FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4533, 598 aa 1>>>pF1KE4533 598 - 598 aa - 598 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2487+/-0.000948; mu= 16.8149+/- 0.058 mean_var=125.2596+/-25.587, 0's: 0 Z-trim(109.4): 63 B-trim: 678 in 1/51 Lambda= 0.114596 statistics sampled from 10816 (10874) to 10816 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 3.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 599) 3889 654.4 1.2e-187 CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 605) 3867 650.8 1.4e-186 CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 536) 3376 569.6 3.6e-162 CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 556) 2287 389.6 5.9e-108 CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 577) 1705 293.3 5.6e-79 CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 ( 579) 1676 288.6 1.5e-77 CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 438) 917 163.0 7.5e-40 >>CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (599 aa) initn: 3889 init1: 3889 opt: 3889 Z-score: 3482.6 bits: 654.4 E(32554): 1.2e-187 Smith-Waterman score: 3889; 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100.0% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (80-598:18-536) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 AIRAIETLSGKVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVEN :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 MFSCPGHYHVDGFLNPGSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVEN 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VEQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 VEQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQ 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 RGDHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 RGDHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIH 110 120 130 140 150 160 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 RKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 RKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLI 170 180 190 200 210 220 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 GKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 GKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFE 230 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK 410 420 430 440 450 460 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYP 470 480 490 500 510 520 590 pF1KE4 QGVASQRSK ::::::::: CCDS77 QGVASQRSK 530 >>CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (556 aa) initn: 2373 init1: 2287 opt: 2287 Z-score: 2051.7 bits: 389.6 E(32554): 5.9e-108 Smith-Waterman score: 3499; 92.8% identity (92.8% similar) in 598 aa overlap (1-598:2-556) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVNQQA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVN--- 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGPFPH :::::::::::::::::::: CCDS33 ----------------------------------------THSGYFSSLYPHHQFGPFPH 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK 500 510 520 530 540 550 >>CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (577 aa) initn: 2546 init1: 948 opt: 1705 Z-score: 1531.4 bits: 293.3 E(32554): 5.6e-79 Smith-Waterman score: 2557; 65.8% identity (85.6% similar) in 603 aa overlap (1-598:1-577) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSGK :::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.::: CCDS11 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTETA :::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::::..::: CCDS11 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSR---E ::::::..::... :. ::.:::.::...:.::::::.... :. ..:: .:: . CCDS11 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQG--PENGRRGGFGSRGQPR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 QGH--APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSG :: : :. .. .:.:.:::.:::::.::::::::: ::.::::::::..:.:::::.: CCDS11 QGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 AAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRN :::: ...:.:::: : ::.::::::.::: .:: :.:.::::::::..::::::::::: CCDS11 AAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAV :::.:..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.:::.:::. :. CCDS11 LKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAM 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFG . :..:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: : CCDS11 SLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPP--PSSVTGAAPYSSFM---------------- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 PFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMV . ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.::::::: : :: . ::: CCDS11 ------QAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMV 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 IITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQ ::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.:.:::::::::::::::: CCDS11 IITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQ 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 NLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQ :::.:::.::::::::::..:::.:::::.::: ::::::.:. :::::.:: .. :. 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