FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7993, 469 aa 1>>>pF1KB7993 469 - 469 aa - 469 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6341+/-0.000585; mu= -7.9350+/- 0.036 mean_var=290.1137+/-59.050, 0's: 0 Z-trim(115.6): 189 B-trim: 1269 in 3/53 Lambda= 0.075299 statistics sampled from 26007 (26219) to 26007 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16 Scan time: 9.020 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 2904 329.5 1.2e-89 XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 2492 284.7 3.4e-76 NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 1741 203.2 1.6e-51 NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 1722 201.2 6.3e-51 NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 1710 199.9 1.6e-50 NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 1709 199.7 1.7e-50 NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 1707 199.5 1.9e-50 NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1693 198.0 4.9e-50 NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1693 198.0 4.9e-50 NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1693 198.0 5.2e-50 XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1657 193.9 5e-49 NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 1623 190.4 1.2e-47 NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 1616 189.6 1.7e-47 NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1595 187.3 8.6e-47 NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 1569 184.6 7e-46 XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1558 183.4 1.5e-45 NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1558 183.4 1.5e-45 NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1548 182.2 3e-45 NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1546 182.0 3.3e-45 NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1546 182.0 3.3e-45 NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 1514 178.6 4.4e-44 XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1508 177.8 4.9e-44 XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1504 177.4 7e-44 NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1494 176.4 1.7e-43 XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1479 174.7 4.6e-43 NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1467 173.5 1.4e-42 NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1465 173.2 1.5e-42 NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1430 169.5 2.5e-41 NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1388 164.8 4.8e-40 NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1387 164.7 5.3e-40 NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1372 163.1 1.6e-39 NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1348 160.5 9.8e-39 NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1347 160.4 1e-38 XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1347 160.4 1e-38 XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1347 160.4 1.2e-38 NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1333 158.9 3e-38 XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1306 155.9 2.1e-37 XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1306 155.9 2.1e-37 NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1165 140.6 8e-33 XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1091 132.5 1.8e-30 NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1063 129.5 1.9e-29 NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1057 128.8 2.8e-29 NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1027 125.6 2.9e-28 XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 920 114.0 9.8e-25 XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 911 112.8 1.2e-24 NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295) 890 110.6 6e-24 NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 795 100.4 1.1e-20 XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 795 100.4 1.1e-20 NP_006149 (OMIM: 162280,607684,607734) neurofilame ( 543) 793 100.2 1.5e-20 XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488) 782 99.0 3.1e-20 >>NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskeletal (469 aa) initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904 Z-score: 1730.4 bits: 329.5 E(85289): 1.2e-89 Smith-Waterman score: 2904; 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NP_000 SIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGT-KTVRQNLEPL 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 FEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKD :: : .:: ::... . :::..:::.:::.:::::::::::::.::.::::::.:::: NP_000 FEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKD 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 VDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGI ::::::.::::::::::: :::::.. . ..::...:...:::::::::::.:.::::.: NP_000 VDAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSI 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 IAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQA ::::::::::.:. ::.:::.:::::.: :: ::.::::::::..::::::: ::::.: NP_000 IAEVKAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRA 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 EIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMS ::::.:.: :.:. :::.::.:::::::::: : ::: :::.::::::: ::::::::. NP_000 EIDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMN 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 pF1KB7 VKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNST------GGSSSGGGIGLTLGG .:::::.::::::::::::: ::.:.::: :::::..:. .::. :::.: ::: NP_000 TKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGG 460 470 480 490 500 510 440 450 460 pF1KB7 TMG-------SNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD .: :.. :::.: :: . :. .. : :.: NP_000 GLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFV 520 530 540 550 560 570 NP_000 STTSSSRKSFKS 580 590 >>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos (564 aa) initn: 1794 init1: 1311 opt: 1722 Z-score: 1035.3 bits: 201.2 E(85289): 6.3e-51 Smith-Waterman score: 1722; 64.3% identity (84.9% similar) in 445 aa overlap (14-450:90-524) 10 20 30 40 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLG : .:.: :. .. :: : . .::: NP_005 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFG----GGAGIG--FGLG 60 70 80 90 100 110 50 60 70 80 90 pF1KB7 ASRPRVAVRSAYGGP-----VGAGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTL .. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: :::::: NP_005 GG---AGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 NNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQ :::::::::::::::::::.::::::::::: . :. : : .:: : .:: ::... NP_005 NNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGT-KTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIV 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 VDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVD . :::..:::.:::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.: NP_005 GERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKAD 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSR .:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. :: NP_005 TLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSR 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 AEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAI ::::.:::::.: ::. ::.::::::::..::.:.:: ::::..:::..:.: :.:.::: NP_005 AEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAI 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 AEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLL :.::.:::.:::::. : : :: :::.::::.:: :.::::::.::::::.::::::::: NP_005 ADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLL 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 EGEESRLAGDGVGAVNISVMNSTGGSSSGGGIGLTLG-GTMGSNALSFSSSAGPGLLKAY :::: :: :.::: :::::..:: .:. ::. :. : : :... :..:. : : NP_005 EGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSS 470 480 490 500 510 520 460 pF1KB7 SIRTASASRRSARD NP_005 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH 530 540 550 560 >>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos (564 aa) initn: 1833 init1: 1304 opt: 1710 Z-score: 1028.3 bits: 199.9 E(85289): 1.6e-50 Smith-Waterman score: 1710; 63.6% identity (84.9% similar) in 445 aa overlap (14-450:90-524) 10 20 30 40 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLG : .:.: :. .. :: : . .::: NP_775 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFG----GGAGIG--FGLG 60 70 80 90 100 110 50 60 70 80 90 pF1KB7 ASRPRVAVRSAYGGP-----VGAGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTL .. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: :::::: NP_775 GG---AGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 NNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQ :::::::::::::::::::.:.::::::::: . :. : : .:: : .:: ::... NP_775 NNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGT-KTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIV 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 VDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVD . :::..:::.:::.:::.:::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.: NP_775 GERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKAD 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSR .:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. :: NP_775 TLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSR 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 AEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAI ::::.:::::.: ::. ::.::::::::..::.:.:: ::::..:::..:.: :.:.::: NP_775 AEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAI 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 AEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLL :.::.:::.:::::. : : :: :::.::::.:: :.::::::.::::::.::::::::: NP_775 ADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLL 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 EGEESRLAGDGVGAVNISVMNSTGGSSSGGGIGLTLG-GTMGSNALSFSSSAGPGLLKAY :::: :: :.::: ::.::..:: .:. ::. :. : : :... :..:. : : NP_775 EGEECRLNGEGVGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSS 470 480 490 500 510 520 460 pF1KB7 SIRTASASRRSARD NP_775 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH 530 540 550 560 >>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos (564 aa) initn: 1780 init1: 1302 opt: 1709 Z-score: 1027.7 bits: 199.7 E(85289): 1.7e-50 Smith-Waterman score: 1709; 63.1% identity (83.5% similar) in 461 aa overlap (14-463:90-535) 10 20 30 40 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLG : .:.: :. .. :: : . .::: NP_005 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFG----GGAGIG--FGLG 60 70 80 90 100 110 50 60 70 80 90 pF1KB7 ASRPRVAVRSAYGGP-----VGAGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTL .. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: :::::: NP_005 GG---AGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 NNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQ :::::::::::::::::::.:.::::::::: ..:. : : .:: : .:: ::. . NP_005 NNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ-GTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIV 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 VDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVD . :::..:::.:::.:::.:::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.: NP_005 GERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKAD 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSR .:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. :: NP_005 TLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSR 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 AEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAI ::::.:::::.: :: ::.::::::::..::.:.:: ::::..:::..:.: :.:.::: NP_005 AEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAI 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 AEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLL :.::.:::.:::::. : : :: :::.::::.:: :.::::::.::::::.::::::::: NP_005 ADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLL 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 EGEESRLAGDGVGAVNISVMNST---G-GSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLL :::: :: :.::: :::::..:: : :..:: : :: ::: :: :.: ..: :. NP_005 EGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGG--GS---SYSYGSGLGVG 470 480 490 500 510 520 460 pF1KB7 KAYSIRTASASRRSARD ..: .. :. NP_005 GGFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH 530 540 550 560 >>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos (551 aa) initn: 1787 init1: 1288 opt: 1707 Z-score: 1026.6 bits: 199.5 E(85289): 1.9e-50 Smith-Waterman score: 1721; 62.2% identity (80.8% similar) in 490 aa overlap (5-451:32-512) 10 20 30 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGL ::: : ..:::: : :. :.::: ... NP_004 SRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSS-VSVARSAA--GSGGLGRISSA-GASF 10 20 30 40 50 40 50 60 pF1KB7 GSSSLYGLGASRPRVAV-------RSA----------------YGGPVGAG--------- :: :::.::... ::.. ::. ::: ::.: NP_004 GSRSLYNLGGAK-RVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFGVNSGFGYGGGVGGGFSGPSFPVC 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 pF1KB7 ----IREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKL :.:::.:::::.::.:. ::..:::: :: :::::::::::::::::::::::::. NP_004 PPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKV 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 LETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDF :::::.::::: : .. : : .:.. . :: :::.. .. ::::::::.:::::::: NP_004 LETKWALLQEQGS-RTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAELRNMQDVVEDF 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTEL : .::::::.:::::::::.::::::::::.:::::::: .: .::::.... ..::..: NP_004 KVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFIHSVFDAELSQL 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 QSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGK :.:..::::::::::.:.::::.::::::::::..:. ::::::.:::::.: ::. ::. NP_004 QTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGR 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 HGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEE ::::::::..::::::: ::::.::::..:.: ..:..:::.::.:::::::::::: . NP_004 HGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGELALKDARAKLVD 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVM :: :::.::::::: ::::::::..:::::.::::::::::::: ::.:.::. :::::. NP_004 LEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVSPVNISVV 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 pF1KB7 NST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD .:: :..:: :: .: ::: : ::..:.: .: NP_004 TSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSG---YSFTTSGGHSLGAGLGGSGFSATSNRGLGGS 480 490 500 510 520 530 NP_004 GSSVKFVSTTSSSQKSYTH 540 550 >>NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele (483 aa) initn: 1242 init1: 1242 opt: 1693 Z-score: 1019.2 bits: 198.0 E(85289): 4.9e-50 Smith-Waterman score: 1693; 62.9% identity (81.8% similar) in 472 aa overlap (6-469:9-470) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGG-LGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYG : : :: :::.:. .. ::. ..:::. .:.: : .. ..:: NP_001 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRS-----YTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 GPVG-AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ : : .:: ::.:::::.:: :..::..: :: .:.::::::::::::::::::::::: NP_001 GASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 NKLLETKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVED ::.:::::.:::.::.:.:. . ..::. : .:: :::.: . .::::: .:: .::: NP_001 NKMLETKWSLLQQQKTARSN-MDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 FKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTE ::::::::::.:: :::::..::::: :::.:::::.....:.::::::: : : :. : NP_001 FKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAG :::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:. ::::::. :: :.: ::. :: NP_001 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE ::::::: :..::::::: :.::::::...:.:::.::::::.::.:::::.::: :: NP_001 KHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: . : :.:. 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NP_002 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLL-KAYSIRTASASRRSARD ..: :: ::. : ::: : : . ::.:.:: . . .. : :.. ... .:: NP_002 HTKTTSGYAGGLSSAYG-GLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRD 420 430 440 450 460 470 NP_002 GKLVSESSDVLPK 480 >>NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele (511 aa) initn: 1242 init1: 1242 opt: 1693 Z-score: 1018.9 bits: 198.0 E(85289): 5.2e-50 Smith-Waterman score: 1693; 62.9% identity (81.8% similar) in 472 aa overlap (6-469:37-498) 10 20 30 pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGG-L : : :: :::.:. .. ::. . 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NP_001 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 CSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLE ::::::. :: :.: ::. ::::::::: :..::::::: :.::::::...:.:::.:: NP_001 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 AAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYR ::::.::.:::::.::: :: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: NP_001 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KB7 KLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAG :::::::::: . : :.:. ..: :: ::. : ::: : : . ::.:.:: NP_001 KLLEGEESRLES---GMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYG-GLTSPGLSYSLGSSFGSGAG 430 440 450 460 470 450 460 pF1KB7 PGLL-KAYSIRTASASRRSARD . . .. : :.. ... .:: NP_001 SSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK 480 490 500 510 469 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 02:36:28 2016 done: Mon Nov 7 02:36:29 2016 Total Scan time: 9.020 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]