FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1525, 257 aa 1>>>pF1KE1525 257 - 257 aa - 257 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7888+/-0.000861; mu= 12.1295+/- 0.052 mean_var=87.7264+/-18.457, 0's: 0 Z-trim(107.3): 69 B-trim: 4 in 1/51 Lambda= 0.136933 statistics sampled from 9421 (9489) to 9421 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16 Scan time: 2.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1184.1 FCER1A gene_id:2205|Hs108|chr1 ( 257) 1765 358.6 2.5e-99 CCDS44266.1 FCGR3A gene_id:2214|Hs108|chr1 ( 254) 542 117.0 1.3e-26 CCDS1232.1 FCGR3A gene_id:2214|Hs108|chr1 ( 290) 542 117.0 1.5e-26 CCDS72845.1 FCGR1B gene_id:2210|Hs108|chr1 ( 280) 536 115.8 3.3e-26 CCDS41433.1 FCGR3B gene_id:2215|Hs108|chr1 ( 233) 522 113.0 1.9e-25 CCDS58040.1 FCGR3B gene_id:2215|Hs108|chr1 ( 269) 522 113.0 2.1e-25 CCDS72961.1 FCGR3B gene_id:2215|Hs108|chr1 ( 216) 509 110.4 1.1e-24 CCDS72844.1 FCGR1B gene_id:2210|Hs108|chr1 ( 224) 499 108.4 4.3e-24 CCDS933.1 FCGR1A gene_id:2209|Hs108|chr1 ( 374) 501 109.0 4.9e-24 CCDS30924.1 FCGR2B gene_id:2213|Hs108|chr1 ( 310) 490 106.7 1.9e-23 CCDS30925.1 FCGR2B gene_id:2213|Hs108|chr1 ( 291) 482 105.1 5.5e-23 CCDS44264.1 FCGR2A gene_id:2212|Hs108|chr1 ( 317) 468 102.4 4e-22 CCDS53414.1 FCGR2B gene_id:2213|Hs108|chr1 ( 303) 467 102.2 4.4e-22 CCDS30922.1 FCGR2A gene_id:2212|Hs108|chr1 ( 316) 459 100.6 1.4e-21 CCDS72962.1 FCRLB gene_id:127943|Hs108|chr1 ( 275) 450 98.8 4.2e-21 CCDS72963.1 FCRLB gene_id:127943|Hs108|chr1 ( 318) 450 98.8 4.7e-21 CCDS30927.1 FCRLB gene_id:127943|Hs108|chr1 ( 426) 450 98.9 5.9e-21 CCDS72964.1 FCRLB gene_id:127943|Hs108|chr1 ( 268) 438 96.4 2.1e-20 CCDS72965.1 FCRLB gene_id:127943|Hs108|chr1 ( 311) 438 96.5 2.4e-20 CCDS1166.1 FCRL4 gene_id:83417|Hs108|chr1 ( 515) 362 81.6 1.2e-15 CCDS1165.1 FCRL5 gene_id:83416|Hs108|chr1 ( 977) 353 80.0 6.7e-15 CCDS1167.1 FCRL3 gene_id:115352|Hs108|chr1 ( 734) 348 78.9 1.1e-14 CCDS81385.1 FCRL3 gene_id:115352|Hs108|chr1 ( 742) 348 78.9 1.1e-14 CCDS72846.1 FCGR1B gene_id:2210|Hs108|chr1 ( 188) 303 69.6 1.7e-12 >>CCDS1184.1 FCER1A gene_id:2205|Hs108|chr1 (257 aa) initn: 1765 init1: 1765 opt: 1765 Z-score: 1896.8 bits: 358.6 E(32554): 2.5e-99 Smith-Waterman score: 1765; 100.0% identity (100.0% similar) in 257 aa overlap (1-257:1-257) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAPDGVLAVPQKPKVSLNPPWNRIFKGENVTLTCNGNNFFEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MAPAMESPTLLCVALLFFAPDGVLAVPQKPKVSLNPPWNRIFKGENVTLTCNGNNFFEVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 STKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQVNESEPVYLEVFSDWLLLQASAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 STKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQVNESEPVYLEVFSDWLLLQASAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 VVMEGQPLFLRCHGWRNWDVYKVIYYKDGEALKYWYENHNISITNATVEDSGTYYCTGKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VVMEGQPLFLRCHGWRNWDVYKVIYYKDGEALKYWYENHNISITNATVEDSGTYYCTGKV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 WQLDYESEPLNITVIKAPREKYWLQFFIPLLVVILFAVDTGLFISTQQQVTFLLKIKRTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 WQLDYESEPLNITVIKAPREKYWLQFFIPLLVVILFAVDTGLFISTQQQVTFLLKIKRTR 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 KGFRLLNPHPKPNPKNN ::::::::::::::::: CCDS11 KGFRLLNPHPKPNPKNN 250 >>CCDS44266.1 FCGR3A gene_id:2214|Hs108|chr1 (254 aa) initn: 526 init1: 477 opt: 542 Z-score: 591.1 bits: 117.0 E(32554): 1.3e-26 Smith-Waterman score: 542; 40.9% identity (66.1% similar) in 230 aa overlap (10-230:5-233) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAPDGVLAVPQKPK--VSLNPPWNRIFKGENVTLTCNGNNFFE :: .:::... : . . . :: : :.: : :... ..::: :.: : CCDS44 MWQLLLPTALLLLVSAG-MRTEDLPKAVVFLEPQWYRVLEKDSVTLKCQGAYSPE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 VSSTKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQVNESEPVYLEVFSDWLLLQAS .::.:::: :: :: : : .:::::.:: . . :.:: ::: :::::: CCDS44 DNSTQWFHNESLISSQASSYFIDAATVDDSGEYRCQTNLSTLSDPVQLEVHIGWLLLQAP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 AEVVMEGQPLFLRCHGWRNWDVYKVIYYKDGEALKYWYENHNISITNATVEDSGTYYCTG : : .:. ::::.:.: ..:: : ..:.. ::...: .. : .::..:::.:.: : CCDS44 RWVFKEEDPIHLRCHSWKNTALHKVTYLQNGKGRKYFHHNSDFYIPKATLKDSGSYFCRG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KVWQLDYESEPLNITVIKAPREKYWLQFFIP-------LLVVILFAVDTGLFISTQQQVT . . :: .:::. .. . .:: : :..:.::::::::..:.. .. 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CCDS41 LVGSKNVSSETVNITITQGLAVSTISSFSPPGYQVSFCLVMVLLFAVDTGLYFSVKTNI 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 FLLKIKRTRKGFRLLNPHPKPNPKNN >>CCDS58040.1 FCGR3B gene_id:2215|Hs108|chr1 (269 aa) initn: 510 init1: 461 opt: 522 Z-score: 569.4 bits: 113.0 E(32554): 2.1e-25 Smith-Waterman score: 522; 40.0% identity (65.2% similar) in 230 aa overlap (10-230:41-269) 10 20 30 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAPDGVLAVPQKPK--VSLNPP :: .:::... : . . . :: : :.: CCDS58 TPSCLVGLVPLGLRISLVTCPLQCGIMWQLLLPTALLLLVSAG-MRTEDLPKAVVFLEPQ 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 WNRIFKGENVTLTCNGNNFFEVSSTKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQ : ... ..::: :.: : .::.:::: .: :: : : .:::::.:: . CCDS58 WYSVLEKDSVTLKCQGAYSPEDNSTQWFHNENLISSQASSYFIDAATVNDSGEYRCQTNL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 VNESEPVYLEVFSDWLLLQASAEVVMEGQPLFLRCHGWRNWDVYKVIYYKDGEALKYWYE . :.:: ::: :::::: : : .:. ::::.:.: ..:: : ..:. ::... CCDS58 STLSDPVQLEVHIGWLLLQAPRWVFKEEDPIHLRCHSWKNTALHKVTYLQNGKDRKYFHH 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 NHNISITNATVEDSGTYYCTGKVWQLDYESEPLNITVIKAPREKYWLQFFIP-------L : .. : .::..:::.:.: : : . . :: .:::. .. . .: : : CCDS58 NSDFHIPKATLKDSGSYFCRGLVGSKNVSSETVNITITQGLAVSTISSFSPPGYQVSFCL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 pF1KE1 LVVILFAVDTGLFISTQQQVTFLLKIKRTRKGFRLLNPHPKPNPKNN ..:.::::::::..:.. .. CCDS58 VMVLLFAVDTGLYFSVKTNI 250 260 >>CCDS72961.1 FCGR3B gene_id:2215|Hs108|chr1 (216 aa) initn: 510 init1: 461 opt: 509 Z-score: 556.9 bits: 110.4 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 509; 40.7% identity (65.1% similar) in 209 aa overlap (29-230:8-216) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAPDGVLAVPQKPKVSLNPPWNRIFKGENVTLTCNGNNFFEVS : : :.: : ... ..::: :.: : . 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CCDS72 GSKNVSSETVNITITQGLAVSTISSFSPPGYQVSFCLVMVLLFAVDTGLYFSVKTNI 160 170 180 190 200 210 240 250 pF1KE1 LKIKRTRKGFRLLNPHPKPNPKNN >>CCDS72844.1 FCGR1B gene_id:2210|Hs108|chr1 (224 aa) initn: 495 init1: 495 opt: 499 Z-score: 546.0 bits: 108.4 E(32554): 4.3e-24 Smith-Waterman score: 499; 41.8% identity (76.4% similar) in 165 aa overlap (15-178:7-170) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAP-DGVLAVPQKPKVSLNPPWNRIFKGENVTLTCNGNNFFEV ::...: :: . . : ..:.::: .:. :..:: :. .. CCDS72 MWFLTTLLLWVPVDGQVDTT-KAVITLQPPWVSVFQEETITLHCEVLHLPGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SSTKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQVNESEPVYLEVFSDWLLLQASA :::.:: ::. .. .. : :..:. .:::::.::. ..:.:. ::. :::::.:. 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CCDS93 SSTQWFLNGTATQTSTPSYRITSASVNDSGEYRCQRGLSGRSDPIQLEIHRGWLLLQVSS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 EVVMEGQPLFLRCHGWRNWDVYKVIYYKDGEALKYWYENHNISITNATVEDSGTYYCTGK .: ::.:: ::::.:.. ::.:.::..:.:.:... : :..: .... .:::.:.: CCDS93 RVFTEGEPLALRCHAWKDKLVYNVLYYRNGKAFKFFHWNSNLTILKTNISHNGTYHCSG- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 VWQLDYESEPLNITVIKAPREKYWLQFFIPLLVVILFAVDTGLFISTQQQVTFLLKIKRT . . : : ...:: CCDS93 MGKHRYTSAGISVTVKELFPAPVLNASVTSPLLEGNLVTLSCETKLLLQRPGLQLYFSFY 180 190 200 210 220 230 >>CCDS30924.1 FCGR2B gene_id:2213|Hs108|chr1 (310 aa) initn: 476 init1: 450 opt: 490 Z-score: 534.4 bits: 106.7 E(32554): 1.9e-23 Smith-Waterman score: 490; 33.6% identity (62.9% similar) in 259 aa overlap (2-256:21-277) 10 20 30 40 pF1KE1 MAPAMESPTLLCVALLFFAP-DGVLAVPQKPKVSLNPPWNR .: . :: .:.::.:: :. :.: : ..:.: : CCDS30 MGILSFLPVLATESDWADCKSPQPWGHMLLWTAVLFLAPVAGTPAAPPKAVLKLEPQWIN 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 IFKGENVTLTCNGNNFFEVSSTKWFHNGSLSEETNSSLNIVNAKFEDSGEYKCQHQQVNE ... ..::::: :.. : .: .:::::.: .. .:. .::::: :: :.. 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