Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6432, 557 aa
  1>>>pF1KE6432 557 - 557 aa - 557 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6606+/-0.000896; mu= 16.7961+/- 0.054
 mean_var=80.1544+/-15.626, 0's: 0 Z-trim(106.7): 63  B-trim: 4 in 1/50
 Lambda= 0.143255
 statistics sampled from 9069 (9132) to 9069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  1.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14          ( 557) 3772 789.6       0
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14         ( 612) 3772 789.6       0
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 558) 2428 511.8 8.4e-145
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3         ( 557) 2359 497.6 1.6e-140
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3        ( 575) 2359 497.6 1.7e-140
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 633) 2105 445.1 1.2e-124
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8           ( 537) 1931 409.1 6.8e-114
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16       ( 548) 1835 389.3 6.5e-108
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 537) 1823 386.8 3.6e-107
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 542) 1823 386.8 3.6e-107
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12        ( 564) 1676 356.4 5.2e-98
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3         ( 553) 1575 335.6 9.8e-92
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3        ( 503) 1439 307.4 2.6e-83
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6          ( 593) 1406 300.6 3.4e-81
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6         ( 301)  984 213.2 3.5e-55


>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14               (557 aa)
 initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772  Z-score: 4214.3  bits: 789.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
              490       500       510       520       530       540

              550       
pF1KE6 PGAPRPCTLATTPSPSP
       :::::::::::::::::
CCDS96 PGAPRPCTLATTPSPSP
              550       

>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14              (612 aa)
 initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772  Z-score: 4213.7  bits: 789.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:56-612)

                                             10        20        30
pF1KE6                               MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHG
                                     :::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS61 GAGASGWSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHG
          30        40        50        60        70        80     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE6 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS61 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFH
          90       100       110       120       130       140     

              100       110       120       130       140       150
pF1KE6 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
         150       160       170       180       190       200     

              160       170       180       190       200       210
pF1KE6 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
         210       220       230       240       250       260     

              220       230       240       250       260       270
pF1KE6 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
         270       280       290       300       310       320     

              280       290       300       310       320       330
pF1KE6 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
         330       340       350       360       370       380     

              340       350       360       370       380       390
pF1KE6 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
         390       400       410       420       430       440     

              400       410       420       430       440       450
pF1KE6 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
         450       460       470       480       490       500     

              460       470       480       490       500       510
pF1KE6 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
         510       520       530       540       550       560     

              520       530       540       550       
pF1KE6 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
         570       580       590       600       610  

>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16             (558 aa)
 initn: 2424 init1: 1440 opt: 2428  Z-score: 2713.1  bits: 511.8 E(32554): 8.4e-145
Smith-Waterman score: 2428; 66.2% identity (86.2% similar) in 542 aa overlap (7-544:14-548)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE6        MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQ
                    : .: :      ::.::::.::. ::::: :::  : : :   .. :
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPC-----ASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ
               10        20             30        40        50     

            60        70        80        90        100       110  
pF1KE6 WVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTEC
       ::.: ::::.::   ::::.:....:.::: : ..:.:.:..  .. : ..: :::. ::
CCDS10 WVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMEC
          60        70        80        90       100       110     

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE6 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
       ::::::.: :::.::::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.:::::::
CCDS10 TLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKS
         120       130       140       150       160       170     

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE6 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
       :::.:.:..:.::. :::.::::::::::: :: :..:: :::::.  :::: ::.::::
CCDS10 DPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDS
         180       190       200       210       220       230     

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE6 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
        :::::::::..::.:::..  . ::  ::::.::::..:...::.::.::::.   ..:
CCDS10 RGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRV
         240       250        260        270       280       290   

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE6 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
       ..::::::::::: :::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::
CCDS10 YSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYD
           300       310       320       330       340       350   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE6 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
       ::::: :.::::::::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::
CCDS10 SDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNV
           360       370       380       390       400       410   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE6 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
       ::::..::. :  :.:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::
CCDS10 APIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVG
           420       430       440       450       460       470   

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE6 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
       ::::.::..:::::: :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::
CCDS10 NADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVE
           480       490       500       510       520       530   

            540          550       
pF1KE6 YYASQGISP---GAPRPCTLATTPSPSP
       ::. .:. :   :.:             
CCDS10 YYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP   
           540       550           

>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3              (557 aa)
 initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359  Z-score: 2636.1  bits: 497.6 E(32554): 1.6e-140
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:3-542)

               10              20        30        40        50    
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQW
           .:. . :  . :::       ..:::::.:.:. :::.:.:: :::.::. :  ::
CCDS30   MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQW
                 10        20        30        40        50        

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE6 VEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTL
        ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: :  .. .. ..  :::. ::::
CCDS30 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
       60        70        80        90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE6 GQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDP
       :::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.: : :::.::.::::::
CCDS30 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
      120       130        140       150       160       170       

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE6 FMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSG
       :.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :  : :: .:.:.::.:
CCDS30 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
       180       190       200       210       220       230       

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE6 KHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHT
       ::::::::::::.::. : :  :...::.::::::. ::::::.::::.:  : ..:.:.
CCDS30 KHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHS
       240       250         260       270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE6 FLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSD
       :::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::.:: ::: ::::::::
CCDS30 FLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSD
         300       310       320       330       340       350     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE6 KRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAP
       : ::::::::::::.. :::::::::. .::::  :.::. .:. :::..:::::::.::
CCDS30 KMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAP
         360       370       380       390       400       410     

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE6 IINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNA
       ::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.::.::::.::::::::
CCDS30 IIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNA
         420       430       440       450       460       470     

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE6 DFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYY
       :::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.:::: :::::: :::.::
CCDS30 DFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYY
         480       490       500       510       520       530     

          540       550       
pF1KE6 ASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
        ..::.:                
CCDS30 NGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP 
         540       550        

>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3             (575 aa)
 initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359  Z-score: 2635.9  bits: 497.6 E(32554): 1.7e-140
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:21-560)

                               10              20        30        
pF1KE6                 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLT
                           .:. . :  . :::       ..:::::.:.:. :::.:.
CCDS75 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
               10        20        30        40        50        60

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE6 KPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGA
       :: :::.::. :  :: ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: :  .. 
CCDS75 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
               70        80        90       100       110       120

      100       110       120       130       140       150        
pF1KE6 TSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTF
       .. ..  :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.:
CCDS75 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAF
              130       140       150        160       170         

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE6 RAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCD
        : :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :
CCDS75 NARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGD
     180       190       200       210       220       230         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE6 VHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKS
         : :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : :  :...::.::::::. ::::::.
CCDS75 PDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
     240       250       260       270         280       290       

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE6 SGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYL
       ::::.:  : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::
CCDS75 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
       300       310       320       330       340       350       

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE6 QALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYR
       .:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .::::  :.::. .:.
CCDS75 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
       360       370       380       390       400       410       

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE6 RCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVR
        :::..:::::::.::::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.
CCDS75 SCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVH
       420       430       440       450       460       470       

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE6 ASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSAL
       ::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.::
CCDS75 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
       480       490       500       510       520       530       

      520       530       540       550       
pF1KE6 AKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
       :: :::::: :::.:: ..::.:                
CCDS75 AKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP 
       540       550       560       570      

>>CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16             (633 aa)
 initn: 2358 init1: 1440 opt: 2105  Z-score: 2351.6  bits: 445.1 E(32554): 1.2e-124
Smith-Waterman score: 2158; 59.0% identity (76.9% similar) in 571 aa overlap (53-544:55-623)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KE6 ELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFE
                                     :::.: ::::.::   ::::.:....:.::
CCDS10 ELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFE
           30        40        50        60        70        80    

             90        100       110                               
pF1KE6 EKQPVQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTECTLGQ-------------------------
       : : ..:.:.:..  .. : ..: :::. ::::::                         
CCDS10 EVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQPAQKWLLQVVMRVSVDVLGPAGHCA
           90       100       110       120       130       140    

                                                          120      
pF1KE6 --------------------------------------------------IVSQTKVTKP
                                                         ::.: :::.:
CCDS10 KHFLCCTESSHLARTGPSFLLRYDDLCLPWATAGAVRWWTCRGGHTQGWQIVAQKKVTRP
          150       160       170       180       190       200    

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE6 LLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQS
       :::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.::::::::::.:.:..:.::.
CCDS10 LLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFLELYRVNDDQG
          210       220       230       240       250       260    

        190       200       210       220       230       240      
pF1KE6 DQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTF
        :::.::::::::::: :: :..:: :::::.  :::: ::.:::: :::::::::..::
CCDS10 LQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKHDFIGEFSTTF
          270       280       290       300       310       320    

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE6 QEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQIS
       .:::..  . ::  ::::.::::..:...::.::.::::.   ..:..::::::::::: 
CCDS10 EEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDYIMGGCQIH
          330         340       350       360       370       380  

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE6 FTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARI
       :::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::::::: :.::::::
CCDS10 FTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFSALGFGARI
            390       400       410       420       430       440  

        370       380       390       400       410       420      
pF1KE6 PPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQRE
       ::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::::::..::. :  :
CCDS10 PPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISKVARVAAAE
            450       460       470       480       490       500  

        430       440       450       460       470       480      
pF1KE6 QSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDD
       .:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::..:::::
CCDS10 ESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTDMQVLDGDD
            510       520       530       540       550       560  

        490       500       510       520       530       540      
pF1KE6 GPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISP---GA
       : :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::::. .:. :   :.
CCDS10 GVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRGLPPRSLGV
            570       580       590       600       610       620  

           550       
pF1KE6 PRPCTLATTPSPSP
       :             
CCDS10 PAGEASPGCTP   
            630      

>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8                (537 aa)
 initn: 1907 init1: 1178 opt: 1931  Z-score: 2158.2  bits: 409.1 E(32554): 6.8e-114
Smith-Waterman score: 1931; 54.2% identity (77.6% similar) in 531 aa overlap (20-548:7-532)

               10        20        30        40         50         
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
                          ..: : ::: .:::.:  .:  : :::.   : .:: ::::
CCDS62              MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVER
                            10        20        30        40       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
       :: ...: .: ::... ..:.::  : ..: :.: .. .    .: :::  :::::::::
CCDS62 TERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVS
        50        60        70        80        90       100       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
       . :.:.::..:.:. :::..::: :::..  :  : . ..: ::::::::.::::..:..
CCDS62 SKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFH
       110       120       130        140       150       160      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
       : . : .  .: ::::::::::: :.::..::.:::  :. . .:   ::::..:.::.:
CCDS62 KQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLI
        170       180       190       200       210       220      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
       : : .:. ...:  :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . :: .    ::::::
CCDS62 GTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYI
        230         240       250       260       270       280    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE6 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
       :::::..:::..:::.::::::: .::: .::   :.:: :: .:: . ::::.:: :::
CCDS62 MGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPA
          290       300       310       320       330       340    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE6 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
       :::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::::: .::::.:
CCDS62 FGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHV
          350       360       370       380       390       400    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE6 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
       :. :    .   :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::::::.:::: :
CCDS62 ARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAM
          410       420       430       440       450       460    

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE6 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
       ..:::: : :: : :  : ::::::::::.:..:   :::.:::::.:.::: :. .  .
CCDS62 EFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKL
          470       480       490       500       510       520    

     540        550       
pF1KE6 SPGAPR-PCTLATTPSPSP
        :  :. : :         
CCDS62 LP--PKNPATKQQKQ    
            530           

>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16            (548 aa)
 initn: 1829 init1: 1154 opt: 1835  Z-score: 2050.9  bits: 389.3 E(32554): 6.5e-108
Smith-Waterman score: 1835; 50.8% identity (76.3% similar) in 545 aa overlap (4-546:10-547)

                     10         20        30        40         50  
pF1KE6       MSDPEMGWVPE-PQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDE
                :  : .:  ::  .    .::: :: ..:::::. .:  : :::.   .. 
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCV---CKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFT-ENNG
               10        20           30        40        50       

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE6 QWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTEC
       .:.: .:::.  .  .:.::. ..:.: ::: : ..: .:: . ..    .  :::.  :
CCDS10 RWIEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSC
         60        70        80        90       100       110      

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE6 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
       .:: :::. :.:.:::: : : :::. :::.:.:.:  :  . :.. . .::.::::.::
CCDS10 SLGTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSD-NRVITLSLAGRRLDKKDLFGKS
        120       130       140       150        160       170     

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE6 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
       :::.:.:: ..: . .:: ::::.: .:.: :.:: . : :::. :...:.. . ::::.
CCDS10 DPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDN
         180       190       200       210       220       230     

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE6 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
       .: ::::::: .. ..: :  :  .  ....::::: . ::::::.:: ..: .: ... 
CCDS10 DGGHDFIGEFQTSVSQMCE--ARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRD
         240       250         260       270       280       290   

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE6 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
       ..:::::.::::. :::.::::::::.: . .::: ..:   :.::.:. ::: : ::::
CCDS10 YSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYD
           300       310       320       330       340       350   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE6 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
       ::: :::.::::..::...:::.:::::.: :: :  ..:.  .:  :::.:..::::: 
CCDS10 SDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNF
           360       370       380       390       400       410   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE6 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
       .::.:.::. : .  .   ::.: .::..::::.::: ::: :.:.::.:::::::::::
CCDS10 SPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVG
           420       430       440       450       460       470   

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE6 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
       ::::. :..::::.  ::   :  ::::::::::::.:..::  .::: ::::.:.:::.
CCDS10 NADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQ
           480       490       500       510       520       530   

            540       550       
pF1KE6 YYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
       :.  ... :   .:           
CCDS10 YFKHKNLPPTNSEPA          
           540                  

>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20              (537 aa)
 initn: 1746 init1: 1139 opt: 1823  Z-score: 2037.6  bits: 386.8 E(32554): 3.6e-107
Smith-Waterman score: 1823; 50.8% identity (76.2% similar) in 537 aa overlap (22-557:8-535)

               10        20        30        40         50         
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
                            :.: .::  :.:.:  .:  : ::::.  .  .:.:. :
CCDS13               MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGR
                             10        20        30        40      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
       :: .:.:::: ::..: ::: ::  : ..: ..: .. .   :.: :::..::.::::::
CCDS13 TERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVS
         50        60        70        80        90       100      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
       .  .: ::.:: :: ::..:::. :.:..  :  : .  .: .::.::...:::::.:..
CCDS13 SQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKD-NRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFF
        110       120       130        140       150       160     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
       . . : . .::.:.::.::::::.:. : . .. .:. .   :..    ::::.:.::.:
CCDS13 RQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLI
          170       180       190       200       210       220    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
       : : ... ..:   : :..   ..::.:. ..:::.::.:::. .  : ::  ..::::.
CCDS13 GTFHTSLAQLQ---AVPAE---FECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYV
          230          240          250       260       270        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE6 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
       ::::::.:::..:::.::::: : .::: :::   :.::.:: .::.. ::::::: :::
CCDS13 MGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPA
      280       290       300       310       320       330        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE6 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
       :::::..::...:::.::.::.: :: :  :.:.. .::. :::..:::::: :::::.:
CCDS13 FGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHV
      340       350       360       370       380       390        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE6 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
       :. : .    : :..: .::.::::.:.:.  :: :.:::: ::::.::::::.:::  :
CCDS13 ARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAM
      400       410       420       430       440       450        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE6 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
       . ::.: :::.   :  ::::::::::.: :..:   :::. :::::: :.: :. .:: 
CCDS13 EQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGW
      460       470       480       490       500       510        

     540       550         
pF1KE6 SPGAPRPCTLATTPSPSP  
       .:  : : . :  :. .:  
CCDS13 APLKPLPPS-AKDPAQAPQA
      520        530       

>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20              (542 aa)
 initn: 1746 init1: 1139 opt: 1823  Z-score: 2037.6  bits: 386.8 E(32554): 3.6e-107
Smith-Waterman score: 1823; 50.8% identity (76.2% similar) in 537 aa overlap (22-557:13-540)

               10        20        30        40         50         
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
                            :.: .::  :.:.:  .:  : ::::.  .  .:.:. :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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