FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6313, 415 aa 1>>>pF1KE6313 415 - 415 aa - 415 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5266+/-0.000952; mu= 15.6206+/- 0.057 mean_var=62.2870+/-12.467, 0's: 0 Z-trim(104.5): 26 B-trim: 435 in 1/50 Lambda= 0.162508 statistics sampled from 7918 (7942) to 7918 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16 Scan time: 2.140 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 2770 658.2 4e-189 CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 871 213.0 4.2e-55 CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 783 192.4 7e-49 CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 783 192.4 7.1e-49 CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 777 190.9 1.7e-48 CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 753 185.3 9.4e-47 CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 743 183.0 4.7e-46 CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 709 175.0 1.1e-43 CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 705 174.0 1.8e-43 CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 684 169.2 7e-42 CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 677 167.5 2e-41 CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 647 160.5 3e-39 CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 624 155.1 1.7e-37 CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 576 143.9 4.1e-34 CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 576 143.9 4.3e-34 CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 576 143.9 4.4e-34 CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 424 108.2 1.6e-23 CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 333 87.0 9.3e-17 CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 333 87.0 9.5e-17 CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 250 67.5 5.1e-11 >>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 (415 aa) initn: 2770 init1: 2770 opt: 2770 Z-score: 3508.8 bits: 658.2 E(32554): 4e-189 Smith-Waterman score: 2770; 99.8% identity (99.8% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AYISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 AYISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGLGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNS ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 DHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGPGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 QPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDHLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 QPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDHLN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 VRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFATD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 VRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFATD 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 ECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE 370 380 390 400 410 >>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa) initn: 749 init1: 332 opt: 871 Z-score: 1102.7 bits: 213.0 E(32554): 4.2e-55 Smith-Waterman score: 871; 37.4% identity (70.2% similar) in 396 aa overlap (21-414:15-408) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM :.: . :.: . : :. : : .. . .. ::: .:. CCDS92 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHT-IYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKEL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT : :. :...:::. ..: . ::. .. . ..::.::. : .. .: .. ::.:: CCDS92 FPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQ . .:..: . : .::..::.. . :. . .:.. . :.:::.::::.. :.:. . CCDS92 VIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTG-GLGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGW :: ..:::.::.:..: :.. ::. : .: :::: ..: ::::..:::: :.: CCDS92 GDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 NSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDH .. : .::::: .: . .: :.:: ::.. :. :::.::: .:: :.... . .. CCDS92 RGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFA . : :: ::.. : .:: ::::: : .:::.. ::. :....: . .:::: : CCDS92 AENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAM-LKDNKKPFIKEAAMAKLAA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 TDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE .. :: .::.:. ::.::. .. .... ::.:. .: ::..:..:..:. ::. CCDS92 SEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS 360 370 380 390 400 410 >>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (421 aa) initn: 767 init1: 400 opt: 783 Z-score: 991.0 bits: 192.4 E(32554): 7e-49 Smith-Waterman score: 783; 33.7% identity (68.1% similar) in 383 aa overlap (36-410:32-413) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 CRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLN----EEQKEFQKVAFDFAAREMA .:..:.. :.::::: .: :: .:. CCDS66 AAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEII 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTA : ::.:. .:: ..:.: .::. ...: . :: ::. .:. .: : :: :::.. . CCDS66 PVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGD : ... : ::..:..:. . . .::.::::.:::.:.. :.:.:.:: CCDS66 AIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGG--LGP--KGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVG .::.::.: .:...:... : .. :. .: :... ..:: :::...:.:: ..: CCDS66 EYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 WNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRD . ::...::: :: : . ..: :: .:. ... : .:. ..: :. .. . CCDS66 QRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 HLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLF . :: ::. :. .: ..: ::.:: .. ::. . :: .. :... :.:: : CCDS66 YALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTY-YASIAKAF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE : : . ..:.:. :: :. .: :.. .::....:: ::.....:....: CCDS66 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK 370 380 390 400 410 420 CCDS66 N >>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (425 aa) initn: 767 init1: 400 opt: 783 Z-score: 990.9 bits: 192.4 E(32554): 7.1e-49 Smith-Waterman score: 783; 33.7% identity (68.1% similar) in 383 aa overlap (36-410:36-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 CRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLN----EEQKEFQKVAFDFAAREMA .:..:.. :.::::: .: :: .:. CCDS44 GRCCRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEII 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTA : ::.:. .:: ..:.: .::. ...: . :: ::. .:. .: : :: :::.. . CCDS44 PVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGD : ... : ::..:..:. . . .::.::::.:::.:.. :.:.:.:: CCDS44 AIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGG--LGP--KGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVG .::.::.: .:...:... : .. :. .: :... ..:: :::...:.:: ..: CCDS44 EYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 WNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRD . ::...::: :: : . ..: :: .:. ... : .:. ..: :. .. . CCDS44 QRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 HLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLF . :: ::. :. .: ..: ::.:: .. ::. . :: .. :... :.:: : CCDS44 YALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTY-YASIAKAF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE : : . ..:.:. :: :. .: :.. .::....:: ::.....:....: CCDS44 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK 370 380 390 400 410 420 CCDS44 N >>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa) initn: 767 init1: 400 opt: 777 Z-score: 984.0 bits: 190.9 E(32554): 1.7e-48 Smith-Waterman score: 777; 34.0% identity (68.4% similar) in 374 aa overlap (41-410:5-377) 20 30 40 50 60 70 pF1KE6 ARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREMAPNMAEWDQK ..:.::::: .: :: .:. : ::.:. CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 ELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTAYISIHNMCA .:: ..:.: .::. ...: . :: ::. .:. .: : :: :::.. . : ... CCDS65 GEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLGQ 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 WMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGDHYILNGSKA : ::..:..:. . . .::.::::.:::.:.. :.:.:.::.::.::.: CCDS65 MPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKM 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 pF1KE6 FISGAGESDIYVVMCRTGG--LGP--KGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAV .:...:... : .. :. .: :... ..:: :::...:.:: ..: . ::.. CCDS65 WITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGI 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 IFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDHLNVRKQFG .::: :: : . ..: :: .:. ... : .:. ..: :. .. . . :: :: CCDS65 VFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFG 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 EPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFATDECFAIC . :. .: ..: ::.:: .. ::. . :: .. :... :.:: :: : . CCDS65 KLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTY-YASIAKAFAGDIANQLA 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KE6 NQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE ..:.:. :: :. .: :.. .::....:: ::.....:....: CCDS65 TDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN 340 350 360 370 380 >>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 582 init1: 303 opt: 753 Z-score: 952.8 bits: 185.3 E(32554): 9.4e-47 Smith-Waterman score: 753; 36.0% identity (65.6% similar) in 381 aa overlap (37-415:53-431) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 RRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREMAPNMAE : . ...:. ... . :: ...:: .. CCDS76 LSSWKIPPHVSKSSQSEALLNITNNGIHFAPLQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVST 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 WDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTAYISIH :.. . .:.. : :. :. .. . ::.: : :.: ...: :: .:.... :. CCDS76 MDENSKMEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVDASVAVFCEIQ 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 N-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGDHYIL : . .: . :.:::. . : : : :: .:.::.: :.:::. .: : : :.::.:.: CCDS76 NTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQL-TTEKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVL 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGG-LGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNSQPTR :::: .::.: .. ...:: . .: :::. ..:.. :::: .:: :.:.: .. : CCDS76 NGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTC 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 AVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDHLNVRKQ . ::. :: :: .:. :.:. :. .:: :::.::. :: :.. : ... : : CCDS76 PLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQ 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 FGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFATDECFA ::. : . : :: .: .::.: ::::.. ::: : : : . :::: .:.. CCDS76 FGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAA-RLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQ 330 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 pF1KE6 ICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE .. .. :: :: ::: :..: ::... : ::..... :.. . : CCDS76 TTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY 390 400 410 420 430 >>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa) initn: 720 init1: 310 opt: 743 Z-score: 940.2 bits: 183.0 E(32554): 4.7e-46 Smith-Waterman score: 743; 33.2% identity (66.6% similar) in 395 aa overlap (25-412:30-421) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDF : .: :: : ::.:::...... : CCDS10 MAEMATATRLLGWRVASWRLRPPLAGFVSQRAH-SLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 AAREMAPNMAEWDQKELFPV--DVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEAL- ...::. : :... : . .. ..:: :. .. :::::. :. ...: . CCDS10 LQEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEIS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 -ATGCTSTTAYISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAAS :.: .. . : . :.: .. ::: :..:. : : . : ... ..::..:::..: CCDS10 RASGAVGLS-YGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 LLTSAKKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGLG-P--KGISCIVVEKGTPGLS . .:.:.:.::::::.: .:... ..:. .:. .: . : .::. ..:::: ::.: CCDS10 MKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 FGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAA .:: :.: .. : .::::: .:.:: .: :..: . . ::. :. .:. :: CCDS10 TSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLM 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 HASVILTRDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAV .: . : .:.::. ::. .. : .: .::: :::.: : .: :.: : .: . : CCDS10 QAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTA- 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 ALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILI :. . :.... . ...: :: ::..:. . ...::.....: :..:: :..: CCDS10 KDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVI 360 370 380 390 400 410 410 pF1KE6 SRSLLQE .:.. CCDS10 GRAFNADFH 420 >>CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (408 aa) initn: 764 init1: 326 opt: 709 Z-score: 897.5 bits: 175.0 E(32554): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 709; 34.4% identity (64.6% similar) in 401 aa overlap (21-414:15-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM :.: . :.: . : :. : : .. . .. ::: .:. CCDS76 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHT-IYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKEL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT : :. :...:::. ..: . ::. .. . ..::.::. : .. .: .. ::.:: CCDS76 FPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQ . .:..: . : .::..::.. . :. . .:.. . :.::: ::: . CCDS76 VIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGP-----SLLGPT--- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GDHYILN--GSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGLGPK----GISCIVVEKGTPGLSFGKKE : . :. : :.: :. . : :. ::: ..: ::::..:::: CCDS76 GPIFALGQVGCPCPSSAATEACTFP-RSRQRVSRPELLREGISAFLVPMPTPGLTLGKKE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVI :.: .. : .::::: .: . .: :.:: ::.. :. :::.::: .:: :.... CCDS76 DKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALD 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LTRDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSM . .. . : :: ::.. : .:: ::::: : .:::.. ::. :....: . .: CCDS76 CAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAM-LKDNKKPFIKEAAM 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 AKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLL ::: :.. :: .::.:. ::.::. .. .... ::.:. .: ::..:..:..:. :: CCDS76 AKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLL 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 QE . CCDS76 RSYRS >>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa) initn: 483 init1: 303 opt: 705 Z-score: 893.9 bits: 174.0 E(32554): 1.8e-43 Smith-Waterman score: 705; 38.5% identity (66.4% similar) in 330 aa overlap (88-415:2-329) 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 REMAPNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCT :. .. . ::.: : :.: ...: :: . CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVDA 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 STTAYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSA :.... :.: . .: . :.:::. . : : : :: .:.::.: :.:::. .: : : CCDS81 SVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQL-TTEKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRA 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 KKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGG-LGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKK :.::.:.::::: .::.: .. ...:: . .: :::. ..:.. :::: .:: :.: CCDS81 DKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPENK 100 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 VGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILT .: .. : . ::. :: :: .:. :.:. :. .:: :::.::. :: :.. : CCDS81 LGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYT 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAK ... : :::. : . : :: .: .::.: ::::.. ::: : : : . :::: CCDS81 IPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAA-RLLEAGKPFIKEASMAK 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 LFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE .:.. .. .. :: :: ::: :..: ::... : ::..... :.. . : CCDS81 YYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAE 270 280 290 300 310 320 CCDS81 Y 330 >>CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 (430 aa) initn: 661 init1: 291 opt: 684 Z-score: 865.4 bits: 169.2 E(32554): 7e-42 Smith-Waterman score: 684; 32.2% identity (64.5% similar) in 400 aa overlap (18-413:31-427) 10 20 30 40 pF1KE6 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKE :: . : . ..::. : .. :. CCDS23 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTD-IGIRRIFSPEHDI 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 FQKVAFDFAAREMAPNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSV :.: . : .:. :. .::.. .: .::.. :. :: : .:: : . .... CCDS23 FRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAI 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IFEALATGCTSTTAYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSG ..: : . : .. :::. . .: . :.::: ..: : . . . ... .::::.: CCDS23 VWEEQAYSNCSGPGF-SIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 SDAASLLTSAKKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGLGPK---GISCIVVEKG :: .. :.:::.:. .::::::.:::... ::. .:. :. .:. ::: ..::.: CCDS23 SDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 TPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASC :. :.: .:.: ..: : ..::: .:.. .: :..:: .. : :. ::. CCDS23 MKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 SLGAAHASVILTRDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEE ...:.. ::.... :: ::. .: : .: ::.. :.. ..: .: : . . CCDS23 AISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAK 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 RKDAVALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEV : :... : ::: .:.. .. . .:.:::.::. .: . . :.::. : :.::. CCDS23 RLDSATAC-MAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEI 360 370 380 390 400 410 410 pF1KE6 MRILISRSLLQE :. ::.: .. CCDS23 MKELIAREIVFDK 420 430 415 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:00:18 2016 done: Tue Nov 8 12:00:18 2016 Total Scan time: 2.140 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]