FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3583, 418 aa 1>>>pF1KE3583 418 - 418 aa - 418 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9448+/-0.00096; mu= 9.4123+/- 0.058 mean_var=95.0008+/-18.901, 0's: 0 Z-trim(106.9): 60 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.131586 statistics sampled from 9183 (9241) to 9183 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16 Scan time: 3.030 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 2693 521.6 5.6e-148 CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 2227 433.1 2.2e-121 CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 1311 259.2 5.6e-69 CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 1296 256.3 3.4e-68 CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 1052 210.0 3.2e-54 CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 1052 210.0 3.3e-54 CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 1029 205.7 6.7e-53 CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 1018 203.6 3.1e-52 CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 960 192.6 6.3e-49 CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 654 134.6 3.4e-31 CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 630 130.0 8e-30 CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 605 125.2 1.8e-28 CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 584 121.3 3.4e-27 CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 572 119.0 1.6e-26 CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 572 119.0 1.6e-26 CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 572 119.0 1.8e-26 CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 558 116.3 1.2e-25 CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 542 113.3 1e-24 CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 537 112.4 2.4e-24 CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 537 112.4 2.5e-24 CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 523 109.7 9e-24 CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 523 109.7 9.4e-24 CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 523 109.7 1e-23 CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 527 110.5 1e-23 CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 520 109.1 1.3e-23 CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 512 107.7 7.7e-23 CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 499 105.1 1.6e-22 CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 499 105.1 1.6e-22 CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 490 103.4 4.9e-22 CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 486 102.6 7.9e-22 CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 474 100.3 3.2e-21 CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 475 100.5 4.3e-21 CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 475 100.5 4.5e-21 CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 461 97.8 2.1e-20 CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 433 92.6 1.4e-18 CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 396 85.6 1.8e-16 CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 377 81.9 1.8e-15 CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 377 82.0 2.2e-15 CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 369 80.4 4.2e-15 CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 339 74.6 1.4e-13 >>CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 (418 aa) initn: 2693 init1: 2693 opt: 2693 Z-score: 2770.1 bits: 521.6 E(32554): 5.6e-148 Smith-Waterman score: 2693; 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CCDS32 GKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQE 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 HAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALH . . .: ... :. .: . : .:.: :::....::..:: ::: .:..::.:. :: :. CCDS32 EERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLN 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 KHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQ .. .:.. :: ..: . .. .. :. ::::::.: : ::..:.::::::: : :.. CCDS32 HKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEE 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 IGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRL .:: ::.::..::::: :::.::::::..:.:.:.::::::..:::::.::..::..::. CCDS32 MGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRV 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 AKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNR :.:.::.:.::::::::.:::.:...:..::.:: .::::::.::::. .::::::::: CCDS32 AEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNR 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 ADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGA .::::::.::::.::::::::::.. :. ::. ::.:.:...: :.: . : .::: CCDS32 IETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGA 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 pF1KE3 DINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK ::..:: :.:..:.:: :. : .::.:. ..:. : .. CCDS32 DIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL 400 410 420 430 440 >>CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 (367 aa) initn: 1255 init1: 1226 opt: 1296 Z-score: 1337.7 bits: 256.3 E(32554): 3.4e-68 Smith-Waterman score: 1296; 51.3% identity (83.6% similar) in 359 aa overlap (56-412:1-359) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 GLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQ--KNLKKEFLHAQEEVKRIQ ..::.:.... : :... . . .: .. CCDS81 MEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLR 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 SIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVL . :. .: . : .:.: :::....::..:: ::: .:..::.:. :: :... .:.. :: CCDS81 GTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 PPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVL ..: . .. .. :. ::::::.: : ::..:.::::::: : :...:: ::.::. CCDS81 MDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVI 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 MYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIF .::::: :::.::::::..:.:.:.::::::..:::::.::..::..::.:.:.::.:.: CCDS81 LYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVF 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 IDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLR :::::::.:::.:...:..::.:: .::::::.::::. .::::::::: .::::::.: CCDS81 IDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIR 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 PGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESG :::.::::::::::.. :. ::. ::.:.:...: :.: . : .:::::..:: :.: CCDS81 PGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAG 280 290 300 310 320 330 390 400 410 pF1KE3 MLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK ..:.:: :. : .::.:. ..:. : .. CCDS81 LMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL 340 350 360 >>CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (398 aa) initn: 1003 init1: 1003 opt: 1052 Z-score: 1086.8 bits: 210.0 E(32554): 3.2e-54 Smith-Waterman score: 1054; 43.5% identity (71.8% similar) in 379 aa overlap (48-414:14-390) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 LSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQ- : : .: . ..:...::.. :.:: CCDS56 MELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRR--LQAQR 10 20 30 40 80 90 100 110 120 pF1KE3 -----------EEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLK ::.. .: .:. ..:.:.. ..: ... : . ..:: . . CCDS56 NELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPL :: :::.. : .: .:: ..: . .. .. :: : :::.: : .:..:..:::. CCDS56 PNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 THFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPR : ::.. .:: :.:::.::::: :::.::.:::::: .:::: :::.:::..::: : CCDS56 KHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGAR 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 MVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNV :::..: .:.:.::.:::.::::.:...:... .:.: :::: .::::::.:::. . :. CCDS56 MVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNI 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVA :::::::: : :: :::::::.::::::: :... . :.. . ::::.. ..:. . CCDS56 KVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAE 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE3 RPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK :::.....: :.:: :.:: : : .::: : :..:: ... CCDS56 LMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK 350 360 370 380 390 >>CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (406 aa) initn: 1045 init1: 1003 opt: 1052 Z-score: 1086.7 bits: 210.0 E(32554): 3.3e-54 Smith-Waterman score: 1073; 42.5% identity (70.8% similar) in 400 aa overlap (27-414:1-398) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEY ... ::: .::. . : : .: . CCDS11 MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLI 10 20 30 70 80 90 100 pF1KE3 IKDEQKNLKKEFLHAQ------------EEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTG ..:...::.. :.:: ::.. .: .:. ..:.:.. ..: CCDS11 VNDKSQNLRR--LQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPE 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 SNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIG ... : . ..:: . . :: :::.. : .: .:: ..: . .. .. :: : :: CCDS11 GKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIG 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 GMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFI :.: : .:..:..:::. : ::.. .:: :.:::.::::: :::.::.:::::: .:: CCDS11 GLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFI 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 RVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRI :: :::.:::..::: ::::..: .:.:.::.:::.::::.:...:... .:.: :::: CCDS11 RVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRT 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 LLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTI .::::::.:::. . :.:::::::: : :: :::::::.::::::: :... . :.. CCDS11 MLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIH 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 TSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIK . ::::.. ..:. . :::.....: :.:: :.:: : : .::: : :.. CCDS11 SRKMNLTRGINLRKIAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQ 340 350 360 370 380 390 410 pF1KE3 KDEQEHEFYK :: ... CCDS11 KDSEKNMSIKKLWK 400 >>CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 (403 aa) initn: 1025 init1: 975 opt: 1029 Z-score: 1063.1 bits: 205.7 E(32554): 6.7e-53 Smith-Waterman score: 1029; 41.6% identity (72.9% similar) in 387 aa overlap (33-418:17-401) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 EIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIK .:.: . : . ::: .. : .. . . .. CCDS97 MAIPGIPYERRLLIMADPRD-KALQDYRKKLLEHKE-IDGRLKELR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRE .. :.: :.. ......: .::. ..:. :. . .. :: .:.: : : .:. CCDS97 EQLKELTKQYEKSENDLKALQSVGQIVGEVLKQLTEEKFIVKATNGPRYVVGCRRQLDKS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 LLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVE :::.. ::: . ... :: :.: .. .. .. .: :..:::.. : .:.::..: CCDS97 KLKPGTRVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIE 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 LPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGE ::::. ::....:: ::.: :.::::: :::.::.::: . :..::.: .:.::.:: CCDS97 LPLTNPELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGE 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 GPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQN . :..:..: :... : :::.::::::. .::. :.::::.:: :.:::::::::: CCDS97 SARLIREMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 VNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLED ::.:::::: :::::::::::::::::.. ::... . :.. .. .. :.: : CCDS97 HRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEA 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE3 YVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEF-YK : : ..:::. ..: :.::.:.: .. .:. .:: :: . : . . : .. :: CCDS97 IVKLSDGFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV 350 360 370 380 390 400 >>CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 (439 aa) initn: 959 init1: 959 opt: 1018 Z-score: 1051.3 bits: 203.6 E(32554): 3.1e-52 Smith-Waterman score: 1049; 40.2% identity (72.5% similar) in 400 aa overlap (38-417:39-438) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKN :.. .: . :..:..... . . : . CCDS79 SPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 LKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEA--VDQNT------------------AIVGSTT .: .. . .:..: ...: .... .: :: : :.. ..: CCDS79 MKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTST 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 GSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADI ..:.. ... .: : :::. :...: : ....:: : :: . . :..: .:.:: CCDS79 RQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDI 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 GGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAF ::.: : ::. ::. ::..: : ....::.::.::::::::: :::.::.: : .: :.: CCDS79 GGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATF 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 IRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQR ....: ..:: ..:.: ..:::.: ::::.::.::::::.:::.:::::.. ..:::::: CCDS79 LKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQR 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 ILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFST .::::::.:::. :..:::: ::::.: ::::::: ::::::::::.:... . :.. CCDS79 TMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQI 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 ITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVI . :::.: .:. :. . : ..::. ...: :.::.:.:.. . .:. .. : CCDS79 HSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQ 370 380 390 400 410 420 410 pF1KE3 KKDEQEHEFYK : . . ..: CCDS79 AKKKANLQYYA 430 >>CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 (433 aa) initn: 955 init1: 955 opt: 960 Z-score: 991.8 bits: 192.6 E(32554): 6.3e-49 Smith-Waterman score: 964; 41.8% identity (70.2% similar) in 383 aa overlap (38-408:38-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRY-KKLQQELEFL--EVQE-EYIKD .. ::: :....... : ...: ::. CCDS57 DQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTYGQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 EQKNLKKEFL-HAQEEVKRIQS-IPLVIGQFLEAVDQNTA----IVGSTTGSNYYVRILS . .: : . . .:: :: ... . .. .. :.. ... : . . CCDS57 SDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSD 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEV . .. . :.. ... . :::. : .. :. ..:::: :.:.:: : ... CCDS57 QVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 REAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQ ::.:: :: : : . ..::.::.:::..:::: :::. :.:::..: : ::::.:::.:: CCDS57 REVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQ 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 KYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMD ::.::: ::::..:..:. . .::.::::::. ::: .:.: :::: .:::.::.: CCDS57 KYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLD 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEE ::: :.::.::::: :::::::.::::::::::: ::: . . ::. . .:.. .. CCDS57 GFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 VDLEDYVAR--PDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHE . .: .:: :.. .::.: :.: :.::.:.: : :. ::: .: . ::: CCDS57 IRFE-LLARLCPNS-TGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSA 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 FYK CCDS57 TPRYMTYN 430 >>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa) initn: 1284 init1: 632 opt: 654 Z-score: 673.5 bits: 134.6 E(32554): 3.4e-31 Smith-Waterman score: 660; 43.7% identity (73.1% similar) in 238 aa overlap (161-398:200-434) 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 ALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFEL .: : :::: : ...: ::::: : : CCDS65 PSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPAL 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 YKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDV .: ::. ::::.:.::::: :::..:.:::..: : :. . : :...: ::. .: . CCDS65 FKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKA 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 FRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMA :. :..::::::::::.:::: :: .. ..: ::. .::. :::. : ..: :. : CCDS65 FEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVER---RIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAA 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKI ::: ...:::: : ::.::.... .:: . :.. :..:.:...::::. . . CCDS65 TNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGH 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 pF1KE3 SGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK :::. ..:.:... :.:.. .. .: CCDS65 VGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRE 410 420 430 440 450 460 >-- initn: 1284 init1: 632 opt: 654 Z-score: 673.5 bits: 134.6 E(32554): 3.4e-31 Smith-Waterman score: 654; 38.5% identity (69.2% similar) in 273 aa overlap (118-390:436-702) 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 VIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEA ::: :... . .:.. :: .. CCDS65 HVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMN-SLAVTMDDFRWAL-----SQS 410 420 430 440 450 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 DSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGP . : . : . :.: . ::::.. :.:..: :. :. : . . ..:. : .:::.::: CCDS65 NPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGP 460 470 480 490 500 510 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 PGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEI ::::::.::::.:.. : :: . : :.. ..::. ::..: :.. :: ..:.::. CCDS65 PGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDEL 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 DAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRL :.:: : . ..:.. ..:..:::.. . :: .: :::: : .:::.:::::: CCDS65 DSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRL 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 DRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAV :. : .::::.... :... : ....:::: . . .::::.. :::.. ::. CCDS65 DQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAI 640 650 660 670 680 690 390 400 410 pF1KE3 RENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK ::. CCDS65 RESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFA 700 710 720 730 740 750 418 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 03:06:49 2016 done: Mon Nov 7 03:06:49 2016 Total Scan time: 3.030 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]