Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2363, 517 aa
  1>>>pF1KE2363 517 - 517 aa - 517 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7588+/-0.000987; mu= 15.2416+/- 0.059
 mean_var=64.6465+/-12.870, 0's: 0 Z-trim(104.4): 40  B-trim: 53 in 1/48
 Lambda= 0.159515
 statistics sampled from 7832 (7872) to 7832 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.242), width:  16
 Scan time:  2.180

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9          ( 517) 3451 803.3       0
CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12           ( 517) 2560 598.3  7e-171
CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 518) 2349 549.7 2.9e-156
CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 497) 2307 540.0 2.3e-153
CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9          ( 501) 2245 525.8 4.5e-149
CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15        ( 512) 2190 513.1  3e-145
CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 422) 2058 482.7 3.5e-136
CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12          ( 470) 2048 480.4 1.9e-135
CCDS31891.1 ALDH1L2 gene_id:160428|Hs108|chr12     ( 923) 1543 364.3 3.4e-100
CCDS58850.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3       ( 801) 1533 362.0 1.5e-99
CCDS3034.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3        ( 902) 1533 362.0 1.6e-99
CCDS58851.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3       ( 912) 1533 362.0 1.7e-99
CCDS76794.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15        ( 405) 1307 309.9 3.6e-84
CCDS1250.2 ALDH9A1 gene_id:223|Hs108|chr1          ( 518) 1236 293.6 3.7e-79
CCDS10164.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 480) 1180 280.7 2.6e-75
CCDS5171.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6        ( 487) 1117 266.2 6.1e-71
CCDS4555.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6         ( 535)  910 218.5 1.5e-56
CCDS9826.1 ALDH6A1 gene_id:4329|Hs108|chr14        ( 535)  753 182.4 1.1e-45
CCDS4137.2 ALDH7A1 gene_id:501|Hs108|chr5          ( 539)  750 181.7 1.8e-45
CCDS55057.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6       ( 437)  726 176.2 6.8e-44
CCDS61501.1 ALDH6A1 gene_id:4329|Hs108|chr14       ( 522)  643 157.1 4.5e-38
CCDS5172.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6        ( 433)  611 149.7 6.2e-36
CCDS4556.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6         ( 548)  580 142.6 1.1e-33
CCDS12766.1 ALDH16A1 gene_id:126133|Hs108|chr19    ( 802)  511 126.8 9.3e-29
CCDS188.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1          ( 563)  489 121.7 2.2e-27
CCDS53272.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1        ( 503)  485 120.7 3.8e-27
CCDS11210.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17        ( 485)  472 117.7   3e-26
CCDS32589.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17        ( 508)  472 117.7 3.1e-26
CCDS11212.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17        ( 453)  391 99.1 1.1e-20
CCDS82090.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17        ( 380)  354 90.6 3.5e-18
CCDS81273.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1        ( 512)  343 88.1 2.7e-17
CCDS31622.1 ALDH3B2 gene_id:222|Hs108|chr11        ( 385)  331 85.3 1.4e-16
CCDS73335.1 ALDH3B1 gene_id:221|Hs108|chr11        ( 468)  327 84.4 3.2e-16
CCDS73336.1 ALDH3B1 gene_id:221|Hs108|chr11        ( 431)  303 78.8 1.4e-14
CCDS46141.1 ALDH16A1 gene_id:126133|Hs108|chr19    ( 751)  273 72.0 2.7e-12


>>CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9               (517 aa)
 initn: 3451 init1: 3451 opt: 3451  Z-score: 4289.5  bits: 803.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3451; 99.6% identity (99.8% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS66 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
              490       500       510       

>>CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12                (517 aa)
 initn: 2556 init1: 2556 opt: 2560  Z-score: 3181.3  bits: 598.3 E(32554): 7e-171
Smith-Waterman score: 2560; 73.4% identity (89.0% similar) in 518 aa overlap (3-517:7-517)

                   10        20           30        40        50   
pF1KE2     MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
             :: .:::    ::  :  ::::   .:.:  .:..  ::.::::::.::::.::
CCDS91 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
                10              20        30        40        50   

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE2 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVE
       ::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::: ::::.:
CCDS91 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
            60        70        80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE2 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
       :::.:::.:::::::::.  :: .::: :.:  ::.::::::.::::::.::. : .:::
CCDS91 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
           120       130       140       150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE2 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
       ::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
CCDS91 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE2 VVNIITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
       ::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
CCDS91 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE2 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
       ...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
CCDS91 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE2 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
         :.::::::. ::...::::. :..:::::::::   ..::.::.::::: ::: : ::
CCDS91 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE2 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
       ::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
CCDS91 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
           420       430       440       450       460       470   

           480       490       500       510       
pF1KE2 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       ..   ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
CCDS91 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
           480       490       500       510       

>>CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (518 aa)
 initn: 2347 init1: 2347 opt: 2349  Z-score: 2918.9  bits: 549.7 E(32554): 2.9e-156
Smith-Waterman score: 2349; 66.5% identity (88.4% similar) in 501 aa overlap (17-517:18-518)

                10        20        30        40        50         
pF1KE2  MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNP
                        : ..:   ::::  : .: :...:::::::.. : ..::. ::
CCDS10 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE2 TTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYL
       .::: . .: :.:.::.:.::.::: :: ::: :::::::::::::. :::::::::. :
CCDS10 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE2 ASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVC
       :..:.:..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.:::
CCDS10 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE2 GQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIIT
       ::::::::::.: .::.::::  :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::. 
CCDS10 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE2 GYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADAD
       :::::::::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::
CCDS10 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 MEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQG
       ...:::: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::.  :.::
CCDS10 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE2 PQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFG
       ::.::.:....:  :: :  ::::: :::. .:..::::.::::..: ::::::::::::
CCDS10 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE2 PVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCH
       ::: ...:: ..::.:::::. .::.::::: :..::.  ..:.::::::.: :: .. .
CCDS10 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       
pF1KE2 TPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       .:::::: ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
CCDS10 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              490       500       510        

>>CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (497 aa)
 initn: 2307 init1: 2307 opt: 2307  Z-score: 2866.9  bits: 540.0 E(32554): 2.3e-153
Smith-Waterman score: 2307; 66.8% identity (88.7% similar) in 488 aa overlap (30-517:10-497)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
                                    :.  :  . .:::::::.. : ..::. ::.
CCDS55                     MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPA
                                   10        20        30        40

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
       ::: . .: :.:.::.:.::.::: :: ::: :::::::::::::. :::::::::. ::
CCDS55 TGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLA
               50        60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
       ..:.:..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.::::
CCDS55 TMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCG
              110       120       130       140       150       160

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
       :::::::::.: .::.::::  :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::. :
CCDS55 QIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPG
              170       180       190       200       210       220

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
       ::::::::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::.
CCDS55 YGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADL
              230       240       250       260       270       280

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
       ..:::: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::.  :.:::
CCDS55 DYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGP
              290       300       310       320       330       340

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
       :.::.:....:  :: :  ::::: :::. .:..::::.::::..: :::::::::::::
CCDS55 QIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGP
              350       360       370       380       390       400

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
       :: ...:: ..::.:::::. .::.::::: :..::.  ..:.::::::.: :: .. ..
CCDS55 VQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQS
              410       420       430       440       450       460

              490       500       510       
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       :::::: ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
CCDS55 PFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              470       480       490       

>>CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9               (501 aa)
 initn: 2242 init1: 2242 opt: 2245  Z-score: 2789.8  bits: 525.8 E(32554): 4.5e-149
Smith-Waterman score: 2245; 65.0% identity (87.2% similar) in 500 aa overlap (21-517:2-501)

               10        20         30          40        50       
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPS-PILNPD--IPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTV
                           :... :. :.:  :  : :...::::::.:.:: : ::. 
CCDS66                    MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVF
                                  10        20        30        40 

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 NPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRV
       ::.: : . .: :::. :::.::::::.::..::::: ::::::::::  ::::.::::.
CCDS66 NPATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRL
              50        60        70        80        90       100 

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 YLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVG
        ::..:....:: ....:  ::   ::. :: :::::: .:.:::.::. : .:::::.:
CCDS66 LLATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIG
             110       120       130       140       150       160 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 VCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNI
       ::::::::::::::  ::..:::. :::::.: ::::::.::..::::::::::::::::
CCDS66 VCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNI
             170       180       190       200       210       220 

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 ITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLAD
       . ::::::::::..:::.::::::::::::.::..::: ::::::::::::::: :::::
CCDS66 VPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLAD
             230       240       250       260       270       280 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 ADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQ
       ::...:::  :...:...:::: :.:: :::::::.::..:.::.::.  .:::.   . 
CCDS66 ADLDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVT
             290       300       310       320       330       340 

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 QGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEI
       ::::.::::....:  :. :.:::::: :::  .:..:.:..::::..: :.::::::::
CCDS66 QGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEI
             350       360       370       380       390       400 

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 FGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
       ::::: ..:::....:..::::: :::.:.:::.:.:::. ...:::::::::: :..:.
CCDS66 FGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVS
             410       420       430       440       450       460 

       480       490       500       510       
pF1KE2 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
        . :::::: ::::::::: :.. ::::::::.:. ::::
CCDS66 AQCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
             470       480       490       500 

>>CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15             (512 aa)
 initn: 2190 init1: 2190 opt: 2190  Z-score: 2721.2  bits: 513.1 E(32554): 3e-145
Smith-Waterman score: 2190; 64.3% identity (86.0% similar) in 493 aa overlap (24-516:19-511)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
                              ::: :: : .. ....::::::... : : : : ::.
CCDS10      MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLA
       : : : .: :::. :::.::.::. ::. ::::::.::  :::::. :::::::::. ::
CCDS10 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
       .:::.:.:::: ... .::.  :.. ::::::::: .::::: : .  :::::::.::::
CCDS10 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
        : ::::::.:  :::::::  :::.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::. :
CCDS10 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
       .:::.::::..: ...:.:::::::::.:...::. :::::::::::::.: :: ::::.
CCDS10 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
         240       250       260       270       280       290     

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
       . :::  :...:::.:::: :.::.::::..:.::..:.:: ::.: ::.::.. :.:::
CCDS10 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
       :.:..::...:  :. :.:::::: :::  . ..:.:::::::. : :.:::::::::::
CCDS10 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
         360       370       380       390       400       410     

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
       :::..:::.::::..:::.: :::.:::::..::::. ...::..::::.: :: .  ..
CCDS10 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
         420       430       440       450       460       470     

              490       500       510       
pF1KE2 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       :::::: ::::::::: .:  ::::::::::. .:: 
CCDS10 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
         480       490       500       510  

>>CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (422 aa)
 initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058  Z-score: 2558.4  bits: 482.7 E(32554): 3.5e-136
Smith-Waterman score: 2058; 68.7% identity (90.3% similar) in 422 aa overlap (96-517:1-422)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KE2 GHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLASLETL
                                     ::::::::::. :::::::::. ::..:.:
CCDS45                               MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
                                             10        20        30

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE2 DNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCGQIIPW
       ..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.:::::::::
CCDS45 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
               40        50        60        70        80        90

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE2 NFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITGYGPTA
       ::::.: .::.::::  :::::.: ::::::::::...:::::::::::.::. ::::::
CCDS45 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
              100       110       120       130       140       150

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE2 GAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADMEHAVE
       :::::.:. .::.:::::::::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::...:::
CCDS45 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
              160       170       180       190       200       210

         310       320       330       340       350       360     
pF1KE2 QCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGPQVDKE
       : :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::.  :.::::.::.
CCDS45 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
              220       230       240       250       260       270

         370       380       390       400       410       420     
pF1KE2 QFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGPVQPLF
       :....:  :: :  ::::: :::. .:..::::.::::..: ::::::::::::::: ..
CCDS45 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
              280       290       300       310       320       330

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 KFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHTPFGGF
       .:: ..::.:::::. .::.::::: :..::.  ..:.::::::.: :: .. ..:::::
CCDS45 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
              340       350       360       370       380       390

         490       500       510       
pF1KE2 KESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       : ::::::.:: ::. :.::::::.:.:::::
CCDS45 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              400       410       420  

>>CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12               (470 aa)
 initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048  Z-score: 2545.2  bits: 480.4 E(32554): 1.9e-135
Smith-Waterman score: 2200; 66.0% identity (80.5% similar) in 518 aa overlap (3-517:7-470)

                   10        20           30        40        50   
pF1KE2     MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
             :: .:::    ::  :  ::::   .:.:  .:..  ::.::::::.::::.::
CCDS55 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
                10              20        30        40        50   

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE2 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVE
       ::::::.::::: .:::::.:                                       
CCDS55 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKA---------------------------------------
            60        70                                           

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE2 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
               :::::::::.  :: .::: :.:  ::.::::::.::::::.::. : .:::
CCDS55 --------LETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
                   80        90       100       110       120      

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE2 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
       ::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
CCDS55 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
        130       140       150       160       170       180      

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE2 VVNIITGYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
       ::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
CCDS55 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
        190       200       210       220       230       240      

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE2 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
       ...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
CCDS55 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
        250       260       270       280       290       300      

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE2 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
         :.::::::. ::...::::. :..:::::::::   ..::.::.::::: ::: : ::
CCDS55 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
        310       320       330       340       350       360      

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE2 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
       ::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
CCDS55 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
        370       380       390       400       410       420      

           480       490       500       510       
pF1KE2 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
       ..   ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
CCDS55 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
        430       440       450       460       470

>>CCDS31891.1 ALDH1L2 gene_id:160428|Hs108|chr12          (923 aa)
 initn: 1521 init1: 891 opt: 1543  Z-score: 1912.3  bits: 364.3 E(32554): 3.4e-100
Smith-Waterman score: 1543; 49.0% identity (77.5% similar) in 484 aa overlap (34-511:441-922)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE2 FLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPTTGE
                                     .:: : :::... :: . ::. :.::: : 
CCDS31 KVVRKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPY-QCFINGQFTDADDGKTYDTINPTDGS
              420       430       440        450       460         

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE2 VIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLASLE
       .: .:. .. ::::.:: ::..::. :  : ::.: :::::.  ::::.:...  ::..:
CCDS31 TICKVSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLEENQEELATIE
     470       480       490        500       510       520        

           130       140       150       160           170         
pF1KE2 TLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMD----GQHFCFTRHEPVGVC
       .::.:  .  .    .   ....:::::: :: .:.:::..    .... ::..::.:::
CCDS31 ALDSGAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTFTKKEPLGVC
      530       540       550       560       570       580        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE2 GQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIIT
       . :::::.::.: .:: :  ::.:::.:.: :. :::.:: .: :  .:::: ::.::: 
CCDS31 AIIIPWNYPLMMLAWKSAACLAAGNTLVLKPAQVTPLTALKFAELSVKAGFPKGVINIIP
      590       600       610       620       630       640        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE2 GYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADAD
       : :  ::  ...: :. :..::::: .:. :.:. . ::::.:.:::::::: :.. : .
CCDS31 GSGGIAGQRLSEHPDIRKLGFTGSTPIGKQIMKSCAVSNLKKVSLELGGKSPLIIFNDCE
      650       660       670       680       690       700        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 MEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQG
       ...::..   :.::: :. : :..: ::::::..::. :.::. :. :.:.:.. .:..:
CCDS31 LDKAVRMGMGAVFFNKGENCIAAGRLFVEESIHDEFVTRVVEEIKKMKIGDPLDRSTDHG
      710       720       730       740       750       760        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE2 PQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFG
       ::  : ..:..: : . : :::: :. ::..  . :::..::::  :.: : .:::: ::
CCDS31 PQNHKAHLEKLLQYCETGVKEGATLVYGGRQVQRPGFFMEPTVFTDVEDYMYLAKEESFG
      770       780       790       800       810       820        

     420         430       440       450       460       470       
pF1KE2 PVQPLFKFKK--IEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
       :.. . ::..  :. :..:::.:.::::..:::::..:::: .. :.::::..:::: . 
CCDS31 PIMVISKFQNGDIDGVLQRANSTEYGLASGVFTRDINKAMYVSEKLEAGTVFINTYNKTD
      830       840       850       860       870       880        

       480       490       500       510       
pF1KE2 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
         .:::: :.:: :..:::..:. : ..::::..      
CCDS31 VAAPFGGVKQSGFGKDLGEEALNEYLKTKTVTLEY     
      890       900       910       920        

>>CCDS58850.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3            (801 aa)
 initn: 1525 init1: 911 opt: 1533  Z-score: 1900.9  bits: 362.0 E(32554): 1.5e-99
Smith-Waterman score: 1533; 49.6% identity (77.1% similar) in 484 aa overlap (34-511:319-800)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE2 FLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPTTGE
                                     .:. ::::..:. :: . ::  :.::: : 
CCDS58 LLVRKLRGDDEEGECSIDYVEMAVNKRTVRMPH-QLFIGGEFVDAEGAKTSETINPTDGS
      290       300       310       320        330       340       

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE2 VIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNLLADLVERDRVYLASLE
       :: .:. .. .:::.:: ::..::. :  : ...: .::::.  ::::.:. .  ::..:
CCDS58 VICQVSLAQVTDVDKAVAAAKDAFENGR-WGKISARDRGRLMYRLADLMEQHQEELATIE
       350       360       370        380       390       400      

           130       140       150       160           170         
pF1KE2 TLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMD----GQHFCFTRHEPVGVC
       .:: :  .  .    .   :...:::::: :: .:.:::..    .... .::.::::::
CCDS58 ALDAGAVYTLALKTHVGMSIQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTLTRKEPVGVC
        410       420       430       440       450       460      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE2 GQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIIT
       : :::::.::.: .:: :  ::.:::::.: :. :::.:: .: :  .::.: ::::.. 
CCDS58 GIIIPWNYPLMMLSWKTAACLAAGNTVVIKPAQVTPLTALKFAELTLKAGIPKGVVNVLP
        470       480       490       500       510       520      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE2 GYGPTAGAAIAQHMDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADAD
       : :  .:  ...: :: :..::::::::. :.:. . ::.:.:.:::::::: :..:: :
CCDS58 GSGSLVGQRLSDHPDVRKIGFTGSTEVGKHIMKSCAISNVKKVSLELGGKSPLIIFADCD
        530       540       550       560       570       580      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 MEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQG
       ...::..   ..::: :. : :..: :::.::..::..:.::.... :::::.. ::..:
CCDS58 LNKAVQMGMSSVFFNKGENCIAAGRLFVEDSIHDEFVRRVVEEVRKMKVGNPLDRDTDHG
        590       600       610       620       630       640      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE2 PQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFG
       ::  . .. ... : : : :::: :.:::..  . :::..::::  :.: : ::::: ::
CCDS58 PQNHHAHLVKLMEYCQHGVKEGATLVCGGNQVPRPGFFFEPTVFTDVEDHMFIAKEESFG
        650       660       670       680       690       700      

     420         430       440       450       460       470       
pF1KE2 PVQPLFKFKK--IEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
       ::. . .:    .. :. ::: :..:::..:::::..::.: .. ::::::.::::: . 
CCDS58 PVMIISRFADGDLDAVLSRANATEFGLASGVFTRDINKALYVSDKLQAGTVFVNTYNKTD
        710       720       730       740       750       760      

       480       490       500       510       
pF1KE2 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
         .::::::.:: :..::: .:. : .:::::..      
CCDS58 VAAPFGGFKQSGFGKDLGEAALNEYLRVKTVTFEY     
        770       780       790       800      




517 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 02:48:57 2016 done: Mon Nov  7 02:48:58 2016
 Total Scan time:  2.180 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com