FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1334, 377 aa 1>>>pF1KE1334 377 - 377 aa - 377 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9222+/-0.000861; mu= 13.2351+/- 0.052 mean_var=75.6349+/-14.994, 0's: 0 Z-trim(106.8): 43 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.147473 statistics sampled from 9172 (9215) to 9172 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 2.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 377) 2531 548.0 5.1e-156 CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 321) 2168 470.7 7.9e-133 CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 1860 405.2 4.8e-113 CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 1843 401.6 6.7e-112 CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 1843 401.6 6.9e-112 CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 1577 345.0 5.2e-95 CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 1236 272.5 4.5e-73 CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 1134 250.8 1.6e-66 CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 1126 249.0 4.2e-66 CCDS8331.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 263) 695 157.3 1.5e-38 CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 314 76.3 5.9e-14 CCDS8332.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 88) 287 70.3 7.6e-13 >>CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 (377 aa) initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 2914.5 bits: 548.0 E(32554): 5.1e-156 Smith-Waterman score: 2531; 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CCDS44 LR-KNRVAHQMFTQTLLNMDQKITSVKPLLQIEAGPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKK 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLT .::::::.:..: :::::::::.::::: :::: .::.:::.::.:: :.: :.::: CCDS44 NHDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNGAHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 ARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNN ::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::.: .::::::::::::::::: CCDS44 ARDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNN 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDF :::::::::::::::::::: ..:::::::::::: . ::::::::: :.: : : :::: CCDS44 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPASLALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDF 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMP ::::::::::::::: : ::::::.::::::::: :::: :.:::::.:::.:.:::::: CCDS44 IAFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYSCCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMP 300 310 320 330 340 350 370 pF1KE1 TIERLSMTRYFYLFPGN :::: ..:: ::::::: CCDS44 TIERATLTRDFYLFPGN 360 370 >>CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (434 aa) initn: 1700 init1: 1645 opt: 1843 Z-score: 2122.4 bits: 401.6 E(32554): 6.7e-112 Smith-Waterman score: 1843; 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81.1% identity (92.0% similar) in 286 aa overlap (92-377:7-292) 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 QEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKER .:::::::.:::. :::::.::::::::. CCDS44 MAALLQIEAGPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKKN 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTA .::::::.:..: :::::::::.::::: :::: .::.:::.::.:: :.: :.:::: CCDS44 HDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNGAHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLTA 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 RDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNR :::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::.: .:::::::::::::::::: CCDS44 RDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNNR 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFI ::::::::::::::::::: ..:::::::::::: . ::::::::: :.: : : ::::: CCDS44 NCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPASLALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDFI 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPT :::::::::::::: : ::::::.::::::::: :::: :.:::::.:::.:.::::::: CCDS44 AFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYSCCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMPT 220 230 240 250 260 270 370 pF1KE1 IERLSMTRYFYLFPGN ::: ..:: ::::::: CCDS44 IERATLTRDFYLFPGN 280 290 >>CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 (383 aa) initn: 1228 init1: 1109 opt: 1236 Z-score: 1425.3 bits: 272.5 E(32554): 4.5e-73 Smith-Waterman score: 1236; 51.0% identity (73.4% similar) in 384 aa overlap (1-377:1-383) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS ::. ..: ..:.:. ..:.::.:.. ::: .: :: : .: . ::.:.. :: CCDS83 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLNKEEMEKVKRENATVMDKTRALIDS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 MQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQ-------ISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEE . : .: :. . . . :. .: .: . : : :: : .::: :: CCDS83 VIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSAAPQAVQDNPAMPTSSG-SEGNVKLCSLEE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 FLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSV :. :... ::::: ....:::::::::: ::: .: :.::. ::::: ::..: ::: CCDS83 AQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDT ::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: ::::: :.:. ::.: .. CCDS83 DVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGIREGICGKKHSEQVPDILQLNA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 IFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYK ::...:..:: ::::::::::.::::: . : .: .:: . : ..:..:.::. : CCDS83 IFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSVGVSGNLSLPTTEEFEDDAIKK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 THVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETP .:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:: .:.:. : .::.::::. ::: : CCDS83 AHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQP 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 RAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN ..::::: ::...:: ::::::. CCDS83 DGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH 360 370 380 >>CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 (404 aa) initn: 1228 init1: 1109 opt: 1134 Z-score: 1307.7 bits: 250.8 E(32554): 1.6e-66 Smith-Waterman score: 1208; 49.1% identity (71.1% similar) in 405 aa overlap (1-377:1-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS ::. ..: ..:.:. ..:.::.:.. ::: .: :: : .: . ::.:.. :: CCDS83 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLNKEEMEKVKRENATVMDKTRALIDS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 M----------------QEKQRMAGQMLL---QT---FFNIDQIS------PNKKAHPNM . .: . .:: . : :: ..:... . : .: . CCDS83 VIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSADQTSGNYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDN 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 EAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPR : : :: : .::: :: :. :... ::::: ....:::::::::: ::: .: : CCDS83 PAMPTSSG-SEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRR 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 NGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGI .::. ::::: ::..: :::::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: CCDS83 TGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGI 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 LEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSP ::::: :.:. ::.: ..::...:..:: ::::::::::.::::: . : .: .:: CCDS83 REGICGKKHSEQVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 ASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQK . : ..:..:.::. :.:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:: .:. 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CCDS83 MADKVLKEKR---KLFIRSMGEAPQAVQD- 10 20 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 KAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEF .: : : :. : .::: :: :. :... ::::: ....:::::::::: :: CCDS83 --NPAM----PTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEF 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 DHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLV : .: :.::. ::::: ::..: :::::..:::: :: . :.::: :::::.::::::: CCDS83 DSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 LMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGEL .::::: ::::: :.:. ::.: ..::...:..:: ::::::::::.::::: CCDS83 FMSHGIREGICGKKHSEQVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRG------ 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 WVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQL ::::: ::::.:: .: CCDS83 ------------------------------------------DNVSWRHPTMGSVFIGRL 200 210 330 340 350 360 370 pF1KE1 ITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN : .:.:. : .::.::::. ::: : ..::::: ::...:: ::::::. CCDS83 IEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH 220 230 240 250 260 377 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 00:58:39 2016 done: Mon Nov 7 00:58:39 2016 Total Scan time: 2.470 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]