Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8012
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8012, 708 aa
1>>>pF1KB8012 708 - 708 aa - 708 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6475+/-0.000844; mu= 6.1723+/- 0.051
mean_var=205.5326+/-41.164, 0's: 0 Z-trim(114.0): 17 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.089461
statistics sampled from 14597 (14613) to 14597 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16
Scan time: 4.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31410.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 708) 4833 636.6 3.8e-182
CCDS66018.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 710) 4819 634.8 1.3e-181
CCDS58114.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 488) 3243 431.2 1.7e-120
CCDS66016.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 475) 3229 429.4 5.9e-120
CCDS66017.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 490) 3229 429.4 6e-120
CCDS66015.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 ( 451) 3081 410.3 3.2e-114
CCDS54761.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 758) 1619 221.8 3e-57
CCDS54762.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 759) 1616 221.4 3.9e-57
CCDS82918.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 737) 1586 217.5 5.7e-56
CCDS43224.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 736) 1569 215.3 2.6e-55
CCDS47279.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 484) 1012 143.3 8.2e-34
CCDS4229.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 486) 998 141.5 2.9e-33
CCDS4228.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 491) 988 140.2 7.1e-33
CCDS4227.1 APBB3 gene_id:10307|Hs108|chr5 ( 493) 824 119.0 1.7e-26
CCDS54760.1 APBB2 gene_id:323|Hs108|chr4 ( 210) 779 112.9 4.8e-25
>>CCDS31410.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (708 aa)
initn: 4833 init1: 4833 opt: 4833 Z-score: 3383.5 bits: 636.6 E(32554): 3.8e-182
Smith-Waterman score: 4833; 100.0% identity (100.0% similar) in 708 aa overlap (1-708:1-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQATAVGPKDLRSAMGEGGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQATAVGPKDLRSAMGEGGGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEASQEPEMAPLGPKGLIHLYSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEASQEPEMAPLGPKGLIHLYSEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ELSAHNAANRGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELSAHNAANRGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EPLESVEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EPLESVEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 TWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 FQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 ECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB8 DARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
670 680 690 700
>>CCDS66018.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (710 aa)
initn: 3209 init1: 3157 opt: 4819 Z-score: 3373.7 bits: 634.8 E(32554): 1.3e-181
Smith-Waterman score: 4819; 99.7% identity (99.7% similar) in 710 aa overlap (1-708:1-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQATAVGPKDLRSAMGEGGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQATAVGPKDLRSAMGEGGGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEASQEPEMAPLGPKGLIHLYSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEASQEPEMAPLGPKGLIHLYSEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ELSAHNAANRGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ELSAHNAANRGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EPLESVEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPLESVEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 TWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB8 DLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGR--DFAYVARDKLTQMLKCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS66 DLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRERDFAYVARDKLTQMLKCH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 VFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 QKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KB8 CLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
670 680 690 700 710
>>CCDS58114.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (488 aa)
initn: 3243 init1: 3243 opt: 3243 Z-score: 2276.7 bits: 431.2 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 3243; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (241-708:21-488)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSAMFSQDFFLAIILQDSSADSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
10 20 30 40 50
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
60 70 80 90 100 110
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
120 130 140 150 160 170
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 RVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCL
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 VNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSS
300 310 320 330 340 350
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 SSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASF
360 370 380 390 400 410
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 CCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRG
420 430 440 450 460 470
700
pF1KB8 VQSLWGSLKPKRLGAHTP
::::::::::::::::::
CCDS58 VQSLWGSLKPKRLGAHTP
480
>>CCDS66016.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 1685 init1: 1685 opt: 3229 Z-score: 2267.1 bits: 429.4 E(32554): 5.9e-120
Smith-Waterman score: 3229; 99.6% identity (99.6% similar) in 470 aa overlap (241-708:6-475)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MTQMRDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500
pF1KB8 RVWGVGRDSGR--DFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNAR
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVWGVGRDSGRERDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNAR
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 CLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVL
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 SSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPA
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 SFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVR
400 410 420 430 440 450
690 700
pF1KB8 RGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
::::::::::::::::::::
CCDS66 RGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
460 470
>>CCDS66017.1 APBB1 gene_id:322|Hs108|chr11 (490 aa)
initn: 1685 init1: 1685 opt: 3229 Z-score: 2266.9 bits: 429.4 E(32554): 6e-120
Smith-Waterman score: 3229; 99.6% identity (99.6% similar) in 470 aa overlap (241-708:21-490)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSAMFSQDFFLAIILQDSSADSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYY
10 20 30 40 50
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQEESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELG
60 70 80 90 100 110
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRS
120 130 140 150 160 170
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISI
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500
pF1KB8 RVWGVGRDSGR--DFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNAR
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVWGVGRDSGRERDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNAR
240 250 260 270 280 290
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 CLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVL
300 310 320 330 340 350
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 SSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVR
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::::::::::::::::::::
CCDS66 RGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS66 VQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHT
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pF1KB8 P
:
CCDS66 P
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.. :: ....::: . . .: : :: : .:.:.::::.:: ...:
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130 140 150 160 170 180
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:: ... .: . . :.: . : .. . : . :: . . .
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190 200 210 220 230 240
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:.. : :. .:. : ..: : :::.:::.:::: : : .::..:: .:. ..:
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250 260 270 280 290
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.:: ::: :: ::.: .::::::::::::::: : . :. ::: .:.
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300 310 320 330 340 350
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.:.: :. :: .: . ....::: . . . .::: : .:: . . .: : :..
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360 370 380 390 400 410
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::::::. : ::.. :.::.:.....::.:::.::::::::::.::::::::::: :..
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::::::::..::: ::::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.:
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:.::::::.: ::: .:: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.. .
CCDS54 KTELVQKFHVQYLGMLPVDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISE
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600 610 620 630 640 650
pF1KB8 QTEA-VLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAAC
..: :: :::::::::..::.::::::::: .: : ::.:::::::...::::::::
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660 670 680 690 700
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:::::::: :: .. : :::.::.::: .:.::: :: .:: :: .. :
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:: . .. : :: . : .: : ...::.::::... :
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.. :: ....::: . . .: : :: : .:.:.::::.:: ...:
CCDS54 KNSTPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDP
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90 100 110 120
pF1KB8 NRN------VTLTLAEEASQEP--------EMAPLGP---KGLIHLYSELELSAHN-AAN
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CCDS54 NKNLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQN
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLESVEAP
:: ... .: . . :.: . : .. . : . :: . . .
CCDS54 RG---------NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPN--RPQSSPEDGQVATVS
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAF
:.. : :. .:. : ..: : :::.:::.:::: : : .::..: ..:. ..:
CCDS54 SSPETKKDHPKTGAKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETADIWSDHSF
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250 260 270 280 290
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.:: ::: :: ::.: .::::::::::::::: : . :. ::: .:.
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pF1KB8 EESQLTWTGFAHGEGFE-DGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQE
.:.: :. :: .: . ....::: . . . .::: : .:: . . .: : :..
CCDS54 NEKQ-PWSDFAVLNGGKINSDIWKDLHAATVNPDPSLKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDD
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pF1KB8 EEKLPPRNTNPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSG
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pF1KB8 GWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQM
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::::::::..::: ::::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.:
CCDS54 LKCHVFRCDTPAKAIATSLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTP
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:.::::::.: ::: .:: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.. .
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pF1KB8 QTEA-VLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAAC
..: :: :::::::::..::.::::::::: .: : ::.:::::::...::::::::
CCDS54 KNEEEVLVECRVRFLSFMGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAAC
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CCDS82 NKNLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQN
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLESVEAP
:: ... .: . . :.: . : .. . : . :: . . .
CCDS82 RG---------NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPN--RPQSSPEDGQVATVS
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pF1KB8 PRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAF
:.. : :. .:. : ..: : :::.:::.:::: : : .::..:: .:. ..:
CCDS82 SSPETKKDHPKTGAKTDCALHRIQNLAPSDEESSWTTLSQDSASPSSPDETD-IWSDHSF
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pF1KB8 ETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPS--QGSSPQEESQLTWTGFAH
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CCDS82 QTDPDLPPGWKRVSDIAGTYYWHIPTGTTQWERP-VSIPADLQGSRKGSLSSVTPSPTPE
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.: .. . : :: ::: : .:: . . .: : :..... :..:
CCDS82 NEDLHAATVNPD-PS--------LKEFEGATLRYASLKLRNAPHPDDDDSCSI-NSDPEA
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pF1KB8 KCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLE
:::::::::::::.::.::::.:::::::::::::: ::...: . : ::::::. : ::
CCDS82 KCFAVRSLGWVEMAEEDLAPGKSSVAVNNCIRQLSYCKNDIRDTV-GIWGEGKDMYLILE
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DETLKLVEPQSQALLHAQPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAK
.. :.::.:.....::.:::.::::::::::.::::::::::: :..::::::::..:::
CCDS82 NDMLSLVDPMDRSVLHSQPIVSIRVWGVGRDNGRDFAYVARDKDTRILKCHVFRCDTPAK
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pF1KB8 NIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKL-VDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYL
::::::::::::::::.::. :. . ..... .:::.::.::.::.::::::.: ::
CCDS82 AIATSLHEICSKIMAERKNAKALACSSLQERANVNLDVPLQVDFPTPKTELVQKFHVQYL
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pF1KB8 GNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEA-VLGECRVR
: .:: ::::.:..:.:.:....::..:.: ...:: ::.:.. ...: :: :::::
CCDS82 GMLPVDKPVGMDILNSAIENLMTSSNKEDWLSVNMNVADATVTVISEKNEEEVLVECRVR
580 590 600 610 620 630
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pF1KB8 FLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQ
::::..::.::::::::: .: : ::.:::::::...:::::::::::::::: ::
CCDS82 FLSFMGVGKDVHTFAFIMDTGNQRFECHVFWCEPNAGNVSEAVQAACMLRYQKCLVARPP
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670 680 690 700
pF1KB8 ASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP
.. : :::.::.::: .:.::: :: .:: :: .. :
CCDS82 SQKVRPPPPPADSVTRRVTTNVKRGVLSLIDTLKQKRPVTEMP
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10 20 30 40
pF1KB8 MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQAT--
:: . .. : :: . : .: : ...::.::::... :
CCDS43 MSEVLPADSGVDTLAVFMASSGTTDVTNRNSPATPPNTLNL--RSSHNELLNAEIKHTET
10 20 30 40 50
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pF1KB8 --AVGPK--------DLRSAMGEGG-GPEP----GPANAKWLKEGQNQLRRAAT-AHRDQ
.. :: ....::: . . .: : :: : .:.:.::::.:: ...:
CCDS43 KNSTPPKCRKKYALTNIQAAMGLSDPAAQPLLGNGSANIKLVKNGENQLRKAAEQGQQDP
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 NRN------VTLTLAEEASQEP--------EMAPLGP---KGLIHLYSELELSAHN-AAN
:.: ...: . ..:: :. : : :.... :..:: ::.. :
CCDS43 NKNLSPTAVINITSEKLEGKEPHPQDSSSCEILPSQPRRTKSFLNYYADLETSARELEQN
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RGLRGPGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLESVEAP
:: ... .: . . :.: . : .. . : . :: . . .
CCDS43 RG---------NHHGTAEEKSQPVQGQASTIIGNGDLLLQKPN--RPQSSPEDGQVATVS
180 190 200 210 220
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