Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5506
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5506, 417 aa
  1>>>pF1KE5506 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5534+/-0.00114; mu= 15.7166+/- 0.068
 mean_var=66.0890+/-13.226, 0's: 0 Z-trim(101.8): 29  B-trim: 116 in 2/48
 Lambda= 0.157765
 statistics sampled from 6659 (6682) to 6659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  2.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3            ( 417) 2806 648.0 4.9e-186
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3           ( 417) 1492 348.9 5.3e-96
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8           ( 437) 1189 280.0 3.2e-75
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13           ( 423) 1130 266.5 3.4e-71
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7            ( 419) 1032 244.2 1.7e-64
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7           ( 421) 1021 241.7 9.9e-64
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7            ( 419) 1004 237.8 1.4e-62
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2           ( 374)  991 234.9   1e-61
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7           ( 436)  977 231.7 1.1e-60
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7          ( 388)  912 216.9 2.7e-56
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7          ( 403)  705 169.8 4.3e-42
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13          ( 386)  616 149.5 5.1e-36


>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3                 (417 aa)
 initn: 2806 init1: 2806 opt: 2806  Z-score: 3453.4  bits: 648.0 E(32554): 4.9e-186
Smith-Waterman score: 2806; 99.5% identity (99.8% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 AAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYN
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 NWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFMDCGIHAREW
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS31 NWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFTDCGIHAREW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 VSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       
pF1KE5 SSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
              370       380       390       400       410       

>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3                (417 aa)
 initn: 1486 init1: 1245 opt: 1492  Z-score: 1837.1  bits: 348.9 E(32554): 5.3e-96
Smith-Waterman score: 1492; 49.8% identity (80.3% similar) in 412 aa overlap (9-415:5-415)

               10        20             30        40        50     
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVR-----FDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
               :. .:.:.: ..     :. ::::::. .::.. .::..::.:...::: : 
CCDS33     MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPD
                   10        20        30        40        50      

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE5 ATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
       .. ..  .  :::::. ... .....: ::...:..:: .:.. .: ::: .    : ::
CCDS33 SVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATG-HS
         60        70        80        90       100       110      

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE5 YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFMDCGI
       : :::.:: : :::...  . : ..::  ::.: :   .:.::.:. .. . :::::::.
CCDS33 YEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMDCGF
         120       130       140       150       160       170     

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE5 HAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRK
       :::::.::::::::: .:..::::.  .:.:::...::.:::.:.::::..:::.:.:::
CCDS33 HAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRK
         180       190       200       210       220       230     

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE5 NRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLN
       .:: . .:.::::: ::::.:.:  :  . .:: ..: : : ::::::::...:::..:.
CCDS33 TRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLS
         240       250       260       270       280       290     

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE5 EIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTI
        ::.:.:.::::::...::.:. ::  :. .:  .::  .  :.. . :.: :::  .::
CCDS33 SIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTI
         300       310       320       330       340       350     

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE5 YPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKH
       :: .:.: ::::: ::...:.::::: :..:::::::.:. ::.::.::.:..:.:.:.:
CCDS33 YPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEH
         360       370       380       390       400       410     

         
pF1KE5 TS
         
CCDS33 LY
         

>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8                (437 aa)
 initn: 1119 init1: 1010 opt: 1189  Z-score: 1464.1  bits: 280.0 E(32554): 3.2e-75
Smith-Waterman score: 1189; 42.5% identity (73.8% similar) in 400 aa overlap (20-414:36-434)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNEL
                                     :.  .::.:  :. :..:  .: ..   ..
CCDS62 KRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKISYQLKV
          10        20        30        40        50        60     

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE5 DFWYPGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDV---
       :.: :..  .:.   ..: .. .. :.:. . :.. ...:..::.:::. .::  ..   
CCDS62 DLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGSSLHTQ
          70        80        90       100       110       120     

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE5 --KEDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNE
         .... : ..:  :.. :.:  : ...   .  ..  ..:: . :   :..::.:....
CCDS62 RNRRSLSG-YNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLGRRSR
         130        140       150       160       170       180    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE5 RRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYI
        ..:...:::::::::..:::::::: .:  ::  .  : :.:... :::.:::::::: 
CCDS62 LKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNVDGYH
          190       200       210       220       230       240    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE5 WSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETK
       .:::..:.:::.::.:.  .: :.: :::....: .   .  :: :.: :  :::: :.:
CCDS62 FSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESEPEVK
          250       260       270       280       290       300    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE5 AVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYET
       ::.::.:.: ..:..:..::.:.::::.::.:     :: . . ..:  ....:.. : .
CCDS62 AVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQSVYGV
          310       320       330       340       350       360    

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE5 RYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLA
       :: :::  .:.:  ::::.::::  :: ..::::::: : :::::::  ::::: :::::
CCDS62 RYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTETMLA
          370       380       390       400       410       420    

          410       
pF1KE5 VKFIAKYILKHTS
       :: :. ..::   
CCDS62 VKNITMHLLKKCP
          430       

>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13                (423 aa)
 initn: 864 init1: 427 opt: 1130  Z-score: 1391.7  bits: 266.5 E(32554): 3.4e-71
Smith-Waterman score: 1130; 40.4% identity (72.7% similar) in 421 aa overlap (1-415:6-422)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE5      MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
            . ...:. :.    ..:   :.  .:. . :.  .:......:. : :. .: : 
CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA---FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPV
               10        20           30        40        50       

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE5 ATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
       ..  .. : .: : :. .. . ... :. . .   .:. :... :..:.. .. .  : :
CCDS94 TADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQIS-NDTVSPRAS
        60        70        80        90       100        110      

            120       130       140       150        160       170 
pF1KE5 ---YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKI-GEKNERRKAIFM
          : .:.. ..: .: : . ...:.:...:.:::. :  ::::::. :...  ..::..
CCDS94 ASYYEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWI
        120       130       140       150       160       170      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE5 DCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNR
       :::::::::.::::: ::. . :. ::    .:.::  ..::..:: ::::: .:: :::
CCDS94 DCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNR
        180       190       200       210       220       230      

             240       250        260       270       280       290
pF1KE5 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNAS-WNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFI
       :::::::   :..:::::::::: .. :     ... :...: :  :::: :.:::..:.
CCDS94 MWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFL
        240       250       260       270       280       290      

              300       310       320       330        340         
pF1KE5 RSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVL-STRYETRYIYG
       : ..:.::.::..::::: ..:::.:: .   .::.:. ::. .. .. .   .::: .:
CCDS94 RRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKISKNTRYTHG
        300       310       320       330       340       350      

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE5 PIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIA
           :.:   :.. :: ::::::..:..:::: : .::::::  :::::::.. ::. ::
CCDS94 HGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIA
        360       370       380       390       400       410      

     410       
pF1KE5 KYILKHTS
        .....  
CCDS94 WHVIRNV 
        420    

>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7                 (419 aa)
 initn: 895 init1: 440 opt: 1032  Z-score: 1271.2  bits: 244.2 E(32554): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 1032; 38.5% identity (70.9% similar) in 426 aa overlap (1-415:3-417)

                 10        20        30         40         50      
pF1KE5   MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQA-DIIKDLAKTN-ELDFWY---
         :::::  : .   .    . :  ..:... :..:.:  ....  :. . .::::    
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLET-FVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKSPT
               10        20         30        40        50         

             60        70        80        90       100            
pF1KE5 -PGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQ-----FDVK
        :: : ::        ::   . ::..  :... . : :.:.:.:  ..:.     :. .
CCDS58 TPGETAHV--------RVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEEMLFNRR
      60                70        80        90       100       110 

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE5 EDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRK
       ..  :  ... :.. :.:    .... ..: .::...:::. :. :. :::..  ...  
CCDS58 RERSGNFNFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFSTGGDK-P
             120       130       140       150       160        170

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE5 AIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSW
       ::..: ::::::::. :   : . . .. ::..  .:..:: .....::: : :::..: 
CCDS58 AIWLDAGIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNPDGYVFSQ
              180       190       200       210       220       230

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE5 TKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVT
       ::::::::.::: ..: :.:.: :::..:....   ...::.:.:.: . .:: :.:...
CCDS58 TKNRMWRKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSEVEVKSIV
              240       250       260       270       280       290

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE5 NFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYI
       .::.:: ...:..::.:::::.:.:::::      . ..:..::. ... : . . :.: 
CCDS58 DFIKSH-GKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSLHGTKYK
               300       310       320       330       340         

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE5 YGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKF
        ::: :.::  ::.:.::.:: :::..::::::: :..:::::  .: :: .:: :..: 
CCDS58 VGPICSVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGLKA
     350       360       370       380       390       400         

       410       
pF1KE5 IAKYILKHTS
       : ...  :  
CCDS58 IMEHVRDHPY
     410         

>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7                (421 aa)
 initn: 943 init1: 434 opt: 1021  Z-score: 1257.7  bits: 241.7 E(32554): 9.9e-64
Smith-Waterman score: 1021; 37.8% identity (69.8% similar) in 421 aa overlap (1-412:1-416)

               10        20        30        40          50        
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWYPGATH
       :: :: .: .  .   .  .:  ..:.:.. ..  . . ...:...:  .:.::   .. 
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 HVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRH----
       .      ::  :     ::..: : .. ..: . :.:::  .... :  .   :..    
CCDS58 NRP----VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSN
                   70        80        90       100       110      

            120       130       140       150       160        170 
pF1KE5 --SYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGE-KNERRKAIFM
         .:. :.. : :    ...   .:... :.::: . :. :.::::..  :. :: :...
CCDS58 NFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWL
        120       130       140       150       160       170      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE5 DCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNR
       . :::.:::.: :   : . . .. : :.  .:..:..:....::: : :::... :.::
CCDS58 NAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNR
        180       190       200       210       220       230      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE5 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIR
       .:::.::.: .:.:::.: :::.:::. .   ...::.. :.:   .:: :.:.:..::.
CCDS58 LWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQ
        240       250       260       270       280       290      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE5 SHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPI
       .: : .: .: .:::::.:..::::. :  :. :.: :::.... .:..   :.:  :: 
CCDS58 KHGN-FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPT
        300        310       320       330       340       350     

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE5 ESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKY
        .:.:: ::::.::::: ::: .:.::::: : .::::: ..: :: .:: :..: : ..
CCDS58 CTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEH
         360       370       380       390       400       410     

             
pF1KE5 ILKHTS
       .     
CCDS58 VRDNLY
         420 

>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7                 (419 aa)
 initn: 948 init1: 504 opt: 1004  Z-score: 1236.8  bits: 237.8 E(32554): 1.4e-62
Smith-Waterman score: 1007; 37.8% identity (70.8% similar) in 421 aa overlap (8-415:3-417)

               10        20             30        40          50   
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDRE-----KVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWY
              ::.. .. .. : : .:     .:.:..  :: :.. .:.:   .  .:::: 
CCDS58      MRGLLVLSVLLGAV-FGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWR
                    10         20        30        40        50    

            60        70        80        90           100         
pF1KE5 PGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQ----EEIEKQFDVKED
        : .:  .    .: ::     ::..  :... . :: .:.:.:    :: :..:  .  
CCDS58 -GPAHPGSP---IDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSR
            60           70        80        90       100       110

     110         120       130       140       150       160       
pF1KE5 IPGRHS--YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRK
         .  .  :: :.. :.:  . . .. . :..::.:.::.: :  :.::::..  . .: 
CCDS58 ARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRP
              120       130       140       150       160       170

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE5 AIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSW
       ::..: :::.::::. :   ::. . :. ::..  .: .:: .....  : : ::. .. 
CCDS58 AIWIDTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTH
              180       190       200       210       220       230

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE5 TKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVT
       . ::::::.::.. .: :::.: :::..:...    ...::...:.:.  .:: :.:...
CCDS58 STNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSEVEVKSIV
              240       250       260       270       280       290

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE5 NFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYI
       .:...: : ::..:..:::::.:..:::: ..  :....: ...: .. .:.. : :.. 
CCDS58 DFVKDHGN-IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFN
               300       310       320       330       340         

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE5 YGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKF
       :: : ..::  :::..::.:. :::..:.::::: :..::::: :.: :: .:: ::.  
CCDS58 YGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLT
     350       360       370       380       390       400         

       410       
pF1KE5 IAKYILKHTS
       : .. :.:  
CCDS58 IMEHTLNHPY
     410         

>>CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2                (374 aa)
 initn: 985 init1: 890 opt: 991  Z-score: 1221.6  bits: 234.9 E(32554): 1e-61
Smith-Waterman score: 991; 47.6% identity (76.9% similar) in 294 aa overlap (114-405:45-337)

            90       100       110       120       130       140   
pF1KE5 QNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRI
                                     .::  :.   .:  : ... .:: :.:.. 
CCDS23 VPGGLGYDRSLAQHRQEIVDKSVSPWSLETYSYNIYHPMGEIYEWMREISEKYKEVVTQH
           20        30        40        50        60        70    

           150       160        170       180       190       200  
pF1KE5 KIGSTVEDNPLYVLKIGEKN-ERRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKI
        .: : : .:.: :::.. . . .: :.::::::::::..:::::::: .  ...  :. 
CCDS23 FLGVTYETHPMYYLKISQPSGNPKKIIWMDCGIHAREWIAPAFCQWFVKEILQNHKDNSS
           80        90       100       110       120       130    

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE5 MTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIP
       . :::  ..::.:::.:.::::..:: .:.:::.:: ..:. :.:::::::::::: :: 
CCDS23 IRKLLRNLDFYVLPVLNIDGYIYTWTTDRLWRKSRSPHNNGTCFGTDLNRNFNASWCSIG
          140       150       160       170       180       190    

            270        280       290       300       310       320 
pF1KE5 NTNDPCADN-YRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLP
        . . : :. . :..: :: :::::..::.:. ..:  ..:.:::.:..: :::::..  
CCDS23 ASRN-CQDQTFCGTGPVSEPETKAVASFIESKKDDILCFLTMHSYGQLILTPYGYTKNKS
           200       210       220       230       240       250   

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE5 PNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRD
        :: .. .:.. ....:...: : :  :   . .:  :::: ::: :.::  ...:::::
CCDS23 SNHPEMIQVGQKAANALKAKYGTNYRVGSSADILYASSGSSRDWARDIGIPFSYTFELRD
           260       270       280       290       300       310   

             390       400       410                               
pF1KE5 KGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS                        
       .: .::.:::..:.:::.::: ::                                    
CCDS23 SGTYGFVLPEAQIQPTCEETMEAVLSVLDDVYAKHWHSDSAGRVTSATMLLGLLVSCMSL
           320       330       340       350       360       370   

>>CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7                (436 aa)
 initn: 990 init1: 497 opt: 977  Z-score: 1203.3  bits: 231.7 E(32554): 1.1e-60
Smith-Waterman score: 977; 36.7% identity (71.1% similar) in 422 aa overlap (2-415:19-434)

                                10        20        30        40   
pF1KE5                  MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDL
                         : .:  ..: .. :.. . :  ..:.::  .:::: ... ::
CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAA-ALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDL
               10        20        30         40        50         

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE5 A--KTNELDFWYPGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEI-
          : ...:::   :      .. ::.::  .: . :.. :... . : :.:.:.:  . 
CCDS58 EGLKPQKVDFWRGPAR----PSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLD
      60        70            80        90       100       110     

                   110       120       130       140       150     
pF1KE5 -EKQFDVK----EDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLY
        :.:  .:    :   .  ::..:.. :.: .: .... .. ..::.:.::.. :.. . 
CCDS58 EERQAMAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSIL
         120       130       140       150       160       170     

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE5 VLKIGEKNERRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYIL
       :::..  . :. ::..: :::.:::.. :   : . . .. ::.....: .:. :...: 
CCDS58 VLKFSTGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIE
         180       190       200       210       220       230     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE5 PVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGS
        : : ::. .. . ::.::::.:   .  :::.:::::.......  ....::...:.: 
CCDS58 LVTNPDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGP
         240       250       260       270       280       290     

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE5 APESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGT
       .:.:: :. :..::: .: : .:. :..:::::::..:::   .   :...:  .:: ..
CCDS58 SPQSEPEVAAIVNFITAHGN-FKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAV
         300       310        320       330       340       350    

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE5 DVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIK
       ..:   .  .::.: : .:.:  :: ..::::: :::..:.::::: :..::::: ..: 
CCDS58 EALYKVHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQII
          360       370       380       390       400       410    

         400       410       
pF1KE5 PTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
       :: .:: .:.. : .. :.:  
CCDS58 PTAQETWMALRTIMEHTLNHPY
          420       430      

>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7               (388 aa)
 initn: 916 init1: 434 opt: 912  Z-score: 1124.1  bits: 216.9 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 960; 37.6% identity (68.0% similar) in 415 aa overlap (1-412:1-383)

               10        20        30        40          50        
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWYPGATH
       :: :: .: .  .   .  .:  ..:.:.. ..  . . ...:...:  .:.::   .. 
CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 HVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAK
       .      ::  :     ::..: : .. ..: . :.:::                     
CCDS55 NRP----VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQ--------------------I
                   70        80        90                          

      120       130       140       150       160        170       
pF1KE5 YNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGE-KNERRKAIFMDCGIHA
       :.. ..:.:        .:... :.::: . :. :.::::..  :. :: :.... :::.
CCDS55 YHEMDNIAA-------DFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGIHS
        100              110       120       130       140         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE5 REWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNR
       :::.: :   : . . .. : :.  .:..:..:....::: : :::... :.::.:::.:
CCDS55 REWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRKTR
     150       160       170       180       190       200         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE5 SKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEI
       :.: .:.:::.: :::.:::. .   ...::.. :.:   .:: :.:.:..::..: : .
CCDS55 SRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN-F
     210       220       230       240       250       260         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE5 KVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYP
       : .: .:::::.:..::::. :  :. :.: :::.... .:..   :.:  ::  .:.::
CCDS55 KGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVYP
      270       280       290       300       310       320        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE5 ISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
        ::::.::::: ::: .:.::::: : .::::: ..: :: .:: :..: : ...     
CCDS55 ASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNLY
      330       340       350       360       370       380        




417 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 01:18:49 2016 done: Tue Nov  8 01:18:49 2016
 Total Scan time:  2.480 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com