Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4485, 501 aa
1>>>pF1KE4485 501 - 501 aa - 501 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1367+/-0.00106; mu= 13.2391+/- 0.064
mean_var=67.7715+/-13.391, 0's: 0 Z-trim(102.8): 38 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155794
statistics sampled from 7089 (7108) to 7089 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2180.1 DARS gene_id:1615|Hs108|chr2 ( 501) 3310 753.4 1.3e-217
CCDS32837.1 NARS gene_id:4677|Hs108|chr18 ( 548) 523 127.0 5.4e-29
CCDS8261.1 NARS2 gene_id:79731|Hs108|chr11 ( 477) 394 98.0 2.5e-20
CCDS58164.1 NARS2 gene_id:79731|Hs108|chr11 ( 250) 336 84.9 1.1e-16
>>CCDS2180.1 DARS gene_id:1615|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 3310 init1: 3310 opt: 3310 Z-score: 4020.2 bits: 753.4 E(32554): 1.3e-217
Smith-Waterman score: 3310; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVV
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CCDS21 MPSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 WVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLF
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE4 LGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::::::::::::::::::::
CCDS21 LGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
490 500
>>CCDS32837.1 NARS gene_id:4677|Hs108|chr18 (548 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 634.1 bits: 127.0 E(32554): 5.4e-29
Smith-Waterman score: 529; 26.9% identity (58.5% similar) in 472 aa overlap (41-501:110-548)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 QEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVRARVHTSR
:. :.. : ....: : . :: :
CCDS32 REKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVK-VFGWVHRLR
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120
pF1KE4 AKGKQC-FLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGS
.::. :::::. .: ..: :. . . .. .. :: : : :.. ... : :.
CCDS32 RQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLA--DELCQCYN--GVLLSTESSVAVYGML-NLTPK-GK
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRT
. :: . .:.:: :. . :.. :..:.:: . .:
CCDS32 QAPGGHELSCDFWELIGLAPAG---GADNLINEESD----------VDVQLNNRHMMIRG
200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 STSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQS
. . ... .: . . ::. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.::
CCDS32 ENMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADT
::: . :. : . :: :. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... :
CCDS32 SQLYLETCLPA-LGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDL
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MVQIF-KGLQERFQTEIQTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE-
. .. . :. . .. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. :
CCDS32 VCDVVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGT
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 -----DDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
.:. :.:. ..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..:
CCDS32 FYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLM
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KE4 RGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTML
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CCDS32 PNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTW
470 480 490 500 510 520
480 490 500
pF1KE4 FLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
.:. ...:.. ..:: .: ::
CCDS32 ILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP
530 540
>>CCDS8261.1 NARS2 gene_id:79731|Hs108|chr11 (477 aa)
initn: 400 init1: 137 opt: 394 Z-score: 478.4 bits: 98.0 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 460; 27.0% identity (57.7% similar) in 492 aa overlap (32-496:15-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRD-LTIQKAD-EV
:: ..::. : ::: : :.:. :
CCDS82 MLGVRCLLRSVRFCSSAPFPKHKPSAKL-SVRDALGAQNASGER
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGV
. ... ... :.. . :: . . . ....: .:.: . . ..: : :.:.:
CCDS82 IKIQGWIRSVRSQKEVLFLHVNDGS-SLESLQVVADSGLD-----SRELNFGSSVEVQGQ
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPR-LPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDT
. : .: .:.:::...:: ::. . . .:.. . : : . :
CCDS82 LIKSPSK-----RQNVELKAEKIKVIGNCDAKDFPIKYKE--RHPLE-------YLRQYP
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTV-
.. : :.. ...:..: .. . ..:::.:.:: : : :::....: .
CCDS82 HFRCR-----TNVLGSILRIRSEATAAIHSFFKDSGFVHIHTPIITSNDSEGAGELFQLE
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KE4 ----------SYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFV
..:. :.:. : ::. .. . . : .::..::.::::.:...:::.::
CCDS82 PSGKLKVPEENFFNVPAFLTVSGQLHLEV-MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFY
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 GLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR--
.. :..: ...:. : . . . . ... .: . :: :.
CCDS82 MIEAEISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNN
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE4 ---LEYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPL
. : ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::
CCDS82 FLIISYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPL
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 AVRPFYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKA
...::: . .:... . :... : :...:. : . ..: :: . :. : .
CCDS82 TLKPFYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLREERYHFLEERLARSGLT-EVYQW
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KE4 YIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:.: :::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
CCDS82 YLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
440 450 460 470
>>CCDS58164.1 NARS2 gene_id:79731|Hs108|chr11 (250 aa)
initn: 291 init1: 137 opt: 336 Z-score: 412.8 bits: 84.9 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 355; 29.8% identity (60.1% similar) in 248 aa overlap (262-496:5-245)
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDI
: .::..::.::::.:...:::.:: ..
CCDS58 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIEA
10 20 30
300 310 320 330 340
pF1KE4 EMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR-----L
:..: ...:. : . . . . ... .: . :: :. .
CCDS58 EISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLII
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRP
: ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::...:
CCDS58 SYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPLTLKP
100 110 120 130 140
410 420 430 440 450
pF1KE4 FYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDS
:: . .:... . :... : :...:. : . ..: :: . :. : . :.:
CCDS58 FYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLREERYHFLEERLARSGLT-EVYQWYLDL
150 160 170 180 190 200
460 470 480 490 500
pF1KE4 FRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
CCDS58 RRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
210 220 230 240 250
501 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:50:19 2016 done: Sun Nov 6 00:50:19 2016
Total Scan time: 2.720 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]