FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6701, 641 aa 1>>>pF1KE6701 641 - 641 aa - 641 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6763+/-0.000438; mu= 16.9244+/- 0.027 mean_var=66.1221+/-13.199, 0's: 0 Z-trim(109.5): 87 B-trim: 118 in 1/49 Lambda= 0.157725 statistics sampled from 17659 (17747) to 17659 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16 Scan time: 5.420 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055104 (OMIM: 300146) calpain-6 [Homo sapiens] ( 641) 4397 1010.1 0 NP_004046 (OMIM: 193235,602537) calpain-5 [Homo sa ( 640) 2070 480.6 7.5e-135 XP_016873712 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calp ( 676) 2070 480.6 7.9e-135 XP_011543527 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calp ( 680) 2070 480.6 8e-135 NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 729) 723 174.1 1.6e-42 NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalyti ( 714) 664 160.7 1.7e-38 XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 664 160.7 1.7e-38 XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 664 160.7 1.7e-38 NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 664 160.7 1.7e-38 NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 664 160.7 1.7e-38 NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subun ( 700) 658 159.3 4.3e-38 XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 650) 634 153.8 1.8e-36 XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 724) 634 153.8 1.9e-36 NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] ( 739) 634 153.8 2e-36 XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 740) 634 153.8 2e-36 XP_011512577 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 743) 634 153.8 2e-36 XP_011512576 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 744) 634 153.8 2e-36 XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 c ( 447) 627 152.2 3.8e-36 NP_057536 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 2 [Homo ( 664) 627 152.2 5.4e-36 NP_006606 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 1 [Homo ( 690) 627 152.2 5.6e-36 XP_011542320 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 695) 627 152.2 5.7e-36 XP_011542319 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 721) 627 152.2 5.9e-36 NP_077320 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 815) 617 150.0 3.2e-35 NP_000061 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 821) 617 150.0 3.2e-35 NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic su ( 622) 549 134.5 1.1e-30 XP_016855587 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 693) 546 133.8 2e-30 XP_016855588 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 495) 527 129.4 3e-29 XP_011542322 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 526) 527 129.4 3.1e-29 XP_016881854 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 503) 478 118.3 6.8e-26 XP_016881852 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 565) 478 118.3 7.6e-26 XP_016881851 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 590) 478 118.3 7.9e-26 XP_016881850 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 604) 478 118.3 8e-26 XP_016881849 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 652) 478 118.3 8.6e-26 XP_016881848 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 676) 478 118.3 8.9e-26 XP_016881847 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 698) 478 118.3 9.1e-26 XP_016881846 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 699) 478 118.3 9.2e-26 XP_016881845 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 702) 478 118.3 9.2e-26 NP_653292 (OMIM: 608839) calpain-12 [Homo sapiens] ( 719) 478 118.3 9.4e-26 XP_016881844 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 723) 478 118.3 9.4e-26 XP_011531465 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 433) 472 116.9 1.5e-25 XP_016860755 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 665) 472 117.0 2.3e-25 XP_016860753 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 472 117.0 2.3e-25 XP_016860754 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 472 117.0 2.3e-25 XP_011531461 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 472 117.0 2.3e-25 XP_011531463 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 472 117.0 2.3e-25 XP_011531462 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 472 117.0 2.3e-25 NP_653176 (OMIM: 610228) calpain-13 [Homo sapiens] ( 669) 472 117.0 2.3e-25 XP_011531166 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 447 111.3 1.2e-23 XP_011531167 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 447 111.3 1.2e-23 XP_011531165 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 447 111.3 1.2e-23 >>NP_055104 (OMIM: 300146) calpain-6 [Homo sapiens] (641 aa) initn: 4397 init1: 4397 opt: 4397 Z-score: 5403.6 bits: 1010.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4397; 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NP_004 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYY-KGTPGPAVRWKRPKGICE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 DPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAG ::.:.: .::.:.: ::..:. .:.: : :: .:: : :.::. :::::::.: . ::: NP_004 DPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 IFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDG ::::.::.::::..::::: :::.:..:.. :.: :::: ::.::::::: :::.:::: NP_004 IFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEE . .: .::::: ..: .:. .: ... .. .:: .. :. ..:::: ::.. . . NP_004 GNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAAD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 QEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEIS .:.. ::.:::.:..::.::.:::. :. :..::. :.::::: :..::.::::. : NP_004 MEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 EEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCRNVNNP---IFGRKELESV ::::... :.:...:....:::::::..:: :: : . :: .:. : : . NP_004 EEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 LGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTV--PEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMG : ::. .:: .::.::: :..:::.::::::: : ::: .:.. .::. :. :: : NP_004 HGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEVKKPED--EVLICIQQRPKRSTRREG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 RPDNYIIGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMF . .: :::...::: ::..:.: : :..:..: ::..:.::: .: ::..:: : NP_004 KGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSL--QHKAASSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 QHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYAN . :.:.:::::.:..:: . ::: :: : .::. :::..:::. : .: : : . NP_004 EPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGL--KDSP 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 ETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLG .: :..::: ..::: :::.: .....::::. . :: ::::: : . :.::: NP_004 TGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGIFYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLG 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 QVTLDADPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHISFKVISSDDLTEL :: : :::.. . :..:.:: ... . : .. ...:: .: NP_004 QVHLKADPDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTVAVHILSSTSLMAV 600 610 620 630 640 >>XP_016873712 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calpain- (676 aa) initn: 2007 init1: 1187 opt: 2070 Z-score: 2541.6 bits: 480.6 E(85289): 7.9e-135 Smith-Waterman score: 2070; 47.0% identity (75.0% similar) in 640 aa overlap (5-638:41-673) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLP .: ...:.:. :...: . . :: :: : XP_016 CFAPRWPQSPHLRTGVPPPLPGAAATMFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPA 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ENDSLFYNRLLPGKVV-WKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQ .:::.: . :: .: ::::. ::.::.:.: .::.:.: ::..:. .:.: : :: . XP_016 TDDSLYY-KGTPGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASR 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFST :: : :.::. :::::::.: . :::::::.::.::::..::::: :::.:..:.. :. XP_016 ESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSN 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 SMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYK : :::: ::.::::::: :::.:::: . .: .::::: ..: .:. .: ... .. . XP_016 SRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQ 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 LFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFS :: .. :. ..:::: ::.. . ..:.. ::.:::.:..::.::.:::. :. :. XP_016 LFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRN .::. :.::::: :..::.::::. :::::... :.:...:....:::::::..:: :: XP_016 SEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRY 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 FHKLNVCRNVNNP---IFGRKELESVLGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFT : . :: .:. : : . : ::. .:: .::.::: :..:::.::::::: XP_016 FTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFE 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KE6 V--PEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTS : ::: .:.. .::. :. :: :. .: :::...::: ::..:.: : :..:..: XP_016 VKKPED--EVLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSL--QHKAASS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 TYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWN ::..:.::: .: ::..:: :. :.:.:::::.:..:: . ::: :: : .::. XP_016 IYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 LARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAI :::..:::. : .: : : . .: :..::: ..::: :::.: .....: XP_016 SLCGYPQLVTQVHVLGAAGL--KDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGI 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 FYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLGQVTLDADPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHI :::. . :: ::::: : . :.::::: : :::.. . :..:.:: ... . : . XP_016 FYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLGQVHLKADPDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTV 610 620 630 640 650 660 630 640 pF1KE6 SFKVISSDDLTEL . ...:: .: XP_016 AVHILSSTSLMAV 670 >>XP_011543527 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calpain- (680 aa) initn: 2007 init1: 1187 opt: 2070 Z-score: 2541.5 bits: 480.6 E(85289): 8e-135 Smith-Waterman score: 2070; 47.0% identity (75.0% similar) in 640 aa overlap (5-638:45-677) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLP .: ...:.:. :...: . . :: :: : XP_011 ALSLQDLVLDWEPRGVPPPLPGAAATMFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPA 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ENDSLFYNRLLPGKVV-WKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQ .:::.: . :: .: ::::. ::.::.:.: .::.:.: ::..:. .:.: : :: . XP_011 TDDSLYY-KGTPGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASR 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFST :: : :.::. :::::::.: . :::::::.::.::::..::::: :::.:..:.. :. XP_011 ESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSN 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 SMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYK : :::: ::.::::::: :::.:::: . .: .::::: ..: .:. .: ... .. . XP_011 SRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQ 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 LFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFS :: .. :. ..:::: ::.. . ..:.. ::.:::.:..::.::.:::. :. :. XP_011 LFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFK 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRN .::. :.::::: :..::.::::. :::::... :.:...:....:::::::..:: :: XP_011 SEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRY 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 FHKLNVCRNVNNP---IFGRKELESVLGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFT : . :: .:. : : . : ::. .:: .::.::: :..:::.::::::: XP_011 FTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFE 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 pF1KE6 V--PEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTS : ::: .:.. .::. :. :: :. .: :::...::: ::..:.: : :..:..: XP_011 VKKPED--EVLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSL--QHKAASS 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 TYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWN ::..:.::: .: ::..:: :. :.:.:::::.:..:: . ::: :: : .::. XP_011 IYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 LARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAI :::..:::. : .: : : . .: :..::: ..::: :::.: .....: XP_011 SLCGYPQLVTQVHVLGAAGL--KDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGI 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 FYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLGQVTLDADPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHI :::. . :: ::::: : . :.::::: : :::.. . :..:.:: ... . : . XP_011 FYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLGQVHLKADPDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTV 610 620 630 640 650 660 630 640 pF1KE6 SFKVISSDDLTEL . ...:: .: XP_011 AVHILSSTSLMAV 670 680 >>NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform c [H (729 aa) initn: 1032 init1: 359 opt: 723 Z-score: 884.5 bits: 174.1 E(85289): 1.6e-42 Smith-Waterman score: 1079; 36.6% identity (65.7% similar) in 505 aa overlap (4-489:52-528) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFL :. :.. ...:...:.. . :. :: : NP_775 PVPHPAQSKATEAGGGNPSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFP 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 PENDSLFYNRLLPGKVVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQ :.. ::::.. .: . ::::: .::..:..:. . . .. ::.:: ...:..::... NP_775 PDETSLFYSQKFPIQFVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLN 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFST . ..::. : . :.:::::::.::..:::..::::: ::: :..:::. :. NP_775 QHLLFRVIPH------DQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSN 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 SMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYK ::::.:::::::::: : :::: : . :. . :::: .:: . :. . NP_775 HRNEFWSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAE--------FFEIRDAPSD 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 LFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFS .. . :.. .:.:. :::.. . :.. ::..::.:..: . .. :. NP_775 MYKIMKKAIERGSLMGCSIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVP--------FK 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRN .::: .:::::: :. ::.: ::. ..:. . ... : ...::::::: ::: . NP_775 GEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYH 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 pF1KE6 FHKLNVCRNVNNPIFGRKELESVLGCWTVD-DDPLMNR---SGGCYNNRDTFLQNPQYIF : ::..: :.. . .:.. :::. .. : .::: : ::: :::: . 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NP_775 KLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQKNRRKDRKLG-ASLFTIGFAIYEVPKEMHGNKQHLQ 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 H---LYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQL . :: .: ..:::. : : : ..::.::. .. . .::.::.::: NP_775 KDFFLYNASKARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLS 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 RELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPV NP_775 EEVENTISVDRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHK 540 550 560 570 580 590 >>NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic su (714 aa) initn: 810 init1: 340 opt: 664 Z-score: 812.1 bits: 160.7 E(85289): 1.7e-38 Smith-Waterman score: 948; 34.0% identity (61.7% similar) in 517 aa overlap (8-497:37-524) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPEND . .: :..:. .:.... :: : .: : . NP_005 TPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQ 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 SLFYNRLLPGK-----VVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAV :: :. : :.. . :::: .. ..:..:: . . .. :: :: ...:.. :.. NP_005 SLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 QESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFS ... ...: : .. . :::::::..:.::::..::.::::: .: ::: : NP_005 NDTLLHRVVP-HGQSFQNG-----YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 TSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKY . ::::.:::::::::. : ::::.: . .. . :::: ..: . :: . NP_005 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTE--------WYELRKAPS 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 KLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVF :. . :.. .:.:. :::. . ..:. : :.:::.:..: ... . NP_005 DLYQIILKALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVN--------Y 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 SAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCR .. : ..:.::: :. ::.: ::. : ::... .: .: . : .:::::::..:: : NP_005 RGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKM-EDGEFWMSFRDFMR 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KE6 NFHKLNVCRNVNNPIFGR--KELESVL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYI .: .:..: . . . .: .. ...: : : . .::: : :: :::. NP_005 EFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWNTTLYEGTWRRG-----STAGGCRNYPATFWVNPQFK 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KE6 FTV-----PED------GHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFR . . :.: : . ...:.:: : ::.:: : ::: ...: :. . NP_005 IRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQKHRRRERRFGR-DMETIGFAVYEVPPELVGQPA 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 LH-----HLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEV .: : :: . .:. : : : :.::.::. :. .. ..:.::.::: NP_005 VHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEK 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 PVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEV . :: NP_005 SAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKH 520 530 540 550 560 570 >>XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa) initn: 810 init1: 340 opt: 664 Z-score: 812.1 bits: 160.7 E(85289): 1.7e-38 Smith-Waterman score: 948; 34.0% identity (61.7% similar) in 517 aa overlap (8-497:37-524) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPEND . .: :..:. .:.... :: : .: : . 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XP_006 DLYQIILKALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVN--------Y 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 SAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCR .. : ..:.::: :. ::.: ::. : ::... .: .: . : .:::::::..:: : XP_006 RGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKM-EDGEFWMSFRDFMR 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KE6 NFHKLNVCRNVNNPIFGR--KELESVL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYI .: .:..: . . . .: .. ...: : : . .::: : :: :::. XP_006 EFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWNTTLYEGTWRRG-----STAGGCRNYPATFWVNPQFK 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KE6 FTV-----PED------GHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFR . . :.: : . ...:.:: : ::.:: : ::: ...: :. . XP_006 IRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQKHRRRERRFGR-DMETIGFAVYEVPPELVGQPA 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 LH-----HLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEV .: : :: . .:. : : : :.::.::. :. .. ..:.::.::: XP_006 VHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEK 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 PVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEV . :: XP_006 SAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKH 520 530 540 550 560 570 >>XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa) initn: 810 init1: 340 opt: 664 Z-score: 812.1 bits: 160.7 E(85289): 1.7e-38 Smith-Waterman score: 948; 34.0% identity (61.7% similar) in 517 aa overlap (8-497:37-524) 10 20 30 pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPEND . .: :..:. .:.... :: : .: : . 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XP_011 DLYQIILKALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVN--------Y 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 SAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCR .. : ..:.::: :. ::.: ::. : ::... .: .: . : .:::::::..:: : XP_011 RGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKM-EDGEFWMSFRDFMR 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KE6 NFHKLNVCRNVNNPIFGR--KELESVL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYI .: .:..: . . . .: .. ...: : : . .::: : :: :::. XP_011 EFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWNTTLYEGTWRRG-----STAGGCRNYPATFWVNPQFK 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KE6 FTV-----PED------GHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFR . . :.: : . ...:.:: : ::.:: : ::: ...: :. . 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