FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6730, 809 aa 1>>>pF1KE6730 809 - 809 aa - 809 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5021+/-0.00104; mu= -0.4260+/- 0.063 mean_var=391.2265+/-80.200, 0's: 0 Z-trim(115.7): 56 B-trim: 171 in 1/52 Lambda= 0.064843 statistics sampled from 16258 (16308) to 16258 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.501), width: 16 Scan time: 3.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 809) 5675 545.5 1.3e-154 CCDS10658.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 853) 4525 437.9 3.3e-122 CCDS58447.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 879) 4525 438.0 3.4e-122 CCDS73865.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 923) 4525 438.0 3.5e-122 CCDS10659.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 910) 3941 383.3 9.6e-106 CCDS45638.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 993) 2401 239.3 2.4e-62 CCDS45639.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 994) 2352 234.7 5.7e-61 CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024) 2347 234.3 8.1e-61 CCDS54508.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1023) 2343 233.9 1e-60 CCDS54509.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1013) 2128 213.8 1.2e-54 CCDS74837.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1011) 2123 213.3 1.6e-54 CCDS54510.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 948) 1847 187.5 9.2e-47 CCDS54511.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 949) 1660 170.0 1.7e-41 CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 655 76.6 8.4e-13 CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 648 75.9 1.3e-12 CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 648 75.9 1.3e-12 >>CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 (809 aa) initn: 5675 init1: 5675 opt: 5675 Z-score: 2889.2 bits: 545.5 E(32554): 1.3e-154 Smith-Waterman score: 5675; 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84.9% identity (84.9% similar) in 841 aa overlap (83-809:83-910) 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDPDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDRDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSP-- :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVL 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 ------------------------------------------------------------ CCDS10 CNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLNLSQEEELLVL 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ----------------------------------------------------AYLLSCGF :::::::: CCDS10 AGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGF 240 250 260 270 280 290 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT 300 310 320 330 340 350 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP 360 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 EPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 GWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIA 660 670 680 690 700 710 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL 720 730 740 750 760 770 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKV-- 780 790 800 810 820 830 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 EELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 -----------TQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS 840 850 860 870 780 790 800 pF1KE6 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI 880 890 900 910 >>CCDS45638.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 (993 aa) initn: 2159 init1: 1155 opt: 2401 Z-score: 1232.9 bits: 239.3 E(32554): 2.4e-62 Smith-Waterman score: 2401; 50.2% identity (78.4% similar) in 644 aa overlap (171-809:352-993) 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 GPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATF :::::: :: :::.:::.::.:::::.: : CCDS45 VIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSARF 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAVGPNL :: .::::.: . : :::.:.: :... : :.:.:::.:.::: :::::: : . :: CCDS45 HCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNL 390 400 410 420 430 440 270 280 290 300 310 pF1KE6 TCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDS-DMDDVPERGLISD ::.:..:: ::.:::::::.::: ::.:::..:.: . .: .::: ... .: .::.:. CCDS45 TCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSS 450 460 470 480 490 500 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 AQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLP .. ..::: ... . ..::.:::.. .:. ::. .:: ... : : :. . ::: : CCDS45 GKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDP 510 520 530 540 550 560 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 GYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDC ::.:: . :::::: .:.::.:::::.:.:.::... :::::::.::. :. :::: CCDS45 GYTLEQGS--IIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDC 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 VWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRRRLLSSGPDLT .:::::.:.:::.:....: . ::.::..::: .::::.: ::. . .:..: :.: CCDS45 IWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFTSMADVT 620 630 640 650 660 670 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 LQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGTVLTYQCE .:::. :: : ::::.:: :::::::::::: ::.. :. .:..:::.:::: CCDS45 IQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCY 680 690 700 710 720 730 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 PGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRC :::...::..: :::::.:: :.::.. .: :::.. ...: :. ::::. ::: : CCDS45 PGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYIC 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 LPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCAL-KYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAG :. : :...:::..:..:.::::::.::: : . .:: . ..:::: .. :. . :: CCDS45 DQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAG 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 ESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVA-YEELLDNRKLEVTQTTDPSR ...: : :. : :...: :::::::.:.. ::.:..: . . ..:.:.:... : CCDS45 ATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASS 860 870 880 890 900 910 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 QLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHS--YSPITVESDFSNP :.....: ::.::: ...: .:::.:...::::: . . . :. ::.:: :.:: CCDS45 TLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNP 920 930 940 950 960 970 800 pF1KE6 LYEAGDTREYEVSI ::.:.:::::::: CCDS45 TYETGETREYEVSI 980 990 >>CCDS45639.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 (994 aa) initn: 2049 init1: 1155 opt: 2352 Z-score: 1208.1 bits: 234.7 E(32554): 5.7e-61 Smith-Waterman score: 2352; 49.6% identity (78.1% similar) in 635 aa overlap (171-800:352-984) 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 GPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATF :::::: :: :::.:::.::.:::::.: : CCDS45 VIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSARF 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAVGPNL :: .::::.: . : :::.:.: :... : :.:.:::.:.::: :::::: : . :: CCDS45 HCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNL 390 400 410 420 430 440 270 280 290 300 310 pF1KE6 TCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDS-DMDDVPERGLISD ::.:..:: ::.:::::::.::: ::.:::..:.: . .: .::: ... .: .::.:. CCDS45 TCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSS 450 460 470 480 490 500 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 AQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLP .. ..::: ... . ..::.:::.. .:. ::. .:: ... : : :. . ::: : CCDS45 GKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDP 510 520 530 540 550 560 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 GYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDC ::.:: . :::::: .:.::.:::::.:.:.::... :::::::.::. :. :::: CCDS45 GYTLEQGSI--IIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDC 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 VWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRRRLLSSGPDLT .:::::.:.:::.:....: . ::.::..::: .::::.: ::. . .:..: :.: CCDS45 IWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFTSMADVT 620 630 640 650 660 670 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 LQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGTVLTYQCE .:::. :: : ::::.:: :::::::::::: ::.. :. .:..:::.:::: CCDS45 IQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCY 680 690 700 710 720 730 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 PGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRC :::...::..: :::::.:: :.::.. .: :::.. ...: :. ::::. ::: : CCDS45 PGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYIC 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 LPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCAL-KYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAG :. : :...:::..:..:.::::::.::: : . .:: . ..:::: .. :. . :: CCDS45 DQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAG 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 ESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVA-YEELLDNRKLEVTQTTDPSR ...: : :. : :...: :::::::.:.. ::.:..: . . ..:.:.:... : CCDS45 ATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASS 860 870 880 890 900 910 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 QLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHS--YSPITVESDFSNP :.....: ::.::: ...: .:::.:...::::: . . . :. ::.:: :.:: CCDS45 TLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNP 920 930 940 950 960 970 800 pF1KE6 LYEAGDTREYEVSI ::.: CCDS45 TYETGSLSFAGDERI 980 990 >>CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024 aa) initn: 1826 init1: 1167 opt: 2347 Z-score: 1205.4 bits: 234.3 E(32554): 8.1e-61 Smith-Waterman score: 2347; 50.6% identity (77.0% similar) in 644 aa overlap (171-809:388-1024) 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 GPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATF :..:::.:: :: :::.: ::: ::.: : CCDS13 QVIRSPTNTISVYFRTFQDDGLGTFQLHYQAFMLSCNFPRRPDSGDVTVMDLHSGGVAHF 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 pF1KE6 HCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPE-PGGAVGPN :: ::.::: . : :.:...: :... : : : :::..::::.::..:: : .. : . 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