Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3769
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3769, 639 aa
1>>>pF1KB3769 639 - 639 aa - 639 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7750+/-0.000431; mu= 13.5633+/- 0.027
mean_var=130.9884+/-25.656, 0's: 0 Z-trim(114.0): 34 B-trim: 40 in 1/52
Lambda= 0.112062
statistics sampled from 23536 (23570) to 23536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 7.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa ( 639) 4119 678.0 2.8e-194
XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock ( 646) 3590 592.5 1.6e-168
NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 646) 3590 592.5 1.6e-168
NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3509 579.4 1.4e-164
NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3509 579.4 1.4e-164
NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3444 568.9 2e-161
NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein ( 643) 3341 552.2 2.1e-156
NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 493) 2739 454.8 3.3e-127
NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated ( 654) 2596 431.8 3.8e-120
NP_004125 (OMIM: 182170,600548,616854) stress-70 p ( 679) 1923 323.0 2.2e-87
NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein ( 509) 1094 188.8 3.9e-47
NP_002145 (OMIM: 601113) heat shock 70 kDa protein ( 840) 944 164.8 1.1e-39
XP_016875852 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 807) 899 157.5 1.7e-37
NP_001273432 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 814) 899 157.5 1.7e-37
XP_016875850 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 851) 897 157.2 2.2e-37
NP_006635 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 kD ( 858) 897 157.2 2.3e-37
XP_016875851 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 809) 815 143.9 2.1e-33
XP_005266293 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 816) 815 143.9 2.1e-33
XP_011533189 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 853) 813 143.6 2.8e-33
NP_001273433 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 860) 813 143.6 2.8e-33
NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein ( 471) 709 126.6 2e-28
XP_016875853 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 736) 468 87.8 1.5e-16
XP_011533190 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 780) 442 83.6 2.9e-15
NP_001273434 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 782) 442 83.6 2.9e-15
XP_016872585 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 390 75.3 1.2e-12
NP_001124463 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated p ( 999) 390 75.3 1.2e-12
XP_016872586 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 390 75.3 1.2e-12
NP_006380 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated prot ( 999) 390 75.3 1.2e-12
XP_005271449 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 390 75.3 1.2e-12
XP_005271450 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 390 75.3 1.2e-12
XP_005271451 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 390 75.3 1.2e-12
XP_016872584 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 390 75.3 1.2e-12
NP_001265134 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa prot ( 143) 234 49.4 1.1e-05
XP_016864924 (OMIM: 609963) PREDICTED: chondroitin ( 449) 221 47.7 0.00011
>>NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa pro (639 aa)
initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119 Z-score: 3608.9 bits: 678.0 E(85289): 2.8e-194
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
610 620 630
>>XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock cogn (646 aa)
initn: 3686 init1: 2468 opt: 3590 Z-score: 3146.6 bits: 592.5 E(85289): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 3624; 86.6% identity (95.8% similar) in 647 aa overlap (3-639:2-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
XP_011 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_011 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::: .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:. ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_011 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
XP_011 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
:::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_011 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::.::: .::.:.
XP_011 FDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
.::.::::..:.: :::::::.:::...::.::::::.:.:::::.:: :::.:.::.::
XP_011 SKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQ--GG-PGGGSGG---GGS----GASGGPTIEEVD
:::.::::::.:::: :: ::: :: ::. :::.::::::::
XP_011 ELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (646 aa)
initn: 3686 init1: 2468 opt: 3590 Z-score: 3146.6 bits: 592.5 E(85289): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 3624; 86.6% identity (95.8% similar) in 647 aa overlap (3-639:2-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
NP_006 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_006 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::: .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:. ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_006 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
NP_006 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_006 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
:::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_006 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::.::: .::.:.
NP_006 FDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
.::.::::..:.: :::::::.:::...::.::::::.:.:::::.:: :::.:.::.::
NP_006 SKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQ--GG-PGGGSGG---GGS----GASGGPTIEEVD
:::.::::::.:::: :: ::: :: ::. :::.::::::::
NP_006 ELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein 1B (641 aa)
initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509 Z-score: 3075.9 bits: 579.4 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
:.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
NP_005 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
NP_005 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
:::::::. : ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
NP_005 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
NP_005 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
NP_005 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
NP_005 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
NP_005 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
NP_005 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
NP_005 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
:::.::::::: :::: :::: .. : .:.:: ::::::::
NP_005 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein 1A (641 aa)
initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509 Z-score: 3075.9 bits: 579.4 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
:.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
NP_005 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
NP_005 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
:::::::. : ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
NP_005 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
NP_005 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
NP_005 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
NP_005 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
NP_005 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
NP_005 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
NP_005 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
:::.::::::: :::: :::: .. : .:.:: ::::::::
NP_005 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein 1-l (641 aa)
initn: 3398 init1: 2358 opt: 3444 Z-score: 3019.1 bits: 568.9 E(85289): 2e-161
Smith-Waterman score: 3444; 82.1% identity (94.7% similar) in 641 aa overlap (2-639:3-641)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
::::: ::.:::::::::::.: .::.::: :::.:..::::::: : ::::.:.:.:::
NP_005 VAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
::::::::.:: :::.:: : .:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
NP_005 ISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNR
::::::::: : ::..::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
NP_005 AAIAYGLDKGG--QGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
.:::..:::::::::::. :::::::::::::::::::::::::..::::::::.:::::
NP_005 LVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
::::::::: :::::::::::::::::::.::..:..::::::::::::.:.::::.:::
NP_005 ITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
..::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.:::::.:::::::: ::::
NP_005 RDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
:.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_005 NSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGVPQIEV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.::: .::.::.:::..:...
NP_005 TFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDKGRLSKEEIERMVLDAEKYKAEDEVQREKI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
:::::::::..:.:..: :: :.:::::.:::::::::.:...::. ::.:::::..::.
NP_005 AAKNALESYAFNMKSVVSDEGLKGKISESDKNKILDKCNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGG---PGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
::::..:::::.:::::: :. :.: . . ::::::::
NP_005 KELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGYVPGRPATGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein 6 [ (643 aa)
initn: 3329 init1: 2246 opt: 3341 Z-score: 2929.1 bits: 552.2 E(85289): 2.1e-156
Smith-Waterman score: 3341; 78.7% identity (94.2% similar) in 639 aa overlap (7-639:8-643)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
:.:::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::.:::::.:
NP_002 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
.:.:: ::.::::::::::: :.::::::::::::::::::::::.: :.:: :::.:::
NP_002 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
::::::.:::: :::::: :. :::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
NP_002 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNR
::::::::..: .::.:::::::::::::::.:.:. :.::::.:::::::::::::::
NP_002 AAIAYGLDRRG--AGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
.:.:. :::.::: ::.. ::::.::::::::::::::::::::..:::::.::::::::
NP_002 LVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
::::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::
NP_002 ITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
::::::::::::::::::::::.:.::: :.:::::::::.:::::.:::::::: ::.:
NP_002 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
:.::::::::::::::::: .:..:::::::::::::::::.:.:.::::::::::::::
NP_002 NATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
::::::::::.:::.:.:::: ::::::::::::::....:::.:::.::.::::.::::
NP_002 TFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEEVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
::::.::......: ....:.:: :: :.:. :. :::.::. ::..::.:::.::::..
NP_002 AAKNSLEAHVFHVKGSLQEESLRDKIPEEDRRKMQDKCREVLAWLEHNQLAEKEEYEHQK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGGPG--GGSGGGGSGASG----GPTIEEVD
.:::..: ::.:.:: :::: :::. : .. .: :: :::::
NP_002 RELEQICRPIFSRLY-GGPGVPGGSSCGTQARQGDPSTGPIIEEVD
600 610 620 630 640
>>NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (493 aa)
initn: 2833 init1: 1615 opt: 2739 Z-score: 2404.7 bits: 454.8 E(85289): 3.3e-127
Smith-Waterman score: 2739; 89.7% identity (96.6% similar) in 474 aa overlap (3-475:2-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
NP_694 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_694 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::: .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:. ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_694 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
NP_694 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_694 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPA-PRGVPQIEV
:::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::.: . : : :
NP_694 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGMPGGMPGGFPGGGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
NP_694 PPSGGASSGPTIEEVD
480 490
>>NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated prot (654 aa)
initn: 2201 init1: 844 opt: 2596 Z-score: 2278.0 bits: 431.8 E(85289): 3.8e-120
Smith-Waterman score: 2596; 64.7% identity (86.1% similar) in 618 aa overlap (5-618:28-640)
10 20 30
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
: ..::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_005 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVV
:::::::: . :::::::::::.. :: ::.::::::::: ..: .::.:.: ::.::
NP_005 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SEGGKPKVQVEYKG-ETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQ
. :: .::. : .:::: :::::.:::::::: :::::: :: ::.::::::::.:
NP_005 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 RQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTI
::::::::::.::::.:::::::::::::::::. ::::.:.:::::::::::.:::
NP_005 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKRE---GEKNILVFDLGGGTFDVSLLTI
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 EDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKR
..:.::: .: :::::::::::.:.. :. . .:.: ::. ..:::..:: :.:::
NP_005 DNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 TLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQ
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NP_005 ALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDID
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]