FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4419, 432 aa 1>>>pF1KE4419 432 - 432 aa - 432 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2577+/-0.00102; mu= 17.0103+/- 0.061 mean_var=61.1233+/-12.413, 0's: 0 Z-trim(102.0): 36 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.164048 statistics sampled from 6719 (6737) to 6719 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16 Scan time: 2.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 432) 2890 693.0 1.5e-199 CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 404) 2706 649.5 1.8e-186 CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 483) 1489 361.5 1e-99 CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 530) 1489 361.5 1.1e-99 CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 1479 359.1 5.6e-99 CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 1479 359.1 5.6e-99 CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 610) 1479 359.1 6.6e-99 CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 611) 1479 359.1 6.6e-99 >>CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 (432 aa) initn: 2890 init1: 2890 opt: 2890 Z-score: 3696.2 bits: 693.0 E(32554): 1.5e-199 Smith-Waterman score: 2890; 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CCDS81 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRV 380 390 400 410 420 430 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA .:::::::.::.:. :.::.: . :.:..: :::.. :. .: :..::::.:: :: CCDS81 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA 440 450 460 470 480 490 400 410 420 430 pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY :: .....::.::. ::.:::.. .:::::..::: CCDS81 SLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY 500 510 520 530 >>CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (508 aa) initn: 1399 init1: 1399 opt: 1479 Z-score: 1890.4 bits: 359.1 E(32554): 5.6e-99 Smith-Waterman score: 1479; 50.4% identity (80.1% similar) in 427 aa overlap (7-432:83-508) 10 20 30 pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR . : .: : .::. ..:::.:::.:: .: CCDS47 YSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALR 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG .: .. ::: ::.:.:: :.:..::::.::: .:::. .:..:::.:: ...:::.:..: CCDS47 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESG 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE .::.:::::..... :::.. . . :::::::::::. :. :::... :.:: :: CCDS47 FPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEE 180 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA ..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::.:..:: . 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