Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6404, 454 aa
1>>>pF1KE6404 454 - 454 aa - 454 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1604+/- 0.001; mu= 13.3170+/- 0.060
mean_var=84.7018+/-16.572, 0's: 0 Z-trim(105.6): 45 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.139357
statistics sampled from 8503 (8538) to 8503 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 1.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12221.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 ( 454) 3066 626.6 1.6e-179
CCDS77230.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 ( 376) 2524 517.6 8.7e-147
CCDS30781.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 ( 458) 1955 403.2 2.8e-112
CCDS72832.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 ( 478) 1948 401.8 7.8e-112
CCDS6986.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 467) 1910 394.2 1.5e-109
CCDS65183.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 458) 1897 391.6 9.1e-109
CCDS65184.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 485) 1896 391.4 1.1e-108
CCDS1297.1 MYOC gene_id:4653|Hs108|chr1 ( 504) 748 160.6 3.4e-39
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 693 149.7 1.6e-35
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 693 149.7 1.8e-35
CCDS65129.1 OLFML2A gene_id:169611|Hs108|chr9 ( 438) 659 142.6 7.4e-34
CCDS6857.2 OLFML2A gene_id:169611|Hs108|chr9 ( 652) 659 142.7 1e-33
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 648 140.7 9.7e-33
CCDS1236.1 OLFML2B gene_id:25903|Hs108|chr1 ( 750) 628 136.5 8.9e-32
CCDS72966.1 OLFML2B gene_id:25903|Hs108|chr1 ( 751) 628 136.5 8.9e-32
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 629 136.9 1.4e-31
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 626 136.2 1.7e-31
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 626 136.2 1.7e-31
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 626 136.2 2e-31
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 626 136.3 2e-31
CCDS9440.1 OLFM4 gene_id:10562|Hs108|chr13 ( 510) 532 117.1 4.1e-26
CCDS81882.1 GLDN gene_id:342035|Hs108|chr15 ( 427) 471 104.8 1.7e-22
CCDS10140.2 GLDN gene_id:342035|Hs108|chr15 ( 551) 471 104.9 2.2e-22
CCDS7779.1 OLFML1 gene_id:283298|Hs108|chr11 ( 402) 455 101.6 1.5e-21
CCDS6987.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 135) 388 87.9 6.8e-18
CCDS72839.1 OLFML3 gene_id:56944|Hs108|chr1 ( 345) 358 82.1 1e-15
CCDS65618.1 OLFML3 gene_id:56944|Hs108|chr1 ( 386) 358 82.1 1.1e-15
CCDS870.1 OLFML3 gene_id:56944|Hs108|chr1 ( 406) 358 82.1 1.1e-15
>>CCDS12221.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 (454 aa)
initn: 3066 init1: 3066 opt: 3066 Z-score: 3336.4 bits: 626.6 E(32554): 1.6e-179
Smith-Waterman score: 3066; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (1-454:1-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSRDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADGSLSAKSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADGSLSAKSFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGYYKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGYYKGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 QRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 WDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISML
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE6 DYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
430 440 450
>>CCDS77230.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 (376 aa)
initn: 2524 init1: 2524 opt: 2524 Z-score: 2748.8 bits: 517.6 E(32554): 8.7e-147
Smith-Waterman score: 2524; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (79-454:1-376)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 VIPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 AADGSLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AADGSLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMG
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 AYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 RVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVV
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 VKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 RLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KE6 PFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
340 350 360 370
>>CCDS30781.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 (458 aa)
initn: 1948 init1: 1550 opt: 1955 Z-score: 2129.2 bits: 403.2 E(32554): 2.8e-112
Smith-Waterman score: 1955; 62.2% identity (85.2% similar) in 447 aa overlap (10-453:11-457)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSRD
::: : .:: . .:.::::.:.::: :::.::::.: : :. ::::
CCDS30 MQATSNLLNLLLLSLFAGLDPSKTQISPKEGWQVYSSAQDPDGRCICTVVAPEQNLCSRD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADG---SLSA
..::.::::.:::::.:::.:::.::: ::.::: ::: :..: :..: . .: .
CCDS30 AKSRQLRQLLEKVQNMSQSIEVLNLRTQRDFQYVLKMETQMKGLKAKFRQIEDDRKTLMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQ
: :::::..: ::::: ::::::.:.. :....::.::::. :..::::.::: ::.:.
CCDS30 KHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNLSAVLTGIQEEIGAYDYEELH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 QRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGY
:::..::.::. : .:: :::: ...:.::.. :.:::.:::: .: ..::::::.:
CCDS30 QRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGAWMTDPLASEKNNRVWYMDSY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 YKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSR
... : :.....::..: . . :: ::::.::::::::..::::::...:: :
CCDS30 TNNKIVREYKSIADFVSGAESRTYNLPFKWAGTNHVVYNGSLYFNKYQSNIIIKYSFDMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLE
::.:::: ::..:..::.::::::.:.:.:: ::::::.:::::::::.:.:. :::
CCDS30 RVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVYATNQNAGNIVISQLNQDTLE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSH
::.::.::::::::::.:::::.::::::::.:::::..: :.::.:::::.:::::: :
CCDS30 VMKSWSTGYPKRSAGESFMICGTLYVTNSHLTGAKVYYSYSTKTSTYEYTDIPFHNQYFH
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE6 ISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::::::: :.::::.::::::::.::::::.:.: :
CCDS30 ISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
430 440 450
>>CCDS72832.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 (478 aa)
initn: 1920 init1: 1550 opt: 1948 Z-score: 2121.3 bits: 401.8 E(32554): 7.8e-112
Smith-Waterman score: 1948; 61.3% identity (84.5% similar) in 457 aa overlap (2-453:21-477)
10 20 30
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAG-QTLFQ-NPEEGWQLYTSAQA
: . : :. : . :. .:: : .:.::::.:.:::
CCDS72 MSPPLLKLGAVLSTMAMISNWMSQTLPSLVGLNTTRLSTPDTLTQISPKEGWQVYSSAQD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PDGKCICTAVIPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETL
:::.::::.: : :. ::::..::.::::.:::::.:::.:::.::: ::.::: :::
CCDS72 PDGRCICTVVAPEQNLCSRDAKSRQLRQLLEKVQNMSQSIEVLNLRTQRDFQYVLKMETQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 MRSLDARLRAADG---SLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNL
:..: :..: . .: .: :::::..: ::::: ::::::.:.. :....::.:::
CCDS72 MKGLKAKFRQIEDDRKTLMTKHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGS
:. :..::::.::: ::.:.:::..::.::. : .:: :::: ...:.::.. :.:::.
CCDS72 SAVLTGIQEEIGAYDYEELHQRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 WMTDTMAPSADSRVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNG
:::: .: ..::::::.: ... : :.....::..: . . :: ::::.::::::
CCDS72 WMTDPLASEKNNRVWYMDSYTNNKIVREYKSIADFVSGAESRTYNLPFKWAGTNHVVYNG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVY
::..::::::...:: : ::.:::: ::..:..::.::::::.:.:.:: ::::::
CCDS72 SLYFNKYQSNIIIKYSFDMGRVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVY
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 TTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAY
.:::::::::.:.:. :::::.::.::::::::::.:::::.::::::::.:::::..:
CCDS72 ATNQNAGNIVISQLNQDTLEVMKSWSTGYPKRSAGESFMICGTLYVTNSHLTGAKVYYSY
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 FTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
:.::.:::::.:::::: :::::::: :.::::.::::::::.::::::.:.: :
CCDS72 STKTSTYEYTDIPFHNQYFHISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
430 440 450 460 470
>>CCDS6986.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (467 aa)
initn: 1869 init1: 1509 opt: 1910 Z-score: 2080.2 bits: 394.2 E(32554): 1.5e-109
Smith-Waterman score: 1910; 59.0% identity (86.7% similar) in 444 aa overlap (10-450:21-464)
10 20 30 40
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAV
:.:.: . :.: ::::.::.:.::: .:.::::.:
CCDS69 MPGRWRWQRDMHPARKLLSLLFLILMGTELTQVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 IPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRA
: :. ::::.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:.....
CCDS69 APQQTMCSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 ADGSLS---AKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEE
.. : . :..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::
CCDS69 VEESHKQHLARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 MGAYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSA
.::: :..::.:: :: ::.:: :::.::::::.:.:.::.. :::::::::: .:: .
CCDS69 IGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 DSRVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSN
:.::::::::...: : :.... ::.. .:: .: ::.::.:::.::::::...::.::.
CCDS69 DNRVWYMDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 VVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIV
..... ......: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.:::::::::
CCDS69 IIIRFDLKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 VSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYT
:::::: .:.....:.:.::::::::::.:::.:::::.. .:.::..:: ::.:.:::
CCDS69 VSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYI
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KE6 DVPFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
:.::.:.:::::::::::..::::.::::::.:::::::::: .
CCDS69 DIPFQNKYSHISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
430 440 450 460
>>CCDS65183.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (458 aa)
initn: 1869 init1: 1509 opt: 1897 Z-score: 2066.2 bits: 391.6 E(32554): 9.1e-109
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSR
..: ::::.::.:.::: .:.::::.: : :. :::
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10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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:.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:..... .. : .
CCDS65 DARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDL
:..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::.::: :..:
CCDS65 ARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIGAYDYDEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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:.:: :: ::.:: :::.::::::.:.:.::.. :::::::::: .:: .:.:::::::
CCDS65 QSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWYMDG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 YYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRS
:...: : :.... ::.. .:: .: ::.::.:::.::::::...::.::...... ...
CCDS65 YHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
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...: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.::::::::::::::: .:
CCDS65 ETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSL
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360 370 380 390 400 410
pF1KE6 EVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYS
.....:.:.::::::::::.:::.:::::.. .:.::..:: ::.:.::: :.::.:.::
CCDS65 QTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYS
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420 430 440 450
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:::::::::..::::.::::::.:::::::::: .
CCDS65 HISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
430 440 450
>>CCDS65184.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (485 aa)
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Smith-Waterman score: 1896; 60.0% identity (87.9% similar) in 428 aa overlap (26-450:55-482)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQST
::::.::.:.::: .:.::::.: : :.
CCDS65 TLPSLVGLNTTKLSAAGGGTLDRSTGVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTM
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
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::::.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:..... .. : .
CCDS65 CSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHK
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ---AKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGY
:..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::.::: :
CCDS65 QHLARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIGAYDY
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWY
..::.:: :: ::.:: :::.::::::.:.:.::.. :::::::::: .:: .:.::::
CCDS65 DELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWY
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYH
::::...: : :.... ::.. .:: .: ::.::.:::.::::::...::.::......
CCDS65 MDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFD
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300 310 320 330 340 350
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......: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.:::::::::::::::
CCDS65 LKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDP
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 HTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHN
.:.....:.:.::::::::::.:::.:::::.. .:.::..:: ::.:.::: :.::.:
CCDS65 VSLQTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQN
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450
pF1KE6 QYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
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CCDS65 KYSHISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
450 460 470 480
>>CCDS1297.1 MYOC gene_id:4653|Hs108|chr1 (504 aa)
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Smith-Waterman score: 758; 31.5% identity (63.4% similar) in 464 aa overlap (26-444:41-501)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQST
: . : :: . : .. : :.:.
CCDS12 FGPEMPAVQLLLLACLVWDVGARTAQLRKANDQSGRCQYTFSVASPNESSCPEQSQAMSV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 CSRDGRSRELRQL-MEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMET---LMRSLDARLRAAD
:. ..: .: .. .:.: : . : : .: .:: :.: : . ::
CCDS12 IHNLQRDSSTQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLD-QAARPQETQEGLQREL-GTLRRER
80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KE6 GSLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYK---------------ADTRTIVRLRE----E
.: ... .::. ...:: .::::. : .... ..:::. .
CCDS12 DQLETQT-RELETAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARLRRGQCPQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE6 VRNLS-----GSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMALEAR----------LHACAQKLGCGK
.:. . :: . .. . ....:.... . : :.. :::.
CCDS12 TRDTARAVPPGSREVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGYLRSGEGDTGCGE
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
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:. :..:.:.:. . ...: :: : : .. .: .: :.:.:. ...:
CCDS12 LVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFEYDLISQF
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260 270 280 290 300 310
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..: :.::.: .:: :::.:::... .: .:..:.. ...: ... .:::::..
CCDS12 MQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEIPGAGYHG
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320 330 340 350 360 370
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:::::::..:.:. :::.:::..:.:.. : ::.:.:.:..::. ..:.:. :.:..
CCDS12 QFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETNIRKQSVA
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 EAFMICGVLYVTNSHL-AGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRERALY
.::.:::.::...:. : : : ::: :.:. . .::.:.:.. ::.:::: :. :.
CCDS12 NAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYNPLEKKLF
430 440 450 460 470 480
440 450
pF1KE6 TWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
.:.: ..: :.. :
CCDS12 AWDNLNMVTYDIKLSKM
490 500
>>CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240 aa)
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140 150 160 170 180 190
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CCDS82 DAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCP-----
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: : :: . . . :.: : . .:.....:: :. . :. . ::: :
CCDS82 GLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPL--QASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAG
140 150 160 170 180 190
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pF1KE6 YSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAF
: ::: ::.:. :::.:::..:.:.:: :.::.:.:.:.::.. .:::.: ::::..::
CCDS82 YRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAF
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::::.:::..: . .: :. . : :. :. .:::: :.:..:. .:::::.
CCDS82 MICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDN
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pF1KE6 ALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::.::: : : :.. . . : ::
CCDS82 LLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLG
380 390 400 410 420 430
>>CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469 aa)
initn: 621 init1: 478 opt: 693 Z-score: 750.1 bits: 149.7 E(32554): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 693; 38.6% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (168-452:112-399)
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 QYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMA--LEARLHACAQKLGC
:.: : ..: . . .: .. :
CCDS54 DAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCP-----
90 100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 GKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGY-YKGRRVLEFRTLGDFIKG
: : :: . . . :.: : . .:.....:: :. . :. . ::: :
CCDS54 GLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPL--QASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAG
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pF1KE6 QNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFP
. . ::. ::: :::.:.::.:: .. .::. .:.: . . .:.:..: :
CCDS54 RPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSP
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: ::: ::.:. :::.:::..:.:.:: :.::.:.:.:.::.. .:::.: ::::..::
CCDS54 YRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAF
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::::.:::..: . .: :. . : :. :. .:::: :.:..:. .:::::.
CCDS54 MICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDN
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CCDS54 LLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLG
380 390 400 410 420 430
454 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:56:42 2016 done: Tue Nov 8 12:56:43 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]