FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4425, 440 aa 1>>>pF1KE4425 440 - 440 aa - 440 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7729+/-0.000788; mu= 14.4434+/- 0.047 mean_var=62.3197+/-12.533, 0's: 0 Z-trim(107.0): 43 B-trim: 91 in 1/51 Lambda= 0.162466 statistics sampled from 9263 (9305) to 9263 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 2.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 440) 2954 701.0 6.1e-202 CCDS62852.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 437) 2934 696.3 1.6e-200 CCDS62853.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 445) 2922 693.5 1.1e-199 CCDS62855.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 488) 2922 693.5 1.2e-199 CCDS62854.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 492) 2922 693.5 1.2e-199 CCDS5893.1 PDIA4 gene_id:9601|Hs108|chr7 ( 645) 332 86.4 8.9e-17 CCDS10101.1 PDIA3 gene_id:2923|Hs108|chr15 ( 505) 310 81.3 2.5e-15 CCDS32840.1 TMX3 gene_id:54495|Hs108|chr18 ( 454) 282 74.7 2.1e-13 CCDS3020.1 PDIA5 gene_id:10954|Hs108|chr3 ( 519) 281 74.5 2.9e-13 CCDS4505.1 TXNDC5 gene_id:81567|Hs108|chr6 ( 432) 259 69.3 8.6e-12 CCDS74613.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2 ( 747) 248 66.8 8.6e-11 CCDS33345.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2 ( 793) 248 66.8 9.1e-11 >>CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (440 aa) initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954 Z-score: 3738.9 bits: 701.0 E(32554): 6.1e-202 Smith-Waterman score: 2954; 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CCDS58 CGHCKQFAPEYEKIANILKDKDPPIPVAKIDATSASVLASRFDVSGYPTIKIL--KKGQA 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 EDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDV-IELTDDSF ::.:.:: : :: . .:.. .. : . .: . :: ..: CCDS58 VDYEGSRTQEEIV----AKVREV-----------------SQPDWTPPPEVTLVLTKENF 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLAS :. :... :. .::::::::::::.: ::. ::.:..... . :: ::::.. ::. CCDS58 DE-VVNDADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSKRSP-PIPLAKVDATAETDLAK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 RYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRT :. . :.::.:::.::. : ::.: : . ::. .. ... : :.: . CCDS58 RFDVSGYPTLKIFRKGR-PYDYNGPREKYGIVDYMIE--QSGPPSKEILTLKQVQEFLKD 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 CEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALG CCDS58 GDDVIIIGVFKGESDPAYQQYQDAANNLREDYKFHHTFSTEIAKFLKVSQGQLVVMQPEK 310 320 330 340 350 360 >-- initn: 265 init1: 165 opt: 274 Z-score: 341.2 bits: 72.8 E(32554): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 274; 43.6% identity (72.3% similar) in 101 aa overlap (157-255:522-620) 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFY ..: : .. .::. :.: . ..::: CCDS58 EFDSDTLREFVTAFKKGKLKPVIKSQPVPKNNKGPVKVVVGKTFDSIVMDPKKDVLIEFY 500 510 520 530 540 550 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 APWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKG ::::::::.::: . . :.. : : :: : .: .:::.:.: ..:: ..::::: . .: CCDS58 APWCGHCKQLEPVYNSLAKKYKGQ-KGLV-IAKMDATANDVPSDRYKVEGFPTIYFAPSG 560 570 580 590 600 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 E--SPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPH . .:: ..:: CCDS58 DKKNPVKFEGGDRDLEHLSKFIEEHATKLSRTKEEL 610 620 630 640 >>CCDS10101.1 PDIA3 gene_id:2923|Hs108|chr15 (505 aa) initn: 423 init1: 249 opt: 310 Z-score: 388.6 bits: 81.3 E(32554): 2.5e-15 Smith-Waterman score: 355; 36.8% identity (64.9% similar) in 174 aa overlap (157-328:22-183) 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLD--SEDVWMVE .. .::.:::::.:.. . : : . .:: CCDS10 MRLRRLALFPGVALLLAAARLAAASDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVE 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 FYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQ :.:::::::: : ::. :::...: : : :: :: :.: ..::. :.::.:::. CCDS10 FFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLK----GIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFR 60 70 80 90 100 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPH :: ::: :: . :::. .. .: : . . .:. :. ... .:. . CCDS10 DGEEAGAYDGPRTADGIVSH----LKKQAGPASV-PLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFD- 110 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 ILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFGYPAMAAINA :. . ... .:.. .: :.:. CCDS10 --DSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKT 170 180 190 200 210 >-- initn: 228 init1: 148 opt: 269 Z-score: 336.7 bits: 71.6 E(32554): 2e-12 Smith-Waterman score: 269; 34.4% identity (62.6% similar) in 163 aa overlap (130-289:348-497) 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 TIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGY-SSGKQGRSDSSS ::.....: . : : .: .:... 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CCDS45 KRDLESLREYVES---QLQRTETGATETVTPSEAPVLAAEPEADKGTVLALTENNFDDTI 280 290 300 310 320 330 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGI .: . ...::::::::::.: : : CCDS45 --AEGITFIKFYAPWCGHCKTLAPTWEELSKKEFPGLAGVKIAEVDCTAERNICSKYSVR 340 350 360 370 380 390 440 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:41:36 2016 done: Sun Nov 6 00:41:36 2016 Total Scan time: 2.870 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]