FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5504, 420 aa 1>>>pF1KE5504 420 - 420 aa - 420 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6832+/-0.000311; mu= 15.0389+/- 0.019 mean_var=71.2715+/-14.628, 0's: 0 Z-trim(117.1): 24 B-trim: 150 in 1/48 Lambda= 0.151921 statistics sampled from 28726 (28750) to 28726 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 9.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004842 (OMIM: 605631) napsin-A preproprotein [H ( 420) 2892 642.9 4.5e-184 XP_011525842 (OMIM: 605631) PREDICTED: napsin-A is ( 420) 2892 642.9 4.5e-184 XP_016883001 (OMIM: 605631) PREDICTED: napsin-A is ( 411) 2010 449.5 6.9e-126 NP_001901 (OMIM: 116890) cathepsin E isoform a pre ( 396) 1168 265.0 2.4e-70 XP_011507546 (OMIM: 116890) PREDICTED: cathepsin E ( 401) 1155 262.1 1.7e-69 NP_000528 (OMIM: 179820,267430,613092) renin prepr ( 406) 1048 238.7 2e-62 NP_055039 (OMIM: 169730) pepsin A-5 preproprotein ( 388) 997 227.5 4.5e-59 NP_001073275 (OMIM: 169710) pepsin A-3 preproprote ( 388) 993 226.6 8.3e-59 XP_016854970 (OMIM: 169720) PREDICTED: pepsin A-4 ( 388) 992 226.4 9.7e-59 NP_001073276 (OMIM: 169720) pepsin A-4 preproprote ( 388) 992 226.4 9.7e-59 NP_002621 (OMIM: 169740) gastricsin isoform 1 prep ( 388) 902 206.7 8.4e-53 NP_001900 (OMIM: 116840,610127) cathepsin D prepro ( 412) 901 206.5 1e-52 NP_683865 (OMIM: 116890) cathepsin E isoform b pre ( 363) 728 168.5 2.4e-41 XP_011507547 (OMIM: 116890) PREDICTED: cathepsin E ( 368) 715 165.7 1.7e-40 NP_001304260 (OMIM: 116890) cathepsin E isoform c ( 288) 653 152.1 1.7e-36 NP_001159896 (OMIM: 169740) gastricsin isoform 2 p ( 315) 537 126.7 8.5e-29 NP_620476 (OMIM: 605668) beta-secretase 2 isoform ( 468) 301 75.0 4.4e-13 NP_620477 (OMIM: 605668) beta-secretase 2 isoform ( 396) 298 74.3 6e-13 NP_036237 (OMIM: 605668) beta-secretase 2 isoform ( 518) 298 74.4 7.6e-13 NP_036236 (OMIM: 604252) beta-secretase 1 isoform ( 501) 255 64.9 5.1e-10 XP_016883803 (OMIM: 605668) PREDICTED: beta-secret ( 423) 234 60.3 1.1e-08 NP_620428 (OMIM: 604252) beta-secretase 1 isoform ( 476) 187 50.0 1.5e-05 NP_620429 (OMIM: 604252) beta-secretase 1 isoform ( 432) 169 46.1 0.00021 NP_620427 (OMIM: 604252) beta-secretase 1 isoform ( 457) 164 45.0 0.00047 >>NP_004842 (OMIM: 605631) napsin-A preproprotein [Homo (420 aa) initn: 2892 init1: 2892 opt: 2892 Z-score: 3425.6 bits: 642.9 E(85289): 4.5e-184 Smith-Waterman score: 2892; 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NP_001 MKTLLLLLLVLLELGEAQGSLHRVPLRRHPSLKKKLRARSQLSEFWKSHNLDMIQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCHFFSVP . :. :: :: :..::: :..:.::::::: :::::::::::: : : NP_001 FTESCSMDQSAKEPLINYLDMEYFGTISIGSPPQNFTVIFDTGSSNLWVPSVYCT--SPA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 CWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGGIKGASVIFGEALWEPS : : ::.:. ::... : .:.:::::: ..::.. :.... :. .. :::.. ::. NP_001 CKTHSRFQPSQSSTYSQPGQSFSIQYGTGSLSGIIGADQVSVEGLTVVGQQFGESVTEPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LVFAFAHFDGILGLGFPILSVEGVRPPMDVLVEQGLLDKPVFSFYLNRDPEEPDGGELVL .:. :.::::::::.: :.: :: : .: .. :.:.: :.:: :.. .:: :.::.. NP_001 QTFVDAEFDGILGLGYPSLAVGGVTPVFDNMMAQNLVDLPMFSVYMSSNPEGGAGSELIF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 GGSDPAHYIPPLTFVPVTVPAYWQIHMERVKVGPGLTLCAKGCAAILDTGTSLITGPTEE :: : .:. :..:::: ::::: .. ..:: . .:..:: ::.::::::::::... 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XP_011 MKTLLLLLLVLLELGEAQGSLHRVPLRRHPSLKKKLRARSQLSEFWKSHNLDMIQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCHFFSVP . :. :: :: :..::: :..:.::::::: :::::::::::: : : XP_011 FTESCSMDQSAKEPLINYLDMEYFGTISIGSPPQNFTVIFDTGSSNLWVPSVYCT--SPA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 CWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGG--IKGASVI---FGEA : : ::.:. ::... : .:.:::::: ..::.. :... . ..: .:. :::. XP_011 CKTHSRFQPSQSSTYSQPGQSFSIQYGTGSLSGIIGADQVSAFSYQVEGLTVVGQQFGES 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LWEPSLVFAFAHFDGILGLGFPILSVEGVRPPMDVLVEQGLLDKPVFSFYLNRDPEEPDG . ::. .:. :.::::::::.: :.: :: : .: .. :.:.: :.:: :.. .:: : XP_011 VTEPGQTFVDAEFDGILGLGYPSLAVGGVTPVFDNMMAQNLVDLPMFSVYMSSNPEGGAG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 GELVLGGSDPAHYIPPLTFVPVTVPAYWQIHMERVKVGPGLTLCAKGCAAILDTGTSLIT .::..:: : .:. :..:::: ::::: .. ..:: . .:..:: ::.:::::::: XP_011 SELIFGGYDHSHFSGSLNWVPVTKQAYWQIALDNIQVGGTVMFCSEGCQAIVDTGTSLIT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GPTEEIRALHAAIGGIPLLAGEYIILCSEIPKLPAVSFLLGGVWFNLTAHDYVIQTTRNG ::...:. :. :::. :. ::: . :... .: :.: ..:: ..:. :.. .: XP_011 GPSDKIKQLQNAIGAAPV-DGEYAVECANLNVMPDVTFTINGVPYTLSPTAYTLLDFVDG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VRLCLSGFQALDVPPPAGPFWILGDVFLGTYVAVFDRGDMKSSARVGLARARTRGADLGW ...: ::::.::. :::::.:::::::. . .:::::. ::::: : XP_011 MQFCSSGFQGLDIHPPAGPLWILGDVFIRQFYSVFDRGN----NRVGLAPAVP 360 370 380 390 400 420 pF1KE5 GETAQAQFPG >>NP_000528 (OMIM: 179820,267430,613092) renin prepropro (406 aa) initn: 470 init1: 470 opt: 1048 Z-score: 1241.6 bits: 238.7 E(85289): 2e-62 Smith-Waterman score: 1048; 42.9% identity (68.6% similar) in 382 aa overlap (26-402:36-406) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSPPPLLQPLLLLLPLLNVEPSGATLIRIPLHRVQPGRRTLNLLR-G--WREPAE : :.: : . .: ... : : : .: . NP_000 RMPRWGLLLLLWGSCTFGLPTDTTTFKRIFLKRMPSIRESLKERGVDMARLGPEWSQPMK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LPKLGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCHFF :: . . : :.:: :.::.::::.:::::.: :.:::::::.:::: .: . NP_000 RLTLGNTTSS-----VILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 SVPCWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGGIKGASVIFGEALW . : :. :: . :::.. :::.....:.:: :.:.::.: .:.::: .. .:::. NP_000 YTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGIT-VTQMFGEVTE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 EPSLVFAFAHFDGILGLGFPILSVEGVRPPMDVLVEQGLLDKPVFSFYLNRDPEEPD--G :.: : .:.:::..:.:: .. : : .: .. ::.: . ::::: ::: :. . : NP_000 MPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 GELVLGGSDPAHYIPPLTFVPVTVPAYWQIHMERVKVGPGLTLCAKGCAAILDTGTSLIT :..::::::: :: . .. . . :::.:. :.:: . :: :: :..:::.: :. NP_000 GQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYIS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GPTEEIRALHAAIGGIPLLAGEYIILCSEIPKLPAVSFLLGGVWFNLTAHDYVIQTTRNG : : :. : :.:. : .:.. :.: : :: .:: ::: ..::. :::.: . .. NP_000 GSTSSIEKLMEALGAKKRLF-DYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VRLCLSGFQALDVPPPAGPFWILGDVFLGTYVAVFDRGDMKSSARVGLARARTRGADLGW .:: ...:.:.:::.:: : :: .:. . . ::: . :.:.: :: NP_000 KKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDR----RNNRIGFALAR 360 370 380 390 400 420 pF1KE5 GETAQAQFPG >>NP_055039 (OMIM: 169730) pepsin A-5 preproprotein [Hom (388 aa) initn: 933 init1: 291 opt: 997 Z-score: 1181.5 bits: 227.5 E(85289): 4.5e-59 Smith-Waterman score: 1002; 41.9% identity (67.2% similar) in 399 aa overlap (11-399:4-385) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSPPPLLQPLLLLLPLLNVEPSGATLIRIPLHRVQPGRRTLN---LLRGWRE-----PAE :::: :. . : . ..:: : . ::::. ::. . . ::. NP_055 MKWLLLLGLVAL--SECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPAR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 --LPKLGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCH .:. ::. :. :: :: :..::: ::.::: :.:::.:::::::::::: : NP_055 KYFPQWEAPTLVDEQ---PLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCS 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FFSVPCWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGGIKGASVIFGEA :. : :.::.:. ::..:... .: :::: . :::. : . .:::. .. ::: . 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NP_001 MKWLLLLGLVAL--SECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPAR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 --LPKLGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCH .:. ::. :. :: :: :..::: ::.::: :.:::.:::::::::::: : NP_001 KYFPQWEAPTLVDEQ---PLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCS 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FFSVPCWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGGIKGASVIFGEA :. : :.::.:. ::..:... .: :::: . :::. : . .:::. .. ::: . 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NP_001 GPTSPIANIQSDIGASENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGS- 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VRLCLSGFQALDVPPPAGPFWILGDVFLGTYVAVFDRGDMKSSARVGLARARTRGADLGW :.::::....: .: .:::::::. : .::::.. .:::: NP_001 ---CISGFQGMNLPTESGELWILGDVFIRQYFTVFDRAN----NQVGLAPVA 350 360 370 380 420 pF1KE5 GETAQAQFPG 420 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 07:41:07 2016 done: Tue Nov 8 07:41:09 2016 Total Scan time: 9.650 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]