Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1482
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1482, 830 aa
1>>>pF1KE1482 830 - 830 aa - 830 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9276+/-0.000335; mu= 13.1076+/- 0.021
mean_var=100.4009+/-20.341, 0's: 0 Z-trim(116.9): 32 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.127999
statistics sampled from 28413 (28445) to 28413 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 13.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006010 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 830) 5541 1034.0 0
XP_011543028 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 5541 1034.0 0
XP_005273766 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 5541 1034.0 0
XP_016872578 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 805) 5374 1003.2 0
NP_006044 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 614) 4097 767.3 0
XP_016872579 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 532) 3542 664.8 2.8e-190
XP_005250451 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2569 485.2 5.2e-136
NP_570856 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2569 485.2 5.2e-136
XP_005250450 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2569 485.2 5.2e-136
NP_065683 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2569 485.2 5.2e-136
NP_570855 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2569 485.2 5.2e-136
NP_001123493 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 837) 2557 483.0 2.4e-135
NP_005168 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 116 ( 831) 2551 481.9 5.2e-135
XP_016880256 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 809) 2440 461.4 7.5e-129
XP_016880257 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 803) 2434 460.3 1.6e-128
XP_016880259 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 783) 2207 418.3 6.5e-116
XP_016880260 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 777) 2201 417.2 1.4e-115
XP_005257516 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 844) 2168 411.1 1e-113
NP_001123492 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 838) 2162 410.0 2.2e-113
XP_016880255 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 816) 2051 389.5 3.2e-107
XP_016880258 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 795) 2009 381.8 6.7e-105
XP_016880261 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1927 366.6 1.8e-100
XP_016880262 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1927 366.6 1.8e-100
XP_016880263 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 575) 1921 365.5 3.9e-100
XP_005257518 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 790) 1818 346.5 2.8e-94
XP_005257520 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 784) 1812 345.4 5.9e-94
XP_011523210 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 802) 1620 309.9 2.8e-83
NP_036595 (OMIM: 219200,278250,611716) V-type prot ( 856) 1217 235.5 7.6e-61
>>NP_006010 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPase 1 (830 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 5528.9 bits: 1034.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE1 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
790 800 810 820 830
>>XP_011543028 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-type p (830 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 5528.9 bits: 1034.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE1 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
790 800 810 820 830
>>XP_005273766 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-type p (830 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 5528.9 bits: 1034.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE1 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
790 800 810 820 830
>>XP_016872578 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-type p (805 aa)
initn: 5374 init1: 5374 opt: 5374 Z-score: 5362.5 bits: 1003.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5374; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPT
310 320 330 340 350 360
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pF1KE1 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA
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pF1KE1 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHR
610 620 630 640 650 660
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pF1KE1 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHT
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pF1KE1 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAF
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pF1KE1 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
:::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHW
790 800
>>NP_006044 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPase 1 (614 aa)
initn: 4097 init1: 4097 opt: 4097 Z-score: 4089.9 bits: 767.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4097; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (217-830:1-614)
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 WRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPF
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPF
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pF1KE1 LQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLAL
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pF1KE1 NQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNR
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pF1KE1 FTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENR
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pF1KE1 PAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSG
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pF1KE1 WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHM
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pF1KE1 AFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSI
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pF1KE1 LIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRRR
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pF1KE1 PADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLG
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pF1KE1 CVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVA
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pF1KE1 ILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
580 590 600 610
>>XP_016872579 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-type p (532 aa)
initn: 3542 init1: 3542 opt: 3542 Z-score: 3537.0 bits: 664.8 E(85289): 2.8e-190
Smith-Waterman score: 3542; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (299-830:1-532)
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 EVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRD
10 20 30
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 LPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNP
40 50 60 70 80 90
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 APYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLL
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 LMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVF
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 LGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 ETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPR
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 QEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNG
340 350 360 370 380 390
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 WSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLS
400 410 420 430 440 450
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pF1KE1 EVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEF
460 470 480 490 500 510
810 820 830
pF1KE1 QNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
::::::::::::::::::::::
XP_016 QNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
520 530
>>XP_005250451 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-type p (840 aa)
initn: 2009 init1: 779 opt: 2569 Z-score: 2562.8 bits: 485.2 E(85289): 5.2e-136
Smith-Waterman score: 2569; 49.6% identity (73.2% similar) in 836 aa overlap (1-825:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
: :.:::::. : :::: . ::: ::..:::::::.:.::: .:..:::.:: .:::::
XP_005 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::. . ::..:.. .: :. : .: ::... .. :.: ::... :::::.
XP_005 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPL-TPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGH---EPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGP-HQDLRVNFVAGAVEP
.. .: .:.. . : . : . . . ::. . : .. ...:.::...
XP_005 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKIT
.. ..:::::: ::: . .: :.. ::: ::: : :.: : :::. :::.::
XP_005 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQV
: :. :.: . : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..:
XP_005 DGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 HKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAH---RIP
.:::::: ::.:....:..:.::: : : : ...:: ...:: . :..: .
XP_005 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRAL-EQGMELSGSSMAPIMTTVQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLM
. :::. :::.:::.::.:::::::: :.:.:::::::::::::::::::: ::: .:
XP_005 SKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 FLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFP
.: :: :.: : : . ..::::.:::.::::.::::.::::::.:::.:::.. .::
XP_005 LLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 SGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLG-PYPFGIDPIWSLAANHLSFLNS
:.::: : .. :. . . .: ::: . ::..: ::::::::::.::.:.:.::::
XP_005 SSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE1 FKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKW
.:::::::::.:.:.:::.:..:::..: . ..:. .::. :.: :::::::..:.::
XP_005 YKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKW
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 LCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPS-NRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGT
: . . ::::::::::::::..: : : :: .:. ::. .::.:: :: .::
XP_005 CCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE1 PLHLLHRHRR-RLR-RRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVP
:. : ::. .:. : . :: : . : .: .: .. . :.:::. : :.
XP_005 PFILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSP-SSRSGQRTSADTHGALDDHGE-EFNF
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 SEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVA
..:..::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::: :: :..
XP_005 GDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIV
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 AVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATD
.: . :::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::: : :::.:::.:
XP_005 GVFI--IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHIL
780 790 800 810 820 830
830
pF1KE1 D
XP_005 DGTAEE
840
>>NP_570856 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPase 1 (840 aa)
initn: 2009 init1: 779 opt: 2569 Z-score: 2562.8 bits: 485.2 E(85289): 5.2e-136
Smith-Waterman score: 2569; 49.6% identity (73.2% similar) in 836 aa overlap (1-825:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE
: :.:::::. : :::: . ::: ::..:::::::.:.::: .:..:::.:: .:::::
NP_570 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
::. . ::..:.. .: :. : .: ::... .. :.: ::... :::::.
NP_570 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPL-TPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 QLHQLQLHAAVLRQGH---EPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGP-HQDLRVNFVAGAVEP
.. .: .:.. . : . : . . . ::. . : .. ...:.::...
NP_570 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKIT
.. ..:::::: ::: . .: :.. ::: ::: : :.: : :::. :::.::
NP_570 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQV
: :. :.: . : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..:
NP_570 DGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 HKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAH---RIP
.:::::: ::.:....:..:.::: : : : ...:: ...:: . :..: .
NP_570 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRAL-EQGMELSGSSMAPIMTTVQ
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start: Mon Nov 7 00:57:24 2016 done: Mon Nov 7 00:57:26 2016
Total Scan time: 13.880 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]