FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2157, 330 aa 1>>>pF1KE2157 330 - 330 aa - 330 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6770+/-0.000747; mu= 15.5066+/- 0.045 mean_var=87.3783+/-16.936, 0's: 0 Z-trim(110.9): 71 B-trim: 16 in 2/51 Lambda= 0.137206 statistics sampled from 11859 (11932) to 11859 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16 Scan time: 2.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 ( 330) 2371 478.8 2.7e-135 CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 1468 300.4 4.8e-81 CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 ( 270) 1201 247.1 1.2e-65 CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 ( 569) 1133 233.9 2.4e-61 CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 330) 1058 218.9 4.7e-57 CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 331) 949 197.3 1.5e-50 CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 577) 934 194.5 1.8e-49 CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 634 135.1 1.5e-31 CCDS53453.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 269) 598 127.7 1e-29 CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 ( 449) 440 96.6 4e-20 CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 389 86.4 3.5e-17 CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 320 73.2 1.1e-12 CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 316 72.7 4.8e-12 CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 316 72.7 5e-12 CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 316 72.7 5e-12 CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 292 67.6 5e-11 >>CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 (330 aa) initn: 2371 init1: 2371 opt: 2371 Z-score: 2542.5 bits: 478.8 E(32554): 2.7e-135 Smith-Waterman score: 2371; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR 310 320 330 >>CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231 aa) initn: 1323 init1: 1323 opt: 1468 Z-score: 1568.5 bits: 300.4 E(32554): 4.8e-81 Smith-Waterman score: 1469; 68.8% identity (80.1% similar) in 311 aa overlap (26-330:935-1231) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGI---LYDEEKYKPFSQVPTGEVFY :.:.::. . : .: :: CCDS13 FRISEENETTCYMGKWSSPPQCEGLPCKSPPEISHGVVAHMSDSYQY--------GEEVT 910 920 930 940 950 60 70 80 90 100 pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRL-CF-FPFVENGHSESSGQ-THLEGDT :.: .: . .. : : :: :.:.. :. .: ::. . . .. :. CCDS13 YKCFEGFGIDGPAI---AKCLGEKWSHPPSCIKTDCLSLPSFENAIPMGEKKDVYKAGEQ 960 970 980 990 1000 1010 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 VQIICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSG : : : :.. .. .:..:.. :. : :: :::::::::::::.:.:::::::::: CCDS13 VTYTCATYYKM-DGASNVTCINSRWTGRPTCR--DTSCVNPPTVQNAYIVSRQMSKYPSG 1020 1030 1040 1050 1060 1070 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ERVRYECRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAP :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 ERVRYQCRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 ASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 ASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLY 1140 1150 1160 1170 1180 1190 290 300 310 320 330 pF1KE2 LRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SRTGESVEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR 1200 1210 1220 1230 >-- initn: 828 init1: 451 opt: 590 Z-score: 629.2 bits: 126.6 E(32554): 1e-28 Smith-Waterman score: 590; 29.3% identity (58.9% similar) in 321 aa overlap (23-330:325-626) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFY ::.: :.:: :: :. .:. : .:. . CCDS13 RNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYS 300 310 320 330 340 350 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQI : :. .: .:: :.: .: ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..: .... CCDS13 YYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDV 360 370 380 390 400 410 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERV :. :: : . .....:.: ::: :.: . : . ..:. : :.. : :.. CCDS13 ACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVKTCSKSSIDIENGFISESQYT-YALKEKA 420 430 440 450 460 470 180 190 200 210 220 pF1KE2 RYECRSPYEMFGDEE----VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPID---NGDITSFPLS .:.:. : . .: : . : . .:. : : : : : .. ..:.: : :. CCDS13 KYQCKLGY-VTADGETSGSITCGKDGWSAQPTCIKS---CDIPVFMNARTKNDFTWFKLN 480 490 500 510 520 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 VYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKR---ITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREI-MENYNIALR ....:.:.. :. . .. :.: . ::. : : . :: . . .. : CCDS13 -----DTLDYECHDGYESNTGSTTGSIVCGYNGWSDLPICYE-----RECELPKIDVHLV 530 540 550 560 570 290 300 310 320 330 pF1KE2 WTAKQKLYLRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKL--EYPTCAKR :. : ..:: .: :: :. . . . . :. : . : : .. CCDS13 PDRKKDQY-KVGEVLKFSCKPGFTIVGPNSV---QCYHFGLSPDLPICKEQVQSCGPPPE 580 590 600 610 620 630 CCDS13 LLNGNVKEKTKEEYGHSEVVEYYCNPRFLMKGPNKIQCVDGEWTTLPVCIVEESTCGDIP 640 650 660 670 680 690 >>CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 (270 aa) initn: 1669 init1: 1008 opt: 1201 Z-score: 1292.1 bits: 247.1 E(32554): 1.2e-65 Smith-Waterman score: 1557; 70.9% identity (77.3% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-270) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MWLLVSVILISRISSVGGEAMFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SPSKSFWTRITCAEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY ::::::::::::::::::::::: CCDS30 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTI------------------------------------ 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL :. :::::::::::::::: ::::::.:::::::::: CCDS30 -----------------------SAEKCGPPPPIDNGDITSFLLSVYAPGSSVEYQCQNL 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC ::::::..::::::::::::::: :::::.::::.::: :.:: .:::: :::. .:::: CCDS30 YQLEGNNQITCRNGQWSEPPKCLDPCVISQEIMEKYNIKLKWTNQQKLYSRTGDIVEFVC 190 200 210 220 230 240 310 320 330 pF1KE2 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR : ::. ..::..:. : .::: ::.: .. CCDS30 KSGYH-PTKSHSFRAMCQNGKLVYPSCEEK 250 260 270 >>CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 (569 aa) initn: 1639 init1: 1031 opt: 1133 Z-score: 1214.8 bits: 233.9 E(32554): 2.4e-61 Smith-Waterman score: 1133; 51.7% identity (68.4% similar) in 329 aa overlap (1-327:1-322) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV : :: :::::: .:.::::.:.::::::.::.::::: :.:::::::::::::::::::: CCDS13 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL :::::::::::::::::::::::::.: ::::.:::::::: ::::::::::::::: : CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY ::::.::::::::::::: : : : : :. .. : : :. ... ::. CCDS13 QNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKES-YKVGDVLKFSCRKNL 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEP-PQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQN :.. :.: . .:. : :: .. .::::: ..::.. . :. :::.:. CCDS13 IRVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFV . ..: :.: : .:.:. : :.. : : . .. . . : :.: CCDS13 NFIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPE---LEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 CKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGK-LEYPTCAKR :. : . . . :: .: : : : CCDS13 CRNEYAMIGNNMI---TCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNS 300 310 320 330 340 350 >-- initn: 810 init1: 622 opt: 685 Z-score: 735.5 bits: 145.2 E(32554): 1.2e-34 Smith-Waterman score: 685; 40.2% identity (66.4% similar) in 229 aa overlap (100-327:345-568) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 ITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRLQNNENNISC ::. ... .. :. .: ... : CCDS13 IWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHS----VC 320 330 340 350 360 370 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VERGWSTPPKC-RSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPYEMFGDEEV .. :. : .. . : :: . ::. .. .. : .::.: :. : . .:. CCDS13 INGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTTVN-YQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEI 380 390 400 410 420 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 MCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKR .: .: : :.: .::. ::::: :.::: :::::::: :.:.: :.::..:.:.:. CCDS13 VCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVT 430 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 ITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVCKRGYRLSS .:::: ::::::.:: :::.:.: :.. :: :.: ::: .::...:: :: .. CCDS13 VTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMI 490 500 510 520 530 540 310 320 330 pF1KE2 RSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR : .:. : .::.::: : CCDS13 SSPPFRAICQEGKFEYPICE 550 560 >>CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 (330 aa) initn: 1236 init1: 561 opt: 1058 Z-score: 1137.9 bits: 218.9 E(32554): 4.7e-57 Smith-Waterman score: 1058; 40.9% identity (71.5% similar) in 330 aa overlap (1-327:1-329) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV : ::..::: .: ..:.. :::: :.:: :. :. .:. : .:. . : :. .: CCDS30 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPDIKHGGLFHENMRRPYFPVAVGKYYSYYCDEHFE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL .:: :.: : ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..:..... :. :: : CCDS30 TPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNYGRKFVQGNSTEVACHPGYGL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY . .....:.:.::: :.: . : . ..:. : :.. : : .....:.:. : CCDS30 PKAQTTVTCTEKGWSPTPRCIRVRTCSKSDIEIENGFI-SESSSIYILNKEIQYKCKPGY 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 EMF-GDEE--VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQC :. . ::...:. : : .:. ::::::::.::: ::: :.::.: : ::::: CCDS30 ATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICINSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 QNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAE : :.:.:.. .:: ::.:::::.:.:::.:..: :.. :: :. . .: : .::.. : CCDS30 QPYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIKLKGRSDRKYYAKTGDTIE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 FVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR :.:: :: .. .....: .: .::: : CCDS30 FMCKLGYNANTSILSFQAVCREGIVEYPRCE 300 310 320 330 >>CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (331 aa) initn: 1085 init1: 505 opt: 949 Z-score: 1021.2 bits: 197.3 E(32554): 1.5e-50 Smith-Waterman score: 949; 40.3% identity (66.9% similar) in 335 aa overlap (1-327:1-330) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGG-EATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNF : ::..::: .: ..: :. ::::.:.:: :: . . . . .:. . : :. :: CCDS41 MLLLINVILTLWVSCANGQEVKPCDFPEIQHGGLYYKSLRRLYFPAAAGQSYSYYCDQNF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFP--FVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTG :.:: :.: : ::..::::: ::: : .::: :.. .. . .: :. : CCDS41 VTPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDIEIENGFISESSSIYILNKEIQYKCKPG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 YRLQ--NNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYE : :. ..:.:.. :::. : : . : . :. .:.. : : .. . . :: CCDS41 YATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-RFKLHDTLDYE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 CRSPYEM-FGDEE--VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASS : . ::. .:. ..: . .:.. : : .:. ::::::::.::: ::: :.::.: : CCDS41 CYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRT ::::::. :.:.:.. .:: ::.:::::.:.:::.:..: :.. :: :. . : : .: CCDS41 VEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIQLKGKSDIKYYAKT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 GESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR :.. ::.:: :: .. .....: .: .::: : CCDS41 GDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGIVEYPRCE 300 310 320 330 >>CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (577 aa) initn: 1126 init1: 505 opt: 934 Z-score: 1001.8 bits: 194.5 E(32554): 1.8e-49 Smith-Waterman score: 934; 41.0% identity (67.3% similar) in 312 aa overlap (23-327:270-576) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFY :.::.:.:: :: :. .:. : ::. . CCDS55 QSYYELQGSKYVTCSNGDWSEPPRCISMKPCEFPEIQHGHLYYENTRRPYFPVATGQSYS 240 250 260 270 280 290 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFP--FVENGHSESSGQTHLEGDTV : :. :::.:: :.: : ::..:: :: ::: : .::: :.. .. . . CCDS55 YYCDQNFVTPSGSYWDYIHCTQDGWLPTVPCLRTCSKSDIEIENGFISESSSIYILNKEI 300 310 320 330 340 350 120 130 140 150 160 pF1KE2 QIICNTGYRLQ--NNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPS : :. :: :. ..:.:.. :::. : : . : . :. .:.. : : .. CCDS55 QYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-RFKL 360 370 380 390 400 410 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GERVRYECRSPYEM-FGDEE--VMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLS . . ::: . ::. .:. ..: . .:.. : : .:. ::::::::.::: ::: :. CCDS55 HDTLDYECYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLK 420 430 440 450 460 470 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 VYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAK ::.: : ::::::. :.:.:.. .:: ::.:::::.:.:::.:..: :.. :: :. . CCDS55 VYVPQSRVEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIQLKGKSD 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 pF1KE2 QKLYLRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR : : .::.. ::.:: :: .. .....: .: .::: : CCDS55 IKYYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGIVEYPRCE 540 550 560 570 >-- initn: 824 init1: 313 opt: 762 Z-score: 817.8 bits: 160.4 E(32554): 3.1e-39 Smith-Waterman score: 762; 40.7% identity (65.9% similar) in 270 aa overlap (1-263:1-265) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV : ::..::: .: ..:.. ::::.:.:: :: . . . . .:. . : :. ::: CCDS55 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPEIQHGGLYYKSLRRLYFPAAAGQSYSYYCDQNFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFP--FVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGY .:: :.: : ::..::::: ::: : .::: :.. .. .. .: :. :: CCDS55 TPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDVEIENGFISESSSIYILNEETQYNCKPGY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RLQ--NNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYEC :. ..:.:.. :::: : : . : . :. .:.. : : . . . ::: CCDS55 ATAEGNSSGSITCLQNGWSTQPICIKF---C-DMPVFENSRAKSNGM-WFKLHDTLDYEC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RSPYEM-FGD--EEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSV . :: .:. . ..: . .:.. : : .:. .:::::::.::: :::: .:: : : : CCDS55 YDGYESSYGNTTDSIVCGEDGWSHLPTCYNSSENCGPPPPISNGDTTSFPQKVYLPWSRV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTG :::::. :.:.:.: .:: ::.:::::.:. CCDS55 EYQCQSYYELQGSKYVTCSNGDWSEPPRCISMKPCEFPEIQHGHLYYENTRRPYFPVATG 240 250 260 270 280 290 >>CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 (661 aa) initn: 852 init1: 311 opt: 634 Z-score: 680.0 bits: 135.1 E(32554): 1.5e-31 Smith-Waterman score: 634; 32.0% identity (62.5% similar) in 309 aa overlap (33-330:218-518) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 LLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQV-PTGEVFYYSCEYNFVS : .. ..: .:. :.: . :. :. CCDS13 GGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFFCHENYYL 190 200 210 220 230 240 70 80 90 100 110 pF1KE2 PSKSFWTRITCTEEGWSP-TPKCL---RLCFFPFVE-NGHSESSGQTHLEGDTVQIICNT .... : : . :: : .: : : : . :.. .. . :. .:. :.: :. CCDS13 SGSDL---IQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHIECEL 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GYRLQNNENNISCVERGWSTPPKC--RSTDTSCVNPPTVQN-AHILSRQMSKYPSGERVR ....... . : : . :. :::: . ..: .:: ..: : : .. : .:..: CCDS13 NFEIHGSAE-IRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKI--YYNGDKVT 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YECRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSV : :.: : . :..:. : :.:: ::.: ... .: :: . :: ... :. :: .::: CCDS13 YACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGAVADGILASYATGSSV 370 380 390 400 410 420 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTG ::.:.. : :.:.: :..:.:: :: ::.::... . :. :: ..: . :. : CCDS13 EYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVL--HG 430 440 450 460 470 300 310 320 330 pF1KE2 ESAEFVCKRGYRLSSRS--HTLRTTCWDGKLEYPTCAKR . .::::.:: :: . : . : :...:: :... CCDS13 DLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISST 480 490 500 510 520 530 CCDS13 VDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWD 540 550 560 570 580 590 >-- initn: 244 init1: 136 opt: 337 Z-score: 362.3 bits: 76.4 E(32554): 7.3e-14 Smith-Waterman score: 337; 26.9% identity (55.2% similar) in 212 aa overlap (4-208:8-213) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHG-ILYDEEKYKPFS-QVPTGEVFYYS .. ...:: . . .: : ::....: : .: : . . . . CCDS13 MRLKNLTFIIILIIS--GELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKKLSFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIIC : .... : . ::: ::::: :.:.. : : . ::. . . .... : CCDS13 CLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQENMRYGC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NTGYRLQN--NENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERV .::. . .:. ..:. :::. : ::. .:. : . :.. . : . . ..: CCDS13 ASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPE-LYNGNYSTTQKT-FKVKDKV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 RYECRSPYEMFGD---EEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAP .::: . : : ::: ::. .:. :.: . :: CCDS13 QYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKC--TKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 ASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLY CCDS13 DVVQFFCHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRH 240 250 260 270 280 290 >-- initn: 459 init1: 264 opt: 330 Z-score: 354.8 bits: 75.0 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 330; 39.4% identity (62.1% similar) in 132 aa overlap (203-330:519-649) 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RYECRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASS .: : : :: : .: : : ...: .:: CCDS13 GYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSS 490 500 510 520 530 540 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRT :::.: . . :::... : .:.:. :: ::.::..: ::. :. :.: .. .. CCDS13 VEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILH 550 560 570 580 590 600 300 310 320 330 pF1KE2 GESAEFVCKRG--Y--RLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR :: ::.: :: : .: . :: : :.:.:: : : CCDS13 GEYIEFIC-RGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLRT 610 620 630 640 650 660 >>CCDS53453.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 (269 aa) initn: 1117 init1: 505 opt: 598 Z-score: 647.0 bits: 127.7 E(32554): 1e-29 Smith-Waterman score: 863; 37.0% identity (62.1% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-268) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV : ::..::: .: ..:.. :::: :.:: :. :. .:. : .:. . : :. .: CCDS53 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPDIKHGGLFHENMRRPYFPVAVGKYYSYYCDEHFE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL .:: :.: : ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..:..... :. :: : CCDS53 TPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNYGRKFVQGNSTEVACHPGYGL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY . .....:.:.::: :.: .: CCDS53 PKAQTTVTCTEKGWSPTPRC-------------------------------IRV------ 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNL .:. ::::::::.::: ::: :.::.: : :::::: CCDS53 ----------------------NSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQPY 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFVC :.:.:.. .:: ::.:::::.:.:::.:..: :.. :: :. . .: : .::.. ::.: CCDS53 YELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIKLKGRSDRKYYAKTGDTIEFMC 190 200 210 220 230 240 310 320 330 pF1KE2 KRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR : :: .. .....: .: .::: : CCDS53 KLGYNANTSILSFQAVCREGIVEYPRCE 250 260 >>CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (449 aa) initn: 561 init1: 440 opt: 440 Z-score: 474.9 bits: 96.6 E(32554): 4e-20 Smith-Waterman score: 440; 40.7% identity (73.7% similar) in 118 aa overlap (23-140:325-442) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFY ::.: :.:: :: :. .:. : .:. . CCDS53 RNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYS 300 310 320 330 340 350 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQI : :. .: .:: :.: .: ::..::::. ::: :.::..:::.... :. ..: .... CCDS53 YYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDV 360 370 380 390 400 410 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ICNTGYRLQNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERV :. :: : . .....:.: ::: :.: CCDS53 ACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVSFTL 420 430 440 330 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 01:09:23 2016 done: Mon Nov 7 01:09:23 2016 Total Scan time: 2.250 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]