FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5708, 737 aa 1>>>pF1KE5708 737 - 737 aa - 737 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5178+/-0.00129; mu= 11.5322+/- 0.077 mean_var=174.6035+/-34.588, 0's: 0 Z-trim(106.3): 84 B-trim: 121 in 1/51 Lambda= 0.097062 statistics sampled from 8816 (8895) to 8816 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16 Scan time: 2.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 4835 690.2 2.9e-198 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 2676 387.9 3.1e-107 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 2675 387.8 3.2e-107 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 731 115.5 2.9e-25 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 731 115.5 2.9e-25 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 703 111.8 5.6e-24 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 703 111.8 5.6e-24 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 699 111.0 5.9e-24 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 696 110.6 7.6e-24 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 693 110.2 1e-23 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 674 107.5 6.1e-23 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 674 107.5 7e-23 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 674 107.6 7.1e-23 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 674 107.6 7.2e-23 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 667 106.7 1.7e-22 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 654 104.8 5.4e-22 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 642 103.1 1.5e-21 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 636 102.2 2.6e-21 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 616 99.5 2.3e-20 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 575 93.7 9.9e-19 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 575 93.7 1e-18 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 570 93.0 1.6e-18 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 545 89.3 1.3e-17 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 541 88.7 1.9e-17 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 527 86.8 7.5e-17 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 517 85.4 2.2e-16 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 515 85.2 3.2e-16 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 478 80.2 1.5e-14 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 456 76.8 6.6e-14 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 453 76.6 1.3e-13 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 447 75.7 2.3e-13 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 442 75.0 3.9e-13 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 434 74.0 1.1e-12 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 434 74.0 1.1e-12 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 420 71.8 2.6e-12 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 418 71.5 2.7e-12 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 418 71.6 3.3e-12 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 415 71.1 4.1e-12 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 415 71.1 4.1e-12 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 397 68.7 2.9e-11 >>CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 (737 aa) initn: 4835 init1: 4835 opt: 4835 Z-score: 3672.9 bits: 690.2 E(32554): 2.9e-198 Smith-Waterman score: 4835; 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CCDS31 KKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFP--H-------PEPDCN 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 EYEKKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFP : :.. :....:. . ::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS31 PSEAASEE-----------SNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFP 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 IQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRE ::.::: :: ::::::::::::::::::::::::.:. . . :..:.:.::::::::: CCDS31 IQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRE 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 LANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLS :::::.:::.:::.::::::::::: : .:....:::::::::::::::::.:.:.:::. CCDS31 LANQVSKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLT 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 KLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMK ::.::::::::::::.:::.:::.:. .:: ::::::::::::::::.::..::::::: CCDS31 KLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMK 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 SRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNV : ::::::.:: :::.: :::::::.:::.:: ::::::..:::: .::.::::::::.. CCDS31 STYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEA 400 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 TEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ :...: :::.:: ::::: :.::::::::::.::: :::::::::::::::::::::: CCDS31 QELSQNSAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 SSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDL ::::.:::::::::::::::::::.:::::: .:. :: ::::::: :::.::::. .. 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CCDS31 SNVGFVTMILQCSIEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVT 640 650 660 670 680 690 650 660 670 680 690 700 pF1KE5 RLQAEWHDSD-WILSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGRS ..: .:::: : ::: .. ::.: .: .:. . : : : : :.:.: CCDS31 EIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREG--------YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRR 700 710 720 730 740 710 720 730 pF1KE5 GRQSRQGSRSGSRQDGRRRSG-NR-NRSRSGGHKRSFD : .:.::: : : :.: .: :. :::.. :.:::: CCDS31 FRGQREGSR-GPR--GQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ 750 760 770 780 >>CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 (715 aa) initn: 2783 init1: 2528 opt: 2675 Z-score: 2038.4 bits: 387.8 E(32554): 3.2e-107 Smith-Waterman score: 2735; 60.8% identity (79.9% similar) in 727 aa overlap (18-736:14-709) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQKKERQKSDRRKS----RHHYDSDEKSETR-ENGVTDD : :... . . :: :.:. .. .: :. :. :. .. CCDS73 MNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDAPKAKKSKMKEKLNGDTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGDIDEYEKKSKRVSSLD .:::: :: : ....::.:.: .:.. : : :. : . : :.. CCDS73 IDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFP--H-------PEPDCNPSEAASEE----- 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 TSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGK :....:. . ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::: :: :: CCDS73 ------SNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGK 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDIT ::::::::::::::::::::::.:. . . :..:.:.::::::::::::::.:::.::: CCDS73 DLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDIT 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 RKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQM .::::::::::: : .:....:::::::::::::::::.:.:.:::.::.:::::::::: CCDS73 KKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQM 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMT ::.:::.:::.:. .:: ::::::::::::::::.::..:::::::: ::::::.:: : CCDS73 LDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKT 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 QKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNA ::.: :::::::.:::.:: ::::::..:::: .::.::::::::.. :...: :::.: CCDS73 QKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQDA 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 QCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHR : ::::: :.::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS73 QSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHR 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 SGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLA :::::::::::.:::::: .:. :: ::::::: :::.::::. ...:..: :::: : CCDS73 SGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLD 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESL :: .:.. :. ::..::::::::.::::::::::::.: . ::::.:. ::::: :. CCDS73 SVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLINSNVGFVTMILQCS 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 EEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSD-WI :. ..: :::::...:. . :.. : .:::..::::::::. ..: .:::: : CCDS73 IEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVTEIQEKWHDSRRWQ 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 LSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSR ::: .. ::.: .: .:. . : : : : :.:.: : .:.::: : : CCDS73 LSVATEQPELEGPREG--------YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRRFRGQREGSR-GPR 640 650 660 670 680 720 730 pF1KE5 QDGRRRSG-NR-NRSRSGGHKRSFD :.: .: :. :::.. :.:::: CCDS73 --GQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ 690 700 710 >>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa) initn: 672 init1: 226 opt: 731 Z-score: 567.1 bits: 115.5 E(32554): 2.9e-25 Smith-Waterman score: 731; 34.4% identity (68.0% similar) in 369 aa overlap (140-501:176-531) 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 RVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFG .::: . .. .: . : ::: . : CCDS33 PYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFP 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 PVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQV-- . :.:... :.::.:::... .: : ... .: .... .: ::::::::::.:: CCDS33 LALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHIN-HQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQ 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 -AKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRH : :. .: :. .:.:::. :: .. :..: ..::::. : :.::. .: . . CCDS33 VADDYGKCSR-LKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTY 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYE .::::.:.:::.:: :.. :. .. . : :::..::: :. : ..:. .... : CCDS33 LVLDEADRMLDMGFEPQIRKIV-DQIRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YT 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 QVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQ-VYSGSEGRAIIFCETKKNVTEM :.. ::.. .: .. ... : :.. . .... ... .:...::: :::. .. CCDS33 QIN-VGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDL 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 AMNPHIKQN---AQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ . ..... :.:.::: .: .:. .:. :: :. .:.::.::.::::. .: .::. CCDS33 TR--RMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVIN 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 SSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDL . :.. :.:.:: :::.:. : :. : . : : CCDS33 YDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLV 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 VKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLIT CCDS33 DHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAG 560 570 580 590 600 610 >>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa) initn: 759 init1: 250 opt: 731 Z-score: 567.1 bits: 115.5 E(32554): 2.9e-25 Smith-Waterman score: 731; 34.4% identity (68.0% similar) in 369 aa overlap (140-501:176-531) 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 RVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFG .::: . .. .: . : ::: . : CCDS46 PYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFP 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 PVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQV-- . :.:... :.::.:::... .: : ... .: .... .: ::::::::::.:: CCDS46 LALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHIN-HQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQ 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 -AKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRH : :. .: :. .:.:::. :: .. :..: ..::::. : :.::. .: . . CCDS46 VADDYGKCSR-LKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTY 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYE .::::.:.:::.:: :.. :. .. . : :::..::: :. : ..:. .... : CCDS46 LVLDEADRMLDMGFEPQIRKIV-DQIRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YT 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 QVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQ-VYSGSEGRAIIFCETKKNVTEM :.. ::.. .: .. ... : :.. . .... ... .:...::: :::. .. CCDS46 QIN-VGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDL 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 AMNPHIKQN---AQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ . ..... :.:.::: .: .:. .:. :: :. .:.::.::.::::. .: .::. CCDS46 TR--RMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVIN 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 SSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDL . :.. :.:.:: :::.:. : :. : . : : CCDS46 YDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLV 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 VKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLIT CCDS46 DHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDR 560 570 580 590 600 610 >>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa) initn: 457 init1: 241 opt: 703 Z-score: 543.9 bits: 111.8 E(32554): 5.6e-24 Smith-Waterman score: 707; 29.8% identity (60.8% similar) in 600 aa overlap (8-566:217-801) 10 20 30 pF1KE5 MPGKLLWGDIMELEA--PLEES-ESQKKERQKSDRRK :. :: : ::. : :.: .: . :. CCDS34 KEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDDPAEAEKEGNEMEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRS 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 pF1KE5 SRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKA------KKSKMKEK----LNGDTEEGFNRLSDE . ...:: . :. . . :: ::... :. .. ..:: :. CCDS34 VKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAVVDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTA 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 pF1KE5 FSKSHKSRRKDL-P--NGDIDEYEKKSK----RVSSLDTSTHKSSDN-KLE-ETLTREQK .. . ..:: : : .: : ::: : .: : ... . .:: : .: . : CCDS34 LTGYQTKQRKLLEPVDHGKI-EYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGK 310 320 330 340 350 360 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 E-----GAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFS .. . :: . .. :: .: :::.... .. :.:::. :.::.:::.. CCDS34 GCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIA 370 380 390 400 410 420 200 210 220 230 240 pF1KE5 FAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLS--VACFYGGTS : .:...... .:........: .....:::::: :..:. : ... :. :.: ::::. CCDS34 FLLPMFRHIM-DQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTG 430 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHL--QSGRL-DLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVE . :: ... : .:.: ::::. : : .:::. .: .. .:::::.:.:.:.:: :: CCDS34 ISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVM 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 DIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHL :. .. . : ::..:::: :. . .:.. . :. .:.. :. . . . ::. CCDS34 RIV-DNVRPDR----QTVMFSATFPRAMEALARRIL-SKPIEVQVGGRSV--VCSDVEQQ 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 AIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQC--LHGDIA .: . .. . ..: :. : : .::: . .... . .. .. . : ::: : CCDS34 VIVIEEEKKFLKLLELLGHYQES-GSVIIFVDKQEHADGL-LKDLMRASYPCMSLHGGID 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 QSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAG : .:. .. :..:. :.::::.:::::::. .. ::.. : :. :.:.::.::::::: CCDS34 QYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAG 660 670 680 690 700 710 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 RTGICICFYQPRERGQLRYV-EQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAV : : . : ::. . .. .. ..:: .. . : : .. ... . CCDS34 NKGYAYTFIT---EDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSS 720 730 740 750 760 770 550 560 570 580 590 pF1KE5 DF------FRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESLE : : . : : .:. .. : .: CCDS34 GFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMA 780 790 800 810 820 830 >>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa) initn: 457 init1: 241 opt: 703 Z-score: 543.9 bits: 111.8 E(32554): 5.6e-24 Smith-Waterman score: 707; 29.8% identity (60.8% similar) in 600 aa overlap (8-566:217-801) 10 20 30 pF1KE5 MPGKLLWGDIMELEA--PLEES-ESQKKERQKSDRRK :. :: : ::. : :.: .: . :. CCDS75 KEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDDPAEAEKEGNEMEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRS 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 pF1KE5 SRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKA------KKSKMKEK----LNGDTEEGFNRLSDE . ...:: . :. . . :: ::... :. .. ..:: :. CCDS75 VKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAVVDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTA 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 pF1KE5 FSKSHKSRRKDL-P--NGDIDEYEKKSK----RVSSLDTSTHKSSDN-KLE-ETLTREQK .. . ..:: : : .: : ::: : .: : ... . .:: : .: . : CCDS75 LTGYQTKQRKLLEPVDHGKI-EYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGK 310 320 330 340 350 360 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 E-----GAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFS .. . :: . .. :: .: :::.... .. :.:::. :.::.:::.. CCDS75 GCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIA 370 380 390 400 410 420 200 210 220 230 240 pF1KE5 FAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLS--VACFYGGTS : .:...... .:........: .....:::::: :..:. : ... :. :.: ::::. CCDS75 FLLPMFRHIM-DQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTG 430 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHL--QSGRL-DLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVE . :: ... : .:.: ::::. : : .:::. .: .. .:::::.:.:.:.:: :: CCDS75 ISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVM 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 DIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHL :. .. . : ::..:::: :. . .:.. . :. .:.. :. . . . ::. CCDS75 RIV-DNVRPDR----QTVMFSATFPRAMEALARRIL-SKPIEVQVGGRSV--VCSDVEQQ 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 AIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQC--LHGDIA .: . .. . ..: :. : : .::: . .... . .. .. . : ::: : CCDS75 VIVIEEEKKFLKLLELLGHYQES-GSVIIFVDKQEHADGL-LKDLMRASYPCMSLHGGID 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 QSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAG : .:. .. :..:. :.::::.:::::::. .. ::.. : :. :.:.::.::::::: CCDS75 QYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAG 660 670 680 690 700 710 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 RTGICICFYQPRERGQLRYV-EQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAV : : . : ::. . .. .. ..:: .. . : : .. ... . CCDS75 NKGYAYTFIT---EDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSS 720 730 740 750 760 770 550 560 570 580 590 pF1KE5 DF------FRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESLE : : . : : .:. .. : .: CCDS75 GFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMA 780 790 800 810 820 830 >>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa) initn: 583 init1: 254 opt: 699 Z-score: 543.6 bits: 111.0 E(32554): 5.9e-24 Smith-Waterman score: 703; 32.5% identity (62.4% similar) in 468 aa overlap (43-489:136-588) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LEAPLEESESQKKERQKSDRRKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKSKMKEK--L :.. . : :. : :.. :. .. . CCDS49 EQPESLVKIFGSKAMQTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGI-DTAFQPSVGKDGSTDNNVV 110 120 130 140 150 160 80 90 100 110 120 pF1KE5 NGDTEE-GFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGDIDEYEKKSKRVSSLDT----STHKSSDNK :: .... .: : .:.. ::: . : :.: .:... : .: . : CCDS49 AGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKWADLPPIKKNFY-KESTATSAMSKVEADSWRKENFNI 170 180 190 200 210 220 130 140 150 160 170 pF1KE5 LEETLTREQK----------EGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGK . : .: . ::. .: :... .: : ::: ... : .: CCDS49 TWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYP---EVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGI 230 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRS-PKVLVLAPTRELANQVAKDFKDI :::. :.::::::. . .: . .: : ..: .:. : .:::.:::::: :: . 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CCDS11 NILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRK--MRRDGWPAM 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 CLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRS .::: .:..:. .:. :..:. .:.::.::.::::. .: .::. . :.. :.:::: CCDS11 GIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRI 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 GRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLAS :::.:. .:: :. : . :. CCDS11 GRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGM 430 440 450 460 470 480 >>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 699 init1: 235 opt: 693 Z-score: 539.3 bits: 110.2 E(32554): 1e-23 Smith-Waterman score: 693; 33.0% identity (68.1% similar) in 367 aa overlap (140-500:99-453) 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 RVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFG .::: . .. .. .. : ::.. . CCDS82 TAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPAN--VMDVIARQNFTEPTAIQAQGWP 70 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 PVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAK . : :... :.::.:::.:. .: : ... .: .... .: ::::::::::.:: . CCDS82 VALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHIN-HQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQ 130 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 DFKDITR--KLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHV . : .:. .:.:::. :: .. :..: ..::::. : :. :. .: . .. CCDS82 VAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYL 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQ ::::.:.:::.:: :.. :. .. . : :::..::: :. : ..:. ..:. : . CCDS82 VLDEADRMLDMGFEPQIRKIV-DQIRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKD-YIH 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 VDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQ-VYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMA .. .: . .: .. ... :: .. . ... ..: .:...:.: :::. :.. CCDS82 IN-IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELT 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 MNPHIKQN---AQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQS . .... :. .::: .:..:. .:. :..:. .:.::.::.::::. .: .::. CCDS82 RK--MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINY 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 SPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLV . :.. :.:::: :::.:. .:: :. : . :. 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