Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2363, 517 aa
1>>>pF1KE2363 517 - 517 aa - 517 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4590+/-0.000418; mu= 17.2172+/- 0.026
mean_var=61.4770+/-12.789, 0's: 0 Z-trim(110.9): 72 B-trim: 238 in 1/50
Lambda= 0.163575
statistics sampled from 19267 (19340) to 19267 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 7.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, ( 517) 3451 823.3 0
XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde de ( 517) 3451 823.3 0
NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydroge ( 517) 2560 613.0 6.6e-175
NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 518) 2349 563.2 6.5e-160
NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase ( 497) 2307 553.3 6e-157
NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [ ( 501) 2245 538.7 1.5e-152
NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydroge ( 512) 2190 525.7 1.3e-148
NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 422) 2058 494.5 2.5e-139
NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydr ( 470) 2048 492.2 1.4e-138
XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1543 373.1 1.7e-102
XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1543 373.1 1.7e-102
NP_001029345 (OMIM: 613584) mitochondrial 10-formy ( 923) 1543 373.1 2e-102
NP_001257294 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 801) 1533 370.7 8.9e-102
XP_011510657 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1533 370.7 9.9e-102
XP_006713544 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1533 370.7 9.9e-102
NP_036322 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltetrah ( 902) 1533 370.7 9.9e-102
NP_001257293 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 912) 1533 370.7 1e-101
NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydr ( 405) 1307 317.3 5.5e-86
NP_000687 (OMIM: 602733) 4-trimethylaminobutyralde ( 518) 1236 300.6 7.5e-81
NP_733797 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 480) 1180 287.3 6.7e-77
XP_011507596 (OMIM: 602733) PREDICTED: 4-trimethyl ( 424) 1163 283.3 9.7e-76
XP_016861103 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 828) 1155 281.5 6.5e-75
XP_016861102 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 838) 1155 281.5 6.6e-75
NP_072090 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 487) 1117 272.5 2e-72
NP_001071 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 535) 910 223.6 1.1e-57
NP_005580 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate-sem ( 535) 753 186.6 1.6e-46
NP_001188306 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadip ( 511) 750 185.9 2.5e-46
NP_001173 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadipic ( 539) 750 185.9 2.6e-46
NP_001180409 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase ( 437) 726 180.2 1.1e-44
NP_001265522 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 522) 643 160.6 1e-38
XP_011541719 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 636 158.9 2.5e-38
XP_016864982 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 636 158.9 2.5e-38
NP_739577 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 433) 611 153.1 1.6e-36
XP_016876820 (OMIM: 603178,614105) PREDICTED: meth ( 381) 610 152.8 1.7e-36
NP_001265523 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 381) 610 152.8 1.7e-36
NP_733936 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 548) 580 145.8 3.2e-34
XP_011536290 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 622) 557 140.4 1.5e-32
XP_011524743 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 511 129.5 3.4e-29
XP_011524744 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 511 129.5 3.4e-29
NP_699160 (OMIM: 613358) aldehyde dehydrogenase fa ( 802) 511 129.5 3.6e-29
NP_733844 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563) 489 124.3 9.5e-28
NP_003739 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563) 489 124.3 9.5e-28
NP_001154976 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroli ( 503) 485 123.3 1.6e-27
XP_016879845 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 472 120.3 1.3e-26
NP_000373 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde deh ( 485) 472 120.3 1.3e-26
XP_016879846 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 472 120.3 1.3e-26
XP_011522035 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 472 120.3 1.4e-26
XP_011522034 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 472 120.3 1.4e-26
NP_001026976 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde ( 508) 472 120.3 1.4e-26
XP_005256579 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570) 447 114.4 9.2e-25
>>NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, mit (517 aa)
initn: 3451 init1: 3451 opt: 3451 Z-score: 4397.5 bits: 823.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3451; 99.6% identity (99.8% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_000 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
490 500 510
>>XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde dehydr (517 aa)
initn: 3451 init1: 3451 opt: 3451 Z-score: 4397.5 bits: 823.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3451; 99.6% identity (99.8% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
XP_011 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
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pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
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pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
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pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
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430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
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490 500 510
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
490 500 510
>>NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogenase (517 aa)
initn: 2556 init1: 2556 opt: 2560 Z-score: 3261.1 bits: 613.0 E(85289): 6.6e-175
Smith-Waterman score: 2560; 73.4% identity (89.0% similar) in 518 aa overlap (3-517:7-517)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
:: .::: :: : :::: .:.: .:.. ::.::::::.::::.::
NP_000 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
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pF1KE2 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVE
::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::: ::::.:
NP_000 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
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pF1KE2 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
:::.:::.:::::::::. :: .::: :.: ::.::::::.::::::.::. : .:::
NP_000 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
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pF1KE2 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
NP_000 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
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pF1KE2 VVNIITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
NP_000 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
NP_000 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
:.::::::. ::...::::. :..::::::::: ..::.::.::::: ::: : ::
NP_000 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
NP_000 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE2 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
.. ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
NP_000 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
480 490 500 510
>>NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (518 aa)
initn: 2347 init1: 2347 opt: 2349 Z-score: 2992.0 bits: 563.2 E(85289): 6.5e-160
Smith-Waterman score: 2349; 66.5% identity (88.4% similar) in 501 aa overlap (17-517:18-518)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNP
: ..: :::: : .: :...:::::::.. : ..::. ::
NP_003 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYL
.::: . .: :.:.::.:.::.::: :: ::: :::::::::::::. :::::::::. :
NP_003 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVC
:..:.:..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.:::
NP_003 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIIT
::::::::::.: .::.:::: :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::.
NP_003 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADAD
:::::::::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::
NP_003 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 MEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQG
...:::: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::. :.::
NP_003 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 PQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFG
::.::.:....: :: : ::::: :::. .:..::::.::::..: ::::::::::::
NP_003 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCH
::: ...:: ..::.:::::. .::.::::: :..::. ..:.::::::.: :: .. .
NP_003 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE2 TPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
.:::::: ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
NP_003 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
490 500 510
>>NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 is (497 aa)
initn: 2307 init1: 2307 opt: 2307 Z-score: 2938.7 bits: 553.3 E(85289): 6e-157
Smith-Waterman score: 2307; 66.8% identity (88.7% similar) in 488 aa overlap (30-517:10-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
:. : . .:::::::.. : ..::. ::.
NP_001 MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
::: . .: :.:.::.:.::.::: :: ::: :::::::::::::. :::::::::. ::
NP_001 TGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
..:.:..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.::::
NP_001 TMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
:::::::::.: .::.:::: :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::. :
NP_001 QIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
::::::::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::.
NP_001 YGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
..:::: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::. :.:::
NP_001 DYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
:.::.:....: :: : ::::: :::. .:..::::.::::..: :::::::::::::
NP_001 QIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
:: ...:: ..::.:::::. .::.::::: :..::. ..:.::::::.: :: .. ..
NP_001 VQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQS
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
:::::: ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
NP_001 PFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
470 480 490
>>NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [Homo (501 aa)
initn: 2242 init1: 2242 opt: 2245 Z-score: 2859.6 bits: 538.7 E(85289): 1.5e-152
Smith-Waterman score: 2245; 65.0% identity (87.2% similar) in 500 aa overlap (21-517:2-501)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPS-PILNPD--IPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTV
:... :. :.: : : :...::::::.:.:: : ::.
NP_000 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 NPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRV
::.: : . .: :::. :::.::::::.::..::::: :::::::::: ::::.::::.
NP_000 NPATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 YLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVG
::..:....:: ....: :: ::. :: :::::: .:.:::.::. : .:::::.:
NP_000 LLATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNI
:::::::::::::: ::..:::. :::::.: ::::::.::..::::::::::::::::
NP_000 VCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLAD
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NP_000 VPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLAD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQ
::...::: :...:...:::: :.:: :::::::.::..:.::.::. .:::. .
NP_000 ADLDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 QGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEI
::::.::::....: :. :.:::::: ::: .:..:.:..::::..: :.::::::::
NP_000 QGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 FGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
::::: ..:::....:..::::: :::.:.:::.:.:::. ...:::::::::: :..:.
NP_000 FGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KE2 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
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NP_000 AQCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
470 480 490 500
>>NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogenase (512 aa)
initn: 2190 init1: 2190 opt: 2190 Z-score: 2789.3 bits: 525.7 E(85289): 1.3e-148
Smith-Waterman score: 2190; 64.3% identity (86.0% similar) in 493 aa overlap (24-516:19-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
::: :: : .. ....::::::... : : : : ::.
NP_000 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
: : : .: :::. :::.::.::. ::. ::::::.:: :::::. :::::::::. ::
NP_000 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
.:::.:.:::: ... .::. :.. ::::::::: .::::: : . :::::::.::::
NP_000 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
: ::::::.: ::::::: :::.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::. :
NP_000 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
.:::.::::..: ...:.:::::::::.:...::. :::::::::::::.: :: ::::.
NP_000 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
. ::: :...:::.:::: :.::.::::..:.::..:.:: ::.: ::.::.. :.:::
NP_000 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
:.:..::...: :. :.:::::: ::: . ..:.:::::::. : :.:::::::::::
NP_000 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
:::..:::.::::..:::.: :::.:::::..::::. ...::..::::.: :: . ..
NP_000 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
:::::: ::::::::: .: ::::::::::. .::
NP_000 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
480 490 500 510
>>NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (422 aa)
initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058 Z-score: 2622.3 bits: 494.5 E(85289): 2.5e-139
Smith-Waterman score: 2058; 68.7% identity (90.3% similar) in 422 aa overlap (96-517:1-422)
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLASLETL
::::::::::. :::::::::. ::..:.:
NP_733 MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCGQIIPW
..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.:::::::::
NP_733 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITGYGPTA
::::.: .::.:::: :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::. ::::::
NP_733 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADMEHAVE
:::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::...:::
NP_733 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 QCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGPQVDKE
: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::. :.::::.::.
NP_733 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGPVQPLF
:....: :: : ::::: :::. .:..::::.::::..: ::::::::::::::: ..
NP_733 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHTPFGGF
.:: ..::.:::::. .::.::::: :..::. ..:.::::::.: :: .. ..:::::
NP_733 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
340 350 360 370 380 390
490 500 510
pF1KE2 KESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
: ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
NP_733 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
400 410 420
>>NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogen (470 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048 Z-score: 2608.8 bits: 492.2 E(85289): 1.4e-138
Smith-Waterman score: 2200; 66.0% identity (80.5% similar) in 518 aa overlap (3-517:7-470)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
:: .::: :: : :::: .:.: .:.. ::.::::::.::::.::
NP_001 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVE
::::::.::::: .:::::.:
NP_001 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKA---------------------------------------
60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
:::::::::. :: .::: :.: ::.::::::.::::::.::. : .:::
NP_001 --------LETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
NP_001 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VVNIITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
NP_001 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
NP_001 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
:.::::::. ::...::::. :..::::::::: ..::.::.::::: ::: : ::
NP_001 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
NP_001 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510
pF1KE2 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
.. ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
NP_001 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
430 440 450 460 470
>>XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondrial 1 (777 aa)
initn: 1521 init1: 891 opt: 1543 Z-score: 1961.2 bits: 373.1 E(85289): 1.7e-102
Smith-Waterman score: 1543; 49.0% identity (77.5% similar) in 484 aa overlap (34-511:295-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 FLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPTTGE
.:: : :::... :: . ::. :.::: :
XP_011 KVVRKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPY-QCFINGQFTDADDGKTYDTINPTDGS
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLASLE
.: .:. .. ::::.:: ::..::. : : ::.: :::::. ::::.:... ::..:
XP_011 TICKVSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLEENQEELATIE
330 340 350 360 370 380
130 140 150 160 170
pF1KE2 TLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMD----GQHFCFTRHEPVGVC
.::.: . . . ....:::::: :: .:.:::.. .... ::..::.:::
XP_011 ALDSGAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTFTKKEPLGVC
390 400 410 420 430 440
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