FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6320, 401 aa 1>>>pF1KE6320 401 - 401 aa - 401 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3976+/-0.000802; mu= 16.3351+/- 0.048 mean_var=68.3625+/-13.640, 0's: 0 Z-trim(106.8): 20 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.155119 statistics sampled from 9175 (9185) to 9175 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 1.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2657.1 CRTAP gene_id:10491|Hs108|chr3 ( 401) 2726 619.1 2.2e-177 CCDS11408.1 P3H4 gene_id:10609|Hs108|chr17 ( 437) 1397 321.7 8.2e-88 CCDS53307.1 P3H1 gene_id:64175|Hs108|chr1 ( 697) 727 171.9 1.6e-42 CCDS472.2 P3H1 gene_id:64175|Hs108|chr1 ( 736) 727 171.9 1.7e-42 CCDS57986.1 P3H1 gene_id:64175|Hs108|chr1 ( 804) 727 171.9 1.9e-42 CCDS3294.1 P3H2 gene_id:55214|Hs108|chr3 ( 708) 659 156.7 6.4e-38 CCDS61027.1 P3H3 gene_id:10536|Hs108|chr12 ( 736) 269 69.4 1.2e-11 >>CCDS2657.1 CRTAP gene_id:10491|Hs108|chr3 (401 aa) initn: 2726 init1: 2726 opt: 2726 Z-score: 3298.0 bits: 619.1 E(32554): 2.2e-177 Smith-Waterman score: 2726; 99.8% identity (100.0% similar) in 401 aa overlap (1-401:1-401) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEPGRRGAAALLALLCVACALRAGRAQYERYSFRSFPRDELMPLESAYRHALDKYSGEHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 MEPGRRGAAALLALLCVACALRAGRAQYERYSFRSFPRDELMPLESAYRHALDKYSGEHW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 AESVGYLEISLRLHRLLRDSEAFCHRNCSAAPQPEPAAGLASYPELRLFGGLLRRAHCLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 AESVGYLEISLRLHRLLRDSEAFCHRNCSAAPQPEPAAGLASYPELRLFGGLLRRAHCLK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 RCKQGLPAFRQSQPSRDVLADFQRREPYKFLQFAYFKANNLPKAIAAAHTFLLKHPDDEM ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 RCKQGLPAFRQSQPSREVLADFQRREPYKFLQFAYFKANNLPKAIAAAHTFLLKHPDDEM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 MKRNMAYYKSLPGAEDYIKDLETKSYESLFIRAVRAYNGENWRTSITDMELALPDFFKAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 MKRNMAYYKSLPGAEDYIKDLETKSYESLFIRAVRAYNGENWRTSITDMELALPDFFKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 YECLAACEGSREIKDFKDFYLSIADHYVEVLECKIQCEENLTPVIGGYPVEKFVATMYHY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 YECLAACEGSREIKDFKDFYLSIADHYVEVLECKIQCEENLTPVIGGYPVEKFVATMYHY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 LQFAYYKLNDLKNAAPCAVSYLLFDQNDKVMQQNLVYYQYHRDTWGLSDEHFQPRPEAVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 LQFAYYKLNDLKNAAPCAVSYLLFDQNDKVMQQNLVYYQYHRDTWGLSDEHFQPRPEAVQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 FFNVTTLQKELYDFAKENIMDDDEGEVVEYVDDLLELEETS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS26 FFNVTTLQKELYDFAKENIMDDDEGEVVEYVDDLLELEETS 370 380 390 400 >>CCDS11408.1 P3H4 gene_id:10609|Hs108|chr17 (437 aa) initn: 1374 init1: 748 opt: 1397 Z-score: 1690.0 bits: 321.7 E(32554): 8.2e-88 Smith-Waterman score: 1397; 54.5% identity (77.0% similar) in 400 aa overlap (6-399:3-396) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEPGRRGAAALLALLCVACALRAGRAQYERYSFRSFPRDELMPLESAYRHALDKYSGEHW : : .:: :: : .. ::::.::::.:: ..:::: .:: :::..: :: : CCDS11 MARVAWGLLWLL-----LGSAGAQYEKYSFRGFPPEDLMPLAAAYGHALEQYEGESW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE6 AESVGYLEISLRLHRLLRDSEAFCHRNCSA-AP--QPEPAAGLASYP--ELRLFGGLLRR ::. ::: .::::::::::::::: :::. :: .:.: .: :. :::::: .:.: CCDS11 RESARYLEAALRLHRLLRDSEAFCHANCSGPAPAAKPDPDGGRADEWACELRLFGRVLER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AHCLKRCKQGLPAFRQSQPSRDVLADFQRREPYKFLQFAYFKANNLPKAIAAAHTFLLKH : ::.:::. ::::. : :..: ::: : ::..:..: :::: : ::.:::.::: .. 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CCDS57 FFVGNPEHMEMQQNLDYYQTMSGVKEADFKDLETQPHMQEFRLGVRLYSEEQPQEAVPHL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 ELALPDFFKAFYECLAACEGSREIKDFK------DFYLSIADHYVEVLECKIQCEENLTP : :: ..: :. :: : ::: . .. :.. .:.:::..::.:: .: .:. 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