Result of FASTA (omim) for pFN21AE1461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1461, 492 aa
  1>>>pF1KE1461 492 - 492 aa - 492 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9644+/-0.000309; mu= 6.2671+/- 0.019
 mean_var=156.9542+/-31.152, 0's: 0 Z-trim(122.0): 52  B-trim: 33 in 1/53
 Lambda= 0.102374
 statistics sampled from 39344 (39408) to 39344 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.462), width:  16
 Scan time:  9.780

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011512557 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast  ( 492) 3505 529.3 9.7e-150
XP_011512556 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast  ( 492) 3505 529.3 9.7e-150
NP_006644 (OMIM: 607744) fibroblast growth factor  ( 492) 3505 529.3 9.7e-150
XP_016865682 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast  ( 455) 3240 490.1 5.5e-138
NP_001265280 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001265282 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001036020 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
XP_016874207 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast  ( 508)  880 141.6 5.1e-33
XP_016874206 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast  ( 508)  880 141.6 5.1e-33
XP_016874208 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast  ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001265286 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001265285 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001265283 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001265284 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_006645 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor  ( 508)  880 141.6 5.1e-33
NP_001184189 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342)  218 43.7 0.00099
NP_001305795 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342)  218 43.7 0.00099
NP_001305796 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 470)  218 43.8  0.0013
NP_001372 (OMIM: 602919) docking protein 1 isoform ( 481)  218 43.8  0.0013
NP_001304729 (OMIM: 604997) docking protein 2 isof ( 258)  206 41.9  0.0027
NP_958728 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 258)  206 41.9  0.0027
XP_005273737 (OMIM: 604997) PREDICTED: docking pro ( 318)  206 41.9  0.0032
NP_003965 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 412)  206 42.0   0.004


>>XP_011512557 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast grow  (492 aa)
 initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505  Z-score: 2809.3  bits: 529.3 E(85289): 9.7e-150
Smith-Waterman score: 3505; 100.0% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
              430       440       450       460       470       480

              490  
pF1KE1 RKTRHNSTDLPL
       ::::::::::::
XP_011 RKTRHNSTDLPL
              490  

>>XP_011512556 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast grow  (492 aa)
 initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505  Z-score: 2809.3  bits: 529.3 E(85289): 9.7e-150
Smith-Waterman score: 3505; 100.0% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
              430       440       450       460       470       480

              490  
pF1KE1 RKTRHNSTDLPL
       ::::::::::::
XP_011 RKTRHNSTDLPL
              490  

>>NP_006644 (OMIM: 607744) fibroblast growth factor rece  (492 aa)
 initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505  Z-score: 2809.3  bits: 529.3 E(85289): 9.7e-150
Smith-Waterman score: 3505; 100.0% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RLSPEEPGWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTA
              430       440       450       460       470       480

              490  
pF1KE1 RKTRHNSTDLPL
       ::::::::::::
NP_006 RKTRHNSTDLPL
              490  

>>XP_016865682 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast grow  (455 aa)
 initn: 3240 init1: 3240 opt: 3240  Z-score: 2598.3  bits: 490.1 E(85289): 5.5e-138
Smith-Waterman score: 3240; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (38-492:1-455)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE1 LNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYLCLRRYGY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MELTQSELVLHLHRREAVRWPYLCLRRYGY
                                             10        20        30

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE1 DSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIITRNSHPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIITRNSHPAE
               40        50        60        70        80        90

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE1 LDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTHALIAPDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCPGEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLGEESTHALIAPDE
              100       110       120       130       140       150

       190       200       210       220       230       240       
pF1KE1 QSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQVKFVLGPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQPLPEGQAPFLPQARGPDQRDPQVFLQPGQVKFVLGPT
              160       170       180       190       200       210

       250       260       270       280       290       300       
pF1KE1 PARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGWRLSPEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHNNNNEAPSECPAQPKCTYENVTGGLWRGAGWRLSPEEP
              220       230       240       250       260       270

       310       320       330       340       350       360       
pF1KE1 GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPPVWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDE
              280       290       300       310       320       330

       370       380       390       400       410       420       
pF1KE1 TPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQVELKGWGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPLTRRRGSPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQVELKGWGG
              340       350       360       370       380       390

       430       440       450       460       470       480       
pF1KE1 DRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTARKTRHNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPARSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTARKTRHNS
              400       410       420       430       440       450

       490  
pF1KE1 TDLPL
       :::::
XP_016 TDLPL
            

>>NP_001265280 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor r  (508 aa)
 initn: 1402 init1: 663 opt: 880  Z-score: 713.8  bits: 141.6 E(85289): 5.1e-33
Smith-Waterman score: 1524; 48.6% identity (73.4% similar) in 523 aa overlap (1-492:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::: ..:.::::: .:::: ::::.: :::::.::::..::.:. ..:..:.: ::
NP_001 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.::..:: :::::.::::.  
NP_001 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVV-E
               70        80        90       100       110          

              130       140       150            160       170     
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCP-----GEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLG
       ::.: .::..::.:. :.. :...... :: :     :..    . :. :..: : ::.:
NP_001 RNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVG
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210              220        
pF1KE1 EESTHALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQ-PLP------EGQAPFLPQARGPDQ
       ::::: :.. .:: :::::: . ... :..:  .. ::       :...:   .  . ..
NP_001 EESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEE-RKNRTSVHVPLEARVSNAESSTP-KEEPSSIED
     180       190       200        210       220        230       

      230       240       250       260       270                  
pF1KE1 RDPQVFLQPGQVKFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHN--NNNEAPS--------E
       ::::..:.:  :::::::::....... . :    .:    .  ::.:  .        .
NP_001 RDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRD
       240       250       260       270       280       290       

      280       290              300        310       320       330
pF1KE1 CPAQPKCTYENVTG-------GLWRGAGWRLSPEEP-GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPP
        :.  : .:::..:       :. ::     :  .  . :. :.::.:::.::::: :::
NP_001 APSVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPP
       300       310       320       330       340       350       

              340       350       360       370       380       390
pF1KE1 VWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPL
       :::  :..:   . :. :.    ::: ::. .. .   :... ..:. .    ..  .  
NP_001 VWE--ARKL---SRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLD---PMHNYVNTENVTVPASAHKIEY
       360            370       380          390       400         

               400       410       420       430       440         
pF1KE1 TRRRG-SPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQVELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPA
       .:::  .: :::::.:::. :  ::::::::.:.: :.:  . ::.:..: .:.: : :.
NP_001 SRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEH-RQLNYIQVDLEG-GSDSDN-PQTPKTPTTPLPQT-PT
     410       420       430        440         450       460      

     450       460       470       480       490  
pF1KE1 RSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTARKTRHNSTDLPL
       : .. :::::...:.::::::.::::::::.:::::::::::.
NP_001 RRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM
         470       480       490       500        

>>NP_001265282 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor r  (508 aa)
 initn: 1402 init1: 663 opt: 880  Z-score: 713.8  bits: 141.6 E(85289): 5.1e-33
Smith-Waterman score: 1524; 48.6% identity (73.4% similar) in 523 aa overlap (1-492:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::: ..:.::::: .:::: ::::.: :::::.::::..::.:. ..:..:.: ::
NP_001 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.::..:: :::::.::::.  
NP_001 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVV-E
               70        80        90       100       110          

              130       140       150            160       170     
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCP-----GEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLG
       ::.: .::..::.:. :.. :...... :: :     :..    . :. :..: : ::.:
NP_001 RNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVG
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210              220        
pF1KE1 EESTHALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQ-PLP------EGQAPFLPQARGPDQ
       ::::: :.. .:: :::::: . ... :..:  .. ::       :...:   .  . ..
NP_001 EESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEE-RKNRTSVHVPLEARVSNAESSTP-KEEPSSIED
     180       190       200        210       220        230       

      230       240       250       260       270                  
pF1KE1 RDPQVFLQPGQVKFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHN--NNNEAPS--------E
       ::::..:.:  :::::::::....... . :    .:    .  ::.:  .        .
NP_001 RDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRD
       240       250       260       270       280       290       

      280       290              300        310       320       330
pF1KE1 CPAQPKCTYENVTG-------GLWRGAGWRLSPEEP-GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPP
        :.  : .:::..:       :. ::     :  .  . :. :.::.:::.::::: :::
NP_001 APSVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPP
       300       310       320       330       340       350       

              340       350       360       370       380       390
pF1KE1 VWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPL
       :::  :..:   . :. :.    ::: ::. .. .   :... ..:. .    ..  .  
NP_001 VWE--ARKL---SRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLD---PMHNYVNTENVTVPASAHKIEY
       360            370       380          390       400         

               400       410       420       430       440         
pF1KE1 TRRRG-SPRVFNFDFRRPGPEPPRQLNYIQVELKGWGGDRPKGPQNPSSPQAPMPTTHPA
       .:::  .: :::::.:::. :  ::::::::.:.: :.:  . ::.:..: .:.: : :.
NP_001 SRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEH-RQLNYIQVDLEG-GSDSDN-PQTPKTPTTPLPQT-PT
     410       420       430        440         450       460      

     450       460       470       480       490  
pF1KE1 RSSDSYAVIDLKKTVAMSNLQRALPRDDGTARKTRHNSTDLPL
       : .. :::::...:.::::::.::::::::.:::::::::::.
NP_001 RRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM
         470       480       490       500        

>>NP_001036020 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor r  (508 aa)
 initn: 1402 init1: 663 opt: 880  Z-score: 713.8  bits: 141.6 E(85289): 5.1e-33
Smith-Waterman score: 1524; 48.6% identity (73.4% similar) in 523 aa overlap (1-492:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL
       ::::::: ..:.::::: .:::: ::::.: :::::.::::..::.:. ..:..:.: ::
NP_001 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCSRAEEIFNLLQDLMQCNSINVMEEPVIIT
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.::..:: :::::.::::.  
NP_001 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVV-E
               70        80        90       100       110          

              130       140       150            160       170     
pF1KE1 RNSHPAELDLPRAPQPPNALGYTVSSFSNGCP-----GEGPRFSAPRRLSTSSLRHPSLG
       ::.: .::..::.:. :.. :...... :: :     :..    . :. :..: : ::.:
NP_001 RNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVG
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210              220        
pF1KE1 EESTHALIAPDEQSHTYVNTPASEDDHRRGRHCLQ-PLP------EGQAPFLPQARGPDQ
       ::::: :.. .:: :::::: . ... :..:  .. ::       :...:   .  . ..
NP_001 EESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEE-RKNRTSVHVPLEARVSNAESSTP-KEEPSSIED
     180       190       200        210       220        230       

      230       240       250       260       270                  
pF1KE1 RDPQVFLQPGQVKFVLGPTPARRHMVKCQGLCPSLHDPPHHN--NNNEAPS--------E
       ::::..:.:  :::::::::....... . :    .:    .  ::.:  .        .
NP_001 RDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRD
       240       250       260       270       280       290       

      280       290              300        310       320       330
pF1KE1 CPAQPKCTYENVTG-------GLWRGAGWRLSPEEP-GWNGLAHRRAALLHYENLPPLPP
        :.  : .:::..:       :. ::     :  .  . :. :.::.:::.::::: :::
NP_001 APSVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPP
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KE1 VWESQAQQLGGEAGDDGDSRDGLTPSSNGFPDGEEDETPLQKPTSTRAAIRSHGSFPVPL
       :::  :..:   . :. :.    ::: ::. .. .   :... ..:. .    ..  .  
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       : .. :::::...:.::::::.::::::::.:::::::::::.
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       : .. :::::...:.::::::.::::::::.:::::::::::.
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>>XP_016874208 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast grow  (508 aa)
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XP_016 RRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM
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492 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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