FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6712, 934 aa 1>>>pF1KE6712 934 - 934 aa - 934 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7352+/-0.000398; mu= 14.0418+/- 0.025 mean_var=97.4812+/-19.722, 0's: 0 Z-trim(114.4): 416 B-trim: 127 in 1/53 Lambda= 0.129901 statistics sampled from 23790 (24212) to 23790 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16 Scan time: 13.080 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002579 (OMIM: 603627) protocadherin gamma-C3 is ( 934) 6089 1152.2 0 NP_115778 (OMIM: 603627) protocadherin gamma-C3 is ( 863) 5247 994.4 0 NP_061740 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 962) 2976 568.9 4.4e-161 NP_061744 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 932) 2928 559.8 2.2e-158 NP_061742 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 932) 2923 558.9 4.2e-158 NP_061737 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 935) 2921 558.5 5.4e-158 NP_061739 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 932) 2920 558.4 6.2e-158 NP_061736 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 936) 2906 555.7 3.8e-157 NP_114477 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 is ( 932) 2869 548.8 4.7e-155 NP_061746 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 931) 2860 547.1 1.5e-154 NP_061743 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 932) 2860 547.1 1.5e-154 NP_061741 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 931) 2859 546.9 1.7e-154 NP_003726 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 932) 2859 546.9 1.7e-154 NP_061735 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 931) 2831 541.7 6.5e-153 NP_061738 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 932) 2787 533.4 2e-150 NP_061751 (OMIM: 606305) protocadherin gamma-C4 is ( 938) 2776 531.4 8.3e-150 NP_061745 (OMIM: 606299) protocadherin gamma-B1 is ( 927) 2775 531.2 9.3e-150 NP_061750 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 929) 2774 531.0 1.1e-149 NP_061747 (OMIM: 606301) protocadherin gamma-B3 is ( 929) 2768 529.9 2.3e-149 NP_061749 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 930) 2713 519.6 2.9e-146 NP_114442 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 851) 2142 412.5 4.4e-114 NP_114478 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 828) 2103 405.2 6.9e-112 NP_114475 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 818) 2095 403.7 1.9e-111 NP_114400 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 829) 2094 403.5 2.2e-111 NP_114480 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 837) 2090 402.8 3.8e-111 NP_061729 (OMIM: 606309) protocadherin alpha-3 iso ( 950) 2083 401.5 1e-110 NP_114479 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 850) 2080 400.9 1.4e-110 NP_061734 (OMIM: 606314) protocadherin alpha-8 iso ( 950) 2076 400.2 2.6e-110 NP_113685 (OMIM: 606309) protocadherin alpha-3 iso ( 824) 2054 396.0 4e-109 NP_114062 (OMIM: 606314) protocadherin alpha-8 iso ( 814) 2049 395.1 7.5e-109 NP_115267 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 811) 2040 393.4 2.4e-108 NP_054723 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 is ( 820) 2037 392.8 3.6e-108 NP_115265 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 820) 2031 391.7 7.9e-108 NP_114443 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 813) 2030 391.5 8.9e-108 NP_114476 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 817) 2030 391.5 8.9e-108 NP_114063 (OMIM: 606315) protocadherin alpha-9 iso ( 950) 2031 391.7 8.9e-108 NP_113688 (OMIM: 606310) protocadherin alpha-4 iso ( 798) 2026 390.8 1.5e-107 NP_061730 (OMIM: 606310) protocadherin alpha-4 iso ( 947) 2026 390.8 1.7e-107 NP_061732 (OMIM: 606312) protocadherin alpha-6 iso ( 950) 2026 390.8 1.7e-107 NP_061723 (OMIM: 606307) protocadherin alpha-1 iso ( 950) 2023 390.2 2.5e-107 NP_114036 (OMIM: 606312) protocadherin alpha-6 iso ( 803) 2009 387.6 1.3e-106 NP_114040 (OMIM: 606313) protocadherin alpha-7 iso ( 789) 2006 387.0 2e-106 NP_113689 (OMIM: 606311) protocadherin alpha-5 iso ( 816) 2006 387.0 2e-106 NP_114089 (OMIM: 606321) protocadherin alpha-C2 is ( 884) 2006 387.1 2.2e-106 NP_061731 (OMIM: 606311) protocadherin alpha-5 iso ( 936) 2006 387.1 2.3e-106 NP_061733 (OMIM: 606313) protocadherin alpha-7 iso ( 937) 2006 387.1 2.3e-106 NP_061722 (OMIM: 606321) protocadherin alpha-C2 is (1007) 2006 387.1 2.4e-106 NP_113684 (OMIM: 606308) protocadherin alpha-2 iso ( 808) 2000 385.9 4.3e-106 NP_061728 (OMIM: 606308) protocadherin alpha-2 iso ( 948) 2001 386.1 4.4e-106 NP_113683 (OMIM: 606308) protocadherin alpha-2 iso ( 824) 2000 385.9 4.4e-106 >>NP_002579 (OMIM: 603627) protocadherin gamma-C3 isofor (934 aa) initn: 6089 init1: 6089 opt: 6089 Z-score: 6166.1 bits: 1152.2 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6089; 100.0% identity (100.0% similar) in 934 aa overlap (1-934:1-934) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE6 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE6 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTW 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE6 PNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIP 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 GSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 910 920 930 >>NP_115778 (OMIM: 603627) protocadherin gamma-C3 isofor (863 aa) initn: 5247 init1: 5247 opt: 5247 Z-score: 5313.8 bits: 994.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5247; 100.0% identity (100.0% similar) in 810 aa overlap (1-810:1-810) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE6 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE6 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTW :::::::::::::::::::::::::::::: NP_115 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQVRFSKSCLTLLVLFYSYIILRKEWSCFFSD 790 800 810 820 830 840 >>NP_061740 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 isofor (962 aa) initn: 1891 init1: 970 opt: 2976 Z-score: 3012.9 bits: 568.9 E(85289): 4.4e-161 Smith-Waterman score: 2976; 52.0% identity (76.8% similar) in 927 aa overlap (15-934:43-962) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKA-STVIHYEIPEEREK :.. . ::::.: . . : : . ::.:. NP_061 PQASTEGKPKHRRLRGGVVMAAPPARPDHTRLLQICLLLGVLVEIRAEQILYSVFEEQEE 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 GFAVGNVVANLGLDLGSLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPS : .:::.. .::: :. : :.:: . ..: .: ..: . . :.:::::: :. NP_061 GSVVGNIAKDLGLAPRELAERGVRIVSRGRTQLFALNPRSGTLVTAGRIDREELCDRSPN 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 CTVTLELVVENPLELFSVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPD :...::...:. .... ::: : :.::: :.: :.. .....: ::.:::: : ::: NP_061 CVTNLEILLEDTVKILRVEVEIIDVNDNPPSFGTEQREIKVAENENPGARFPLPEAFDPD 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 VGSNSLQTYELSRNEYFALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPA :: :::: :.:. : ::.: ::. :. :: :::::::::::.: .:::::.::: :. NP_061 VGVNSLQGYQLNSNGYFSLDVQSGADGIKYPELVLERALDREEEAVHHLVLTAFDGGDPV 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 LSASLPIHIKVLDANDNAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSF :.. : : ..:.:::::::.: :.. : :..: :::.. : ::: ::: ::.. ::: NP_061 RSGTARILIILVDTNDNAPVFTQPEYHVSVRENVPVGTRLLTVKATDPDEGANGDVTYSF 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GSHNRAGVRQLFALDLVTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVV . : . ::: :. ..: .:: : ::.::. ...: ..:.: : . . :. :::: :. NP_061 -RKVRDKISQLFQLNSLSGDITILGGLDYEDSGFYDIDVEAHD-GPGLR-ARSKVLVTVL 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 DVNDNAPEITVTSVYSPVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSL : ::::::.::::. : : :.. ::::::..: : :.: :::::: .: .:::.: .. NP_061 DENDNAPEVTVTSLTSSVQESSSPGTVIALFNVHDSDSGGNGLVTCSIPDNLPFTLEKTY 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 KNYFTLKTSADLDRETVPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYD ::. : : :::: : :::...:: : ::: ::. : . .:: ::::::: ..::. NP_061 GNYYRLLTHRTLDREEVSEYNITVTATDQGTPPLSTETHISLQVMDINDNPPTFPHASYS 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 VYIEENNLPGAPILNLSVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLV .:: ::: :: ::.... :::. .:::... : :. . . .. : .:: ..::. .: NP_061 AYIPENNPRGASILSMTAQDPDSGDNARITYSLAEDTFQGAPLSSYVSINSNTGILYALC 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 PLDYEDRREFELTAHISDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEML .:::. :...: ::.: : :..:.:...:: :.:::.:..::: : :...::. NP_061 SFDYEQFRDLQLLMTASDSGDPPLSSNVSLSLFVLDQNDNVPEILYPTFPTDGSTGVELA 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 PRGTSAGHLVSRVVGWDADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSP ::....:.::..::. : :.:.::::::::: : . .:::.:::::.. ::: . : :. NP_061 PRSADSGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSYSLLKSSEPGLFAVGLHTGEVRTARALLDRDAL 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 pF1KE6 RQTLTVLIKDNGEPSLSTTATLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPRE-QKKNLTFYLLLSLI .: :.:...:.:.: ::.:.::::.:... :.. :.. : . . . ..::.::.... NP_061 KQRLVVVVQDHGQPPLSATVTLTVAVADSIPDVLADLGSLKPSADPDDSGLTLYLVVAVA 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 LVSVGFVVTVFGVIIFKVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYH :: :.. : .. .:. .:..:: : .: : : .:. . .:.::. :.. : NP_061 AVSCVFLAFVTVLLALKLRRWHKSR-LLHAEGSRLAGVPASHFVGVDGVRAFLQT--YSH 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 QVYLTTDSRRSDPLLKKPGAASPLASRQNTLRSCDPVFYRQ-VLGAESAPPGQQAPPNTD .: ::.:::.: ....:. :. : ::.. .: .:.. : .: ... : :::::::: NP_061 EVSLTADSRKSHLIFSQPSYADTLISRESCEKS-EPLLITQDLLETKGDPNLQQAPPNTD 790 800 810 820 830 840 820 830 840 850 860 870 pF1KE6 WRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 WRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGL 850 860 870 880 890 900 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 SARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 SARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 910 920 930 940 950 960 >>NP_061744 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 isofor (932 aa) initn: 1716 init1: 1716 opt: 2928 Z-score: 2964.5 bits: 559.8 E(85289): 2.2e-158 Smith-Waterman score: 2928; 49.9% identity (76.7% similar) in 930 aa overlap (14-934:11-932) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKA-STVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLG ::.: . ::: : .: .. :.: .::: :::. :::. .:.:. NP_061 MAAPTKCQLRGRLVLLCSLLGMLWEARASQIRYSVPEETEKGYIVGNISKDLALEPR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELF :. :: :.:: . ..: .: ..: . . :.::::::. : : :.....::. ..:. NP_061 ELAERRVRIVSRGRTQLFSLNPRSGTLVTAGRIDREELCAQSPRCLVNFKVLVEDRVKLY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEY ..:. . ::::. : : .. ....:.: ..::.:.:: : ::::: ::::.:.:: :.. NP_061 GIEIEVTDINDSAPKFQAESLEVKINEIAVPGARYPLPEAIDPDVGVNSLQSYQLSPNHH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDAND :.: ::: .... :::::::::::. . .::::: ::: : :... ::. :::.:: NP_061 FSLNVQTGDNGAINPELVLERALDREEATAHHLVLTASDGGEPRRSSTVRIHVTVLDTND 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDL ::::: : .::..:::..: :: .. . :.::::: ::.. :.: . :. :: :. NP_061 NAPVFAQRIYRVKVLENVPPGTWLLTATASDLDEGINGKVAYKFWKINEKQ-SLLFQLNE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYS :: .. ::.:. ...:. :::.: :.. .: :::. : ::::: ::.:.::..: NP_061 NTGEISTAKSLDYEECSFYEMEIQAED-GGGLKGW-TKVLISVEDVNDNRPEVTITSLFS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 PVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRET :: :::: :::: :... : :.:.:: :.: . .: :.: .: ..:. : :. :::: NP_061 PVREDAPQGTVILLFNAHDRDSGKNGQVVCSIQENLSFTLENSEEDYYRLLTAQILDREK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNL . :::...:: : ::: ::. . .::.::::::: ::.::.::. ::: :. :... NP_061 ASEYNITVTATDRGTPPLSTEIHITLQVTDINDNPPAFSQASYSVYLPENNARGTSIFSV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHI ..:::. .:.:. . : :. . . .. : .:: :.:.. .: .:::. :.... . NP_061 IAYDPDSNENSRVIYSLAEDTIQGSPLSTYVSINSDTGVLYALCSFDYEQFRDLQMQVTA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 SDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGW ::.:.: :..:.:. .:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.::..::. NP_061 SDSGSPPLSSNVSLRLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 DADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSL : :.:.:::::: :. . . .::..:::::.. ::: . : :. .:.:.: ..:.:.: : NP_061 DRDSGQNAWLSYRLFKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 STTATLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPRE-QKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIF :.:.::::..... :. :.. : . : . . ..::.::.... .:: :.. :. .. . NP_061 SATVTLTVAIADSIPDILADLGSLQIPADLEASDLTLYLVVAVAVVSCVFLTFVITLLAL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 KVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYHQVY-LTTDSRRSDPLL .. .:..:. : :: ..: .: . .:.::. :.. : : . ::.:::.: .. NP_061 RLRHWHSSH-LLRATSDGLAGVPTSHFVGVDGVRAFLQT---YSQEFSLTADSRKSHLIF 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 KKPGAASPLASRQNTLRSCDP--VFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGS .:. :. : :.:. .. .: : . . :..: ::::::::::::::::::::: NP_061 PQPNYADTLISQQSCEKN-EPLCVSVDSKFPIEDTPLVPQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGS 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE6 QNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 QNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVP 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 pF1KE6 DYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 DYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 890 900 910 920 930 >>NP_061742 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 isofor (932 aa) initn: 1670 init1: 1670 opt: 2923 Z-score: 2959.5 bits: 558.9 E(85289): 4.2e-158 Smith-Waterman score: 2923; 51.0% identity (76.1% similar) in 926 aa overlap (17-934:14-932) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGAL-NKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLG : .: :::.: . :.. :.: :::: ::: :::.: .:::. NP_061 MAPPQRHPQRSEQVLLLTLLGTLWGAAAAQIRYSIPEELEKGSFVGNIVKDLGLEPQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELF :. . :.:: . ..: .: ..: . . :.::::::. : : :.....::. :.:. NP_061 ELAEHGVRIVSRGRMQLFSLNPRNGSLVTAGRIDREELCAQSPRCLVSFNILVEDKLNLY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEY ::: : :::::.: : .:....: : .::..:::: ..::::: :::: ..:: : . NP_061 PVEVEIVDINDNTPRFLKEELEVKILENAAPSSRFPLMEVYDPDVGMNSLQGFKLSGNSH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDAND :.. ::.. . :: ::::: .:::: : .:::::.::: :. :. : . :::.:: NP_061 FSVDVQSEAHGPKYPELVLEGTLDREGEAVYRLVLTAMDGGDPVRSSVAQILVTVLDVND 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDL :.:.:.: .::. : :. : :: :. : ::: ::: .::. ::: . . :.: :.. NP_061 NTPMFTQPVYRVSVPENLPVGTPVLAVTATDQDEGVHGEVTYSF-VKITEKISQIFCLNV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYS .:: .. .. ::.::....:. ..:.: . . : :::. ..:::::.::..::: NP_061 LTGEISTSANLDYEDSSFYELGVEARDGPGLRDRA--KVLITILDVNDNVPEVVVTSGSR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 PVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRET . :.:: ::::::..: : :.: :::::: .: .::: : .:. ::. : :.: :::: NP_061 TIAESAPPGTVIALFQVFDRDSGLNGLVTCSIPRSLPFELEKSVGNYYRLVTNAALDREE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNL : ::...:: : ::: ::. ::. ..:.: ::::: .:::.::. ::: :: :... NP_061 VFLYNITVTATDKGTPPLSTETIISLNVADTNDNPPTFPHSSYSVYVLENNPRGASIFSV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHI .. :::. :::..:. : :. . . .. : .:: :.::. .: .:::. :...: . NP_061 NALDPDVDQNAQVSYSLAEDTLQGAPLSSYVSINSDTGILYALRSFDYEQLRDLQLWVTA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 SDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGW ::.: : :..:.:...:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.::..::. NP_061 SDSGDPPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 DADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSL : :.:.:::::: :: . . .::..:::::.. ::: . : :. .:.:.: ..:.:.: : NP_061 DRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 STTATLTVSVTEDSPEARAEFPS-GSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIF :.:.::::.:.. :. :.. : . . . ..::.::.... :: :.. :. .. . NP_061 SATVTLTVAVADRIPDILADLGSLEPSAKPNDSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVIVLLAL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 KVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLK .. .:..:: : .: ..: :: . ...::. :.. :.: ::.:::.: .. NP_061 RLQRWHKSR-LLQASGGGLASMPGSHFVGVEGVRAFLQT--YSHEVSLTADSRKSHLIFP 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 KPGAASPLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQ--QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQ .:. :. : . :.. .. .:.. : : .. : : :::::::::::::::::::::: NP_061 QPNYADTLIN-QESYEKSEPLLITQDLLETKGEPRQLQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQ 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE6 NGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 NGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPD 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 YRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 YRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 900 910 920 930 >>NP_061737 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 isofo (935 aa) initn: 1794 init1: 949 opt: 2921 Z-score: 2957.4 bits: 558.5 E(85289): 5.4e-158 Smith-Waterman score: 2921; 50.8% identity (76.4% similar) in 924 aa overlap (21-934:19-935) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNK-ASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLG ..::.: . :.: .::: ::: :::. .:::. NP_061 MANRLQRGDRSRLLLLLCIFLGTLRGFRARQIRYSVPEETEKGSFVGNISKDLGLEPR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELF :. : :.:: .. ..: :: ..: ... :.:::::: :. :: ...::.::. :... NP_061 ELAKRGVRIVSRGKTQLFAVNPRSGSLITAGRIDREELCETVSSCFLNMELLVEDTLKIY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEY .::: : ::::: :.: .:.....:: . ::.:: : .:.::::: ::::.:.:: :.: NP_061 GVEVEIIDINDNAPSFQEDEVEIKVSEHAIPGARFALPNARDPDVGVNSLQSYQLSPNNY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDAND :.:... : :..: ::::: .::::.: . :.::::::: : ....::.. :::.:: NP_061 FSLQLRGRTDGAKNPELVLEGSLDREKEAAHLLLLTALDGGDPIRKGAVPIRVVVLDVND 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDL . :.:.::.::. : :. :::::..: ::: ::: :::..::: . .. . ..: :: NP_061 HIPMFTQSVYRVSVPENISSGTRVLMVNATDPDEGINGEVMYSF-RNMESKASEIFQLDS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYS :: . ..: :::: ...:. ::..: :. . .:. ::::::::::::.:: . NP_061 QTGEVQVRGSLDFEKYRFYEMEIQGQDGGG--LFTTTTMLITVVDVNDNAPEITITSSIN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 PVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRET . :..: :::::::.: : :.:::: :.: .: :::.: .. ::. : :: :::: NP_061 SILENSPPGTVIALLNVQDQDSGENGQVSCFIPNHLPFKLEKTYGNYYKLITSRVLDREL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNL : ::...:: : :.: ::: : : ..:.: ::::: .:::..:: ::: :: :... NP_061 VQSYNITLTATDQGSPPLSAETHVWLNVADDNDNPPVFPHSSYSAYIPENNPRGASIFSV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHI .. :::. ::: ... : .. .. .. : .:: ..:.. .: .:::. :..:: . NP_061 TALDPDSKQNALVTYSLTDDTVQGVPLSSYVSINSNTGVLYALQSFDYEQFRDLELRVIA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 SDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGW :.: : :..:.:...:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.::..::. NP_061 RDSGDPPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 DADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSL : :.:.:::::: :: . . .:::.: :::.. ::: . : :. .:.:.: ..:.:.: : NP_061 DKDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFAVGEHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 STTATLTVSVTEDSPEARAEFPS-GSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIF :.:.::::.:... ::. :.. : : . ..:..::.... :: :.: :. .. . NP_061 SATVTLTVAVADSIPEVLADLGSLESLANSETSDLSLYLVVAVAAVSCIFLVFVIVLLAL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 KVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLK ....:..:: : .: ..: : . .:.:.. :.. :.: : .::..: .. NP_061 RLWRWHKSR-LLQASEGGLAGMPTSHFVGVDGVQAFLQT--YSHEVSLIADSQKSHLIFP 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 KPGAASPLASRQNTLRSCDPVFYRQ----VLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSG .:. .. : :... .: .:.. . .:: . .::::::::::::::::::::: NP_061 QPNYGDTLISQESCEKS-EPLLIAEDSAIILGKCDPTSNQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSG 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE6 SQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 SQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHV 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 PDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 PDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 900 910 920 930 >>NP_061739 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 isofor (932 aa) initn: 1728 init1: 1728 opt: 2920 Z-score: 2956.4 bits: 558.4 E(85289): 6.2e-158 Smith-Waterman score: 2920; 50.6% identity (77.0% similar) in 932 aa overlap (14-934:10-932) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLL-LLGALNKA-STVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDL :: ...: :::.: .. : :.: . :: .:: :::.. .:::. NP_061 MTNCLSFRNGRGLALLCALLGTLCETGSGQIRYSVSEELDKGSFVGNIANDLGLEP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 GSLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLEL :. : :.:: . ..: .: ..: . . .:.::::::. .: : : ....::. :.. NP_061 RELAERGVRIVSRGRTQLFSLNPQSGSLVTAERIDREELCAQIPLCLVKINILVEDKLKI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 FSVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNE : ::. :.::::: : :::.:....:.: ..::::::...: ::::: ::::.:.:: :. NP_061 FEVEIEIKDINDNAPNFPTEELEIKIGELTVPGTRFPIKTAFDPDVGINSLQNYKLSPND 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 YFALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDAN ::.: :.. ...:: :::::::::::.. ::::.: ::: :. :..: :.. ::::: NP_061 YFSLAVNSVSEGAKYPELVLERALDREKKEIHQLVLVASDGGDPVHSGNLHIQVIVLDAN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DNAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALD :: :.:.: ::. : :..: :::.. : ::: ::: :... : . . . . ..: :. NP_061 DNPPMFTQPEYRVSVWENVPVGTRLLTVNATDPDEGFNAQVSYILDKMP-GKIAEIFHLN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LVTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEG--AHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTS :.: ..: ::.::. ..:: :.:.: .: : .. :.:: :.::::::::::.:: NP_061 SVSGEVSILKSLDYEDAMFYEIKIEAQD---GP-GLLSRAKILVTVLDVNDNAPEITITS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 VYSPVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLD . : :::.. .: :::..: : :.:.:: : : .:::.: .:. .:. : :...:: NP_061 LTSSVPEEGTVGREIALIDVHDRDSGQNGQVEVFVLGNLPFKLEKSIDQYYRLVTATSLD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 RETVPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPI :: . :::.:. : :.:.: ::. : . ..: ::::::: . ::..:: ::: :: : NP_061 REQISEYNISLRASDGGSPPLSTETHITLHVIDINDNPPTFPHLSYSAYIPENNPRGASI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LNLSVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELT ..... :::. .:::... : :. . . .. . .:: ..:.. .: .:::. :...: NP_061 FSVTAQDPDSNNNARITYALTEDTLQGAPLSSFVSINSNTGVLYALRSFDYEQFRDLKLL 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 AHISDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLVSRV . ::.:.: :..:.:.:.:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.::..: NP_061 VTASDSGNPPLSSNVSLNLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 VGWDADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGE :. : :.:.:::::: :: . . .::..:::::.. ::: . : :. .:.:.: ..:.:. NP_061 VAVDRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 PSLSTTATLTVSVTEDSPEARAEFPS-GSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGV : ::.:.::::.:.. :. :.. : . . . ..::.::.... :: :.. :. . NP_061 PPLSATVTLTVAVADRIPDILADLGSLEPSAKPNDSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVIVL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 IIFKVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDP . ... .:..:: : .: ..: ::: . ::.::. :.. :.: ::.:::.: NP_061 LALRLRRWHKSR-LLQASGGGLASTPGSHFVGADGVRAFLQT--YSHEVSLTADSRKSHL 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 pF1KE6 LLKKPGAASPLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPG--QQAPPNTDWRFSQAQRPGTS .. .:. :. : :... .: .:.. : : .. . :::::::::::::::::::: NP_061 IFPQPNYADTLISQESCEKS-EPLLITQDLLEMKGDSNLLQQAPPNTDWRFSQAQRPGTS 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 GSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 GSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQH 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 VPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 VPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 890 900 910 920 930 >>NP_061736 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 isofo (936 aa) initn: 1691 init1: 1691 opt: 2906 Z-score: 2942.2 bits: 555.7 E(85289): 3.8e-157 Smith-Waterman score: 2906; 50.9% identity (74.9% similar) in 934 aa overlap (8-934:15-936) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVAN :::: :. :: . : : :::: ::: :::. . NP_061 MAAQRNRSKESKDCSGLVLLCLFFGIPWEAGARQ-----ISYSIPEELEKGSFVGNISKD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LGLDLGSLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVE ::: :. : :.:: . ..: .: ..: ... :.::::::. :.:.....:: NP_061 LGLAPRELAERGVRIVSRGRTQLFSLNPRSGSLITAGRIDREELCAQSARCVVSFNILVE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NPLELFSVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYE . ..::..:. . ::::: : : .... ..:.: :: : :::: : ::::: ::::.:. NP_061 DRVKLFGIEIEVTDINDNAPKFQAENLDVKINENVAAGMRFPLPEAIDPDVGVNSLQSYQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LSRNEYFALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIK :: :..:.::::.: ...:: :::::..::::.: .::::: ::: : :... . . NP_061 LSPNKHFSLRVQSRANGVKYPELVLEHSLDREEEAIHHLVLTASDGGDPLRSGTVLVSVT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 VLDANDNAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQ :.:::::::::. ::. : :. : ::... : ::: ::: :::. ::: . . . . NP_061 VFDANDNAPVFTLPEYRVSVPENLPVGTQLLTVTATDRDEGANGEVTYSFRKLPDTQLLK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LFALDLVTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEIT : :. :: . :. ::.:.: ..:: :::.: :: : :::. : :::::.::.: NP_061 -FQLNKYTGEIKISENLDYEETGFYEIEIQAEDGGAY--LATAKVLITVEDVNDNSPELT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 VTSVYSPVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSA .::..::: ::.:::::.:::.: :::. .:: ::: . :::.: .:. .:. : NP_061 ITSLFSPVTEDSPLGTVVALLNVHDLDSEQNGQVTCSILAYLPFKLEKSIDSYYRLVIHR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 DLDRETVPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPG :::: : ::...:: :.:.: ::. . .::.::::::: :: :: .:: ::: : NP_061 ALDREQVSSYNITVTATDGGSPPLSTEAHFMLQVADINDNPPTFSQVSYFTYIPENNARG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 APILNLSVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREF : :..... :::. .::.. . : :. . .. :..:: :.:.. .: .:::. .:. NP_061 ASIFSVTALDPDSKENAQIIYSLAEDTIQGVPLSSYISINSDTGVLYALRSFDYEQFHEL 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 ELTAHISDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLV .. . ::.: : :..:.:...:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.:: NP_061 QMQVTASDSGDPPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 SRVVGWDADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKD ..::. : :.:.:::::: :: . . .:::.: :::.. ::: . : :. .:.:.: ..: NP_061 TKVVAVDRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFAVGEHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQD 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 NGEPSLSTTATLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQK-KNLTFYLLLSLILVSVGFVVTV .:.: ::.:.::::.:... :.. :.. : .: ... ..::.::.... :: :.. : NP_061 HGQPPLSATVTLTVAVADSIPQVLADLGSFESPANSETSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFV 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 FGVIIFKVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSL-HADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRR . .. .. .:..:: : .: ..: . : . .:.::. :.. :.: ::.:::. NP_061 IVLLAHRLRRWHKSR-LLQASGGGLTGVSGSHFVGVDGVRAFLQT--YSHEVSLTADSRK 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 SDPLLKKPGAASPLASRQNTLRSCDPV--FYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRP : .. .:. :. : : :.. .. ::. . . . :..: :::::::::::::::: NP_061 SHLIFPQPNYADTLIS-QESCEKNDPLSLLDDSKFPIEDTPLVPQAPPNTDWRFSQAQRP 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 GTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 GTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFT 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 LQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 LQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 890 900 910 920 930 >>NP_114477 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 isofor (932 aa) initn: 1717 init1: 1717 opt: 2869 Z-score: 2904.8 bits: 548.8 E(85289): 4.7e-155 Smith-Waterman score: 2869; 50.2% identity (75.4% similar) in 934 aa overlap (14-934:11-932) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKAST-VIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLG :... . :::.: . . :.: .::: .:: :::. .:::: NP_114 MAAPQSRPRRGELILLCALLGTLWEIGRGQIRYSVPEETDKGSFVGNISKDLGLDPR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELF .:. . :.:: . ..: .: ..: ... :.::::::. : : .... .::. .:: NP_114 KLAKHGVRIVSRGRTQLFALNPRSGSLITAGRIDREELCAQSPRCLININTLVEDKGKLF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEY .::. : ::::::: : .......:.: ..::.:.:: : ::::: ::::.:.:: :.. NP_114 GVEIEIIDINDNNPKFQVEDLEVKINEIAVPGARYPLPEAVDPDVGVNSLQSYQLSPNHH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDAND :.: ::: .... :::::::::::.: . .::::: ::: : :... ::. :::.:: NP_114 FSLDVQTGDNGAINPELVLERALDREEEAAHHLVLTASDGGKPPRSSTVRIHVTVLDTND 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDL ::::: . .::..:::. : :::.. : :.: ::: ::.. :.: . :. . :: :. NP_114 NAPVFPHPIYRVKVLENMPPGTRLLTVTASDPDEGINGKVAYKFRKINEKQT-PLFQLNE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYS :: ..: ::.:. ...:. :::.: :: .. :.:. : ::::: ::. .::..: NP_114 NTGEISIAKSLDYEECSFYEMEIQAEDVGA--LLGRTKLLISVEDVNDNRPEVIITSLFS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 PVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRET :: :.. :::::.::: : :.:.:: :.: . .:::.: .:. ::. : : ::::. NP_114 PVLENSLPGTVIAFLSVHDQDSGKNGQVVCYTRDNLPFKLEKSIGNYYRLVTRKYLDREN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNL : ::... : : ::: ::. : . ..:.::::::: ..::..:: :::: :: :..: NP_114 VSIYNITVMASDLGTPPLSTETQIALHVADINDNPPTFPHASYSAYILENNLRGASIFSL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHI .. :::. .::.... . :. . . .. :..:: :.:.. .: .:::. :...: . NP_114 TAHDPDSQENAQVTYSVTEDTLQGAPLSSYISINSDTGVLYALQSFDYEQIRDLQLLVTA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 SDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR-P--GGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGW ::.: : :..:.:...:: :.:::::..::: : :...::. ::.. :.::..::. NP_114 SDSGDPPLSSNMSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAERGYLVTKVVAV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 DADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSL : :.:.:::::: :: . . .::..:::::.. ::: . : :. .:.:.: ..:.:.: : NP_114 DRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 STTATLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQK-KNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIF :.:.::::.:... ::. .:. : . . . ..::.::.... .: :.. : .. . NP_114 SATVTLTVAVADSIPEVLTELGSLKPSVDPNDSSLTLYLVVAVAAISCVFLAFVAVLLGL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 KVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPG-PSLHADAVRGGLMSPHLYHQ-VYLTTDSRRSDPLL .. .:..:: : .: : : :. : .:. . : : : ::.:::.: .. NP_114 RLRRWHKSRLLQ----DSGGRLVGVPASHFVGVEEVQAFLQTYSQEVSLTADSRKSHLIF 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 KKPGAASPLASRQ------NTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPG .:. :. : :.. . : : : :. . : ::::::::::::::::::: NP_114 PQPNYADMLISQEGCEKNDSLLTSVDFHEYK-----NEADHGQQAPPNTDWRFSQAQRPG 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 TSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_114 TSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTL 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 QHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_114 QHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 890 900 910 920 930 >>NP_061746 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 isofor (931 aa) initn: 1751 init1: 844 opt: 2860 Z-score: 2895.7 bits: 547.1 E(85289): 1.5e-154 Smith-Waterman score: 2860; 50.3% identity (73.3% similar) in 943 aa overlap (7-934:7-931) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLL--LLGALNKASTV-IHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLD : ::: : . ::: ::. . : : :.: :::: :. .:::.. .:::. NP_061 MKASSGRCGLV---RWLQVLLPFLLSLFPGALPVQIRYSIPEELAKNSVVGNLAKDLGLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LGSLSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLE . .: ::..:: .: ...: :: :.:...:.::.:::..:: : :.. .. :.::::. NP_061 VRDLPARKLRV--SAEKEYFTVNPESGDLLVSDRIDREQICGKQPLCVLDFDTVAENPLN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LFSVEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRN .: . :..::::::.: : ...:.:.:.. ::: :::. : : ::: :::: :.:. : NP_061 IFYIAVIVQDINDNTPLFKQTKINLKIGESTKPGTTFPLDPALDSDVGPNSLQRYHLNDN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EYFALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDA ::: : . :. :: ::.:...::::.. ::::::.::: : :.. :.::: :: NP_061 EYFDLAEKQTPDGRKYPELILKHSLDREEHSLHQLVLTAVDGGDPPQSGTTQIRIKVTDA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NDNAPVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHN-RAGVRQLFA ::: :::.:..::. . ::.: : :.:: ::: ::: :.:: ::: :: :...: NP_061 NDNPPVFSQDVYRVTLREDVPPGFFVLQVTATDRDEGINAEITYSF--HNVDEQVKHFFN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LDLVTGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTS :. :: .: : :::: .. . . :.::: : .:::.. ::..: :: :::. ::: NP_061 LNEKTGEITTKDDLDFEIASSYTLSIEAKDPG--DLAAHCSIQVEILDDNDCAPEVIVTS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 VYSPVPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLD : .:.:::.: ::::::... : :.:::: : :.: . : : :: :::. : :.. :: NP_061 VSTPLPEDSPPGTVIALIKTRDRDSGENGEVYCQVLGNAKFILKSSSKNYYKLVTDGALD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 RETVPEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPI :: .:::::.::: :.: : ::. :: ...::.::: : .:.:: :.. ::: ::: : NP_061 REEIPEYNLTITATDGGKPPLSSSIIVTLHISDVNDNAPVFQQTSYMVHVAENNPPGASI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LNLSVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELT ..:. ::: ....:. .. . . . : ... ..:.: . .:.:. : :::: NP_061 AQISASDPDLGPSGQVSYSIVASDLKPREILSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQLRAFELT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 AHISDGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPR--PGGSSV-EMLPRGTSAGHLVSRV . : :.:.:..:.:. ..: : :::::.:::: : ::.. .:.::.. :.::..: NP_061 LQARDQGSPALSANVSLRVLVGDLNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 VGWDADAGHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGE :. :::.:::::::: .: . . .::..::.::.. ::: . : :. :: : : ..:.:. NP_061 VAVDADSGHNAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 PSLSTTATLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVI : ::.:::: . ... :. .. . : . . .: :::...: :.:: : ..:. .: NP_061 PPLSATATLHLIFADSLQEVLPDLSDRREPSDPQAKLQFYLVVALALISVLFFLAVILAI 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 IFKVYKWKQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLL ... . .. : . .: :::.. . .: : :. :. . ... .: NP_061 SLRL-RLSSRSDAWDCFQPGLSSKPGPGVLPNYSEGTL--PYSYNLCVASQSAKTEFNFL 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 pF1KE6 KKPGAASP-LASRQNTLRSCDPVFYRQVL--GAESAPPG-----QQAPPNTDWRFSQAQR . .: :. :. . :: . ..: :: ..: . .::::::::::::::: NP_061 N----ITPELVPAQDLV--CDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILKQAPPNTDWRFSQAQR 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 PGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 PGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQF 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 TLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_061 TLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 890 900 910 920 930 934 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:36:40 2016 done: Tue Nov 8 15:36:42 2016 Total Scan time: 13.080 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]