FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4370, 387 aa 1>>>pF1KE4370 387 - 387 aa - 387 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1342+/-0.000887; mu= 17.4876+/- 0.053 mean_var=66.9446+/-13.512, 0's: 0 Z-trim(105.9): 70 B-trim: 538 in 1/46 Lambda= 0.156753 statistics sampled from 8625 (8701) to 8625 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 2.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10936.1 HSD17B2 gene_id:3294|Hs108|chr16 ( 387) 2618 601.1 5.4e-172 CCDS10837.1 HSD11B2 gene_id:3291|Hs108|chr16 ( 405) 836 198.1 1.2e-50 CCDS3328.1 BDH1 gene_id:622|Hs108|chr3 ( 343) 594 143.4 3e-34 CCDS2231.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 ( 319) 590 142.4 5.4e-34 CCDS74600.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 ( 379) 590 142.5 6.2e-34 CCDS41797.1 RDH16 gene_id:8608|Hs108|chr12 ( 317) 562 136.1 4.3e-32 CCDS8926.1 SDR9C7 gene_id:121214|Hs108|chr12 ( 313) 560 135.6 5.8e-32 CCDS8925.1 HSD17B6 gene_id:8630|Hs108|chr12 ( 317) 559 135.4 6.9e-32 CCDS31829.1 RDH5 gene_id:5959|Hs108|chr12 ( 318) 519 126.4 3.6e-29 CCDS12736.1 HSD17B14 gene_id:51171|Hs108|chr19 ( 270) 275 71.1 1.3e-12 CCDS82092.1 DHRS7B gene_id:25979|Hs108|chr17 ( 310) 249 65.3 8.6e-11 CCDS11215.1 DHRS7B gene_id:25979|Hs108|chr17 ( 325) 249 65.3 8.9e-11 >>CCDS10936.1 HSD17B2 gene_id:3294|Hs108|chr16 (387 aa) initn: 2618 init1: 2618 opt: 2618 Z-score: 3201.2 bits: 601.1 E(32554): 5.4e-172 Smith-Waterman score: 2618; 100.0% identity (100.0% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-387) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLIL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 FSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 AEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 AEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 MFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 LAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYD 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 YFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT ::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT 370 380 >>CCDS10837.1 HSD11B2 gene_id:3291|Hs108|chr16 (405 aa) initn: 784 init1: 784 opt: 836 Z-score: 1023.0 bits: 198.1 E(32554): 1.2e-50 Smith-Waterman score: 836; 39.4% identity (66.8% similar) in 373 aa overlap (6-378:8-377) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTFFSDTAWICLAVPTVLCGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGL : ::. .:. ..: .. . . . : . .. ::.: .: .: : .: CCDS10 MERWPWPSGGAWLLVAARALL--QLLRSDLRLGRPLLAALALLAALDWLCQRLLPPPAAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENG ..... .. . :. . ::: .:::.:: : :.:. : :: .::::.: ::. :. CCDS10 AVLAAAGWIALSRLARPQRLPVATRAVLITGCDSGFGKETAKKLDSMGFTVLATVLELNS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGE ::: ::: ::::: .::::.::: .:. . . : . :::...:::: .:.: CCDS10 PGAIELRTCCSPRLRLLQMDLTKPGDISRVLEFTKAHTTSTGLWGLVNNAGHNEVVADAE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAA : .. ...:: :::::..:.:: .:::::.:.::.:.:.: .: :. :..::.:::: CCDS10 LSPVATFRSCMEVNFFGALELTKGLLPLLRSSRGRIVTVGSPAGDMPYPCLGAYGTSKAA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQD :... ... :: ::.::. :::: : :. . . .::: .. .: .:: :. . ::.: CCDS10 VALLMDTFSCELLPWGVKVSIIQPGCFKTESVRNVGQWEKRKQLLLANLPQELLQAYGKD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGI :: .. .: :: .:..::. : :.:: : : ::.: : . .::: :. CCDS10 YIEHLHGQFLHSLRLAMSDLTPVVDAITDALLAARPRRRYYPGQGLGLMYFIHYYLPEGL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 YDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT : . : .. .::::. CCDS10 RRRFLQAFF-ISHCLPRALQPGQPGTTPPQDAAQDPNLSPGPSPAVAR 360 370 380 390 400 >>CCDS3328.1 BDH1 gene_id:622|Hs108|chr3 (343 aa) initn: 469 init1: 246 opt: 594 Z-score: 728.3 bits: 143.4 E(32554): 3e-34 Smith-Waterman score: 594; 36.0% identity (62.7% similar) in 303 aa overlap (70-365:45-343) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 CLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKAVLVTGGDCGLGHALC :: :. : :: .::::::: : :.: .: CCDS33 GKTLSACDRENGARRPLLLGSTSFIPIGRRTYASAAE--PVGSKAVLVTGCDSGFGFSLA 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 KYLDELGFTVFAGVL--NENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAMLQ :.: :: :::: : ... :..:: : :: ..:... . ... . : . :. CCDS33 KHLHSKGFLVFAGCLMKDKGHDGVKELDSLNSDRLRTVQLNVCSSEEVEKVVEIVRSSLK 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 D--RGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRLV : .:.:...::::. : . :. . ::: ::..:::..::.::::.:..:::.: CCDS33 DPEKGMWGLVNNAGISTFG-EVEFTSLETYKQVAEVNLWGTVRMTKSFLPLIRRAKGRVV 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 NVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTS-D :.::: : . : .: .: ::. .: :. :.::. ..::.:.. . : . CCDS33 NISSMLGRMANPARSPYCITKFGVEAFSDCLRYEMYPLGVKVSVVEPGNFIAATSLYSPE 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 KWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSP . . . : . ..:: :..:::. :. . . : .: : :::. . ::. : .: CCDS33 SIQAIAKKMWEELPEVVRKDYGKKYFDEKIAKMETYCSSGSTDTSPVIDAVTHALTATTP 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 pF1KE4 FAYYTPGKGAYLWICLA--HYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT .. : : : :. . .:: .: :.. : CCDS33 YTRYHP-MDYYWWLRMQIMTHLPGAISDMIYIR 320 330 340 >>CCDS2231.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 (319 aa) initn: 389 init1: 223 opt: 590 Z-score: 723.8 bits: 142.4 E(32554): 5.4e-34 Smith-Waterman score: 590; 34.3% identity (65.7% similar) in 315 aa overlap (55-362:3-305) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 CKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKA :: : :. . : ...: . .. . .: CCDS22 MLFWVLGLL-ILCGFLWTRKGKLKIEDITDKY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQ ...:: : :.:. . .:. :: :.:. :.:.: : :. : :: .. .:.: : . CCDS22 IFITGCDSGFGNLAARTFDKKGFHVIAACLTESGSTA--LKAETSERLRTVLLDVTDPEN 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 IKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFL .: . . : .. ..:::..:::::: : . . : . ::.. . ::.:: . :: ..: CCDS22 VKRTAQWVKNQVGEKGLWGLINNAGVPGVLAPTDWLTLEDYREPIEVNLFGLISVTLNML 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 PLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLA----SYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASI ::..:..::..::::.:: ::: .: :: :: :.. .: ... .:..:. : CCDS22 PLVKKAQGRVINVSSVGG-----RLAIVGGGYTPSKYAVEGFNDSLRRDMKAFGVHVSCI 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 pF1KE4 QPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKD--ILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF .:: : ::.: : . .:: : ..: .....::. :: . . : .: .. :. CCDS22 EPGLFKTNLA---DPVKVIEKKLAIWEQLSPDIKQQYGEGYIEKSLDKLKGNKSYVNMDL 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYL-WICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRAL :::.. ..::. . : ..:. :: : . :: :.: .: .. :.. CCDS22 SPVVECMDHALTSLFPKTHYAAGKDAKIFWIPLSH-MPAALQDFLLLKQKAELANPKAV 270 280 290 300 310 380 pF1KE4 RMPNYKKKAT >>CCDS74600.1 DHRS9 gene_id:10170|Hs108|chr2 (379 aa) initn: 389 init1: 223 opt: 590 Z-score: 722.8 bits: 142.5 E(32554): 6.2e-34 Smith-Waterman score: 590; 34.3% identity (65.7% similar) in 315 aa overlap (55-362:63-365) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 CKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLPVDQKA :: : :. . : ...: . .. . .: CCDS74 DPPQPAHWRHHLLVLYKKGVYLSHTGGKMLFWVLGLL-ILCGFLWTRKGKLKIEDITDKY 40 50 60 70 80 90 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQ ...:: : :.:. . .:. :: :.:. :.:.: : :. : :: .. .:.: : . CCDS74 IFITGCDSGFGNLAARTFDKKGFHVIAACLTESGSTA--LKAETSERLRTVLLDVTDPEN 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 IKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPTDGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFL .: . . : .. ..:::..:::::: : . . : . ::.. . ::.:: . :: ..: CCDS74 VKRTAQWVKNQVGEKGLWGLINNAGVPGVLAPTDWLTLEDYREPIEVNLFGLISVTLNML 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 PLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLA----SYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASI ::..:..::..::::.:: ::: .: :: :: :.. .: ... .:..:. : CCDS74 PLVKKAQGRVINVSSVGG-----RLAIVGGGYTPSKYAVEGFNDSLRRDMKAFGVHVSCI 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 QPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKD--ILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF .:: : ::.: : . .:: : ..: .....::. :: . . : .: .. :. CCDS74 EPGLFKTNLA---DPVKVIEKKLAIWEQLSPDIKQQYGEGYIEKSLDKLKGNKSYVNMDL 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYL-WICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRAL :::.. ..::. . : ..:. :: : . :: :.: .: .. :.. CCDS74 SPVVECMDHALTSLFPKTHYAAGKDAKIFWIPLSH-MPAALQDFLLLKQKAELANPKAV 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 RMPNYKKKAT >>CCDS41797.1 RDH16 gene_id:8608|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 442 init1: 272 opt: 562 Z-score: 689.7 bits: 136.1 E(32554): 4.3e-32 Smith-Waterman score: 562; 34.9% identity (63.1% similar) in 312 aa overlap (50-360:3-303) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 CGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLP : :. : :: .:.. : : : CCDS41 MWLYLAVFVGLY------YLLHWYRERQVLSH 10 20 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 VDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDI . .: :..:: : :.:. : . :: :. :.:. :.:.: ::.:: : :: .. .:. CCDS41 LRDKYVFITGCDSGFGKLLARQLDARGLRVLAACLTEKG--AEQLRGQTSDRLETVTLDV 30 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 TKPVQIKDAYSKVAAMLQDRGLWAVINNAGVLGFPT-DGELLLMTDYKQCMAVNFFGTVE :: .. : . : ..:.:::...::::. ..:: .::: :. . ::..:... CCDS41 TKTESVAAAAQWVKECVRDKGLWGLVNNAGI-SLPTAPNELLTKQDFVTILDVNLLGVID 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 VTKTFLPLLRKSKGRLVNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVA :: ..:::.:...::.:::::. : . . ..: :: .: ::. .: ::: .:.::: CCDS41 VTLSLLPLVRRARGRVVNVSSVMGRVSLFG-GGYCISKYGVEAFSDSLRRELSYFGVKVA 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 SIQPGGFLTNIAGTSDKWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDF :.:: : : .. ..... : .: :. ::.: ::. .. .. ... ..:. CCDS41 MIEPGYFKTAVT-SKERFLKSFLEIWDRSSPEVKEAYGEKFVADYKKSAEQMEQKCTQDL 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 SPVLRDIQHAILAKSPFAYYTPGKGAYLWICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALR : : ..::..: : . :. : : : :.: . : CCDS41 SLVTNCMEHALIACHPRTRYSAGWDAKLLYLPMSYMPTFLVDAIMYWVSPSPAKAL 270 280 290 300 310 380 pF1KE4 MPNYKKKAT >>CCDS8926.1 SDR9C7 gene_id:121214|Hs108|chr12 (313 aa) initn: 366 init1: 252 opt: 560 Z-score: 687.3 bits: 135.6 E(32554): 5.8e-32 Smith-Waterman score: 560; 35.2% identity (67.1% similar) in 304 aa overlap (67-367:9-306) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 WMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLP-VDQKAVLVTGGDCGLG .:: .... .:. ...: :..:: : :.: CCDS89 MAALTDLSFMYRWFKNCNLVGNLSEKYVFITGCDSGFG 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 HALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDITKPVQIKDAYSKVAAM . : : : . :. :.:. ..:. :...:.: : ::.. .:.:: .:: : . : CCDS89 NLLAKQLVDRGMQVLAACFTEE--GSQKLQRDTSYRLQTTLLDVTKSESIKAAAQWVRDK 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 LQDRGLWAVINNAGVLGFPTD-GELLLMTDYKQCMAVNFFGTVEVTKTFLPLLRKSKGRL . ..::::..::::: :.:. .: : :. . . ::. : .::: .::......::. CCDS89 VGEQGLWALVNNAGV-GLPSGPNEWLTKDDFVKVINVNLVGLIEVTLHMLPMVKRARGRV 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 VNVSSMGGGAPMERLASYGSSKAAVTMFSSVMRLELSKWGIKVASIQPGGFLTNIAGTSD ::.:: :: . . ..: :: .: ::. .: :: .:.:: :.::.. : : : . CCDS89 VNMSSSGGRVAVIG-GGYCVSKFGVEAFSDSIRRELYYFGVKVCIIEPGNYRTAILGKEN 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 KWEKLEKDILDHLPAEVQEDYGQDYILAQRNFLLLINSLASKDFSPVLRDIQHAILAKSP ...: . ..:: :....::.::. . : : ..: :. ...:::...:: CCDS89 LESRMRK-LWERLPQETRDSYGEDYFRIYTDKLKNIMQVAEPRVRDVINSMEHAIVSRSP 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 pF1KE4 FAYYTPGKGA-YLWICLAHYLPIGIYDYFAKRHFGQDKPMPRALRMPNYKKKAT :.:: : :.: ::. :: . :.. .:.. CCDS89 RIRYNPGLDAKLLYIPLAK-LPTPVTDFILSRYLPRPADSV 280 290 300 310 >>CCDS8925.1 HSD17B6 gene_id:8630|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 444 init1: 267 opt: 559 Z-score: 686.0 bits: 135.4 E(32554): 6.9e-32 Smith-Waterman score: 559; 33.8% identity (64.0% similar) in 325 aa overlap (50-372:3-313) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 CGTVFCKYKKSSGQLWSWMVCLAGLCAVCLLILSPFWGLILFSVSCFLMYTYLSGQELLP : :. : :: .:.. : : . CCDS89 MWLYLAAFVGLY------YLLHWYRERQVVSH 10 20 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 VDQKAVLVTGGDCGLGHALCKYLDELGFTVFAGVLNENGPGAEELRRTCSPRLSVLQMDI ...: :..:: : :.:. : . :: :. :.:. :.:. :::.:: : :: .. .:. 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