Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1308
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1308, 524 aa
  1>>>pF1KE1308 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6757+/-0.000745; mu= 12.3870+/- 0.045
 mean_var=97.5051+/-19.806, 0's: 0 Z-trim(112.0): 15  B-trim: 560 in 1/49
 Lambda= 0.129886
 statistics sampled from 12855 (12869) to 12855 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.395), width:  16
 Scan time:  2.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3           ( 524) 3571 679.2  3e-195
CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3           ( 484) 2336 447.8 1.3e-125
CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20         ( 539) 1296 252.9 6.6e-67
CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20         ( 516) 1268 247.7 2.4e-65
CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20         ( 566) 1268 247.7 2.6e-65
CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20         ( 580) 1268 247.7 2.7e-65
CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20         ( 489) 1156 226.7 4.8e-59
CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5           ( 400)  860 171.2   2e-42
CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5           ( 473)  860 171.2 2.3e-42


>>CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3                (524 aa)
 initn: 3571 init1: 3571 opt: 3571  Z-score: 3618.8  bits: 679.2 E(32554): 3e-195
Smith-Waterman score: 3571; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520    
pF1KE1 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
              490       500       510       520    

>>CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3                (484 aa)
 initn: 2327 init1: 2327 opt: 2336  Z-score: 2368.6  bits: 447.8 E(32554): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 3203; 92.4% identity (92.4% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-484)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
       :::::::::::::::::::::::                                     
CCDS27 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKEN-------------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ---LSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
              150       160       170       180       190       200

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
              210       220       230       240       250       260

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
              270       280       290       300       310       320

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
              330       340       350       360       370       380

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
              390       400       410       420       430       440

              490       500       510       520    
pF1KE1 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
              450       460       470       480    

>>CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20              (539 aa)
 initn: 1303 init1: 532 opt: 1296  Z-score: 1314.6  bits: 252.9 E(32554): 6.6e-67
Smith-Waterman score: 1345; 44.6% identity (69.6% similar) in 523 aa overlap (30-522:39-537)

                10        20        30         40        50        
pF1KE1  MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
                                     :.:. . :.. ::::.:: :: .: ::::.
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSE
       10        20        30        40        50        60        

       60            70                     80        90       100 
pF1KE1 YEQP----LEVKNNSNLQRMG-------------SSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENP
         .     :  .. : : ...             ::::.:.:.:.:::.:.: .   .. 
CCDS13 TPKSQVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTF
       70        80        90       100       110       120        

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE1 MRRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLH
        . :..  . . . . :..:          :: . ::      .: :: : .:.  .  :
CCDS13 EQAIQAASRIIRNEQFAIRR----------FQSM-PD------GFVFKMPWKPTHPSSTH
      130       140                 150              160       170 

              170       180       190       200       210          
pF1KE1 SHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSD--EDDGF
       . .   .. . :.:: .:::  :  : .: . :  .. ::   .  .: . .:  :::::
CCDS13 ALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSPLALGRFSLTPAEGDTEEDDGF
             180       190       200        210       220       230

      220       230       240              250        260       270
pF1KE1 VDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTTNLDNRC-KLFDSPSLCSSSTR
       ::.:... ::... .:  : :: .::::        .   . ..: .:: :::.  :  :
CCDS13 VDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVMYSKCQRLFRSPSMPCSVIR
               240       250       260       270       280         

              280       290       300       310       320       330
pF1KE1 SVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENIL
        .::: :: :... : ..:::.:..   :.:. . :. .  . .: ::  .    :::.:
CCDS13 PILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSKSLCHD---EIENLL
     290       300       310         320       330          340    

              340       350       360       370       380       390
pF1KE1 DNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYE
       :.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:.:::.:.. .:::.:::::::
CCDS13 DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVDKFVIVDCRYPYE
          350       360       370       380       390       400    

              400       410       420        430       440         
pF1KE1 YEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERD
       ::::::: :::: .:...:.::::.::.: .  ::::..:::::::::::::::..::::
CCDS13 YEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERD
          410       420       430       440       450       460    

     450       460       470       480       490       500         
pF1KE1 RLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWA
       :  :.::.:.:::.:.::::::::: .  ..::: .::::.:: ::..:: :: :.:.::
CCDS13 RAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWA
          470       480       490       500       510       520    

     510       520    
pF1KE1 GEKSKREMYSRLKKL
       ::.:.::. :::.  
CCDS13 GERSRRELCSRLQDQ
          530         

>>CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20              (516 aa)
 initn: 1299 init1: 532 opt: 1268  Z-score: 1286.6  bits: 247.7 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1360; 46.5% identity (71.9% similar) in 484 aa overlap (76-522:39-514)

          50        60        70        80        90          100  
pF1KE1 TVTMDQLQGLGSDYEQPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLD---SKENLENPM
                                     ::::.:.:.:.:::.:.:   .....:. .
CCDS74 QVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTFEQAI
       10        20        30        40        50        60        

                          110       120       130               140
pF1KE1 --------------RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------EN
                     ::..:.: .::: ::.: :. ..:   :  .  .          :.
CCDS74 QAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGED
       70        80        90        100       110       120       

              150       160        170       180       190         
pF1KE1 KENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIP
       :::..: :: : .:.  .  :. .   .. . :.:: .:::  :  : .: . :  .. :
CCDS74 KENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSP
       130       140       150       160       170        180      

     200       210         220       230       240              250
pF1KE1 LFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTT
       :   .  .: . .:  :::::::.:... ::... .:  : :: .::::        .  
CCDS74 LALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDL
        190       200       210        220       230       240     

               260       270       280       290       300         
pF1KE1 NLDNRC-KLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAH
        . ..: .:: :::.  :  : .::: :: :... : ..:::.:..   :.:. . :. .
CCDS74 VMYSKCQRLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPK
         250       260       270       280       290         300   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE1 ETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVL
         . .: ::  .    :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:
CCDS74 ARVLRSKSLCHDE---IENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALL
           310          320       330       340       350       360

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE1 NGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVV
       .:::.:.. .:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: .  ::::..
CCDS74 TGKFSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILI
              370       380       390       400       410       420

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE1 FHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRP
       :::::::::::::::..:::::  :.::.:.:::.:.::::::::: .  ..::: .:::
CCDS74 FHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRP
              430       440       450       460       470       480

      490       500       510       520    
pF1KE1 MHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       :.:: ::..:: :: :.:.::::.:.::. :::.  
CCDS74 MNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
              490       500       510      

>>CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20              (566 aa)
 initn: 1273 init1: 532 opt: 1268  Z-score: 1286.0  bits: 247.7 E(32554): 2.6e-65
Smith-Waterman score: 1408; 45.3% identity (71.2% similar) in 534 aa overlap (30-522:39-564)

                10        20        30         40        50        
pF1KE1  MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
                                     :.:. . :.. ::::.:: :: .: :::: 
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSR
       10        20        30        40        50        60        

       60         70          80        90          100            
pF1KE1 YEQP-LEVKNNSNLQRMGS--SESTDSGFCLDSPGPLD---SKENLENPM----------
        .   : ..  .. . ..:  :::.:.:.:.:::.:.:   .....:. .          
CCDS13 SRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTFEQAIQAASRIIRNE
       70        80        90       100       110       120        

                110       120       130               140       150
pF1KE1 ----RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------ENKENEAFEFKK
           ::..:.: .::: ::.: :. ..:   :  .  .          :.:::..: :: 
CCDS13 QFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGEDKENDGFVFKM
      130       140        150       160       170       180       

              160        170       180       190       200         
pF1KE1 PVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTA
       : .:.  .  :. .   .. . :.:: .:::  :  : .: . :  .. ::   .  .: 
CCDS13 PWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSPLALGRFSLTP
       190       200       210       220        230       240      

     210         220       230       240              250          
pF1KE1 TLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTTNLDNRC-KLF
       . .:  :::::::.:... ::... .:  : :: .::::        .   . ..: .::
CCDS13 AEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVMYSKCQRLF
        250       260        270       280       290       300     

     260       270       280       290       300       310         
pF1KE1 DSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSLSLA
        :::.  :  : .::: :: :... : ..:::.:..   :.:. . :. .  . .: :: 
CCDS13 RSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSKSLC
         310       320       330       340         350       360   

     320       330       340       350       360       370         
pF1KE1 SSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANLIKE
        .    :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:.:::.:.. .
CCDS13 HD---EIENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVDK
              370       380       390       400       410       420

     380       390       400       410       420        430        
pF1KE1 FVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVVFHCEFSSERG
       :::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: .  ::::..::::::::::
CCDS13 FVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSSERG
              430       440       450       460       470       480

      440       450       460       470       480       490        
pF1KE1 PRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFKEDL
       :::::..:::::  :.::.:.:::.:.::::::::: .  ..::: .::::.:: ::..:
CCDS13 PRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFKDEL
              490       500       510       520       530       540

      500       510       520    
pF1KE1 KKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       : :: :.:.::::.:.::. :::.  
CCDS13 KTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
              550       560      

>>CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20              (580 aa)
 initn: 1360 init1: 532 opt: 1268  Z-score: 1285.8  bits: 247.7 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 1398; 44.5% identity (69.5% similar) in 548 aa overlap (30-522:39-578)

                10        20        30         40        50        
pF1KE1  MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
                                     :.:. . :.. ::::.:: :: .: ::::.
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSE
       10        20        30        40        50        60        

       60            70                     80        90           
pF1KE1 YEQP----LEVKNNSNLQRMG-------------SSESTDSGFCLDSPGPLD---SKENL
         .     :  .. : : ...             ::::.:.:.:.:::.:.:   .....
CCDS13 TPKSQVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTF
       70        80        90       100       110       120        

      100                     110       120       130              
pF1KE1 ENPM--------------RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD------
       :. .              ::..:.: .::: ::.: :. ..:   :  .  .        
CCDS13 EQAIQAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASS
      130       140       150       160        170       180       

        140       150       160        170       180       190     
pF1KE1 --ENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPG
         :.:::..: :: : .:.  .  :. .   .. . :.:: .:::  :  : .: . :  
CCDS13 SGEDKENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVE
       190       200       210       220       230       240       

         200       210         220       230       240             
pF1KE1 NFIPLFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM------
       .. ::   .  .: . .:  :::::::.:... ::... .:  : :: .::::       
CCDS13 ELSPLALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEE
        250       260       270        280       290       300     

        250        260       270       280       290       300     
pF1KE1 -RTTNLDNRC-KLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNP
        .   . ..: .:: :::.  :  : .::: :: :... : ..:::.:..   :.:. . 
CCDS13 EKDLVMYSKCQRLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEA
         310       320       330       340       350         360   

         310       320       330       340       350       360     
pF1KE1 EKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIM
       :. .  . .: ::  .    :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :
CCDS13 EEPKARVLRSKSLCHD---EIENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETM
           370          380       390       400       410       420

         370       380       390       400       410       420     
pF1KE1 ASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKR
       ...:.:::.:.. .:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: .  ::
CCDS13 VALLTGKFSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKR
              430       440       450       460       470       480

          430       440       450       460       470       480    
pF1KE1 VIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPP
       ::..:::::::::::::::..:::::  :.::.:.:::.:.::::::::: .  ..::: 
CCDS13 VILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQ
              490       500       510       520       530       540

          490       500       510       520    
pF1KE1 SYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       .::::.:: ::..:: :: :.:.::::.:.::. :::.  
CCDS13 DYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
              550       560       570       580

>>CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20              (489 aa)
 initn: 1314 init1: 532 opt: 1156  Z-score: 1173.5  bits: 226.7 E(32554): 4.8e-59
Smith-Waterman score: 1296; 46.1% identity (70.6% similar) in 477 aa overlap (76-522:39-487)

          50        60        70        80        90          100  
pF1KE1 TVTMDQLQGLGSDYEQPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLD---SKENLENPM
                                     ::::.:.:.:.:::.:.:   .....:. .
CCDS74 QVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTFEQAI
       10        20        30        40        50        60        

                          110       120       130               140
pF1KE1 --------------RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------EN
                     ::..:.: .::: ::.: :. ..:   :  .  .          :.
CCDS74 QAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGED
       70        80        90        100       110       120       

              150       160        170       180       190         
pF1KE1 KENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIP
       :::..: :: : .:.  .  :. .   .. . :.:: .:::  :  : .: . :  .. :
CCDS74 KENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSP
       130       140       150       160       170        180      

     200       210         220       230       240       250       
pF1KE1 LFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVMRTTNLDNRC-
       :   .  .: . .:  :::::::.:... ::.               ::: .     .: 
CCDS74 LALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKD---------------LVMYS-----KCQ
        190       200       210                       220          

        260       270       280       290       300       310      
pF1KE1 KLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSL
       .:: :::.  :  : .::: :: :... : ..:::.:..   :.:. . :. .  . .: 
CCDS74 RLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSK
         230       240       250       260         270       280   

        320       330       340       350       360       370      
pF1KE1 SLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANL
       ::  .    :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:.:::.:.
CCDS74 SLCHDE---IENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNI
              290       300       310       320       330       340

        380       390       400       410       420        430     
pF1KE1 IKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVVFHCEFSS
       . .:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: .  ::::..:::::::
CCDS74 VDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSS
              350       360       370       380       390       400

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pF1KE1 ERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFK
       ::::::::..:::::  :.::.:.:::.:.::::::::: .  ..::: .::::.:: ::
CCDS74 ERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFK
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         500       510       520    
pF1KE1 EDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
       ..:: :: :.:.::::.:.::. :::.  
CCDS74 DELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
              470       480         

>>CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5                (400 aa)
 initn: 830 init1: 443 opt: 860  Z-score: 875.1  bits: 171.2 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 860; 49.5% identity (74.4% similar) in 273 aa overlap (254-523:134-396)

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE1 GENLKNEEETPSCMASLWTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEES
                                     .:  :. :::.  . .:  ::. :. ....
CCDS42 DKNPNLGEDQAEEISDELMEFSLKDQEAKVSRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNT
           110       120       130       140       150       160   

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pF1KE1 PPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRD--LIGDF
        : ..:. : .::       .  .    :....:: .    :: ..:..:  .  :::::
CCDS42 IPDKVKK-KYFSGQ------GKLRKGLCLKKTVSLCDI---TITQMLEEDSNQGHLIGDF
           170              180       190          200       210   

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pF1KE1 SKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVN
       ::   . ::.::::::::..:: .:..:.::: .::..: .::::::::: ::::.::.:
CCDS42 SKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALN
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KE1 LHMEEEVEDFLLKKPIVPTDG-KRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHY
       :. .::. .:.::::::: :  ::.:.:::::::::::::::: .::.::  :.:: :.:
CCDS42 LYSQEELFNFFLKKPIVPLDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYY
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pF1KE1 PELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSR
       ::::.:::::..:: . .  ::: :: ::::.: : .: . :..:..  ::.. ::. . 
CCDS42 PELYILKGGYRDFFPEYMELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIAL
           340       350       360       370       380       390   

              
pF1KE1 LKKL   
       : :    
CCDS42 LVKDMSP
           400

>>CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5                (473 aa)
 initn: 862 init1: 443 opt: 860  Z-score: 874.0  bits: 171.2 E(32554): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 865; 41.6% identity (66.1% similar) in 375 aa overlap (154-523:123-469)

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE1 SDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAPARM
                                     :..  :   .::..:     .:. .:   :
CCDS42 LDETGHLDSSGLQEVHLAGMNHDQHLMKCSPAQLLCSTPNGLDRG-----HRKRDA---M
            100       110       120       130            140       

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pF1KE1 LSSNERDSSEPGNFIPLFTPQ--SPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLW
        ::.    .. ::..        ::.:.         :  :: .   .:...      : 
CCDS42 CSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITT---------VPKLDKNPNLGEDQAEEISDELM
          150       160       170                180       190     

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pF1KE1 TAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKE
          :  . ... .:  :. :::.  . .:  ::. :. .... : ..:. : .::     
CCDS42 EFSLKDQEAKV-SRSGLYRSPSMPENLNRPRLKQVEKFKDNTIPDKVKK-KYFSG-----
         200        210       220       230       240              

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         .  .    :....:: .    :: ..:..:  .  :::::::   . ::.::::::::
CCDS42 -QGKLRKGLCLKKTVSLCDI---TITQMLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGKHQDLKY
       250       260          270       280       290       300    

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pF1KE1 ISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVP
       ..:: .:..:.::: .::..: .::::::::: ::::.::.::. .::. .:.:::::::
CCDS42 VNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELFNFFLKKPIVP
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pF1KE1 TDG-KRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQ
        :  ::.:.:::::::::::::::: .::.::  :.:: :.:::::.:::::..:: . .
CCDS42 LDTQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRCLREEDRSLNQYPALYYPELYILKGGYRDFFPEYM
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CCDS42 ELCEPQSYCPMHHQDHKTELLRCRSQSKVQEGERQLREQIALLVKDMSP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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