Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4543
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4543, 627 aa
1>>>pF1KE4543 627 - 627 aa - 627 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6798+/-0.000601; mu= 17.5066+/- 0.037
mean_var=113.3832+/-22.133, 0's: 0 Z-trim(108.9): 212 B-trim: 141 in 2/52
Lambda= 0.120448
statistics sampled from 16819 (17066) to 16819 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 7.590
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005266431 (OMIM: 153430) PREDICTED: plastin-2 i ( 627) 4130 730.0 5.9e-210
NP_002289 (OMIM: 153430) plastin-2 [Homo sapiens] ( 627) 4130 730.0 5.9e-210
NP_001129497 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isofo ( 630) 3394 602.1 1.9e-171
NP_005023 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isoform ( 630) 3394 602.1 1.9e-171
XP_011535836 (OMIM: 300131,300910) PREDICTED: plas ( 630) 3394 602.1 1.9e-171
NP_001269267 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isofo ( 585) 3261 579.0 1.6e-164
XP_016862116 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
XP_006713723 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
NP_002661 (OMIM: 602734) plastin-1 [Homo sapiens] ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
XP_016862115 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
NP_001138791 (OMIM: 602734) plastin-1 [Homo sapien ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
XP_011511205 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
XP_011511202 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
NP_001165783 (OMIM: 602734) plastin-1 [Homo sapien ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
XP_011511203 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 i ( 629) 3161 561.6 2.9e-159
NP_001165806 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isofo ( 603) 3109 552.6 1.5e-156
NP_001269266 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isofo ( 617) 1858 335.2 4.1e-91
XP_006712150 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 221 51.3 4.4e-05
NP_003119 (OMIM: 182790) spectrin beta chain, non- (2364) 221 51.3 4.4e-05
XP_005264574 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 221 51.3 4.4e-05
XP_016860268 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 221 51.3 4.4e-05
XP_016860269 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 221 51.3 4.4e-05
XP_016860270 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 221 51.3 4.4e-05
NP_842565 (OMIM: 182790) spectrin beta chain, non- (2155) 220 51.1 4.7e-05
XP_005264575 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2351) 220 51.2 5e-05
XP_011543771 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (1915) 216 50.4 7e-05
XP_016884819 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (2160) 216 50.4 7.6e-05
XP_016884818 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (2166) 216 50.4 7.6e-05
XP_011543770 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3295) 216 50.6 0.0001
XP_006724538 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3575) 216 50.7 0.00011
XP_006724537 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3593) 216 50.7 0.00011
XP_006724536 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3657) 216 50.7 0.00011
XP_011543769 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3662) 216 50.7 0.00011
XP_016884817 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3672) 216 50.7 0.00011
NP_000100 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3677) 216 50.7 0.00011
NP_004000 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3681) 216 50.7 0.00011
NP_003997 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) dyst (3685) 216 50.7 0.00011
XP_006724533 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3690) 216 50.7 0.00011
XP_006724532 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3695) 216 50.7 0.00011
XP_006724531 (OMIM: 300376,300377,302045,310200) P (3703) 216 50.7 0.00011
NP_001120959 (OMIM: 102565,609524,614065,617047) f (2692) 199 47.6 0.00068
NP_001449 (OMIM: 102565,609524,614065,617047) fila (2725) 199 47.6 0.00069
XP_011529433 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2580) 196 47.0 0.00095
XP_011529432 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2581) 196 47.0 0.00095
XP_011529431 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2589) 196 47.0 0.00095
XP_011529430 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2607) 196 47.0 0.00096
XP_011529429 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2615) 196 47.0 0.00096
NP_001447 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30032 (2639) 196 47.1 0.00097
NP_001104026 (OMIM: 300017,300048,300049,300244,30 (2647) 196 47.1 0.00097
XP_016866734 (OMIM: 128240) PREDICTED: utrophin is (2675) 196 47.1 0.00098
>>XP_005266431 (OMIM: 153430) PREDICTED: plastin-2 isofo (627 aa)
initn: 4130 init1: 4130 opt: 4130 Z-score: 3890.4 bits: 730.0 E(85289): 5.9e-210
Smith-Waterman score: 4130; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKAYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKAYY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_005 QDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAKKSSSISS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 FKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVYAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVYAL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE4 PEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
610 620
>>NP_002289 (OMIM: 153430) plastin-2 [Homo sapiens] (627 aa)
initn: 4130 init1: 4130 opt: 4130 Z-score: 3890.4 bits: 730.0 E(85289): 5.9e-210
Smith-Waterman score: 4130; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKAYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKAYY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
NP_002 QDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAKKSSSISS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 FKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVYAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVYAL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE4 PEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
610 620
>>NP_001129497 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isoform 1 (630 aa)
initn: 3394 init1: 3394 opt: 3394 Z-score: 3199.1 bits: 602.1 E(85289): 1.9e-171
Smith-Waterman score: 3394; 79.9% identity (93.1% similar) in 627 aa overlap (1-627:4-630)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENL
:: ..: .:. ::.::::::: ..::.: ::..::: : .:::::.:::: ..:
NP_001 MDEMATTQISKDELDELKEAFAKVDLNSNGFICDYELHELFKEANMPLPGYKVREIIQKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHS
: :: ..::.::::::. ::. .::.:.:::::::::.::::::.::::: :: :::::
NP_001 MLDGDRNKDGKISFDEFVYIFQEVKSSDIAKTFRKAINRKEGICALGGTSELSSEGTQHS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::
NP_001 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTDDLFKAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLF
:.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::.::::::::.::::::
NP_001 RAINKKKLTPFIIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLRAGKPHLVLGLLWQIIKIGLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ADIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSK
::::::::::: ::::.::.::.:::::::::::::::.::::.: .::.:::.::::::
NP_001 ADIELSRNEALAALLRDGETLEELMKLSPEELLLRWANFHLENSGWQKINNFSADIKDSK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AYYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVR
::.:::.:.::::..:: : . :.:::. : ::..::: :::::..:::::::: .:::
NP_001 AYFHLLNQIAPKGQKEGEPRIDINMSGFNETDDLKRAESMLQQADKLGCRQFVTPADVVS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLY
:::::::::.:::::.:::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 GNPKLNLAFVANLFNKYPALTKPENQDIDWTLLEGETREERTFRNWMNSLGVNPHVNHLY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVG
.::.:::::.::::.:::::::..::::::::::.::::::::::::::::. :::::::
NP_001 ADLQDALVILQLYERIKVPVDWSKVNKPPYPKLGANMKKLENCNYAVELGKHPAKFSLVG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 IGGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSS
:::::::.::.::::::.::::::::::.::..: :::.::::::::::.:: :: ::.:
NP_001 IGGQDLNDGNQTLTLALVWQLMRRYTLNVLEDLGDGQKANDDIIVNWVNRTLSEAGKSTS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 ISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARV
:.:::: ::.:: :.::::::::: :::::.:. ::..:.: ::::::.::::.:::::
NP_001 IQSFKDKTISSSLAVVDLIDAIQPGCINYDLVKSGNLTEDDKHNNAKYAVSMARRIGARV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KE4 YALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
::::::::::.:::::::::::::.:::::
NP_001 YALPEDLVEVKPKMVMTVFACLMGRGMKRV
610 620 630
>>NP_005023 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isoform 1 [H (630 aa)
initn: 3394 init1: 3394 opt: 3394 Z-score: 3199.1 bits: 602.1 E(85289): 1.9e-171
Smith-Waterman score: 3394; 79.9% identity (93.1% similar) in 627 aa overlap (1-627:4-630)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENL
:: ..: .:. ::.::::::: ..::.: ::..::: : .:::::.:::: ..:
NP_005 MDEMATTQISKDELDELKEAFAKVDLNSNGFICDYELHELFKEANMPLPGYKVREIIQKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHS
: :: ..::.::::::. ::. .::.:.:::::::::.::::::.::::: :: :::::
NP_005 MLDGDRNKDGKISFDEFVYIFQEVKSSDIAKTFRKAINRKEGICALGGTSELSSEGTQHS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::
NP_005 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTDDLFKAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLF
:.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::.::::::::.::::::
NP_005 RAINKKKLTPFIIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLRAGKPHLVLGLLWQIIKIGLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ADIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSK
::::::::::: ::::.::.::.:::::::::::::::.::::.: .::.:::.::::::
NP_005 ADIELSRNEALAALLRDGETLEELMKLSPEELLLRWANFHLENSGWQKINNFSADIKDSK
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 AYYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVR
::.:::.:.::::..:: : . :.:::. : ::..::: :::::..:::::::: .:::
NP_005 AYFHLLNQIAPKGQKEGEPRIDINMSGFNETDDLKRAESMLQQADKLGCRQFVTPADVVS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLY
:::::::::.:::::.:::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::
NP_005 GNPKLNLAFVANLFNKYPALTKPENQDIDWTLLEGETREERTFRNWMNSLGVNPHVNHLY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVG
.::.:::::.::::.:::::::..::::::::::.::::::::::::::::. :::::::
NP_005 ADLQDALVILQLYERIKVPVDWSKVNKPPYPKLGANMKKLENCNYAVELGKHPAKFSLVG
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480 490 500 510 520 530
pF1KE4 IGGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSS
:::::::.::.::::::.::::::::::.::..: :::.::::::::::.:: :: ::.:
NP_005 IGGQDLNDGNQTLTLALVWQLMRRYTLNVLEDLGDGQKANDDIIVNWVNRTLSEAGKSTS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 ISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARV
:.:::: ::.:: :.::::::::: :::::.:. ::..:.: ::::::.::::.:::::
NP_005 IQSFKDKTISSSLAVVDLIDAIQPGCINYDLVKSGNLTEDDKHNNAKYAVSMARRIGARV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KE4 YALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
::::::::::.:::::::::::::.:::::
NP_005 YALPEDLVEVKPKMVMTVFACLMGRGMKRV
610 620 630
>>XP_011535836 (OMIM: 300131,300910) PREDICTED: plastin- (630 aa)
initn: 3394 init1: 3394 opt: 3394 Z-score: 3199.1 bits: 602.1 E(85289): 1.9e-171
Smith-Waterman score: 3394; 79.9% identity (93.1% similar) in 627 aa overlap (1-627:4-630)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENL
:: ..: .:. ::.::::::: ..::.: ::..::: : .:::::.:::: ..:
XP_011 MDEMATTQISKDELDELKEAFAKVDLNSNGFICDYELHELFKEANMPLPGYKVREIIQKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHS
: :: ..::.::::::. ::. .::.:.:::::::::.::::::.::::: :: :::::
XP_011 MLDGDRNKDGKISFDEFVYIFQEVKSSDIAKTFRKAINRKEGICALGGTSELSSEGTQHS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::
XP_011 YSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTDDLFKAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLF
:.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::.::::::::.::::::
XP_011 RAINKKKLTPFIIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLRAGKPHLVLGLLWQIIKIGLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ADIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSK
::::::::::: ::::.::.::.:::::::::::::::.::::.: .::.:::.::::::
XP_011 ADIELSRNEALAALLRDGETLEELMKLSPEELLLRWANFHLENSGWQKINNFSADIKDSK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AYYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVR
::.:::.:.::::..:: : . :.:::. : ::..::: :::::..:::::::: .:::
XP_011 AYFHLLNQIAPKGQKEGEPRIDINMSGFNETDDLKRAESMLQQADKLGCRQFVTPADVVS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLY
:::::::::.:::::.:::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::
XP_011 GNPKLNLAFVANLFNKYPALTKPENQDIDWTLLEGETREERTFRNWMNSLGVNPHVNHLY
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 SDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVG
.::.:::::.::::.:::::::..::::::::::.::::::::::::::::. :::::::
XP_011 ADLQDALVILQLYERIKVPVDWSKVNKPPYPKLGANMKKLENCNYAVELGKHPAKFSLVG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 IGGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSS
:::::::.::.::::::.::::::::::.::..: :::.::::::::::.:: :: ::.:
XP_011 IGGQDLNDGNQTLTLALVWQLMRRYTLNVLEDLGDGQKANDDIIVNWVNRTLSEAGKSTS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 ISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARV
:.:::: ::.:: :.::::::::: :::::.:. ::..:.: ::::::.::::.:::::
XP_011 IQSFKDKTISSSLAVVDLIDAIQPGCINYDLVKSGNLTEDDKHNNAKYAVSMARRIGARV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KE4 YALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
::::::::::.:::::::::::::.:::::
XP_011 YALPEDLVEVKPKMVMTVFACLMGRGMKRV
610 620 630
>>NP_001269267 (OMIM: 300131,300910) plastin-3 isoform 4 (585 aa)
initn: 3261 init1: 3261 opt: 3261 Z-score: 3074.6 bits: 579.0 E(85289): 1.6e-164
Smith-Waterman score: 3261; 81.9% identity (94.4% similar) in 585 aa overlap (43-627:1-585)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 ELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMATGDLDQDGRISFD
.:::::.:::: ..:: :: ..::.::::
NP_001 MPLPGYKVREIIQKLMLDGDRNKDGKISFD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 EFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINK
::. ::. .::.:.:::::::::.::::::.::::: :: ::::::::::::::::::::
NP_001 EFVYIFQEVKSSDIAKTFRKAINRKEGICALGGTSELSSEGTQHSYSEEEKYAFVNWINK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 ALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQE
::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.::::::::: :::
NP_001 ALENDPDCRHVIPMNPNTDDLFKAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERAINKKKLTPFIIQE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 NLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALIALL
::::::::::::::::::::::::. :::.::::::::.::::::::::::::::: :::
NP_001 NLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLRAGKPHLVLGLLWQIIKIGLFADIELSRNEALAALL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 REGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDE
:.::.::.:::::::::::::::.::::.: .::.:::.::::::::.:::.:.::::..
NP_001 RDGETLEELMKLSPEELLLRWANFHLENSGWQKINNFSADIKDSKAYFHLLNQIAPKGQK
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 EGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFN
:: : . :.:::. : ::..::: :::::..:::::::: .::: :::::::::.:::::
NP_001 EGEPRIDINMSGFNETDDLKRAESMLQQADKLGCRQFVTPADVVSGNPKLNLAFVANLFN
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 RYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEK
.:::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::.::.:::::.::::.
NP_001 KYPALTKPENQDIDWTLLEGETREERTFRNWMNSLGVNPHVNHLYADLQDALVILQLYER
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 IKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIGGQDLNEGNRTLTL
:::::::..::::::::::.::::::::::::::::. ::::::::::::::.::.::::
NP_001 IKVPVDWSKVNKPPYPKLGANMKKLENCNYAVELGKHPAKFSLVGIGGQDLNDGNQTLTL
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 ALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSISSFKDPKISTSLPV
::.::::::::::.::..: :::.::::::::::.:: :: ::.::.:::: ::.:: :
NP_001 ALVWQLMRRYTLNVLEDLGDGQKANDDIIVNWVNRTLSEAGKSTSIQSFKDKTISSSLAV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 LDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMV
.::::::::: :::::.:. ::..:.: ::::::.::::.:::::::::::::::.::::
NP_001 VDLIDAIQPGCINYDLVKSGNLTEDDKHNNAKYAVSMARRIGARVYALPEDLVEVKPKMV
520 530 540 550 560 570
620
pF1KE4 MTVFACLMGKGMKRV
:::::::::.:::::
NP_001 MTVFACLMGRGMKRV
580
>>XP_016862116 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 isofo (629 aa)
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Smith-Waterman score: 3161; 74.0% identity (91.8% similar) in 623 aa overlap (5-627:7-628)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLM
..: ::. ::.::: :.: :..::.: ::.:::: : ::::::.::::.:...
XP_016 MENSTTTISREELEELQEAFNKIDIDNSGYVSDYELQDLFKEASLPLPGYKVREIVEKIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSY
...: ..::.:::.::..... ::: :..::::: :::.::: :::::: :: ::::::
XP_016 SVADSNKDGKISFEEFVSLMQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSTISSEGTQHSY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDER
::::: ::::::::::::::::.:.:::::: ..::....:::.:::::::: :::::::
XP_016 SEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMNPNDDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDER
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFA
.:::::::::::.::::::::::::::: :::::: :::::::.::::::::.::.::::
XP_016 AINKKKLTPFTISENLNLALNSASAIGCTVVNIGASDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKA
:::.:::::::::: ::: ::.:::::::::::::.:::: ::: . :.::: :::::.:
XP_016 DIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWHTISNFSQDIKDSRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRG
:.:::.:.:::: :.: ::..::.::. : .:..:: :::.:..:::.:::: .::: :
XP_016 YFHLLNQIAPKGGEDG-PAIAIDLSGINETNDLKRAGLMLQEADKLGCKQFVTPADVVSG
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS
::::::::.::::: :: ::::.:.::: . ::::..:::::::::::::::: .:::::
XP_016 NPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPNNNDIDMNLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYS
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 DLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGI
::.:::::::::: :.:::.:..::::::: :::::::.::::::::::::.::::::::
XP_016 DLADALVIFQLYEMIRVPVNWSHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKAKFSLVGI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSI
.:::::::: ::::::.::::::::::.: ..: :.::::.::..:::.::. :.:..::
XP_016 AGQDLNEGNSTLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKSANKKTSI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 SSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVY
::::: .:::::::::::::: :... .... :::.:..::::::::::.:::::::.:
XP_016 SSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIRRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIY
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE4 ALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::.:::::.:::::::::::::::..:.
XP_016 ALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK
600 610 620
>>XP_006713723 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 isofo (629 aa)
initn: 3203 init1: 1628 opt: 3161 Z-score: 2980.3 bits: 561.6 E(85289): 2.9e-159
Smith-Waterman score: 3161; 74.0% identity (91.8% similar) in 623 aa overlap (5-627:7-628)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLM
..: ::. ::.::: :.: :..::.: ::.:::: : ::::::.::::.:...
XP_006 MENSTTTISREELEELQEAFNKIDIDNSGYVSDYELQDLFKEASLPLPGYKVREIVEKIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSY
...: ..::.:::.::..... ::: :..::::: :::.::: :::::: :: ::::::
XP_006 SVADSNKDGKISFEEFVSLMQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSTISSEGTQHSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDER
::::: ::::::::::::::::.:.:::::: ..::....:::.:::::::: :::::::
XP_006 SEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMNPNDDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDER
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFA
.:::::::::::.::::::::::::::: :::::: :::::::.::::::::.::.::::
XP_006 AINKKKLTPFTISENLNLALNSASAIGCTVVNIGASDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKA
:::.:::::::::: ::: ::.:::::::::::::.:::: ::: . :.::: :::::.:
XP_006 DIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWHTISNFSQDIKDSRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRG
:.:::.:.:::: :.: ::..::.::. : .:..:: :::.:..:::.:::: .::: :
XP_006 YFHLLNQIAPKGGEDG-PAIAIDLSGINETNDLKRAGLMLQEADKLGCKQFVTPADVVSG
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS
::::::::.::::: :: ::::.:.::: . ::::..:::::::::::::::: .:::::
XP_006 NPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPNNNDIDMNLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 DLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGI
::.:::::::::: :.:::.:..::::::: :::::::.::::::::::::.::::::::
XP_006 DLADALVIFQLYEMIRVPVNWSHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKAKFSLVGI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSI
.:::::::: ::::::.::::::::::.: ..: :.::::.::..:::.::. :.:..::
XP_006 AGQDLNEGNSTLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKSANKKTSI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 SSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVY
::::: .:::::::::::::: :... .... :::.:..::::::::::.:::::::.:
XP_006 SSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIRRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIY
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE4 ALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::.:::::.:::::::::::::::..:.
XP_006 ALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK
600 610 620
>>NP_002661 (OMIM: 602734) plastin-1 [Homo sapiens] (629 aa)
initn: 3203 init1: 1628 opt: 3161 Z-score: 2980.3 bits: 561.6 E(85289): 2.9e-159
Smith-Waterman score: 3161; 74.0% identity (91.8% similar) in 623 aa overlap (5-627:7-628)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLM
..: ::. ::.::: :.: :..::.: ::.:::: : ::::::.::::.:...
NP_002 MENSTTTISREELEELQEAFNKIDIDNSGYVSDYELQDLFKEASLPLPGYKVREIVEKIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSY
...: ..::.:::.::..... ::: :..::::: :::.::: :::::: :: ::::::
NP_002 SVADSNKDGKISFEEFVSLMQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSTISSEGTQHSY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDER
::::: ::::::::::::::::.:.:::::: ..::....:::.:::::::: :::::::
NP_002 SEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMNPNDDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDER
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFA
.:::::::::::.::::::::::::::: :::::: :::::::.::::::::.::.::::
NP_002 AINKKKLTPFTISENLNLALNSASAIGCTVVNIGASDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKA
:::.:::::::::: ::: ::.:::::::::::::.:::: ::: . :.::: :::::.:
NP_002 DIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWHTISNFSQDIKDSRA
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 YYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRG
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NP_002 YFHLLNQIAPKGGEDG-PAIAIDLSGINETNDLKRAGLMLQEADKLGCKQFVTPADVVSG
310 320 330 340 350
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pF1KE4 NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS
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NP_002 NPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPNNNDIDMNLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 DLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGI
::.:::::::::: :.:::.:..::::::: :::::::.::::::::::::.::::::::
NP_002 DLADALVIFQLYEMIRVPVNWSHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKAKFSLVGI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSI
.:::::::: ::::::.::::::::::.: ..: :.::::.::..:::.::. :.:..::
NP_002 AGQDLNEGNSTLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKSANKKTSI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 SSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVY
::::: .:::::::::::::: :... .... :::.:..::::::::::.:::::::.:
NP_002 SSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIRRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIY
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE4 ALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::.:::::.:::::::::::::::..:.
NP_002 ALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK
600 610 620
>>XP_016862115 (OMIM: 602734) PREDICTED: plastin-1 isofo (629 aa)
initn: 3203 init1: 1628 opt: 3161 Z-score: 2980.3 bits: 561.6 E(85289): 2.9e-159
Smith-Waterman score: 3161; 74.0% identity (91.8% similar) in 623 aa overlap (5-627:7-628)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISFNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLM
..: ::. ::.::: :.: :..::.: ::.:::: : ::::::.::::.:...
XP_016 MENSTTTISREELEELQEAFNKIDIDNSGYVSDYELQDLFKEASLPLPGYKVREIVEKIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ATGDLDQDGRISFDEFIKIFHGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSY
...: ..::.:::.::..... ::: :..::::: :::.::: :::::: :: ::::::
XP_016 SVADSNKDGKISFEEFVSLMQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSTISSEGTQHSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTNDLFNAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDER
::::: ::::::::::::::::.:.:::::: ..::....:::.:::::::: :::::::
XP_016 SEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMNPNDDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDER
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFA
.:::::::::::.::::::::::::::: :::::: :::::::.::::::::.::.::::
XP_016 AINKKKLTPFTISENLNLALNSASAIGCTVVNIGASDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DIELSRNEALIALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCNKIGNFSTDIKDSKA
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XP_016 DIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWHTISNFSQDIKDSRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YYHLLEQVAPKGDEEGVPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRG
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XP_016 YFHLLNQIAPKGGEDG-PAIAIDLSGINETNDLKRAGLMLQEADKLGCKQFVTPADVVSG
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS
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XP_016 NPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPNNNDIDMNLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 DLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGI
::.:::::::::: :.:::.:..::::::: :::::::.::::::::::::.::::::::
XP_016 DLADALVIFQLYEMIRVPVNWSHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKAKFSLVGI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GGQDLNEGNRTLTLALIWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLREAEKSSSI
.:::::::: ::::::.::::::::::.: ..: :.::::.::..:::.::. :.:..::
XP_016 AGQDLNEGNSTLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKSANKKTSI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 SSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARVY
::::: .:::::::::::::: :... .... :::.:..::::::::::.:::::::.:
XP_016 SSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIRRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIY
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE4 ALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGKGMKRV
:::.:::::.:::::::::::::::..:.
XP_016 ALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK
600 610 620
627 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:06:33 2016 done: Sun Nov 6 00:06:34 2016
Total Scan time: 7.590 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]