: :::..: ..:.: .::.: CCDS44 DNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ 710 720 730 740 750 760 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 TYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLN CCDS44 RDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRV 770 780 790 800 810 820 >>CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489 aa) initn: 950 init1: 253 opt: 758 Z-score: 766.9 bits: 154.0 E(32554): 2.1e-36 Smith-Waterman score: 882; 30.3% identity (54.9% similar) in 532 aa overlap (43-539:36-550) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK ::.. :.:. : : :: : ..: : .: CCDS44 PRSPEPVGPPAPGLPFCCGGSLLAVVVLLALPVAWGQCNAPEWLPFARPTNLT-DEFEFP 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLS :: :.: : ::: : .. : ... :. . : : ::.: . ::.:.. .. CCDS44 IGTYLNYECRPGY--SGRPFSIICLKNSVWTGAKDRCRRKSCRNPPDPVNGMVHVIKGIQ 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 pF1KE1 FGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGE :::::..::..:. ::::... : .. : :.. : :. . : :: : :: ... CCDS44 FGSQIKYSCTKGYRLIGSSSATCIISGDTVIWDNETPICDRIPCGLPPTITNGDFISTNR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 ENFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKP :::. :: ::: :.: : :.:. :: :: ... .:.: : : : : CCDS44 ENFH-YGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINL .: .: .:: ... .... :.:: :::..: ..:.: .::.: :.: : CCDS44 NVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 PDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CE ::. :: : : .: . : . : :.::: ... : . :.: :: CCDS44 PDVLHA--ERTQR--DKDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCE 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE1 ALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHE-------TSRFSAICQGDGT . : . :.. . : :.: . : ...: : : .. . .. .. CCDS44 VKSCDDF---MGQLLNGRVLFPVNLQL---GAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESL 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 WSPRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKL :. .: : .: : :: : .:.. . : : . . : :: .: . :.:.. . CCDS44 WNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTI 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 SCSYSH-----WSAPAPQCKAL--CRKPE-LVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVV :. . ::.:::.: : :. :. .. ..:... . : ..... . CCDS44 RCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYY 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 G-PQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLE : : :::: : .: :. CCDS44 GRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLI 530 540 550 560 570 580 >-- initn: 950 init1: 253 opt: 811 Z-score: 820.9 bits: 164.0 E(32554): 2.1e-39 Smith-Waterman score: 875; 30.8% identity (55.8% similar) in 520 aa overlap (48-531:1844-2347) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 AAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGTTL :.: : . ::.: : ... .: .::.: CCDS44 GESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPT-IPINDFEFPVGTSL 1820 1830 1840 1850 1860 1870 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 KYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWV-YNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQI .: : ::: . ...: . : . : : : : : ::.:.:.:: .::: . CCDS44 NYECRPGYF--GKMFSISCLENLVWSSVEDNCRRKSCGPPPEPFNGMVHINTDTQFGSTV 1880 1890 1900 1910 1920 1930 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 EFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGR-HSGEENFYAY ..::.::: :::: .. : :. .: :.. : :::..:.::: : :: .:.... . CCDS44 NYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFYSNNRTSFHN 1940 1950 1960 1970 1980 1990 200 210 220 230 240 pF1KE1 GFSVTYSC------DPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKPDVSHGE : :::.: . : :.:. :: :: ... .::: :: : . . : :.: .. CCDS44 GTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRCISTNKCTAPEVENAI 2000 2010 2020 2030 2040 2050 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 MVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHA : : ... . : :.:: :::. :: ...:.....:.:. : : : :.: :. CCDS44 RVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPHCS-RVCQPPPEILHG 2060 2070 2080 2090 2100 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEALCCPE ...: . : . : :.:.: ... : . :.: : . : . CCDS44 EHTL----SHQDNFSPGQEVFYSCEPSYD--LRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDD 2110 2120 2130 2140 2150 2160 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 PKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF----SAICQGDGT---WSPRTP :.. . : : : . : ..:: : : :. .. : : :. .: CCDS44 FL---GQLPHGRVLLPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGRSASHCVLAGMKALWNSSVP 2170 2180 2190 2200 2210 430 440 450 460 470 pF1KE1 SCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSCSYSH : .: : :: : .:.. . .. . .:: : :: .: . :.:.... :. . CCDS44 VCEQIFCPNPPAILNGRHTGTPFGDIPYGKEISYACDTHPDRGMTFNLIGESSIRCTSDP 2220 2230 2240 2250 2260 2270 480 490 500 510 520 pF1KE1 -----WSAPAPQCK----ALC-RKPELVNGR-LSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQ ::.:::.:. : : . :.. ::. .. . :. ... :: :: .:: CCDS44 QGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLYLPGMTISYICDPGYLLVGKG 2280 2290 2300 2310 2320 2330 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 SITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMALEVYKLSLEIEQL : :. . : CCDS44 FIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKVYHYGDYVTLKCEDGYTLEGS 2340 2350 2360 2370 2380 2390 >-- initn: 359 init1: 185 opt: 773 Z-score: 782.1 bits: 156.8 E(32554): 3e-37 Smith-Waterman score: 773; 31.4% identity (53.6% similar) in 472 aa overlap (46-485:1389-1842) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 KMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKTGT .::.: : . :: . . . : :: CCDS44 SFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAK-LKTQTNASDFPIGT 1360 1370 1380 1390 1400 1410 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 TLKYTCLPGYV-RSHSTQTLTCNSDGEWVY-NTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFG .::: : : : : : .:: .. : . : : :. : . ::.:.. ::.. : CCDS44 SLKYECRPEYYGRPFS---ITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVG 1420 1430 1440 1450 1460 1470 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 SQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEEN :.:..::. : ::: ....: .. . :: : :. . : :: : :: ...:: CCDS44 SRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN 1480 1490 1500 1510 1520 1530 200 210 220 230 240 pF1KE1 FYAYGFSVTYSCD--PR----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDV :. :: ::: :. : : :.:. :: :: ... .:.: : : : :.: CCDS44 FH-YGSVVTYRCNLGSRGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNV 1540 1550 1560 1570 1580 1590 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPD .: .:: ... .... :.:: :::..: ..:.: .::.: :.: : :. CCDS44 ENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCS-RVCQPPPE 1600 1610 1620 1630 1640 1650 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQG-CEAL : :. :...: . : . : :.::: ... : . :.: : . CCDS44 ILHGE----HTPSHQDNFSPGQEVFYSCEPGY--DLRGAASLHCTPQGDWSPEAPRCAVK 1660 1670 1680 1690 1700 370 380 390 400 410 pF1KE1 CCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF--SAI--CQGDGT---WS : . :.. . : : : . : ..:: : : :. :.. : : :. CCDS44 SCDDFL---GQLPHGRVLFPLNLQL---GAKVSFVCDEGFRLKGSSVSHCVLVGMRSLWN 1710 1720 1730 1740 1750 1760 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSF-FKEEIIYECD----KG--YILVGQAKLSC .: : : : :: : .:.. . : .. . .:: : :: .: . :.:.. . : CCDS44 NSVPVCEHIFCPNPPAILNGRHTGTPSGDIPYGKEISYTCDPHPDRGMTFNLIGESTIRC 1770 1780 1790 1800 1810 1820 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 -SYSH----WSAPAPQCKALCRKPELVNGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDSGYGVVGPQSI : : ::.:::.:. : CCDS44 TSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPTIPINDFEFPVGTSLNYECRPGY 1830 1840 1850 1860 1870 1880 >-- initn: 709 init1: 208 opt: 591 Z-score: 596.8 bits: 122.5 E(32554): 6.4e-27 Smith-Waterman score: 750; 26.6% identity (52.5% similar) in 556 aa overlap (43-555:740-1271) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 RKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFK ::. : ::: . : . :. CCDS44 EVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAE--RTQRDKDNFS 710 720 730 740 750 760 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 TGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNT-FCIYKRCRH-PGELRNGQVEIKTDL : . :.: ::: ... .. :. .:.: . : : : :.: ::.: . ..: CCDS44 PGQEVFYSCEPGY-DLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRVLFPVNL 770 780 790 800 810 820 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 SFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRHSGEE ..:....: :.::: : ::..: : . :. .: :: . : :: : ::::.:. CCDS44 QLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKP 830 840 850 860 870 880 200 210 220 230 240 pF1KE1 -NFYAYGFSVTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKIT-CRKP . . .: .:.:.:::. :.:.:...: :: . . ::: : : . :. : CCDS44 LEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAP 890 900 910 920 930 940 250 260 270 280 290 pF1KE1 DVSHGEMVSGFGPIYNYKD-----TIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPN : : . . . : .: .. ..:. . : : : : . :. .:. . CCDS44 D--H-FLFAKLKTQTNASDFPIGTSLKYECRPEYYGRPFS-ITCLDNLVWSSPKDVCKRK 950 960 970 980 990 1000 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 SCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNL-RWTP :: . :: .. .. :. : :. . : : :.. . : . : .:. CCDS44 SCKTPPDPVNGMVHVIT-----DIQV-GSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWST 1010 1020 1030 1040 1050 360 370 380 390 400 pF1KE1 YQG-CEALCCP-EPKLNNGE-ITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETS---------- :. . : : . ::. :. .:.. . ::. ... :. : CCDS44 KPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNREN-------FHYGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVG 1060 1070 1080 1090 1100 410 420 430 440 450 pF1KE1 RFSAICQGD----GTWSPRTPSC--GDICNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEII-YECDK . : : .. : :: .:.: . :. ::.. .: ... : .:.. ..:. CCDS44 EPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCT-PPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQP 1110 1120 1130 1140 1150 1160 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 GYILVGQAKLSC-SYSHWSAPAPQCKALCRKPELV--NGRLSVDKDQYVEPENVTIQCDS :... : ...: . ..: :.:. .:. : : : . :::.. ..: .:. CCDS44 GFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEVFYSCEP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 520 530 540 550 560 pF1KE1 GYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCE----QVLTGKRLMQCLPNPEDVKMAL :: . : :. :. . : : .: :: .. :. :.:.:. : CCDS44 GYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKS---CDDFMGQLLNGRVLFPVNLQLGAKVDFV 1230 1240 1250 1260 1270 1280 570 580 590 pF1KE1 EVYKLSLEIEQLELQRDSARQSTLDKEL CCDS44 CDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 >-- initn: 338 init1: 187 opt: 462 Z-score: 465.4 bits: 98.2 E(32554): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 462; 35.6% identity (62.8% similar) in 188 aa overlap (111-289:552-738) 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 CLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTFCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQIEFSC : :. : . ::.:.. ::.. ::.:..:: CCDS44 ECRPEYYGRPFSITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGMVHVITDIQVGSRINYSC 530 540 550 560 570 580 150 160 170 180 190 pF1KE1 SEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRH--SGEENFYAYGFS . : ::: ....: .. .. :: : :. . : :: : :: ...:::. :: CCDS44 TTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNRENFH-YGSV 590 600 610 620 630 640 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 VTYSCDPR------FSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCE-KITCRKPDVSHGEMVS ::: :.: : :.:. :: :: ... .:.: : : : :.: .: .:: CCDS44 VTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVS 650 660 670 680 690 700 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 GFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWE ... .... :.:: :::..: ..:.: .::.: CCDS44 DNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQ 710 720 730 740 750 760 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 TYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLN CCDS44 RDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVKSCDDFMGQLLNGRV 770 780 790 800 810 820 >>CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (377 aa) initn: 565 init1: 261 opt: 638 Z-score: 656.1 bits: 130.8 E(32554): 3.2e-30 Smith-Waterman score: 638; 36.7% identity (55.8% similar) in 308 aa overlap (21-317:10-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS31 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP : . .. : . : : :: . .:.:. :. . : : . : . : . CCDS31 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTI-CDRNHTWLPVSDDACYRETCPYI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKC . ::: : . :: :..: :.::..::: ::.. . :: : :: : : CCDS31 RDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLC 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE1 KPPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP ::: :.::.:. .: . . : .::::::: :::.:...: : .: .:: CCDS31 TPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSR 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNP . : :. . :: : : .:...:::: . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: CCDS31 AAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDP 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 SPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQ : : : . : :: . :::: CCDS31 PVPKCLKVSTSSTTKSP-ASSASGPRPTYKPPVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVI 280 290 300 310 320 330 >>CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (384 aa) initn: 565 init1: 261 opt: 638 Z-score: 656.0 bits: 130.8 E(32554): 3.2e-30 Smith-Waterman score: 638; 36.7% identity (55.8% similar) in 308 aa overlap (21-317:10-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS14 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP : . .. : . : : :: . .:.:. :. . : : . : . : . CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTI-CDRNHTWLPVSDDACYRETCPYI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKC . ::: : . :: :..: :.::..::: ::.. . :: : :: : : CCDS14 RDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLC 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE1 KPPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRP ::: :.::.:. .: . . : .::::::: :::.:...: : .: .:: CCDS14 TPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSR 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNP . : :. . :: : : .:...:::: . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: CCDS14 AAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDP 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 SPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQ : : : . : :: . :::: CCDS14 PVPKCLKVSTSSTTKSP-ASSASGPRPTYKPPVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVI 280 290 300 310 320 330 >>CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (349 aa) initn: 565 init1: 261 opt: 632 Z-score: 650.4 bits: 129.6 E(32554): 6.6e-30 Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS14 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG : . .. : . : : :: : : :. . : : . : . : . CCDS14 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK . ::: : . :: :..: :.::..::: ::.. . :: : :: : : CCDS14 DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 PPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPS ::: :.::.:. .: . . : .::::::: :::.:...: : .: .:: . CCDS14 PPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSRA 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPS : :. . :: : : .:...:::: . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: CCDS14 APECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE1 PPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKE-----DVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT : : . . : ... ::.: . ::.:..... CCDS14 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIGKQMVELNMPLTRL 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF CCDS14 NQPLQQSREAE 340 >>CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (362 aa) initn: 565 init1: 261 opt: 632 Z-score: 650.2 bits: 129.6 E(32554): 6.8e-30 Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS31 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG : . .. : . : : :: : : :. . : : . : . : . CCDS31 MELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ELRNGQ-VEIKTDLSFGSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCK . ::: : . :: :..: :.::..::: ::.. . :: : :: : : CCDS31 DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 PPPDIRNGRHS-GEENFYAYGFSVTYSCDPR-----FSLLGHASISCTVENETIGVWRPS ::: :.::.:. .: . . : .::::::: :::.:...: : .: .:: . CCDS31 PPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCG-DN---SVWSRA 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPS : :. . :: : : .:...:::: . :: :..:.:.::: : ::..: ::..: :.: CCDS31 APECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE1 PPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKE-----DVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT : : . . : ... ::.: . ::.:..... CCDS31 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRY 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF CCDS31 LQRRKKKGTYLTDETHREVKFTSL 340 350 360 >>CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (369 aa) initn: 565 init1: 261 opt: 632 Z-score: 650.1 bits: 129.6 E(32554): 6.9e-30 Smith-Waterman score: 632; 34.7% identity (55.1% similar) in 323 aa overlap (21-328:10-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS14 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLT-CNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHPG : . .. : . : : :: : : :. . : : . : . : . 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CCDS14 VPKCLKGPRPTYKP-PVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRY 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 VICQKNLRWTPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSRF CCDS14 LQRRKKKGKADGGAEYATYQTKSTTPAEQRG 340 350 360 >>CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 (392 aa) initn: 481 init1: 261 opt: 623 Z-score: 640.6 bits: 127.9 E(32554): 2.3e-29 Smith-Waterman score: 626; 35.7% identity (54.3% similar) in 322 aa overlap (21-317:10-320) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHPPKTPSGALHRKRKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLGNCGPPPTLSFAA :: :. .: :.: :: . : ::: : : CCDS14 MEPPGRRECPFPS-WRFPGLLLAAMVL---LLYSFSDACEEPPT--FEA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 PMDITLTETRFKTGTTLKYTCLPGY--VRSHSTQTLTCNSDGEW--VYNTFCIYKRCRHP : . .. : . : : :: . .:.:. :. . : : . : . : . 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