Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6701
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6701, 641 aa
  1>>>pF1KE6701 641 - 641 aa - 641 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7033+/-0.000993; mu= 16.5807+/- 0.060
 mean_var=62.5918+/-12.263, 0's: 0 Z-trim(103.1): 34  B-trim: 37 in 1/47
 Lambda= 0.162112
 statistics sampled from 7246 (7270) to 7246 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  1.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX           ( 641) 4397 1037.5       0
CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11           ( 640) 2070 493.3 4.3e-139
CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1        ( 703)  750 184.6   4e-46
CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 729)  723 178.3 3.3e-44
CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11          ( 714)  664 164.5 4.7e-40
CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1           ( 700)  658 163.0 1.2e-39
CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6        ( 739)  634 157.4 6.2e-38
CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1         ( 664)  627 155.8 1.8e-37
CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1          ( 690)  627 155.8 1.8e-37
CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 815)  617 153.5 1.1e-36
CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 821)  617 153.5 1.1e-36
CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1           ( 622)  549 137.5 5.1e-32
CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19      ( 719)  478 121.0 5.8e-27
CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2        ( 669)  472 119.5 1.4e-26
CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2       ( 684)  447 113.7 8.5e-25
CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2        ( 517)  431 109.9 8.8e-24
CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2        ( 672)  431 110.0 1.1e-23
CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1         ( 627)  378 97.5 5.6e-20


>>CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX                (641 aa)
 initn: 4397 init1: 4397 opt: 4397  Z-score: 5551.9  bits: 1037.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4397; 100.0% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRLLPGKVVWKRPQDICDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRLLPGKVVWKRPQDICDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 PHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 TITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 EVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 EWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCRNVNNPIFGRKELESVLGCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCRNVNNPIFGRKELESVLGCW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 TVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTVPEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTVPEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 IGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 EFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 LVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLGQVTLDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLGQVTLDA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640 
pF1KE6 DPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHISFKVISSDDLTEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHISFKVISSDDLTEL
              610       620       630       640 

>>CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11                (640 aa)
 initn: 2007 init1: 1187 opt: 2070  Z-score: 2610.6  bits: 493.3 E(32554): 4.3e-139
Smith-Waterman score: 2070; 47.0% identity (75.0% similar) in 640 aa overlap (5-638:5-637)

               10        20        30        40        50          
pF1KE6 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRLLPGKVV-WKRPQDICD
           .: ...:.:. :...: . . :: :: :   .:::.: .  :: .: ::::. ::.
CCDS82 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYY-KGTPGPAVRWKRPKGICE
               10        20        30        40         50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 DPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAG
       ::.:.: .::.:.: ::..:.  .:.: : :: .:: : :.::. :::::::.: . :::
CCDS82 DPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAG
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 IFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDG
       ::::.::.::::..::::: :::.:..:..  :.: :::: ::.::::::: :::.::::
CCDS82 IFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDG
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 LTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEE
        . .: .::::: ..: .:. .: ...   .. .:: .. :. ..::::  ::.. .  .
CCDS82 GNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAAD
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 QEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEIS
       .:..   ::.:::.:..::.::.:::. :.  :..::. :.::::: :..::.::::. :
CCDS82 MEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTS
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340          350      
pF1KE6 EEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCRNVNNP---IFGRKELESV
       ::::... :.:...:....:::::::..:: :: :  .  :: .:.    :    :   .
CCDS82 EEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARL
     300       310       320       330       340       350         

        360       370       380       390         400       410    
pF1KE6 LGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTV--PEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMG
        : ::. .:: .::.::: :..:::.::::::: :  :::  .:.. .::.  :. :: :
CCDS82 HGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEVKKPED--EVLICIQQRPKRSTRREG
     360       370       380       390         400       410       

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE6 RPDNYIIGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMF
       . .:  :::...::: ::..:.: :  :..:..: ::..:.:::     .: ::..:: :
CCDS82 KGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSL--QHKAASSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTF
       420       430       440         450       460       470     

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE6 QHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYAN
       . :.:.:::::.:..:: . ::: :: :  .::.   :::..:::. : .:  :  : . 
CCDS82 EPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGL--KDSP
         480       490       500       510       520         530   

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE6 ETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLG
         .: :..:::  ..::: :::.:    .....::::.  . :: ::::: : . :.:::
CCDS82 TGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGIFYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLG
           540       550       560       570       580       590   

          600       610       620       630       640 
pF1KE6 QVTLDADPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHISFKVISSDDLTEL
       :: : :::.. . :..:.:: ...   .   : .. ...:: .:   
CCDS82 QVHLKADPDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTVAVHILSSTSLMAV
           600       610       620       630       640

>>CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1             (703 aa)
 initn: 927 init1: 377 opt: 750  Z-score: 941.5  bits: 184.6 E(32554): 4e-46
Smith-Waterman score: 1021; 35.9% identity (62.7% similar) in 518 aa overlap (8-497:27-514)

                                  10        20        30        40 
pF1KE6                    MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFY
                                 . .: .. :.:.:. .. :: :: :    ..: :
CCDS73 MAAQAAGVSRQRAATQGLGSNQNALKYLGQDFKTLRQQCLDSGVLFKDPEFPACPSALGY
               10        20        30        40        50        60

                   50        60        70        80        90      
pF1KE6 NRLLPGK-----VVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESH
       . : ::.     ..:::: ..: .:..:::. .  .. :: ::   ...:.. :...:  
CCDS73 KDLGPGSPQTQGIIWKRPTELCPSPQFIVGGATRTDICQGGLGDCWLLAAIASLTLNEEL
               70        80        90       100       110       120

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE6 WTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMN
         ...:  ..:...    :.:::::::.::..:::.:::::: ::: ::.:.:  : . :
CCDS73 LYRVVP--RDQDFQ----ENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVIDDRLPTKNGQLLFLHSEQGN
                130           140       150       160       170    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE6 EFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFG
       :::.:::::::::: :::::: : . .. . :::: ..:  :..:           .:. 
CCDS73 EFWSALLEKAYAKLNGCYEALAGGSTVEGFEDFTGGISEFYDLKK--------PPANLYQ
          180       190       200       210               220      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE6 ELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEK
        . :..  :.:. :::.  .  : :. :.  :.:.:.:..: ....         :... 
CCDS73 IIRKALCAGSLLGCSIDVSSAAEAEAITSQKLVKSHAYSVTGVEEVN--------FQGHP
        230       240       250       260       270                

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE6 VYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHK
         ..::::: :. :::: ::. . ::...    ...:   . .:::::::: :: :.: .
CCDS73 EKLIRLRNPWGEVEWSGAWSDDAPEWNHIDPRRKEELDKKV-EDGEFWMSLSDFVRQFSR
      280       290       300       310        320       330       

        340       350            360       370       380       390 
pF1KE6 LNVCRNVNNPIFGRKELES---VL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFT-
       :..: :..   .. .:...   ::  : ::       . .::: :   :.  :::. .  
CCDS73 LEIC-NLSPDSLSSEEVHKWNLVLFNGHWTRG-----STAGGCQNYPATYWTNPQFKIRL
       340        350       360            370       380       390 

                        400       410       420         430        
pF1KE6 --VPEDGHK--------VIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFRLH-
         : :: ..        :...:.::. :  .:.:.     ::. ...:  :.. .   : 
CCDS73 DEVDEDQEESIGEPCCTVLLGLMQKNRRWRKRIGQ-GMLSIGYAVYQVPKELESHTDAHL
             400       410       420        430       440       450

           440       450       460       470       480       490   
pF1KE6 ----HLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQ
            :  :  : ::::.. : :     :  :.:..::. :.  . .:: ::.:::  .:
CCDS73 GRDFFLAYQPSARTSTYVNLREVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKAQ
              460       470       480       490       500       510

           500       510       520       530       540       550   
pF1KE6 LRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSP
         :.                                                        
CCDS73 ALEIGDVVAGNPYEPHPSEVDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSKRTDI
              520       530       540       550       560       570

>>CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15               (729 aa)
 initn: 1032 init1: 359 opt: 723  Z-score: 907.1  bits: 178.3 E(32554): 3.3e-44
Smith-Waterman score: 1079; 36.6% identity (65.7% similar) in 505 aa overlap (4-489:52-528)

                                          10        20        30   
pF1KE6                            MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFL
                                     :.   :.. ...:...:.. . :. :: : 
CCDS10 PVPHPAQSKATEAGGGNPSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFP
              30        40        50        60        70        80 

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE6 PENDSLFYNRLLPGKVVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQ
       :.. ::::.. .: . ::::: .::..:..:. . .  .. ::.::   ...:..::...
CCDS10 PDETSLFYSQKFPIQFVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLN
              90       100       110       120       130       140 

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE6 ESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFST
       .    ..::.      : .  :.:::::::.::..:::..::::: ::: :..:::. :.
CCDS10 QHLLFRVIPH------DQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSN
             150             160       170       180       190     

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE6 SMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYK
         ::::.:::::::::: : :::: : . :. . :::: .::        . :. .    
CCDS10 HRNEFWSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAE--------FFEIRDAPSD
         200       210       220       230               240       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE6 LFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFS
       ..  . :.. .:.:. :::..    . :..   ::..::.:..: . ..         :.
CCDS10 MYKIMKKAIERGSLMGCSIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVP--------FK
       250       260       270       280       290                 

           280       290       300       310       320       330   
pF1KE6 AEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRN
       .::: .:::::: :. ::.: ::.  ..:. .  ...  :   ...::::::: :::  .
CCDS10 GEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYH
     300       310       320       330       340       350         

           340       350       360        370          380         
pF1KE6 FHKLNVCRNVNNPIFGRKELESVLGCWTVD-DDPLMNR---SGGCYNNRDTFLQNPQYIF
       : ::..: :..   .   .:..    :::. ..    :   .::: :  :::  :::: .
CCDS10 FTKLEIC-NLTADALQSDKLQT----WTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRL
     360        370       380           390       400       410    

     390                400       410       420         430        
pF1KE6 TV------PEDGHKV---IMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMN-RKFRLH
        .      :.:.. .   ...:.::. :  :..:  . . ::: ...:  ::.  : .:.
CCDS10 KLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQKNRRKDRKLG-ASLFTIGFAIYEVPKEMHGNKQHLQ
          420       430       440        450       460       470   

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE6 H---LYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQL
       .   ::   .: ..:::. : :     :  ..::.::. ..  . .::.::.:::     
CCDS10 KDFFLYNASKARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLS
           480       490       500       510       520       530   

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE6 RELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPV
                                                                   
CCDS10 EEVENTISVDRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHK
           540       550       560       570       580       590   

>>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11               (714 aa)
 initn: 810 init1: 340 opt: 664  Z-score: 832.6  bits: 164.5 E(32554): 4.7e-40
Smith-Waterman score: 948; 34.0% identity (61.7% similar) in 517 aa overlap (8-497:37-524)

                                      10        20        30       
pF1KE6                        MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPEND
                                     . .: :..:. .:.... :: : .: :  .
CCDS44 TPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQ
         10        20        30        40        50        60      

        40             50        60        70        80        90  
pF1KE6 SLFYNRLLPGK-----VVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAV
       :: :. : :..     . :::: .. ..:..:: . .  .. :: ::   ...:.. :..
CCDS44 SLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTL
         70        80        90       100       110       120      

            100       110       120       130       140       150  
pF1KE6 QESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFS
       ...   ...: : ..  .      :::::::..:.::::..::.:::::  .: :::  :
CCDS44 NDTLLHRVVP-HGQSFQNG-----YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
        130        140            150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE6 TSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKY
       .  ::::.:::::::::. : ::::.: . .. . :::: ..:        . :: .   
CCDS44 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTE--------WYELRKAPS
              190       200       210       220               230  

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE6 KLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVF
        :.  . :.. .:.:. :::.  .  ..:. :   :.:::.:..:  ...         .
CCDS44 DLYQIILKALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVN--------Y
            240       250       260       270       280            

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE6 SAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCR
        .. : ..:.::: :. ::.: ::. : ::...   .: .: . : .:::::::..:: :
CCDS44 RGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKM-EDGEFWMSFRDFMR
          290       300       310       320        330       340   

            340       350           360       370       380        
pF1KE6 NFHKLNVCRNVNNPIFGR--KELESVL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYI
       .: .:..:  . . . .:  .. ...:  : :        . .::: :   ::  :::. 
CCDS44 EFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWNTTLYEGTWRRG-----STAGGCRNYPATFWVNPQFK
           350       360       370            380       390        

      390                  400       410       420         430     
pF1KE6 FTV-----PED------GHKVIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFR
       . .     :.:      : . ...:.::  :  ::.:: :   ::: ...:  :.  .  
CCDS44 IRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQKHRRRERRFGR-DMETIGFAVYEVPPELVGQPA
      400       410       420       430        440       450       

              440       450       460       470       480       490
pF1KE6 LH-----HLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEV
       .:      :    :: .  .:. : :     :  :.::.::. :. .. ..:.::.::: 
CCDS44 VHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEK
       460       470       480       490       500       510       

              500       510       520       530       540       550
pF1KE6 PVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEV
        .   ::                                                     
CCDS44 SAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKH
       520       530       540       550       560       570       

>>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1                (700 aa)
 initn: 768 init1: 367 opt: 658  Z-score: 825.2  bits: 163.0 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 1014; 33.4% identity (63.2% similar) in 551 aa overlap (8-526:27-547)

                                  10        20        30        40 
pF1KE6                    MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFY
                                 . :: :. :..::.. . :: ::.:    ..: .
CCDS31 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
               10        20        30        40        50        60

                   50        60        70        80        90      
pF1KE6 NRLLPGK-----VVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESH
       ..: : .     . :::: .:: ::..:.:. .  .. :: ::   ...:.. :...:  
CCDS31 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
               70        80        90       100       110       120

        100        110       120       130       140       150     
pF1KE6 WTKTIP-NHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSM
        ....: :.. ::       .:::::::.::..:::.:::.:: ::: .:.:.:  :.  
CCDS31 LARVVPLNQSFQE-------NYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEG
              130              140       150       160       170   

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE6 NEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLF
       .:::.:::::::::. ::::::.: . :. . :::: .::  ...:           .::
CCDS31 SEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKK--------PPPNLF
           180       190       200       210               220     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE6 GELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAE
         . :.. ::.:. :::.  .  ..:. :   :.:::.:..:  .... .  :      .
CCDS31 KIIQKALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSL------Q
         230       240       250       260       270               

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE6 KVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFH
       :  ..:.::: :. ::.: :..    :. .   .:. :     .:::::::. :: :.. 
CCDS31 K--LIRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERL-TRRHEDGEFWMSFSDFLRHYS
     280         290       300       310        320       330      

         340           350       360       370       380       390 
pF1KE6 KLNVCR----NVNNPIFGRKELESVLGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTV
       .:..:     ....  . . .: .. : :        . .::: :  .:: .::::.. .
CCDS31 RLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTKMDGNWRRG-----STAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKL
        340       350       360            370       380       390 

                      400       410       420         430          
pF1KE6 PE------DGHK---VIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV--EMNRKFRLH---
        :      ::..    ...: ::  :  :.::. : . ::: ...:  :.. .  .:   
CCDS31 EEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGE-DMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSK
             400       410       420        430       440       450

       440         450       460       470       480       490     
pF1KE6 HLYIQERAG--TSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQLR
       .... .::   ..:.:. : :.    :  :.:.:::. :. .. ..: .:.:::  .. .
CCDS31 NFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQ
              460       470       480       490       500       510

               500       510       520       530       540         
pF1KE6 ------ELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEE
             : .:.   .:  ..  :. .. .:.. ..::                       
CCDS31 AVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSD
              520       530       540       550       560       570

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE6 VRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLGQVTLDADPSDCRDLK
                                                                   
CCDS31 GFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKA
              580       590       600       610       620       630

>>CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6             (739 aa)
 initn: 779 init1: 339 opt: 634  Z-score: 794.5  bits: 157.4 E(32554): 6.2e-38
Smith-Waterman score: 945; 33.9% identity (62.2% similar) in 510 aa overlap (8-489:61-541)

                                      10        20        30       
pF1KE6                        MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPEND
                                     : ::...::.  :.. ..:: :: :  : .
CCDS47 PTFTDTGMVAHINNSRLKAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPS
               40        50        60        70        80        90

        40             50        60        70        80        90  
pF1KE6 SLFYNRLLPGK-----VVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAV
       :: .. : :..     . :.::.:: ..: .:. .::  .. :: ::   ...:.. :..
CCDS47 SLGFKDLGPNSKNVQNISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTT
              100       110       120       130       140       150

            100       110       120       130       140       150  
pF1KE6 QESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFS
         .   ...:  . : .     ..:::::::..:.::.:..::.:: ::: :  :::  :
CCDS47 CPKLLYRVVP--RGQSFK----KNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHS
              160             170       180       190       200    

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE6 TSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKY
       :  .:::.:::::::::: : ::::.: .  . . :::: .:.. ..:.           
CCDS47 TERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQR--------PPQ
          210       220       230       240       250              

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE6 KLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVF
       .:.  : :.  ...:. ::::  .. : :  ::  :..::.:..: .. ..        .
CCDS47 NLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVH--------Y
        260       270       280       290       300                

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE6 SAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCR
        ..   ..:.::: :: ::.: ::. ..::... ::: .   :  ..::::::: .::  
CCDS47 RGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEV-ASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLN
      310       320       330       340        350       360       

            340         350         360       370       380        
pF1KE6 NFHKLNVCRNVNNPIFG--RKELESVL--GCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYI
       ::  :..:  . . . :  ..  ....  : :        . .::: :.  ::  :::. 
CCDS47 NFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYWHTTFYEGSWRRG-----SSAGGCRNHPGTFWTNPQFK
       370       380       390       400            410       420  

      390                   400       410       420       430      
pF1KE6 FTVPE--------DGHKVI----MSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKVEMN-RKFR
       ...::        .:. :.    ..:.::. :  :..:  .   ::: :. :  . ....
CCDS47 ISLPEGDDPEDDAEGNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQG-AQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQ
            430       440       450       460        470       480 

         440             450       460       470       480         
pF1KE6 LHHLY------IQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSE
         ::        :... .  . ..: :  .  :  :.:...:. :.  : ..::::.:.:
CCDS47 DVHLKKEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTE
             490       500       510       520       530       540 

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE6 VPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEE
                                                                   
CCDS47 KHSESWELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIK
             550       560       570       580       590       600 

>>CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1              (664 aa)
 initn: 781 init1: 328 opt: 627  Z-score: 786.4  bits: 155.8 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 896; 33.3% identity (60.1% similar) in 511 aa overlap (11-503:27-480)

                               10        20        30        40    
pF1KE6                 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRL
                                 :......:::.. . :: :  :   :.::::.. 
CCDS31 MPYLYRAPGPQAHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYSER
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE6 LPGKVVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNH
            ::::: .:  .:..:.:. .  .. ::.::   ...:.. :.....  ...::  
CCDS31 PQIPFVWKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIP--
               70        80        90       100       110          

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE6 KEQEWDPQKTEKYAGIFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLE
       ..: . :     :::::::.::. .:: .::::: :::.   :::  :.. ::::.::::
CCDS31 QDQSFGPG----YAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLE
      120           130       140       150       160       170    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE6 KAYAKLLGCYEALDGLTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTK
       :::::: : :::: : .  . . :::: .::: . .     :  :. :..   : :.. .
CCDS31 KAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTK-----EAPENFYEI---LEKALKR
          180       190       200       210               220      

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE6 GGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRN
       :.:. : :.. .  :.:..: .::.:::.:..: : ..         : .... ..:.::
CCDS31 GSLLGCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVS--------FRGQRIELIRIRN
        230       240       250       260               270        

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE6 PLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCR---
       : :. ::.: ::            ::              :...::  .: :...:    
CCDS31 PWGQVEWNGSWS------------DR--------------MAFKDFKAHFDKVEICNLTP
      280       290                                 300       310  

              350       360       370       380       390          
pF1KE6 -NVNNPIFGRKELESVLGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTVPE--DGHK-
         ...  . . :.    : :.       . .::: :  :::  :::  ... :  .:.. 
CCDS31 DALEEDAIHKWEVTVHQGSWVRG-----STAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQEE
            320       330            340       350       360       

         400       410       420            430       440       450
pF1KE6 --VIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV-----EMNRKFRLHHLYIQERAGTSTY
          ...:.::: :  .:.:  .   ::. ...      ..:. :  .:     :: ..:.
CCDS31 CSFLVALMQKDRRKLKRFG-ANVLTIGYAIYECPDKDEHLNKDFFRYH---ASRARSKTF
       370       380        390       400       410          420   

              460       470       480       490           500      
pF1KE6 IDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELT----LDMPKMSC
       :. : :     :  :.:.:.:. :.  . ..: ::::::  .  :..     .:.:.   
CCDS31 INLREVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPK
           430       440       450       460       470       480   

        510       520       530       540       550       560      
pF1KE6 WNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQ
                                                                   
CCDS31 PTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKNI
           490       500       510       520       530       540   

>>CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1               (690 aa)
 initn: 921 init1: 328 opt: 627  Z-score: 786.1  bits: 155.8 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 1033; 35.0% identity (63.4% similar) in 511 aa overlap (11-503:27-506)

                               10        20        30        40    
pF1KE6                 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRL
                                 :......:::.. . :: :  :   :.::::.. 
CCDS15 MPYLYRAPGPQAHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYSER
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE6 LPGKVVWKRPQDICDDPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNH
            ::::: .:  .:..:.:. .  .. ::.::   ...:.. :.....  ...::  
CCDS15 PQIPFVWKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIP--
               70        80        90       100       110          

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       ..: . :     :::::::.::. .:: .::::: :::.   :::  :.. ::::.::::
CCDS15 QDQSFGPG----YAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLE
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       :::::: : :::: : .  . . :::: .::: . .     :  :. :..   : :.. .
CCDS15 KAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTK-----EAPENFYEI---LEKALKR
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pF1KE6 GGLICCSIESPNQEEQEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRN
       :.:. : :.. .  :.:..: .::.:::.:..: : ..         : .... ..:.::
CCDS15 GSLLGCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVS--------FRGQRIELIRIRN
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pF1KE6 PLGRQEWSGPWSEISEEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCR---
       : :. ::.: ::. : ::...  ...: :  .  :::::::...::  .: :...:    
CCDS15 PWGQVEWNGSWSDSSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTP
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pF1KE6 -NVNNPIFGRKELESVLGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTVPE--DGHK-
         ...  . . :.    : :.       . .::: :  :::  :::  ... :  .:.. 
CCDS15 DALEEDAIHKWEVTVHQGSWVRG-----STAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQEE
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pF1KE6 --VIMSLQQKDLRTYRRMGRPDNYIIGFELFKV-----EMNRKFRLHHLYIQERAGTSTY
          ...:.::: :  .:.:  .   ::. ...      ..:. :  .:     :: ..:.
CCDS15 CSFLVALMQKDRRKLKRFG-ANVLTIGYAIYECPDKDEHLNKDFFRYH---ASRARSKTF
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pF1KE6 IDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMFQHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELT----LDMPKMSC
       :. : :     :  :.:.:.:. :.  . ..: ::::::  .  :..     .:.:.   
CCDS15 INLREVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPK
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pF1KE6 WNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYANETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQ
                                                                   
CCDS15 PTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKNI
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       :.. ::::.. .: . ::::: .::..:..:. . .  .. ::.::   ...:..::...
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       ..  . :.. .:.:. :::.         ::                 :.  :. . :  
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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