FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2236, 476 aa 1>>>pF1KE2236 476 - 476 aa - 476 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1102+/-0.000737; mu= 13.9651+/- 0.045 mean_var=73.9318+/-14.499, 0's: 0 Z-trim(110.2): 37 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.149162 statistics sampled from 11385 (11422) to 11385 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16 Scan time: 3.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 3286 716.2 1.9e-206 CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 2651 579.5 2.6e-165 CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 1633 360.4 2.3e-99 CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 1442 319.3 5.6e-87 CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 1009 226.2 6.1e-59 CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 967 217.1 3.2e-56 CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 909 204.6 1.8e-52 CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 ( 488) 880 198.4 1.4e-50 CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 508) 848 191.5 1.8e-48 CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 ( 267) 835 188.6 6.8e-48 CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 ( 513) 742 168.7 1.3e-41 CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 638 146.4 8.9e-35 CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 619 142.3 1.4e-33 CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 ( 261) 600 138.1 1.1e-32 CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 603 138.8 1.8e-32 CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 599 137.9 2.7e-32 CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 590 136.0 1.1e-31 CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 544 126.1 9.8e-29 CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 ( 603) 544 126.1 1e-28 CCDS7647.1 MMP21 gene_id:118856|Hs108|chr10 ( 569) 455 107.0 5.6e-23 CCDS76996.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 393) 449 105.6 9.8e-23 CCDS74036.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 520) 449 105.7 1.3e-22 CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 411 97.5 4.6e-20 CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 403 95.8 1.4e-19 CCDS7763.1 HPX gene_id:3263|Hs108|chr11 ( 462) 302 74.0 3.8e-13 CCDS61146.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 305) 290 71.4 1.5e-12 >>CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 (476 aa) initn: 3286 init1: 3286 opt: 3286 Z-score: 3819.8 bits: 716.2 E(32554): 1.9e-206 Smith-Waterman score: 3286; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQFRRKDSNLIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQFRRKDSNLIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 KKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRIVNY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 KKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRIVNY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPGHSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 TPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPGHSL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 AHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLYN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 AHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLYN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 SFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDAIST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 SFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDAIST 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 LRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFW 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 AIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 AIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 FPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 FPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC 430 440 450 460 470 >>CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 (477 aa) initn: 2726 init1: 2443 opt: 2651 Z-score: 3081.2 bits: 579.5 E(32554): 2.6e-165 Smith-Waterman score: 2651; 78.2% identity (92.0% similar) in 477 aa overlap (1-476:1-477) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQF-RRKDSNLI : : .:.:::. :::::::.:::. ::.. .:.:.:::.::.:.:::::: :::::. . CCDS83 MKSLPILLLLCVAVCSAYPLDGAARGEDTSMNLVQKYLENYYDLKKDVKQFVRRKDSGPV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRIVN ::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::: .:::.:::::::::::::: CCDS83 VKKIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHFRTFPGIPKWRKTHLTYRIVN 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 YTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPGHS ::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: :::::. CCDS83 YTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFDGPGNV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLY ::::: ::::. :: ::::::.::.:..:::::::::::.:::::::::::::::::::: CCDS83 LAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWTKDTTGTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANTEALMYPLY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 NSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDAIS .:.:.:..:::::::.::::::::::: : : :::::. :: ::.:::::::::.: CCDS83 HSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGPPPDSPETPLVPTEPVPPEPGTPANCDPALSFDAVS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 TLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEF ::::: :.::::.:::.: . :::.::::.::::::: .::::::.:.: :::::::.: CCDS83 TLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 WAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQ ::::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::.:::::. ::::::::. .::: CCDS83 WAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSMEP 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 GFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC :::. ::.::::.. :.:::.. :::::::.::::.::::::. ::: :::::::.: CCDS83 GFPKQIAEDFPGIDSKIDAVFEEFGFFYFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC 430 440 450 460 470 >>CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 (470 aa) initn: 1672 init1: 794 opt: 1633 Z-score: 1897.4 bits: 360.4 E(32554): 2.3e-99 Smith-Waterman score: 1633; 49.6% identity (76.2% similar) in 478 aa overlap (2-476:1-470) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKD-VKQFRRKDS-NL :.. ...:: . .: ::..... : .: ....::::.:.:: . . . : : :: CCDS73 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 IVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRIV . .::: ::.::::.:::.:::.:::.:. :::::::: :: .:: : ::: ..:::: CCDS73 MKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRIN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPGH :::::. :. :: ::.::..:: .:::: ::.. : :::.. :: ::::..::: : CCDS73 NYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPL ::::. :: :. :: :::.:: :: ..::::::.:.::.:::::: ::.. .:.:.: CCDS73 ILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 YNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDAI :. .... :::: ::. ::::::: : . . : :..:: :: ::: :::::. CCDS73 YK-YVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLP------NPDNSE-PALCDPNLSFDAV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 STLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNE .:. .. .:::::.:: . :. .:::..::.::: ..::::...:. ::.:: .. CCDS73 TTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 FWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSME .: : . . . .::..::..::: ..:::::: . . .::::. ..:::.:: : :. CCDS73 YWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFG-FFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC :.:.::. .: :. ::.:::. . . ..:::.::.:::.: . .:. ::::::. : CCDS73 PGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 1326 init1: 764 opt: 1442 Z-score: 1675.1 bits: 319.3 E(32554): 5.6e-87 Smith-Waterman score: 1442; 45.6% identity (71.5% similar) in 478 aa overlap (4-476:9-483) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCSAYP--LSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYY-NLE-KDVKQF :: .... : .: : .... . .: ::: ::.::: : : ... .. CCDS83 MKVLPASGLAVFLIMALKFSTAAPSLVAASPRTWRNNYRLAQAYLDKYYTNKEGHQIGEM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RRKDSNLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKT . :: ...::. .: :.::.:::::: :..:..:::::::::... ::: :::.:. CCDS83 VARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPDVANYRLFPGEPKWKKN 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 HLTYRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFY ::::: .:::.. ::.:.: ::..: ..::.: :. ::::::::: .::: : CCDS83 TLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSFVRINSGEADIMISFENGDHGDSY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SFDGPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANT :::: .::::. :: :: :: :::. :::: ..: ::: :::::.::.::: ::.. CCDS83 PFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTMGTNGFNLFTVAAHEFGHALGLAHSTDP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EALMYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDP ::::: :. . . :.: .:::.:::.:::: . .: .: . : .: :: CCDS83 SALMYPTYK-YKNPYGFHLPKDDVKGIQALYGPRKVFLGKPTLPHAPHHKPS-IPDLCDS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ALSFDAISTLRGEYLFFKDRYFWRRS-HWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDT . ::::.. : : :.:::: ::::. : . :.. .:.: : .:::::: : : CCDS83 SSSFDAVTMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSFPQLMSNVDAAYEVAERGT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 VFIFKGNEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRF ...::: ..: :: ..: : :: :. .::: ...::::: .: .:: ::..:.:. . CCDS83 AYFFKGPHYWITRGFQMQ-GPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGDEYYSY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DENSQSMEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKS :: ...::. .:. ..: ::. ..::... :..::::: . ...: . . :. ..:: CCDS83 DERKRKMEKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAVELNGYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVVSVVKS 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 NSWLHC .::. : CCDS83 SSWIGC 480 >>CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 (471 aa) initn: 1638 init1: 865 opt: 1009 Z-score: 1171.7 bits: 226.2 E(32554): 6.1e-59 Smith-Waterman score: 1637; 49.7% identity (76.3% similar) in 481 aa overlap (2-476:1-471) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMH---LAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEED-SNKDL--AQQYLEKYYNLEKDVKQFRRK :: :: ...: : : :: ... :.: :..:: :..::..::. . . .... CCDS83 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKEN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSNLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLT .. ...... ::.:.::::::::: .::.::.::::::::::... :: :: : .:: CCDS83 AASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 YRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFD :::::::::. .. :..:..::.::: .::::.:.::..: :::::::..::::::: :: CCDS83 YRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEAL ::. ::::.::::. :: :::::: :: ...: :::::::::.:::::: :: . :: CCDS83 GPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 MYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALS :.:.: ..: ..: : .:::.:::::::: . :.: :. . : ::::.:: CCDS83 MFPIY-TYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGP---GDEDP------NPKHPKTPDKCDPSLS 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 FDAISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIF .:::..:::: ..::::.::: . . :. : ..::: ::. .::::: :.: .::: CCDS83 LDAITSLRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIF 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 KGNEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENS .: .:::. : .. :::. : ::.: ..::.::: .. :: .:.... ::.:... CCDS83 RGRKFWALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTN 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 QSMEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWL . :.. .:::: .::::. ::::: . :..:::.: :::.. . ..... .:: : CCDS83 HIMDKDYPRLIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSIL 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 HC : CCDS83 WC 470 >>CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 (469 aa) initn: 1691 init1: 772 opt: 967 Z-score: 1122.8 bits: 217.1 E(32554): 3.2e-56 Smith-Waterman score: 1722; 52.3% identity (78.5% similar) in 474 aa overlap (6-476:7-466) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCS-AYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQF-RRKDSN .:.:: : : ..: . ..:.: ::.:.::::::::..: .: .:..:. CCDS83 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDV--DLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRI .:.:.. ::.:.::.:::: :..::.::..::::::::..: : :.:..::::::: CCDS83 PVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPG :::::::: :: :::::...: .::::::... ::.:::::::. .: : ::::: CCDS83 ENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 HSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYP .::::. ::::. :: :::.::.::.. :: :::::::::::: ::.. ::::: CCDS83 GNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDA :.: .. .:.:::..:::..:: ...:. : : . : :: :.::: CCDS83 ---SYTFSGDVQLAQDDIDGIQAIYG----RSQNPVQPI-----GPQTPKACDSKLTFDA 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGN :.:.::: .:::::.. : . . :: :...::.:::.::. :.:::: .:: : .:::: CCDS83 ITTIRGEVMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGN 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EFWAIRGNEVQAGYPRGIHT-LGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQS ..::..:..: :::. :.. .::: :...::::.:... :::::.:.::::.:: ..: CCDS83 KYWAVQGQNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 MEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC :. :.:..:: ::::. :::::.. :::::: :. :..:::... . . :.:::..: CCDS83 MDPGYPKMIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNC 410 420 430 440 450 460 CCDS83 RKN >>CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 (467 aa) initn: 1557 init1: 716 opt: 909 Z-score: 1055.4 bits: 204.6 E(32554): 1.8e-52 Smith-Waterman score: 1614; 50.2% identity (74.1% similar) in 474 aa overlap (4-476:7-464) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQFRRKD-S : ::.:: . . .:.:.: .::. : .:.::::.:.: .. : ::. . CCDS83 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVS--SKEK--NTKTVQDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 NLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYR :.::.:.. ::.:.::.:::: . .::..:.:::::::: : : :: :::..:.:::: CCDS83 NVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGP : ::::.: . :. ::. :...: ..:: :.:. .::::: :.: ..::: :::: CCDS83 IRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMY . ::::. :: :. :: ::: .: ::. ... :::::::::.:::::: ::.. :::: CCDS83 NGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFD : : .: : ... : :::..:::..:: . .:. :: : : :::.:.:: CCDS83 PNY-AFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYG----LSSNPIQPT-----GPSTPKPCDPSLTFD 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKG ::.::::: ::::::::::: . :...:: ::::::. ..:::: .:: .:.::: CCDS83 AITTLRGEILFFKDRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKG 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 NEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQS :..::. : .. :::. : . ::: ... ::::: ..:::::. :..::.:.. : CCDS83 NQYWALSGYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVF--YRSKTYFFVNDQFWRYDNQRQF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 MEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC :: :.:. :. :::.: :::::.: ::. ::: . :: :. ::.. ..:.::.: CCDS83 MEPGYPKSISGAFPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNC 410 420 430 440 450 460 CCDS83 RYG >>CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 (488 aa) initn: 780 init1: 352 opt: 880 Z-score: 1021.4 bits: 198.4 E(32554): 1.4e-50 Smith-Waterman score: 880; 41.3% identity (63.0% similar) in 395 aa overlap (86-459:75-460) 60 70 80 90 100 pF1KE2 SNLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPK-------- .: ::::::: . : . : CCDS13 RRGPQPWHAALPSSPAPAPATQEAPRPASSLRPPRCGVPDPSDGLSARNRQKRFVLSGGR 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 WRKTHLTYRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEH :.:: :::::. . .: .. : ... .::::: .::::::....::.:::::.:: : CCDS13 WEKTDLTYRILRFPWQLVQEQVRQTMAEALKVWSDVTPLTFTEVHEGRADIMIDFARYWH 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GDFYSFDGPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWT-EDASGTNLFLVAAHELGHSLGLF :: ::::: ::::. : ::.::: :: :: : .::.:. :::::.:: ::: CCDS13 GDDLPFDGPGGILAHAFFPKTHREGDVHFDYDETWTIGDDQGTDLLQVAAHEFGHVLGLQ 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 HSANTEALMYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPP-PA-STEEP-LVPTKSVPSGS :.. ..::: .:. :. :: :: :.: ::: : :. ... : : : .. .. CCDS13 HTTAAKALMSAFYTFRYPLS---LSPDDCRGVQHLYGQPWPTVTSRTPALGPQAGIDTNE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 EMPAKCD-PA----LSFDAISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFH-LISAFWPSLPS : . : : ::::.::.::: .::: . :: . .: . : : : .::: CCDS13 IAPLEPDAPPDACEASFDAVSTIRGELFFFKAGFVWRLRGGQLQPGYPALASRHWQGLPS 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 YLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIR-KIDAA-VSDKE .:::.: ... ...:.: ..:. :.. : : . ::. .: . :: : : CCDS13 PVDAAFE-DAQGHIWFFQGAQYWVYDGEKPVLG-PAPLTELGL---VRFPVHAALVWGPE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 KKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQ-AFGFFYFFSGSSQ :.: ::: . :::: ... ... :: : :. :: ..::..: : :. ::. : CCDS13 KNKIYFFRGRDYWRFHPSTRRVDSPVPRR-ATDWRGVPSEIDAAFQDADGYAYFLRGRLY 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 FEFDPNARMVTHILKSNSWLHC ..::: CCDS13 WKFDPVKVKALEGFPRLVGPDFFGCAEPANTFL 460 470 480 >>CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 (508 aa) initn: 645 init1: 178 opt: 848 Z-score: 983.9 bits: 191.5 E(32554): 1.8e-48 Smith-Waterman score: 848; 35.2% identity (62.0% similar) in 460 aa overlap (37-476:31-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 LVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVK---QFRRKDSNLIVKKI :: .: :.: .. .:. .: :.. . CCDS88 MNCQQLWLGFLLPMTVSGRVLGLAEVAPVDYLSQYGYLQKPLEGSNNFKPED---ITEAL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGM--PKWRKTHLTYRIVNYT ...:. : :.:.:: : ::.::::. : . ... . .::: :::.::.: CCDS88 RAFQEASELPVSGQLDDATRARMRQPRCGLEDPFNQKTLKYLLLGRWRKKHLTFRILNLP 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFY-SFDGPGHSL :: .. .:...:.. : .:.::::... : ::: .:: .. . .:::::. : CCDS88 STLPPHTARAALRQAFQDWSNVAPLTFQEVQAGAADIRLSFHGRQSSYCSNTFDGPGRVL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 AHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDA-SGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLY ::: : :..:::.:: ::: . :.:: ..::::.::.::: :: ..::: :.: CCDS88 AHADIPE---LGSVHFDEDEFWTEGTYRGVNLRIIAAHEVGHALGLGHSRYSQALMAPVY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 NSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGP--PPASTEE------PLVPTKSVPS-GSEMPAKCD ... .:.: ::: :::.::: : :: : :: ::. : :: :. CCDS88 EGYR--PHFKLHPDDVAGIQALYGKKSPVIRDEEEEETELPTVPP--VPTEPSPMPDPCS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 PALSFDAISTL-RGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRD : ::. ::. :: : : : .: : :. .::.: .::. :::: . CCDS88 SEL--DAMMLGPRGKTYAFKGDYVWTVSDSGPGPLFR-VSALWEGLPGNLDAAVYSPRTQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 TVFIFKGNEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWR . .:::.. : . ... :.:. .. . :. .:::. ..:...: .. ::. CCDS88 WIHFFKGDKVWRYINFKMSPGFPKKLNRV--EPN---LDAALYWPLNQKVFLFKGSGYWQ 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 FDENSQSMEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQ-AFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHIL .:: ... ...:. : : :: . .:... : :::.:. .... . :. CCDS88 WDELARTDFSSYPKPIKGLFTGVPNQPSAAMSWQDGRVYFFKGKVYWRLNQQLRVEKGYP 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 K--SNSWLHC . :..:.:: CCDS88 RNISHNWMHCRPRTIDTTPSGGNTTPSGTGITLDTTLSATETTFEY 470 480 490 500 >>CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 (267 aa) initn: 640 init1: 640 opt: 835 Z-score: 973.3 bits: 188.6 E(32554): 6.8e-48 Smith-Waterman score: 835; 48.3% identity (74.0% similar) in 265 aa overlap (2-263:1-259) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MMHLAFLVLLCL-PVCSAYPLSG-AAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKDVKQFRRKDSNL :.:. : .:: : : :: :. . . . ::.::...: ....: ..: CCDS83 MRLTVLCAVCLLPGSLALPLPQEAGGMSELQWEQAQDYLKRFYLYDSETK-----NANS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 IVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRIV . :.. ::::.:: .:: :.. ..:.:.:::::::::...: ::. ::: . .::::: CCDS83 LEAKLKEMQKFFGLPITGMLNSRVIEIMQKPRCGVPDVAEYSLFPNSPKWTSKVVTYRIV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPGH .:: :::. .:: . :::..: . :: : .. : :::::.:: ::: : :::::. CCDS83 SYTRDLPHITVDRLVSKALNMWGKEIPLHFRKVVWGTADIMIGFARGAHGDSYPFDGPGN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDAS-GTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYP .::::. :: :: :: :::.::.::. .: : :.. .:.::::::::. ::.. .:.::: CCDS83 TLAHAFAPGTGLGGDAHFDEDERWTDGSSLGINFLYAATHELGHSLGMGHSSDPNAVMYP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDA :.. . .:.:::::..:::.::: CCDS83 TYGN-GDPQNFKLSQDDIKGIQKLYGKRSNSRKK 240 250 260 476 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 15:38:05 2016 done: Mon Nov 7 15:38:05 2016 Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]