FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1461, 492 aa 1>>>pF1KE1461 492 - 492 aa - 492 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9644+/-0.000309; mu= 6.2671+/- 0.019 mean_var=156.9542+/-31.152, 0's: 0 Z-trim(122.0): 52 B-trim: 33 in 1/53 Lambda= 0.102374 statistics sampled from 39344 (39408) to 39344 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16 Scan time: 9.780 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011512557 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 492) 3505 529.3 9.7e-150 XP_011512556 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 492) 3505 529.3 9.7e-150 NP_006644 (OMIM: 607744) fibroblast growth factor ( 492) 3505 529.3 9.7e-150 XP_016865682 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 455) 3240 490.1 5.5e-138 NP_001265280 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001265282 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001036020 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 XP_016874207 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 880 141.6 5.1e-33 XP_016874206 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 880 141.6 5.1e-33 XP_016874208 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001265286 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001265285 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001265283 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001265284 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_006645 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor ( 508) 880 141.6 5.1e-33 NP_001184189 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342) 218 43.7 0.00099 NP_001305795 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342) 218 43.7 0.00099 NP_001305796 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 470) 218 43.8 0.0013 NP_001372 (OMIM: 602919) docking protein 1 isoform ( 481) 218 43.8 0.0013 NP_001304729 (OMIM: 604997) docking protein 2 isof ( 258) 206 41.9 0.0027 NP_958728 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 258) 206 41.9 0.0027 XP_005273737 (OMIM: 604997) PREDICTED: docking pro ( 318) 206 41.9 0.0032 NP_003965 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 412) 206 42.0 0.004 >>XP_011512557 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast grow (492 aa) initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505 Z-score: 2809.3 bits: 529.3 E(85289): 9.7e-150 Smith-Waterman score: 3505; 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NP_001 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVV-E 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCP-----GEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLG ::.: .::..::.:. :.. :...... :: : :.. . :. :..: : ::.: NP_001 RNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EESTHALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQ-PLP------EGQAPFLPQARGPDQ ::::: :.. .:: :::::: . ... :..: .. :: :...: . . .. NP_001 EESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEE-RKNRTSVHVPLEARVSNAESSTP-KEEPSSIED 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE1 RDPQVFLQPGQVKFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHN--NNNEAPS--------E ::::..:.: :::::::::....... . : .: . ::.: . . NP_001 RDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRD 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 CPAQPKCTYENVTG-------GLWRGAGWRLSPEEP-GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPP :. : .:::..: :. :: : . . :. :.::.:::.::::: ::: NP_001 APSVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPP 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 VWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPL ::: :..: . :. :. ::: ::. .. . :... ..:. . .. . NP_001 VWE--ARKL---SRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLD---PMHNYVNTENVTVPASAHKIEY 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE1 TRRRG-SPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQVELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPA .::: .: :::::.:::. : ::::::::.:.: :.: . ::.:..: .:.: : :. NP_001 SRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEH-RQLNYIQVDLEG-GSDSDN-PQTPKTPTTPLPQT-PT 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE1 RSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTARKTRHNSTDLPL : .. :::::...:.::::::.::::::::.:::::::::::. 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