FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1573, 960 aa 1>>>pF1KE1573 960 - 960 aa - 960 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5766+/-0.0013; mu= 0.3189+/- 0.077 mean_var=231.9300+/-47.601, 0's: 0 Z-trim(107.5): 91 B-trim: 72 in 1/53 Lambda= 0.084216 statistics sampled from 9507 (9587) to 9507 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 3.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32278.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 ( 960) 6387 790.4 0 CCDS32279.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 ( 856) 4558 568.1 2.5e-161 CCDS7407.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1780) 771 108.2 1.5e-22 CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820) 766 107.6 2.3e-22 CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 454 69.7 5.7e-11 CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 454 69.7 5.7e-11 CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 454 69.7 5.7e-11 CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 454 69.7 5.8e-11 >>CCDS32278.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 (960 aa) initn: 6387 init1: 6387 opt: 6387 Z-score: 4210.0 bits: 790.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6387; 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CCDS74 ---------QEKLFGPVKSS---QDVSLDSNS---NSKILNVKRATISWENSLEDLMEDE 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 NLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHMQGKLNEKEKMISGQKLEIERL--EK .: . . . . :. : : ...:... .::. . .::.:... . ..: :: CCDS74 DLVEELENAEETQNVETKLLDEDLDKTL--EENKAFISHEEKRKLLDLIEDLKKKLINEK 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KNK-TLEYKI--EILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKLQRQFSDKRRLEARLQGMVTE :.: :::.:: :. .. : . . . .... : . . :.. . .::: : .. .: . CCDS74 KEKLTLEFKIREEVTQEFTQYWAQREADFKETLLQEREILEE--NAERRL-AIFKDLVGK 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 pF1KE1 TTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTEPKTE----KPERPSRERDRE . .: . . : ..: .. . :..:.:: ... : : : : .:: . . CCDS74 CDTR--EEAAKDICATKVETEEATACLELKFNQIKAELAKTKGELIKTKEELKKRENESD 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE1 KVTQR-SVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLMSQPQ--LHRRSNSCSSI-SVASCISEWEQK .. :. .: . . ... : .. : ...: . ... .: : . .. .: ..: CCDS74 SLIQELETSNKKIITQNQRIKELIN---IIDQKEDTINEFQNLKSHMENTFKC----NDK 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 pF1KE1 IPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRRRGMYWTEGREVVPTFRNEIEIEEDHCG : . .. : . . : .::. : :.:.: CCDS74 ADTSSLIINNKLICNETVEVPKDSKSKICSERKRVNENELQQDEPPAKKGSIHVSSAITE 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 840 850 pF1KE1 RLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPHAITVSVANEKAL CCDS74 DQKKSEEVRPNIAEIEDIRVLQENNEGLRAFLLTIENELKNEKEEKAELNKQIVHFQQEL 820 830 840 850 860 870 >>CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820 aa) initn: 888 init1: 368 opt: 766 Z-score: 515.1 bits: 107.6 E(32554): 2.3e-22 Smith-Waterman score: 868; 30.6% identity (64.1% similar) in 651 aa overlap (23-641:56-667) 10 20 30 40 pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQEC----CIEVIN :: . : :.::. ..: :..... CCDS60 SEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQVCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILD 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 NTTVQLHTPEGY--RLNRNGDYKETQ-YSFKQVFGTHTTQKELFD-VVANPLVNDLIHGK . :: :. :. ::..... . .: .::..::: :::::.:. . .: :.::..:. CCDS60 SQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFGPATTQKEFFQGCIMQP-VKDLLKGQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 pF1KE1 NGLLFTYGVTGSGKTHTMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGS----------FQAKRYVFK . :.::::.:.::::.:. :. . :.::: :...:.:. ....:. CCDS60 SRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLFDSLQERLYTKMNLKPHRSREYLRL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 pF1KE1 SNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMPNPKTSSSKRQVD-----PEFADMITVQEFCKAEE :..... .: . .:::.. :. .. : . .. .. :: . ..... .:. CCDS60 SSEQEKEEIASK-SALLRQIKEVTVHNDSDDTLYGSLTNSLNISEFEE--SIKDYEQANL 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 VDEDSV-YGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFDPIKPKPPQSKLLR--EDKNHNMYVAGCT .:. ..:.::..::::.::::: : :.. : . :.:: .: . .. 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CCDS60 ---------QEKLFGPVKSSQ---DVSLDSNS---NSKILNVKRATISWENSLEDLMEDE 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 NLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHMQGKLNEKEKMISGQKLEIERL--EK .: . . . . :. : : ...:... .::. . .::.:... . ..: :: CCDS60 DLVEELENAEETQNVETKLLDEDLDKTL--EENKAFISHEEKRKLLDLIEDLKKKLINEK 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KNK-TLEYKI--EILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKLQRQFSDKRRLEARLQGMVTE :.: :::.:: :. .. : . . . .... : . . :.. . .::: : .. .: . CCDS60 KEKLTLEFKIREEVTQEFTQYWAQREADFKETLLQEREILEE--NAERRL-AIFKDLVGK 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 TTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTEPKTEKPERPSRERDREKVTQ . .: . . : ..: . CCDS60 CDTR--EEAAKDICATKVETEETHNYVGFEDIIDSLQDNVADIKKQAEIAHLYIASLPDP 650 660 670 680 690 700 >>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749 aa) initn: 663 init1: 165 opt: 454 Z-score: 310.5 bits: 69.7 E(32554): 5.7e-11 Smith-Waterman score: 548; 25.1% identity (51.6% similar) in 900 aa overlap (26-901:6-751) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQE----CCIEVINNTTVQLHT : : ::::.. . : : .:. .: :: :: CCDS47 MSDTKVKVAVRVRPMNRRELELNTKCVVEMEGNQTV-LHP 10 20 30 60 70 80 90 100 pF1KE1 PEGYRLNRNGDYKETQ-YSFKQVFGT----HTT----QKELFDVVANPLVNDLIHGKNGL : . ...:. : . ..: : . .:: :. .: ... ... ..: :. CCDS47 PPSN--TKQGERKPPKVFAFDYCFWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNAC 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LFTYGVTGSGKTHTMTGSPGEGGLLPR-CLDMIFNSIGSFQAKRYVFKSNDRNSMDIQCE .:.:: :::::. .: : . ::.:: : : CCDS47 IFAYGQTGSGKSFSMMGHAEQLGLIPRLC-----------------------------C- 100 110 120 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VDALLERQKREAMPNPKTSSSKRQVDPEFADMITVQEFCKAEEVDEDSVYGVFVSYIEIY ::..: :.... .:.... : :::.::: CCDS47 --ALFKR-------------------------ISLEQ-------NESQTFKVEVSYMEIY 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 NNYIYDLLEEVPFDPIKPKPPQSKLLREDKNHNMYVAGCTEVEVKSTEEAFEVFWRGQKK :. . ::: :: . :: .:: : . :: : ... : : :. .. .:.:. CCDS47 NEKVRDLL-----DPKGSR--QSLKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKS 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 RRIANTHLNRESSRSHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKEQITISQLSLVDLAGSERTNR : .: :..:.::::::.:::: ..:. : .. : :: .:..::::::::::... 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CCDS47 AQERQRQLES----MGISLEMSGIKVGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADT 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 pF1KE1 KRNLQQELETQNQKLQRQFSDKRRLEARLQGMVTETTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLW . :... . .: : . .. .: :: : . . : : . . ..:: CCDS47 S----QDIQLFGIGIQPQHCE---IDIASDGDVTLTPKENARSC---VNGTLVCSTTQLW 480 490 500 510 520 650 660 670 680 690 700 pF1KE1 VKDEKLKQLKAIVTEPKTEKPERPSRERDREKVTQRSVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLM :. : . . . . :.: ..:: : .. ..: :.. :. CCDS47 HGDRILWGNNHFF---RINLPKR--KRRDWLKDFEKETGPPEHDLDAASEAS-------- 530 540 550 560 570 710 720 730 740 750 760 pF1KE1 SQPQLHRRSNSCSSISVASCISEWEQKIPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRR :.:. . . ... : . : :. : .... ... . : . ... CCDS47 SEPDYNYE------------FAQMEVIMKTLNSNDPVQNVVQVLEKQYLEEKRSAL-EEQ 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 820 pF1KE1 RGMYWTEGREVVPTFRNEIEIEEDHCGRLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDR---WVDH : :: : . .:... .. :: :.. : :: . :..: .. :... 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