Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4393, 415 aa
  1>>>pF1KE4393 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7303+/-0.00126; mu= 14.5033+/- 0.075
 mean_var=67.4556+/-13.565, 0's: 0 Z-trim(100.9): 51  B-trim: 159 in 1/49
 Lambda= 0.156158
 statistics sampled from 6254 (6305) to 6254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.194), width:  16
 Scan time:  2.170

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX       ( 415) 2694 616.5 1.5e-176
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14    ( 435) 1369 318.0 1.1e-86
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14   ( 422) 1114 260.5 2.1e-69
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14       ( 427) 1092 255.6 6.7e-68
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14        ( 423) 1090 255.1 9.1e-68
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14       ( 418) 1020 239.3   5e-63
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14        ( 405) 1003 235.5   7e-62
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14    ( 286)  962 226.2 3.1e-59
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14       ( 406)  954 224.5 1.5e-58
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14    ( 414)  925 217.9 1.4e-56
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14    ( 335)  831 196.7 2.7e-50
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14     ( 444)  677 162.1 9.7e-40
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22      ( 499)  592 142.9 6.3e-34
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6       ( 380)  565 136.8 3.3e-32
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6       ( 395)  565 136.8 3.5e-32
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6        ( 376)  563 136.4 4.5e-32
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18      ( 390)  557 135.0 1.2e-31
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6        ( 376)  551 133.7 2.9e-31
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18      ( 390)  551 133.7   3e-31
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18      ( 374)  547 132.8 5.5e-31
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6        ( 379)  545 132.3 7.6e-31
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3        ( 405)  538 130.7 2.4e-30
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3       ( 415)  538 130.8 2.4e-30
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18     ( 397)  533 129.6 5.1e-30
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3        ( 410)  532 129.4 6.2e-30
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1         ( 464)  520 126.7 4.5e-29
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7        ( 402)  515 125.6 8.6e-29
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17      ( 418)  493 120.6 2.8e-27
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18     ( 400)  476 116.8 3.8e-26
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18     ( 391)  473 116.1 5.9e-26
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11        ( 418)  419 103.9 2.9e-22
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2       ( 397)  415 103.0 5.2e-22
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2       ( 409)  415 103.0 5.3e-22
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2        ( 398)  402 100.1 3.9e-21
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18      ( 375)  401 99.9 4.4e-21
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11        ( 500)  365 91.8 1.6e-18
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17      ( 427)  346 87.5 2.6e-17
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17      ( 491)  346 87.5   3e-17
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18      ( 242)  305 78.2 9.6e-15
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18      ( 192)  293 75.4 5.1e-14
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18    ( 305)  281 72.8   5e-13
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18      ( 380)  279 72.4 8.3e-13
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18      ( 363)  270 70.4 3.3e-12


>>CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX            (415 aa)
 initn: 2694 init1: 2694 opt: 2694  Z-score: 3283.2  bits: 616.5 E(32554): 1.5e-176
Smith-Waterman score: 2694; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCASPEGKVTACHSSQPNATLYKMSSINADFAFNLYRRFTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCASPEGKVTACHSSQPNATLYKMSSINADFAFNLYRRFTVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQHLICSLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQHLICSLN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEINSHVEMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEINSHVEMQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 TKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTVQVPMMHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTVQVPMMHQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 MEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWNRLLQKGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWNRLLQKGW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 VDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKAVLHIGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKAVLHIGEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410     
pF1KE4 GTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNPTEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNPTEA
              370       380       390       400       410     

>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14         (435 aa)
 initn: 1400 init1: 1305 opt: 1369  Z-score: 1669.6  bits: 318.0 E(32554): 1.1e-86
Smith-Waterman score: 1369; 50.6% identity (80.6% similar) in 417 aa overlap (1-415:19-435)

                                 10        20        30          40
pF1KE4                   MSPFLYLVLLVLGLHATIHCASPEGKVTACH--SSQPNATLY
                         :. .:: ::...:: : :.:.:: .  .:    ::  ..   
CCDS41 MQGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPAS
               10        20        30        40        50        60

               50        60        70        80        90       100
pF1KE4 KMSSINADFAFNLYRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNL
       .. :.:.:::: ::::...:::..::::::::.:..:.:::.::   :.:.:.. :::::
CCDS41 QVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNL
               70        80        90       100       110       120

              110       120       130       140       150       160
pF1KE4 TDTPMVEIQHGFQHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFS
       : ::   :..:::::. ::. :.:.: :..:.:::. :.:.  :.::..:: :::.::::
CCDS41 THTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFS
              130       140       150       160       170       180

              170       180       190       200       210       220
pF1KE4 TDFSNISAAKQEINSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTE
       ::::: : :. .:::::. .:.:::: .:: :   : :::::.: :::.: .:: :  :.
CCDS41 TDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTR
              190       200       210       220       230       240

              230       240       250       260       270       280
pF1KE4 DSSSFLIDKTTTVQVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESV
        .  ::. . .::.:::::: ::.   :: :::: ::::::. .:.:.::::..:.:...
CCDS41 KNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQL
              250       260       270       280       290       300

              290       300       310       320       330       340
pF1KE4 EAAMSSKTLKKWNRLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTE
       : :.:..::.::.. ::: :...:.:.:::::.:.: . : :::::.....::::::...
CCDS41 EQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAK
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KE4 DNGLKLSNAAHKAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERST
        ..:..:.:.::::: ..:.::::.:.  ...  . ..   .  ....:.:...: ...:
CCDS41 RDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKAT
              370       380       390       400       410       420

              410     
pF1KE4 RSILFLGKVVNPTEA
        .::::::: :::..
CCDS41 DGILFLGKVENPTKS
              430     

>>CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14        (422 aa)
 initn: 1070 init1: 1034 opt: 1114  Z-score: 1359.3  bits: 260.5 E(32554): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 1114; 43.1% identity (75.8% similar) in 422 aa overlap (1-412:1-419)

               10        20                30         40        50 
pF1KE4 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCA--------SPEGKVTACHS-SQPNATLYKMSSINADFAF
       :.:  .: ::  :. :..::         : .:     :. :.:  . ....   ..::.
CCDS32 MGP-AWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFAL
                10        20        30        40        50         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 NLYRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHG
        ::.......:  ::::::::::..:..::.::  .:.. :.: ::::::.:: ..:..:
CCDS32 RLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQG
      60        70         80        90       100       110        

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 FQHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQ
       :. :. .: .:. .:::..::.::. :.:::  ..:...: :: . .::..:..  .. .
CCDS32 FRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGR
      120       130       140       150       160       170        

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE4 EINSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTT
       .::.... :: :.::  . ... .:.:::.::: :::.: .::.  .:. . ::..:. :
CCDS32 QINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERT
      180       190       200       210       220       230        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE4 TVQVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKK
       ..::::::: :..  : :..: :::::..:  :::::.:::  :.:..::::.. .::.:
CCDS32 SLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRK
      240       250       260       270       280       290        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE4 WNRLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAH
       :..::  . .:: .:.::::.::.:   : ..:. .  . .:::::.: . .  .:...:
CCDS32 WGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSH
      300       310       320       330       340       350        

             360       370        380       390       400       410
pF1KE4 KAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPE-NTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVV
       ::.. ..::::::.:.  . ::. :  ::.  :  ...: :.::. : .:.:.:::::::
CCDS32 KAMVDMSEKGTEAGAASGL-LSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVV
      360       370        380       390       400       410       

            
pF1KE4 NPTEA
       ::   
CCDS32 NPVAG
       420  

>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14            (427 aa)
 initn: 1064 init1: 800 opt: 1092  Z-score: 1332.5  bits: 255.6 E(32554): 6.7e-68
Smith-Waterman score: 1106; 43.7% identity (73.3% similar) in 423 aa overlap (6-414:6-426)

               10        20         30                40        50 
pF1KE4 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCA-SPEGKVTACHSSQPNATL--------YKMSSINADFAF
            ::.::..:: :  :     :    .: .:. .  :         :..  ::::::
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAF
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 NLYRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHG
        .:  .. ::: :::::::.::::: .:::.:::  ....:.: ::::::.    ....:
CCDS99 RFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRG
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 FQHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQ
       ::::. .::.: . :: ..:.:::....:: :::::::. ..::...: :.: .  .. :
CCDS99 FQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQ
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE4 EINSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTT
        ::.::. .:.::.: :...:: ...:::::::.::: : .::  :.:  .. : .:..:
CCDS99 LINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKD-FYVDENT
              190       200       210       220       230          

             240        250       260       270       280       290
pF1KE4 TVQVPMMHQ-MEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLK
       ::.:::: : .:....: :  : :.::.:::. .: ..:.::..:.:. .: ... . : 
CCDS99 TVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLM
     240       250       260       270       280       290         

                  300       310       320       330       340      
pF1KE4 KWNRLLQK----GWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKL
       .:: ::.:      ..: .::::::..: :   : ..:.   .:. ::.::.:... :. 
CCDS99 RWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEA
     300       310       320       330       340       350         

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE4 SNAAHKAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFL
       :.. :::.: . : ::::::.    ..    .:  : :....: :...:.  ::.:.:::
CCDS99 SKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRH-ILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFL
     360       370       380       390        400       410        

        410     
pF1KE4 GKVVNPTEA
       ::::.::. 
CCDS99 GKVVDPTKP
      420       

>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14             (423 aa)
 initn: 1008 init1: 742 opt: 1090  Z-score: 1330.1  bits: 255.1 E(32554): 9.1e-68
Smith-Waterman score: 1090; 43.1% identity (74.6% similar) in 422 aa overlap (1-415:4-423)

                  10        20          30        40          50   
pF1KE4    MSPFLYLVLLVLGLHATIHC--ASPEGKVTACHSSQPNATLYKM--SSINADFAFNL
          : :.: : ::. :.  .. :   ::  . .  . .:  .:   .  .: :.::::.:
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE4 YRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQ
       :.......::::..:::.:::.::..::.::  .: :::.. : ::::.:  .::...::
CCDS32 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE4 HLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEI
       ::. .::  . ::.:..:::.:. ..:. : .: .:.: :: .:.:.:::.. .:::. :
CCDS32 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE4 NSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTV
       :..:.  :.::.. ::.::  .:.::::::: :::.:  ::::. :..:  : ..:   :
CCDS32 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSR-FYLSKKKWV
              190       200       210       220       230          

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE4 QVPMM--HQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKK
       .::::  :..   : . : ::.:::... :. :: :::.:: . .:: ::: .  .:::.
CCDS32 MVPMMSLHHLTIPY-FRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKR
     240       250        260       270       280       290        

             300        310       320       330       340       350
pF1KE4 WNRLLQKGWV-DLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAA
       :   :.   . .:..::::::  :.:.  ::..::..:.. .::.::.:   .: .:...
CCDS32 WRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVV
      300       310       320       330       340       350        

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 HKAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVV
       ::::: . :.::::.:.  :...     .  . :....: :...:.  .:..:.:..::.
CCDS32 HKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVT
      360       370       380       390       400       410        

            
pF1KE4 NPTEA
       :: .:
CCDS32 NPKQA
      420   

>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14            (418 aa)
 initn: 599 init1: 549 opt: 1020  Z-score: 1244.9  bits: 239.3 E(32554): 5e-63
Smith-Waterman score: 1020; 41.5% identity (74.6% similar) in 414 aa overlap (8-414:9-417)

                10        20               30        40        50  
pF1KE4  MSPFLYLVLLVLGLHATIHCA---SPEG----KVTACHSSQPNATLYKMSSINADFAFN
               .::. ::   .  .   .:.:    :. . : .: . :. :..   :.:::.
CCDS99 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFAFS
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE4 LYRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGF
       :::... .. . :::::::::..:..:::.:.  .:. ::.: :.::::. : ..:..::
CCDS99 LYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHEGF
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE4 QHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQE
       :.:. .:: : ..:.:  ::.::... :: . :::.::: ::..:.:...:..   ::..
CCDS99 QELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAKKQ
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE4 INSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTT
       ::..::  :.::.: :...:  .:...::::: ::..:  ::. . ::. . : .:..::
CCDS99 INDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEED-FHVDQVTT
              190       200       210       220       230          

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE4 VQVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKW
       :.::::... ..      .:.  :: : :  :: :.: :: ::... .:  ..   . :.
CCDS99 VKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIITKF
     240       250       260       270       280       290         

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE4 NRLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHK
        .  ..  ..: .::.::..:::: ..: ..:: ...:..::.::.::.  ::::.:.::
CCDS99 LENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAVHK
     300       310       320       330       340       350         

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE4 AVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNP
       ::: : :::::::..  . :   : .  . : ..... :..:..:..:.: ::.::::::
CCDS99 AVLTIDEKGTEAAGA--MFLEAIPMS--IPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNP
     360       370         380         390       400       410     

          
pF1KE4 TEA
       :. 
CCDS99 TQK
          

>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14             (405 aa)
 initn: 963 init1: 520 opt: 1003  Z-score: 1224.5  bits: 235.5 E(32554): 7e-62
Smith-Waterman score: 1003; 41.7% identity (73.6% similar) in 398 aa overlap (23-412:13-404)

               10        20        30        40               50   
pF1KE4 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCASPEGKVTACHSSQPNATLYKMS-------SINADFAFNL
                             : . . . .. .:::.  .::       : :.::::.:
CCDS99           MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSL
                         10        20        30        40        50

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE4 YRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQ
       :..... .: ::::.:::::: ::.:::.:.:  :...... ::::::.   .::..:::
CCDS99 YKHLVALSPKKNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQ
               60        70        80        90       100       110

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE4 HLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEI
       ::   .      ::. .:::::.   :. : .:  :.:  ::.::.. .:.. ..:...:
CCDS99 HLHQLFAKSDTSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQI
              120       130       140       150       160       170

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE4 NSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTV
       ::.:. .:.::.: :.. :   .:.:::::: ::. :..::: ..:.. . : .:.::.:
CCDS99 NSYVKNKTQGKIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREEN-FYVDETTVV
              180       190       200       210       220          

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE4 QVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWN
       .:::: :     .: : :: : ..::.:  :. ..:.:: .:.:..: ::.:  :...:.
CCDS99 KVPMMLQSSTISYLHDSELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWS
     230       240       250       260       270       280         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE4 RLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKA
         : .. :::..:: .::..:::: .: .:::   ....:.:: .:.:  :: :...:::
CCDS99 AGLTSSQVDLYIPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKA
     290       300       310       320       330       340         

           360       370       380        390       400       410  
pF1KE4 VLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPII-QIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNP
       ::...:.:...:.   : :     :   .::: .... :...:... : : :::..:.::
CCDS99 VLQLNEEGVDTAGSTGVTL-----NLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNP
     350       360            370       380       390       400    

          
pF1KE4 TEA
          
CCDS99 V  
          

>>CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14         (286 aa)
 initn: 979 init1: 951 opt: 962  Z-score: 1177.0  bits: 226.2 E(32554): 3.1e-59
Smith-Waterman score: 962; 50.7% identity (81.8% similar) in 286 aa overlap (130-415:1-286)

     100       110       120       130       140       150         
pF1KE4 LTDTPMVEIQHGFQHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVF
                                     .:.:::. :.:.  :.::..:: :::.:::
CCDS61                               MGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVF
                                             10        20        30

     160       170       180       190       200       210         
pF1KE4 STDFSNISAAKQEINSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKT
       :::::: : :. .:::::. .:.:::: .:: :   : :::::.: :::.: .:: :  :
CCDS61 STDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYT
               40        50        60        70        80        90

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE4 EDSSSFLIDKTTTVQVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMES
       . .  ::. . .::.:::::: ::.   :: :::: ::::::. .:.:.::::..:.:..
CCDS61 RKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQ
              100       110       120       130       140       150

     280       290       300       310       320       330         
pF1KE4 VEAAMSSKTLKKWNRLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLT
       .: :.:..::.::.. ::: :...:.:.:::::.:.: . : :::::.....::::::..
CCDS61 LEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA
              160       170       180       190       200       210

     340       350       360       370       380       390         
pF1KE4 EDNGLKLSNAAHKAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERS
       . ..:..:.:.::::: ..:.::::.:.  ...  . ..   .  ....:.:...: ...
CCDS61 KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKA
              220       230       240       250       260       270

     400       410     
pF1KE4 TRSILFLGKVVNPTEA
       : .::::::: :::..
CCDS61 TDGILFLGKVENPTKS
              280      

>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14            (406 aa)
 initn: 531 init1: 497 opt: 954  Z-score: 1164.8  bits: 224.5 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 954; 38.3% identity (73.4% similar) in 413 aa overlap (1-412:1-406)

               10         20        30        40        50         
pF1KE4 MSPFLYLVLLVLGLH-ATIHCASPEGKVTACHSSQPNATLYKMSSINADFAFNLYRRFTV
       :. :: : :..:. . :..:   :.      .. . .::.   :    ::.:.::: .. 
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSR--RDFTFDLYRALAS
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE4 ETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQHLICSL
        .:...::::::::: .:.:::.::  ::. .:.: ::.::  .   :...:::.:.  :
CCDS99 AAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQEL
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE4 NFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEINSHVEM
       : :.  ..:..:::::    .     :.. .:::: ...: :.: . ..: ..::..:  
CCDS99 NQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAK
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE4 QTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTVQVPMMH
       :::::.: :...:  :.....:::: :::.: . :. . :.... : . . :.:.:::: 
CCDS99 QTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQD-FYVTSETVVRVPMMS
      180       190       200       210       220        230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE4 QMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWNRLLQKG
       . .::..:.: .:.: :. . :. :: :::.::.::.:..:: ..: :::.:: ....: 
CCDS99 REDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKR
       240       250       260       270       280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE4 WVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKAVLHIGE
        ..:..::::: ..:.:  .: ..::..... .::.::... .....:. .::::... :
CCDS99 QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDE
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410     
pF1KE4 KGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNPTEA
       .::.:::.  . .. .      . .. ..: :...:.. .   :::::::  :   
CCDS99 SGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIVDNN---ILFLGKVNRP   
       360       370       380        390          400         

>>CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14         (414 aa)
 initn: 586 init1: 370 opt: 925  Z-score: 1129.3  bits: 217.9 E(32554): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 925; 35.7% identity (71.6% similar) in 412 aa overlap (1-412:7-411)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE4       MSPFLYLVLLVLGLHATIHCASPEGKVTACHSSQPNATLYKMSSINADFAFNLY
             .. :: ..: : ::            ..  .. .   .  ...  : :..:.: 
CCDS99 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLL
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE4 RRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHGFQH
       ....  .: .:::.::.:::.:. :: .::  ::  :: .  :::.   :  ....::..
CCDS99 KKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQ--GFNFRKMPEKDLHEGFHY
               70        80        90       100         110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE4 LICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQEIN
       .:  :.   ..:.:.:::.::: ..:.:  :::.:.:..: .:.. :.:.:.  :...::
CCDS99 IIHELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQIN
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE4 SHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTVQ
       . . ..:.::. .::... :.:.:.:.::: :.:.: . :::. :.. . :...:...:.
CCDS99 DFISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEED-FFLEKNSSVK
      180       190       200       210       220        230       

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE4 VPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWNR
       :::: .   :    : .:.::.:.. :.::  :.:.:: ::... .: ...  :...:. 
CCDS99 VPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKT
       240       250       260       270       280       290       

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE4 LLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKAV
       ::..  ::. ::.. ...:.::  ::  .:... . :..:.. ..   .::...:.::: 
CCDS99 LLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAE
       300       310       320       330       340       350       

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE4 LHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNPTE
       :.. :.:::.::   ..    : .: :  ...::. ..:::  ..  :.:::::.:::  
CCDS99 LKMDERGTEGAAGTGAQ--TLPMETPL--VVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIG
       360       370         380         390       400       410   

        
pF1KE4 A
        
CCDS99 K
        




415 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 22:55:16 2016 done: Sat Nov  5 22:55:17 2016
 Total Scan time:  2.170 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com