FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4329, 334 aa 1>>>pF1KE4329 334 - 334 aa - 334 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6147+/-0.00106; mu= 13.7623+/- 0.064 mean_var=59.5347+/-12.398, 0's: 0 Z-trim(101.6): 33 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.166222 statistics sampled from 6577 (6601) to 6577 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16 Scan time: 2.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8691.1 LDHB gene_id:3945|Hs108|chr12 ( 334) 2161 527.0 8.3e-150 CCDS7839.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 332) 1720 421.2 5.6e-118 CCDS53609.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 361) 1720 421.3 6.1e-118 CCDS7840.1 LDHC gene_id:3948|Hs108|chr11 ( 332) 1584 388.6 3.7e-108 CCDS10171.1 LDHAL6B gene_id:92483|Hs108|chr15 ( 381) 1516 372.3 3.4e-103 CCDS7841.1 LDHAL6A gene_id:160287|Hs108|chr11 ( 332) 1504 369.4 2.2e-102 CCDS53611.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 241) 1283 316.4 1.5e-86 CCDS53610.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 274) 1243 306.8 1.3e-83 CCDS44549.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 274) 1023 254.1 9.7e-68 CCDS58122.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 341) 514 132.0 6.6e-31 CCDS58123.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 357) 514 132.0 6.9e-31 CCDS7843.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 379) 514 132.1 7.3e-31 CCDS58124.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 449) 514 132.1 8.6e-31 CCDS41624.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 471) 514 132.1 8.9e-31 >>CCDS8691.1 LDHB gene_id:3945|Hs108|chr12 (334 aa) initn: 2161 init1: 2161 opt: 2161 Z-score: 2803.0 bits: 527.0 E(32554): 8.3e-150 Smith-Waterman score: 2161; 100.0% identity (100.0% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-334) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL 310 320 330 >>CCDS7839.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 1712 init1: 1668 opt: 1720 Z-score: 2231.5 bits: 421.2 E(32554): 5.6e-118 Smith-Waterman score: 1720; 75.6% identity (93.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-331) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::::..:: . .:: : :.::::::::: :::::::::: :.::::::::::.::::: CCDS78 MATLKDQLIYNLLKEEQT-PQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :::::::::::::.:::::. :::.::::::.:..:::.:::::::::::::::::.::: CCDS78 GEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG :::..:::::.: ...:::::::::::.::.::.::.::::::::::::::::::.:.:: CCDS78 IIPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY .:: :::::.::::::::: ::::.:::::::. :.:..:::.:.:.::::::.:::::: CCDS78 VHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG :::::::::.:::::::::: ::..::: :.::::::.::.:::...::::.::::. : CCDS78 EVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPVSTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KE4 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL ...... : ..: :.::::::::: :::.:. CCDS78 ISDLVKVTLTSEEEARLKKSADTLWGIQKELQF 300 310 320 330 >>CCDS53609.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (361 aa) initn: 1712 init1: 1668 opt: 1720 Z-score: 2230.9 bits: 421.3 E(32554): 6.1e-118 Smith-Waterman score: 1720; 75.6% identity (93.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:30-360) 10 20 30 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQ :::::..:: . .:: : :.::::::::: CCDS53 MGEPSGGYTYTQTSIFLFHAKIPFGSKSNMATLKDQLIYNLLKEEQT-PQNKITVVGVGA 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 VGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSK :::::::::: :.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::. :::.:::::: CCDS53 VGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSK 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 IVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKL .:..:::.:::::::::::::::::.::::::..:::::.: ...:::::::::::.::. CCDS53 LVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKI 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 SGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVS ::.::.::::::::::::::::::.:.::.:: :::::.::::::::: ::::.:::::: CCDS53 SGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRI :. :.:..:::.:.:.::::::.:::::::::::::::.:::::::::: ::..::: :. CCDS53 LKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 HPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDL ::::::.::.:::...::::.::::. :...... : ..: :.::::::::: :::.: CCDS53 HPVSTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDLVKVTLTSEEEARLKKSADTLWGIQKEL 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 KDL . CCDS53 QF 360 >>CCDS7840.1 LDHC gene_id:3948|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 1554 init1: 1554 opt: 1584 Z-score: 2055.3 bits: 388.6 E(32554): 3.7e-108 Smith-Waterman score: 1584; 69.8% identity (90.9% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-330) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :.:.::.:: . :.. . . :::.::.: :::::::::: :.:::::::::: :::: CCDS78 MSTVKEQLIEKLIEDDEN-SQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF ::::::::::::..: ::.. :::::.:::.::.::::.::::::.:: :::::: ..: CCDS78 GEMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG ::: ::.::::: :.:::::::::::..::.:::: :::::::::::::::::..:::: CCDS78 IIPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY .::.::::::.:::::::: .:::::::::.:. :.:..:::.:.:.::..::.:..::: CCDS78 VHPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG :.:::::::.::::::: ::. :.:::: :.:::::::::.:::..:.:::.::.:. : CCDS78 EIIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KE4 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL ...:.. .:...: : .::::.:::.::::: CCDS78 VSDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF 300 310 320 330 >>CCDS10171.1 LDHAL6B gene_id:92483|Hs108|chr15 (381 aa) initn: 1518 init1: 1498 opt: 1516 Z-score: 1966.1 bits: 372.3 E(32554): 3.4e-103 Smith-Waterman score: 1516; 66.9% identity (88.6% similar) in 332 aa overlap (1-332:50-380) 10 20 30 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVG :::.: .:: . :. : ..:....:.: CCDS10 NFLCLGMALCPRQATRIPLNGTWLFTPVSKMATVKSELIERFTSEKP-VHHSKVSIIGTG 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 QVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANS .:::::::::: :.:.:::::::. ::::::: ::::::: : . :.:: .::: ::::: CCDS10 SVGMACAISILLKGLSDELALVDLDEDKLKGETMDLQHGSPFTKMPNIVCSKDYFVTANS 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 KIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWK ..:..:::.::..::.::::::::: .::..: .::.::: : .:.:::::::::::.:: CCDS10 NLVIITAGARQEKGETRLNLVQRNVAIFKLMISSIVQYSPHCKLIIVSNPVDILTYVAWK 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 LSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGV ::..::.:.::::::::.::::.:...::::: ::::::::::::::: ::::::.::: CCDS10 LSAFPKNRIIGSGCNLDTARFRFLIGQKLGIHSESCHGWILGEHGDSSVPVWSGVNIAGV 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 SLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSR :..:: ..:::.: :.::.::: :. .:::.::.::::.:::::::::: ::.:::: : CCDS10 PLKDLNSDIGTDKDPEQWKNVHKEVTATAYEIIKMKGYTSWAIGLSVADLTESILKNLRR 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 IHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKD ::::::..::.:::..:::::.::::. :.:..:. :: .: :.::::: :::.::. CCDS10 IHPVSTIIKGLYGIDEEVFLSIPCILGENGITNLIKIKLTPEEEAHLKKSAKTLWEIQNK 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 LKDL :: CCDS10 LKL 380 >>CCDS7841.1 LDHAL6A gene_id:160287|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 1468 init1: 1468 opt: 1504 Z-score: 1951.6 bits: 369.4 E(32554): 2.2e-102 Smith-Waterman score: 1504; 65.7% identity (90.1% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-331) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::.: .:: ::::: . .:::..::.:.::.::::::: :.:.:::.:::: : ::: CCDS78 MATIKSELIKNFAEEEA-IHHNKISIVGTGSVGVACAISILLKGLSDELVLVDVDEGKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :: ::::::: :.. :.::..::: :::::..:..:::.::..::.::.::::::..::. CCDS78 GETMDLQHGSPFMKMPNIVSSKDYLVTANSNLVIITAGARQKKGETRLDLVQRNVSIFKL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG .::.:..::: : ...:.:::::::::.:::::.::.::::::::::::::::.....:: CCDS78 MIPNITQYSPHCKLLIVTNPVDILTYVAWKLSGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYFIGQRLG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY :: :::: :::::::::: ::::::.::: :..:::..:::.: :.:..::: :. :.: CCDS78 IHSESCHGLILGEHGDSSVPVWSGVNIAGVPLKDLNPDIGTDKDPEQWENVHKKVISSGY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG :..:.::::.:.:.:::::: ::.:::: :.:::::. ::.:::....:::.::::. : CCDS78 EMVKMKGYTSWGISLSVADLTESILKNLRRVHPVSTLSKGLYGINEDIFLSVPCILGENG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KE4 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL .:..:. :: .: : :.:::.:::.:::.:: CCDS78 ITDLIKVKLTLEEEACLQKSAETLWEIQKELKL 300 310 320 330 >>CCDS53611.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (241 aa) initn: 1275 init1: 1231 opt: 1283 Z-score: 1667.5 bits: 316.4 E(32554): 1.5e-86 Smith-Waterman score: 1283; 77.9% identity (94.6% similar) in 240 aa overlap (1-240:1-239) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::::..:: . .:: : :.::::::::: :::::::::: :.::::::::::.::::: CCDS53 MATLKDQLIYNLLKEEQT-PQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :::::::::::::.:::::. :::.::::::.:..:::.:::::::::::::::::.::: CCDS53 GEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG :::..:::::.: ...:::::::::::.::.::.::.::::::::::::::::::.:.:: CCDS53 IIPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY .:: :::::.::::::::: ::::.:::::::. :.:..:::.:.:.::::::.::: .. CCDS53 VHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVERVF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG CCDS53 TE 240 >>CCDS53610.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (274 aa) initn: 1206 init1: 1206 opt: 1243 Z-score: 1614.7 bits: 306.8 E(32554): 1.3e-83 Smith-Waterman score: 1243; 78.7% identity (94.8% similar) in 230 aa overlap (1-230:1-229) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::::..:: . .:: : :.::::::::: :::::::::: :.::::::::::.::::: CCDS53 MATLKDQLIYNLLKEEQT-PQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :::::::::::::.:::::. :::.::::::.:..:::.:::::::::::::::::.::: CCDS53 GEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG :::..:::::.: ...:::::::::::.::.::.::.::::::::::::::::::.:.:: CCDS53 IIPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY .:: :::::.::::::::: ::::.:::::::. :.:..:::.:.:.::: CCDS53 VHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKECRYTLGDPKG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG CCDS53 AAILKSSDVISFHCLGYNRILGGGCACCPFYLICD 240 250 260 270 >>CCDS44549.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (274 aa) initn: 1356 init1: 1019 opt: 1023 Z-score: 1329.6 bits: 254.1 E(32554): 9.7e-68 Smith-Waterman score: 1272; 62.0% identity (76.5% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-273) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK :::::..:: . .:: : :.::::::::: :::::::::: :.::::::::::.::::: CCDS44 MATLKDQLIYNLLKEEQT-PQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF :::::::::::::.:::::. : CCDS44 GEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGK-------------------------------------- 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG :::::::.::.::.::.::::::::::::::::::.:.:: CCDS44 --------------------VDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLG 90 100 110 120 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY .:: :::::.::::::::: ::::.:::::::. :.:..:::.:.:.::::::.:::::: CCDS44 VHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAY 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG :::::::::.:::::::::: ::..::: :.::::::.::.:::...::::.::::. : CCDS44 EVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPVSTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNG 190 200 210 220 230 240 310 320 330 pF1KE4 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL ...... : ..: :.::::::::: :::.:. CCDS44 ISDLVKVTLTSEEEARLKKSADTLWGIQKELQF 250 260 270 >>CCDS58122.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 (341 aa) initn: 470 init1: 339 opt: 514 Z-score: 668.3 bits: 132.0 E(32554): 6.6e-31 Smith-Waterman score: 514; 43.2% identity (76.8% similar) in 190 aa overlap (15-204:140-321) 10 20 30 40 pF1KE4 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKS :. :: ::::::: :..:.::...: .:. CCDS58 DEARQVDLLAYIAKITEGVSDTNSKSWANHENKTV--NKITVVGGGELGIACTLAISAKG 110 120 130 140 150 160 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEG .::.:.:.: : . :: :::. ... :.. .:: :..:.::.:. :.. . CCDS58 IADRLVLLD-LSEGTKGATMDLE----IFNLPNVEISKDLSASAHSKVVIFTVN-SLGSS 170 180 190 200 210 220 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGC .: :..:: ::..:. ..: . .:: ...:.:.::.:.:::::::: .: .:::: :: CCDS58 QSYLDVVQSNVDMFRALVPALGHYSQHSVLLVASQPVEIMTYVTWKLSTFPANRVIGIGC 230 240 250 260 270 280 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 NLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDND :::: :..:.... : . :. . :..::.:...: .::: CCDS58 NLDSQRLQYIITNVLKAQTSGKEVWVIGEQGEDKVLTWSGQEEVVSHTSQVQLSNRDIMI 290 300 310 320 330 340 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 SENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGI 334 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 02:16:18 2016 done: Sun Nov 6 02:16:18 2016 Total Scan time: 2.240 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]