FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4315, 323 aa 1>>>pF1KE4315 323 - 323 aa - 323 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6825+/-0.000906; mu= 13.9086+/- 0.054 mean_var=72.2342+/-14.768, 0's: 0 Z-trim(106.3): 29 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.150905 statistics sampled from 8893 (8918) to 8893 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 2164 480.3 8.7e-136 CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1848 411.5 4.5e-115 CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1847 411.3 5.2e-115 CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1843 410.4 9.5e-115 CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1818 405.0 4.1e-113 CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1285 289.0 3.6e-78 CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1132 255.6 3.4e-68 CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1066 241.3 7.8e-64 CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1032 233.9 1.3e-61 CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1011 229.3 3.1e-60 CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 936 213.0 2.8e-55 CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 905 206.2 2.8e-53 CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 653 151.2 4.5e-37 CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 606 141.1 1.1e-33 CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 513 120.9 1.2e-27 CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 363 88.1 6.8e-18 CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 363 88.2 7.9e-18 >>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa) initn: 2164 init1: 2164 opt: 2164 Z-score: 2551.3 bits: 480.3 E(32554): 8.7e-136 Smith-Waterman score: 2164; 99.4% identity (99.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::: CCDS70 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMILNKP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN :::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY ::::::::::::::::::::::: CCDS70 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY 310 320 >>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa) initn: 1848 init1: 1848 opt: 1848 Z-score: 2179.5 bits: 411.5 E(32554): 4.5e-115 Smith-Waterman score: 1848; 83.0% identity (95.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ :: ::: :.::::::::::::::::: :::...:.:.:::::::::::::::.::::::: CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM :::::::::::::::::::::::::::. .:..:.:::: :::.::::::::::.:::. 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CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE4 GLNRNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY .::.: :.: . . :::.::: ::: CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY 310 320 >>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa) initn: 1106 init1: 1047 opt: 1132 Z-score: 1337.7 bits: 255.6 E(32554): 3.4e-68 Smith-Waterman score: 1132; 57.7% identity (85.3% similar) in 279 aa overlap (6-283:8-286) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNN .:. :.::. .:..:.:::. :. .:.. . .:.::..:.::::.::.:.: CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLH :..:: ::: :::.:.:.:::::: .::: : :.::.:.:: .:. :::::::::... CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPMALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMIL :::.:::. :.::::: .. .: ::::.:: ::::::.::.:::::: ::::.:: CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLE ::::::.::: ::::::::..: ::: ::...:::..:.: :::.:. .::. .:: ::. 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