Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3124, 556 aa
1>>>pF1KB3124 556 - 556 aa - 556 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8731+/-0.000864; mu= 16.1255+/- 0.052
mean_var=75.2612+/-14.777, 0's: 0 Z-trim(106.9): 13 B-trim: 78 in 1/51
Lambda= 0.147839
statistics sampled from 9253 (9263) to 9253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX ( 556) 3749 809.1 0
CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13 ( 555) 2422 526.1 4.2e-149
CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7 ( 579) 1387 305.4 1.3e-82
CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2 ( 558) 1158 256.5 6.1e-68
CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13 ( 572) 712 161.4 2.7e-39
CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 580) 591 135.6 1.6e-31
CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 603) 523 121.1 3.9e-27
CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 526) 456 106.8 6.9e-23
>>CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX (556 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 4319.9 bits: 809.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-556)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 LTVFCILFLVMQREWR
::::::::::::::::
CCDS14 LTVFCILFLVMQREWR
550
>>CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13 (555 aa)
initn: 2398 init1: 1676 opt: 2422 Z-score: 2790.3 bits: 526.1 E(32554): 4.2e-149
Smith-Waterman score: 2422; 64.8% identity (85.6% similar) in 549 aa overlap (6-553:10-552)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDH
:: :: : : :. :..:..::.:::. : .:::. : : .:: :.:
CCDS94 MPSWIGAVILP-LLGLLLSLPAG---ADVKARSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIAGEH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LKICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENA
:.:::: :::. :::.: : ::: .:...: : . ....:.::.:::::::.::::::
CCDS94 LRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVSRHKKFDEFFRELLENA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 EKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLV
:::::::::.::: :::::::.:.:::.::::::. :::::::::::::::::::::.:.
CCDS94 EKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMFQLI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 NSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVS
: ::::...:::::::::.:::::::::::::.::::::.:::::.:::.:. .:...::
CCDS94 NPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGREVANRVS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAML
:.:: : .::.::.:: .:::: ::.:: ::: :.:.::::::.::: ::: ::::::
CCDS94 KVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWNLFIDAML
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSI
.:::::::::::::::::::::::.::::::.::.::: ::::::: ::: :: : .::
CCDS94 LVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 SESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAG
:. :..::::..:::::::::::::::::::.::::: .:: ::.:: ..:.:: ..::
CCDS94 PEN-FNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTICKDESVTAG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 NGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMK
..::..::::..:.::: . ..::.:: :::::.:: ..:: .: .:::::::::.:.:
CCDS94 TSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 NAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEK-ADSAGVRPG
::::::::.: : :::::: :::::: . ::.::.. .:. . . ... .::.... :
CCDS94 NAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRG
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB3 AQAYLLTVFCILFLVMQREWR
. .. ::. :..::
CCDS94 HSLLSWSLTCIV-LALQRLCR
540 550
>>CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7 (579 aa)
initn: 1250 init1: 474 opt: 1387 Z-score: 1596.9 bits: 305.4 E(32554): 1.3e-82
Smith-Waterman score: 1387; 42.6% identity (74.7% similar) in 479 aa overlap (27-499:29-505)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
..::.:.:.. ..:.. : : :.:.::.
CCDS56 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
.::: ::::.: :.. ... :...: .. . : ..:.:..:::::: :.: :..
CCDS56 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
::...: ..::.:: :.. .:. :: .:. .: .. .:.. : ::::.::::.: :..
CCDS56 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QYHFTDEYLECVSKYTEQ----LKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK
:: : .:: :.:. . . :.:::: ::.:.::.::..::::.:.::: .. .:::.
CCDS56 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA
. : . :..::...: : :::. .. :: ..: :..::::...: :. .:.:..:.
CCDS56 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWGNYLDG
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR
.:..:..:.:::..: . . : ::::...: .:.::..:: .::: :::: :.:: : :
CCDS56 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA-RNRR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 SISESAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERM
. ..:. ::::::::::.: ::: ...:.: . . ::. : .::.: ::
CCDS56 APPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 AAGNGNED-DCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMT
:: . : ::.: :..::: :.:.. :.: ::::..::.: ::. :. . ::. :
CCDS56 AADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAAT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 SKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGV
..::.: :.:.: : ....:: :.:
CCDS56 ARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGK
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2 (558 aa)
initn: 1516 init1: 1128 opt: 1158 Z-score: 1333.2 bits: 256.5 E(32554): 6.1e-68
Smith-Waterman score: 1640; 43.9% identity (75.0% similar) in 560 aa overlap (9-556:10-558)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSA-ALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
:::. :.: : : ::.::.:::..: .:::. .:.: ::.:.::.
CCDS25 MELRARGWWLLCAAAALVACARGDPASKSRSCGEVRQIYGAKGFSLSDVPQAEISGEHLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
::::: :::..::::. . .:. ...... .. :::..:.. ..::. :..::...:.
CCDS25 ICPQGYTCCTSEMEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLATQLRSFDDHFQHLLNDSER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
.:. : ..:.:: ::.. :.::. ::. :: .:..::: : .::::::::.:. ..
CCDS25 TLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEETLAEFWARLLERLFKQLHP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVV
: . :.::.:..: .: :.:::..::.:.:..::::::::.:.:::.::.::: ::. :
CCDS25 QLLLPDDYLDCLGKQAEALRPFGEAPRELRLRATRAFVAARSFVQGLGVASDVVRKVAQV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMV
.:..:..:..::.:: :. ..:: .:: :...::::::.::: :: :..:.:...
CCDS25 PLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLANQADLDAEWRNLLDSMVLI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 AERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISE
.... : ..:::. . . ...:: .::: .. ::.:::: :: : :
CCDS25 TDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQGCGNPKVNPQG-------P
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 SAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGN
. : : . :.::: . :: :..::...: .:.... :: :::...:. :.:: ..
CCDS25 GPEEKRRRGKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDFWISLPGTLCS-EKMALST
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 GNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKN
...: :::: ...::: : :.::::: :::::.:: .:::. : .::: :..::.....
CCDS25 ASDDRCWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDMTIRQQIMQLKIMTNRLRS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB3 AYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATD------HA--GKSANE-KAD
::::::::: : ::..:: :::.:: . : . . .... :: : : .: .
CCDS25 AYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSRTPLTHALPGLSEQEGQKT
470 480 490 500 510 520
530 540 550
pF1KB3 SAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQR-EWR
::. : ..:: .. .: :.. : .::
CCDS25 SAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR
530 540 550
>>CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13 (572 aa)
initn: 706 init1: 426 opt: 712 Z-score: 818.9 bits: 161.4 E(32554): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 750; 27.7% identity (62.8% similar) in 494 aa overlap (28-501:28-510)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNK-NDAPLHEINGDHLKI
..: :::.:. . .. : : :..
CCDS94 MDAQTWPVGFRCLLLLALVGSARSEGVQTCEEVRKLFQWRLLGAVRGLPDSPRAGPDLQV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 C-PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
: . :::...:::.:.. ...:... .. . . :. ... :.: .. :...::.
CCDS94 CISKKPTCCTRKMEERYQIAARQDMQQFLQTSSSTLKFLISRNAAAFQETLETLIKQAEN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLVN
. .: .:: .. .. . ...:... : ..:: ::..: :. :. .. .:.:
CCDS94 YTSILFCSTYRNMALEAAASVQEFFTDVGLYLFGADVNPEEFVNRFFDSLFPLVYNHLIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SQYHFTD---EYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK
:: :: ::. ....:::..:... :. :... .::: :.: .. .:..
CCDS94 PG--VTDSSLEYSECIRMARRDVSPFGNIPQRVMGQMGRSLLPSRTFLQALNLGIEVINT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA
.. .. . .:..::::: :: ::.::. .:::..:: :.::::::....:. .:. .: .
CCDS94 TDYLHFSKECSRALLKMQYCPHCQGLALTKPCMGYCLNVMRGCLAHMAELNPHWHAYIRS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR
. ... ..: ..: :. . . ..::... . :. .. ..: . :: : :.
CCDS94 LEELSDAMHGTYDIGHVLLNFHLLVNDAVLQAHLNGQKLLEQVNRICGRPVRTPTQSPRC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 SISESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMA
:...: . .: . : . .: . ..:. ..:...: ...: .: .:
CCDS94 SFDQS------KEKHGMKTTTRNSEETLANRRKEFINSLRLYRSFYGGLADQLCANE-LA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB3 AGNGNEDDCWNGKGKSR-YLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI--LI--LRQIMALR
:..: ::::. . : :.:::. :..::::.: : : .: :.... :
CCDS94 AADGLP--CWNGEDIVKSYTQRVVGNGIKAQSGNPEVKVKGIDPVINQIIDKLKHVVQLL
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 VMTSKMKNAYN-------GNDVDFF--DISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAG
: . .. :. :. : .::.. :::::
CCDS94 QGRSPKPDKWELLQLGSGGGMVEQVSGDCDDEDGCGGSGSGEVKRTLKITDWMPDDMNFS
470 480 490 500 510 520
530 540 550
pF1KB3 KSANEKADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR
CCDS94 DVKQIHQTDTGSTLDTTGAGCAVATESMTFTLISVVMLLPGIW
530 540 550 560 570
>>CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX (580 aa)
initn: 465 init1: 256 opt: 591 Z-score: 679.4 bits: 135.6 E(32554): 1.6e-31
Smith-Waterman score: 636; 26.9% identity (60.7% similar) in 494 aa overlap (29-501:34-512)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
.: .:: .. . . .: . :. :.
CCDS14 TVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPGSDLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 IC-PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAE
.: :.: ::::..:::::.: .. ....... .:. .. . :.: :. ....:.
CCDS14 VCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAFEIVVRHAK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLV
. : :: ..: : : :. ..:.... : . ...:...:.:... :. .. .:.
CCDS14 NYTNAMFKNNYPSLTPQAFEFVGEFFTDVSLYILGSDINVDDMVNELFDSLFPVIYTQLM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 NSQYHFTDEYL---ECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVS
: . : : ::. ..:: ::. :. . ::.... ..: : :.: .. .:..
CCDS14 NP--GLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQALNLGIEVIN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFID
.. .. . .: . : .: :::.:.::. :::: .::. .:.::.:. ..: : ..:
CCDS14 TTDHLKFSKDCGRMLTRMWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGVVEIDKYWREYIL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 AMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRIS
.. ... . ...:.:. . : :.:. .: :. ... . . :. . :
CCDS14 SLEELVNGMYRIYDMENVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTIGKLCAHSQQ----RQY
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB3 RSI--SESAFSAR--FRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCN
:: :. : . .. : :.. : .: : .. .:::. .:.:.::. .:.
CCDS14 RSAYYPEDLFIDKKVLKVAHVEHEETL---SSRRR---ELIQKLKSFISFYSALPGYICS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 DERMAAGNGNEDDCWNGKGK-SRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI--LI--LRQ
.: :. ::::. :: .. ::. :: : :... .: . .: :..
CCDS14 HSPVAE---NDTLCWNGQELVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKH
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB3 I-MALRVMTSKMKNAYNGN-DVDFFDISDESSGE-----GSGSGCEYQQCPSEFDYNATD
: . ::.:. . . : : . :. .: .. : :::.:
CCDS14 INQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAY
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB3 HAGKSANEKADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR
CCDS14 DLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGNVHSPLKLLTSMAISVVCFFFLVH
530 540 550 560 570 580
>>CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX (603 aa)
initn: 447 init1: 309 opt: 523 Z-score: 600.7 bits: 121.1 E(32554): 3.9e-27
Smith-Waterman score: 620; 25.2% identity (60.2% similar) in 507 aa overlap (29-501:34-535)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
.: .:: .. . . .: . :. :.
CCDS55 TVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPGSDLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 IC-PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAE
.: :.: ::::..:::::.: .. ....... .:. .. . :.: :. ....:.
CCDS55 VCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAFEIVVRHAK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLV
. : :: ..: : : :. ..:.... : . ...:...:.:... :. .. .:.
CCDS55 NYTNAMFKNNYPSLTPQAFEFVGEFFTDVSLYILGSDINVDDMVNELFDSLFPVIYTQLM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 NSQYHFTDEYL---ECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVS
: . : : ::. ..:: ::. :. . ::.... ..: : :.: .. .:..
CCDS55 NP--GLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQALNLGIEVIN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFID
.. .. . .: . : .: :::.:.::. :::: .::. .:.::.:. ..: : ..:
CCDS55 TTDHLKFSKDCGRMLTRMWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGVVEIDKYWREYIL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB3 AMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDN-----SVQVSQKVFQGCGP-----
.. ... . ...:.:. . : :.:. .: : .... .:... :
CCDS55 SLEELVNGMYRIYDMENVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTETEKKIWHFKYPIFFLC
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB3 -PKPLPAGRISRSISESAFSARFRPHH--PEERPTTAAGTSLDRLVTDVK----EKLKQA
: :.. .. . . . :. ... .: . .. ... . .:::.
CCDS55 IGLDLQIGKLCAHSQQRQYRSAYYPEDLFIDKKVLKVAHVEHEETLSSRRRELIQKLKSF
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 KKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNEDDCWNGKGK-SRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTS
.:.:.::. .:. .: :. ::::. :: .. ::. :: : :...
CCDS55 ISFYSALPGYICSHSPVAE---NDTLCWNGQELVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGP
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB3 KPDI--LI--LRQI-MALRVMTSKMKNAYNGN-DVDFFDISDESSGE-----GSGSGCEY
.: . .: :..: . ::.:. . . : : . :. .: .. : :::.:
CCDS55 EPVVSQIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIK
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KB3 QQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR
CCDS55 VKNQLRFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGNVHSPLKLLTSMAISVVCF
540 550 560 570 580 590
>>CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX (526 aa)
initn: 382 init1: 256 opt: 456 Z-score: 524.4 bits: 106.8 E(32554): 6.9e-23
Smith-Waterman score: 501; 27.0% identity (60.0% similar) in 415 aa overlap (107-501:59-458)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 LQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSLNDMFVKTYGHLYMQNS
: :. ....:.. : :: ..: : :
CCDS55 PPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPEAFEIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQAF
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 ELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLVNSQYHFTDEYL---ECVSK
:. ..:.... : . ...:...:.:... :. .. .:.: . : : ::.
CCDS55 EFVGEFFTDVSLYILGSDINVDDMVNELFDSLFPVIYTQLMNPG--LPDSALDINECLRG
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 YTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNPTAQCTHALLKMI
..:: ::. :. . ::.... ..: : :.: .. .:.. .. .. . .: . : .:
CCDS55 ARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQALNLGIEVINTTDHLKFSKDCGRMLTRMW
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 YCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAERLEGPFNIESVM
:::.:.::. :::: .::. .:.::.:. ..: : ..: .. ... . ...:.:.
CCDS55 YCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGVVEIDKYWREYILSLEELVNGMYRIYDMENVL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360
pF1KB3 DPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSI--SESAFSAR--FRPH
. : :.:. .: :. ... . . :. . : :: :. : . ..
CCDS55 LGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTIGKLCAHSQQ----RQYRSAYYPEDLFIDKKVLKVA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNEDDCWNGKG
: :.. : .: : .. .:::. .:.:.::. .:. .: :. ::::.
CCDS55 HVEHEETL---SSRRR---ELIQKLKSFISFYSALPGYICSHSPVAE---NDTLCWNGQE
330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 K-SRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI--LI--LRQI-MALRVMTSKMKNAYNGN
:: .. ::. :: : :... .: . .: :..: . ::.:. . . :
CCDS55 LVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKN
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KB3 -DVDFFDISDESSGE-----GSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGA
: . :. .: .. : :::.:
CCDS55 LDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDN
440 450 460 470 480 490
556 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 04:52:20 2016 done: Sat Nov 5 04:52:20 2016
Total Scan time: 3.140 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]