FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6230, 300 aa 1>>>pF1KE6230 300 - 300 aa - 300 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8116+/-0.000356; mu= 18.3051+/- 0.022 mean_var=65.5743+/-12.796, 0's: 0 Z-trim(113.9): 10 B-trim: 18 in 1/49 Lambda= 0.158383 statistics sampled from 23469 (23479) to 23469 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16 Scan time: 5.640 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001766 (OMIM: 107270) ADP-ribosyl cyclase/cycli ( 300) 2100 488.5 6.6e-138 XP_005248243 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 289) 659 159.3 8.4e-39 XP_005248242 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 290) 659 159.3 8.4e-39 XP_011512181 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 295) 659 159.3 8.6e-39 XP_016864055 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 297) 659 159.3 8.6e-39 XP_011512180 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 300) 659 159.3 8.7e-39 XP_016864054 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 305) 659 159.3 8.8e-39 NP_004325 (OMIM: 600387) ADP-ribosyl cyclase/cycli ( 318) 659 159.3 9.1e-39 XP_011512183 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 260) 555 135.5 1.1e-31 XP_016864056 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 192) 416 103.6 3.2e-22 >>NP_001766 (OMIM: 107270) ADP-ribosyl cyclase/cyclic AD (300 aa) initn: 2100 init1: 2100 opt: 2100 Z-score: 2596.9 bits: 488.5 E(85289): 6.6e-138 Smith-Waterman score: 2100; 100.0% identity (100.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 ETVLARCVKYTEIHPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPCN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ETVLARCVKYTEIHPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPCN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 KILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKDC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKDC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 SNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSRSKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTLEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSRSKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTLEA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 WVIHGGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSCTSEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 WVIHGGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSCTSEI 250 260 270 280 290 300 >>XP_005248243 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (289 aa) initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.6 bits: 159.3 E(85289): 8.4e-39 Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP : :: :: : . .:.:.:.. : : .: : ::. .. 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