FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6266, 770 aa 1>>>pF1KB6266 770 - 770 aa - 770 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9109+/-0.00105; mu= -4.0616+/- 0.063 mean_var=361.7222+/-77.510, 0's: 0 Z-trim(113.8): 70 B-trim: 151 in 1/52 Lambda= 0.067435 statistics sampled from 14373 (14439) to 14373 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16 Scan time: 4.170 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6661.1 TLE1 gene_id:7088|Hs108|chr9 ( 770) 5268 527.0 4.3e-149 CCDS43837.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 773) 4564 458.5 1.8e-128 CCDS61691.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 767) 4210 424.1 4.1e-118 CCDS61692.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 764) 4206 423.7 5.4e-118 CCDS45293.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 772) 4190 422.2 1.6e-117 CCDS45294.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 769) 4186 421.8 2.1e-117 CCDS61689.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 762) 4131 416.4 8.5e-116 CCDS65070.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 748) 3859 389.9 7.7e-108 CCDS65069.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 805) 2990 305.4 2.3e-82 CCDS75851.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 704) 2980 304.4 4.1e-82 CCDS73747.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 699) 2931 299.6 1.1e-80 CCDS58375.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 760) 2647 272.0 2.4e-72 CCDS45912.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 621) 2313 239.5 1.3e-62 CCDS45911.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 743) 2313 239.5 1.5e-62 CCDS74255.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 744) 2313 239.5 1.5e-62 CCDS45913.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 706) 1935 202.7 1.6e-51 CCDS12102.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 197) 814 93.2 4.4e-19 CCDS12101.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 264) 779 89.9 5.7e-18 CCDS45910.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 572) 716 84.1 7.1e-16 CCDS12100.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 449) 704 82.8 1.3e-15 >>CCDS6661.1 TLE1 gene_id:7088|Hs108|chr9 (770 aa) initn: 5268 init1: 5268 opt: 5268 Z-score: 2790.2 bits: 527.0 E(32554): 4.3e-149 Smith-Waterman score: 5268; 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CCDS43 QSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEEKE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 -SSHYDSDGDKSDDNLVVDVSNEDPSSPRASPAHSPRENGIDKNRLLKKDASSSPASTAS ...:::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.::.::::::: :::: :: CCDS43 IAARYDSDGEKSDDNLVVDVSNEDPSSPRGSPAHSPRENGLDKTRLLKKDAPISPASIAS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 SASSTSLKSKEMSLHEKASTPVLKSSTPTPRSDMPTPGTSATPGLRPGLGKPPAIDPLVN :.:. : ::::.::.::..::: ::.:::::.: ::::...:::::: ::::..::: CCDS43 SSSTPSSKSKELSLNEKSTTPVSKSNTPTPRTDAPTPGSNSTPGLRPVPGKPPGVDPL-- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 QAAAGLRTPLAVPGPYPAPFGMVPHAGMNGELTSPGAAYASLHNMSPQMSAAAAAAAVVA :..::::.::: :::.:::.::::::::::::::::::.:::.::::::::::::..: CCDS43 --ASSLRTPMAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAAA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 -YGRSPMVGFDPPPHMRVPTIPPNLAGIPGGKPAYSFHVTADGQMQPVPFPPDALIGPGI :::::.::::: :::::.:::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::: CCDS43 AYGRSPVVGFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDALIGPGI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 PRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDN 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 YIRSCKLLPDGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFS :::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 YIRSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFS 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 CCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 CCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB6 QQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHVNKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGK ::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::: CCDS43 QQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAHCGK 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB6 WFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 WFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY 720 730 740 750 760 770 >>CCDS61691.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 (767 aa) initn: 3747 init1: 2386 opt: 4210 Z-score: 2233.9 bits: 424.1 E(32554): 4.1e-118 Smith-Waterman score: 4210; 80.6% identity (92.6% similar) in 774 aa overlap (1-770:1-767) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MFPQSRHPTPHQAAGQP-FKFTIPESLDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASEKTEMQR :.::.:::.::: ::: ::::. :: ::::.:::::::::::::.: .:::.::::::: CCDS61 MYPQGRHPAPHQP-GQPGFKFTVAESCDRIKDEFQFLQAQYHSLKVEYDKLANEKTEMQR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 HYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTICAQVIPFLSQEHQQQVAQAVERAKQVTMAEL ::::::::::::::::::::::::::::: ::..:::::::::::::::::::::::.:: CCDS61 HYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFLSQEHQQQVAQAVERAKQVTMTEL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 NAIIGQQQLQAQHLSHG-HGPPVPLTPHPSGLQPPGIPPL-GGSAGLLALSSALSGQSHL ::::::::::::::::. ::::: : :::::::::::::. :.:.:::::. ::..:.:: CCDS61 NAIIGQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPPHPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALG-ALGSQAHL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 AIKDDKKHHDAEHHRDREPGTSNSLLVPDSLRGTDKRRNGPEFSNDIKKRKVDDKDS-SH ..::.:.::. .: :.:: ...::. .:::...:.:.. ..: . ::::...::: :. CCDS61 TVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEEKDSLSR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 YDSDGDKSDDNLVVDVSNEDPSSPRASPAHSPRENGIDKNRLLKKDASSSPASTASSASS :::::::::: ::::::::::..::.:::::: :::.:: : ::::: .::::.:::.:. CCDS61 YDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASVASSSST 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 TSLKSKEMSLHEKASTPVLKSSTPTPRSDMPTPGTSATPGLRPGLGKPPAIDPLVNQAAA : :.:... ..:.::: :::.:::::.: ::::::.::::: ::::..:: .. :. 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CCDS61 TVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEEKDSLSR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 YDSDGDKSDDNLVVDVSNEDPSSPRASPAHSPRENGIDKNRLLKKDASSSPASTASSASS :::::::::: ::::::::::..::.:::::: :::.:: : ::::: .::::.:::.:. CCDS61 YDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASVASSSST 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 TSLKSKEMSLHEKASTPVLKSSTPTPRSDMPTPGTSATPGLRPGLGKPPAIDPLVNQAAA : :.:... ..:.::: :::.:::::.: ::::::.::::: ::::..::. :. 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CCDS61 TVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEEKDSLSR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 YDSDGDKSDDNLVVDVSNEDPSSPRASPAHSPRENGIDKNRLLKKDASSSPASTASSASS :::::::::: ::::::::::..::.:::::: :::.:: : ::::: .::::.:::.:. CCDS61 YDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASVASSSST 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 TSLKSKEMSLHEKASTPVLKSSTPTPRSDMPTPGTSATPGLRPGLGKPPAIDPLVNQAAA : :.:... ..:.::: :::.:::::.: ::::::.::::: ::::..::. :. CCDS61 PSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDAPTPGTSTTPGLRSMPGKPPGMDPI----AS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 GLRTPLAVPGPYPAPFGMVPHAGMNGELTSPGAAYASLHNMSPQMSAAAAAAAVVAYGRS .::::... . : :::.:. : ::: :::::: ::.:::. :::::::::::. ::::: CCDS61 ALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGA-YAGLHNIPPQMSAAAAAAAA-AYGRS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 PMV-----GFDPPPHMRVPTIPPNLAGIPGGKPAYSFHVTADGQMQPVPFPPDALIGPGI ::: :::: : ::. .: .::.::::::::::::.::::::::::: ::: :::: CCDS61 PMVSFGAVGFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPHDALAGPGI 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 PRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDN ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::: CCDS61 PRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPGSKSPISQLDCLNRDN 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 YIRSCKLLPDGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFS ::::::::::: :::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::.::::: CCDS61 YIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDAKVCFS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 CCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQL ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: CCDS61 CCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB6 QQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHVNKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGK :::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::: CCDS61 QQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHHTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGK 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB6 WFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS61 WFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISADDKYIVTGSGDKKATVYEVIY 710 720 730 740 750 760 >>CCDS65070.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 (748 aa) initn: 3115 init1: 2478 opt: 3859 Z-score: 2049.5 bits: 389.9 E(32554): 7.7e-108 Smith-Waterman score: 4367; 83.4% identity (92.1% similar) in 772 aa overlap (1-770:8-748) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MFPQSRHPTPHQAAGQPFKFTIPESLDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE :.::.:::.::: : ::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 MIRDLSKMYPQTRHPAPHQPA-QPFKFTISESCDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTICAQVIPFLSQEHQQQVAQAVERAKQ :::::::::::::::::::::::::.::.::::.:::::::::::: CCDS65 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNAICAQVIPFLSQE-------------- 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 VTMAELNAIIGQQQLQAQHLSHGHGPPVPLTPHPSGLQPPGIPPLGGSAGLLALSSALSG ::::::::::::: ::::::::::::::.:::.:.:::::::::::.: CCDS65 ------------QQLQAQHLSHGHGLPVPLTPHPSGLQPPAIPPIGSSAGLLALSSALGG 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 QSHLAIKDDKKHHDAEHHRDREPGTSNSLLVPDSLRGTDKRRNGPEFSNDIKKRKVDDKD :::: :::.::::: .:.:::. :.:. :.::..:.::. ..:.. ::.:...:. 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CCDS75 QSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEEKE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 SSHYDSDGDKSDDNLVVDVSNEDPSSPRASPAHSPRENGIDKNRLLKKDASSSPASTASS . : : CCDS75 IA--------------------------------ARYN---------------------- 240 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 ASSTSLKSKEMSLHEKASTPVLKSSTPTPRSDMPTPGTSATPGLRPGLGKPPAIDPLVNQ ::..::: ::.:::::.: ::::...:::::: ::::..::: CCDS75 --------------EKSTTPVSKSNTPTPRTDAPTPGSNSTPGLRPVPGKPPGVDPL--- 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 AAAGLRTPLAVPGPYPAPFGMVPHAGMNGELTSPGAAYASLHNMSPQMSAAAAAAAVVA- :..::::.::: :::.:::.::::::::::::::::::.:::.::::::::::::..: CCDS75 -ASSLRTPMAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAAAA 290 300 310 320 330 340 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 YGRSPMVGFDPPPHMRVPTIPPNLAGIPGGKPAYSFHVTADGQMQPVPFPPDALIGPGIP :::::.::::: :::::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS75 YGRSPVVGFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDALIGPGIP 350 360 370 380 390 400 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 RHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDNY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDNY 410 420 430 440 450 460 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 IRSCKLLPDGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFSC ::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 IRSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFSC 470 480 490 500 510 520 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 CSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 CSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQ 530 540 550 560 570 580 660 670 680 690 700 710 pF1KB6 QHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHVNKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGKW :::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.:::: CCDS75 QHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAHCGKW 590 600 610 620 630 640 720 730 740 750 760 770 pF1KB6 FVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 FVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY 650 660 670 680 690 700 770 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 01:58:22 2016 done: Mon Nov 7 01:58:23 2016 Total Scan time: 4.170 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]