Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3769
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3769, 639 aa
1>>>pF1KB3769 639 - 639 aa - 639 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1345+/-0.00107; mu= 11.5696+/- 0.065
mean_var=123.5534+/-25.011, 0's: 0 Z-trim(106.9): 27 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.115384
statistics sampled from 9246 (9269) to 9246 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 4119 697.4 1.6e-200
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 3590 609.3 5.1e-174
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 3509 595.8 5.9e-170
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 3509 595.8 5.9e-170
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 3444 585.0 1.1e-166
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 3341 567.8 1.5e-161
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 2739 467.6 1.8e-131
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 2596 443.8 3.4e-124
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 1923 331.8 1.8e-90
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 1094 193.7 5e-49
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 944 168.9 2.5e-41
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 814) 899 161.4 4.4e-39
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 858) 897 161.1 5.8e-39
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 885 159.1 2.3e-38
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 860) 813 147.1 9.4e-35
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 796 144.3 6.4e-34
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 ( 471) 709 129.6 9.3e-30
CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 782) 442 85.3 3.4e-16
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 390 76.7 1.7e-13
>>CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 (639 aa)
initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119 Z-score: 3713.6 bits: 697.4 E(32554): 1.6e-200
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
610 620 630
>>CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 (646 aa)
initn: 3686 init1: 2468 opt: 3590 Z-score: 3237.6 bits: 609.3 E(32554): 5.1e-174
Smith-Waterman score: 3624; 86.6% identity (95.8% similar) in 647 aa overlap (3-639:2-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
CCDS84 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS84 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::: .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:. ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS84 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS84 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
:::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS84 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::.::: .::.:.
CCDS84 FDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
.::.::::..:.: :::::::.:::...::.::::::.:.:::::.:: :::.:.::.::
CCDS84 SKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQ--GG-PGGGSGG---GGS----GASGGPTIEEVD
:::.::::::.:::: :: ::: :: ::. :::.::::::::
CCDS84 ELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509 Z-score: 3164.8 bits: 595.8 E(32554): 5.9e-170
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
:.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
CCDS34 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
CCDS34 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
:::::::. : ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
CCDS34 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
CCDS34 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
CCDS34 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
CCDS34 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
CCDS34 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
CCDS34 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
CCDS34 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
:::.::::::: :::: :::: .. : .:.:: ::::::::
CCDS34 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509 Z-score: 3164.8 bits: 595.8 E(32554): 5.9e-170
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
:.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
CCDS34 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
CCDS34 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
:::::::. : ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
CCDS34 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
CCDS34 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
CCDS34 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
CCDS34 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
CCDS34 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
:::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
CCDS34 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
CCDS34 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
:::.::::::: :::: :::: .. : .:.:: ::::::::
CCDS34 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 3398 init1: 2358 opt: 3444 Z-score: 3106.3 bits: 585.0 E(32554): 1.1e-166
Smith-Waterman score: 3444; 82.1% identity (94.7% similar) in 641 aa overlap (2-639:3-641)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
::::: ::.:::::::::::.: .::.::: :::.:..::::::: : ::::.:.:.:::
CCDS34 VAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
::::::::.:: :::.:: : .:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS34 ISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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::::::::: : ::..::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS34 AAIAYGLDKGG--QGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
.:::..:::::::::::. :::::::::::::::::::::::::..::::::::.:::::
CCDS34 LVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
::::::::: :::::::::::::::::::.::..:..::::::::::::.:.::::.:::
CCDS34 ITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
..::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.:::::.:::::::: ::::
CCDS34 RDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
:.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS34 NSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGVPQIEV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.::: .::.::.:::..:...
CCDS34 TFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDKGRLSKEEIERMVLDAEKYKAEDEVQREKI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
:::::::::..:.:..: :: :.:::::.:::::::::.:...::. ::.:::::..::.
CCDS34 AAKNALESYAFNMKSVVSDEGLKGKISESDKNKILDKCNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGG---PGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
::::..:::::.:::::: :. :.: . . ::::::::
CCDS34 KELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGYVPGRPATGPTIEEVD
600 610 620 630 640
>>CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 (643 aa)
initn: 3329 init1: 2246 opt: 3341 Z-score: 3013.6 bits: 567.8 E(32554): 1.5e-161
Smith-Waterman score: 3341; 78.7% identity (94.2% similar) in 639 aa overlap (7-639:8-643)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
:.:::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS12 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
.:.:: ::.::::::::::: :.::::::::::::::::::::::.: :.:: :::.:::
CCDS12 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE
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120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
::::::.:::: :::::: :. :::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS12 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNR
::::::::..: .::.:::::::::::::::.:.:. :.::::.:::::::::::::::
CCDS12 AAIAYGLDRRG--AGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
.:.:. :::.::: ::.. ::::.::::::::::::::::::::..:::::.::::::::
CCDS12 LVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
::::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::
CCDS12 ITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
::::::::::::::::::::::.:.::: :.:::::::::.:::::.:::::::: ::.:
CCDS12 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
:.::::::::::::::::: .:..:::::::::::::::::.:.:.::::::::::::::
CCDS12 NATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
::::::::::.:::.:.:::: ::::::::::::::....:::.:::.::.::::.::::
CCDS12 TFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEEVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
::::.::......: ....:.:: :: :.:. :. :::.::. ::..::.:::.::::..
CCDS12 AAKNSLEAHVFHVKGSLQEESLRDKIPEEDRRKMQDKCREVLAWLEHNQLAEKEEYEHQK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGGPG--GGSGGGGSGASG----GPTIEEVD
.:::..: ::.:.:: :::: :::. : .. .: :: :::::
CCDS12 RELEQICRPIFSRLY-GGPGVPGGSSCGTQARQGDPSTGPIIEEVD
600 610 620 630 640
>>CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 (493 aa)
initn: 2833 init1: 1615 opt: 2739 Z-score: 2473.7 bits: 467.6 E(32554): 1.8e-131
Smith-Waterman score: 2739; 89.7% identity (96.6% similar) in 474 aa overlap (3-475:2-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
:::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
CCDS44 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
::::::::::::::::: : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS44 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
::::::::: .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
:.:. ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS44 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
:::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS44 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPA-PRGVPQIEV
:::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::.: . : : :
CCDS44 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGMPGGMPGGFPGGGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
CCDS44 PPSGGASSGPTIEEVD
480 490
>>CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 (654 aa)
initn: 2201 init1: 844 opt: 2596 Z-score: 2343.3 bits: 443.8 E(32554): 3.4e-124
Smith-Waterman score: 2596; 64.7% identity (86.1% similar) in 618 aa overlap (5-618:28-640)
10 20 30
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
: ..::::::::::::::..:.:::::::::::
CCDS68 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVV
:::::::: . :::::::::::.. :: ::.::::::::: ..: .::.:.: ::.::
CCDS68 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SEGGKPKVQVEYKG-ETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQ
. :: .::. : .:::: :::::.:::::::: :::::: :: ::.::::::::.:
CCDS68 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 RQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTI
::::::::::.::::.:::::::::::::::::. ::::.:.:::::::::::.:::
CCDS68 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKRE---GEKNILVFDLGGGTFDVSLLTI
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 EDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKR
..:.::: .: :::::::::::.:.. :. . .:.: ::. ..:::..:: :.:::
CCDS68 DNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 TLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQ
.:::. :: :::.:.::: :: ..:::.::::: ::::.:..::.:.:.:. : :..:.
CCDS68 ALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDID
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 EIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLL
:::::::::::::::.:...:::::: ...:::::::::::::::..: ::. .. ::.
CCDS68 EIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKD
:::: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: :::: .: ..:::::: .:::
CCDS68 LLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKD
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 NNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSK
:.::: ::::::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::..::::::::..::.
CCDS68 NHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 DDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNALESYTYNIKQTVED-EKLRGKISEQDKNKIL
..:.:::..::.. ::. ..:. ..: ::::.:..:. . : ::: ::.: .::. .
CCDS68 EEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETME
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 DKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLY-QGGPGGGSGGGGSGASGGP
.: :.::. .: :. .... :.::::.. .::::::: ..::
CCDS68 KAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 TIEEVD
>>CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 (679 aa)
initn: 1238 init1: 540 opt: 1923 Z-score: 1737.6 bits: 331.8 E(32554): 1.8e-90
Smith-Waterman score: 1923; 49.3% identity (76.8% similar) in 641 aa overlap (4-637:52-677)
10 20 30
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIAND
.: ..::::::: :::.:.. ..... :
CCDS42 TAARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 QGNRTTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWP
.: ::::: :::: : :::.: :: :.. ::.::.. .::::::...: ::.:.:. :
CCDS42 EGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVP
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 FRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFN
:..: .... . :: .: : . : .:...:: :::: :: ::: ...::::::::::
CCDS42 FKIV-RASNGDAWVEAHG--KLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFN
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 DSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSI
::::::::::: :.::::::.::::::::.::::::. .: . ..::::::::.::
CCDS42 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSE----DKVIAVYDLGGGTFDISI
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACER
: :. :.:::::: ::: :::::::. .. :...::::. :. .. :..:.: : :.
CCDS42 LEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEK
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KB3 AKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVD----FYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAK
:: ::::.:..:.. : . . ..:::.:: . .::.: :. : .::..::.
CCDS42 AKCELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAE
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 LDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKS
..:..: :..:::: ::.::.:. .::.: :. .:..::::::: :::.:...: ::
CCDS42 VSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLF-GRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD--
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 ENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEG
: :.:::::::::::::: :::.: ::.::::::::..:.:.: .:.:..: ..: .:
CCDS42 --VTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQG
440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 ERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITN
:: :. ::.:::.: : :::::::::::::::::::::::..:.: ::.::.:..:.: .
CCDS42 EREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIVIQS
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 DKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQ
. : ::::::. ::..::.: ::. ...:: : : :. .. . .:. .. .. .
CCDS42 SGG-LSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKKERVEAVNMAEGIIHDTETKMEE--FKDQLPAD
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 DKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLYQ--GGPGGGSGGGG
. ::. .. ... . : :.. .. .. . :... .. :. .. :::..:
CCDS42 ECNKLKEEISKMRELLARKDSETGENIRQAASSLQQASLKLFEMAYKKMASEREGSGSSG
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