FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3595, 354 aa 1>>>pF1KE3595 354 - 354 aa - 354 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8877+/-0.00096; mu= 19.6588+/- 0.059 mean_var=71.3356+/-13.939, 0's: 0 Z-trim(104.8): 46 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.151852 statistics sampled from 8050 (8095) to 8050 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16 Scan time: 2.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 2328 519.2 2.1e-147 CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1940 434.2 8e-122 CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1937 433.5 1.3e-121 CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1690 379.4 2.5e-105 CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1688 379.0 3.3e-105 CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1678 376.8 1.5e-104 CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1554 349.6 2.1e-96 CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1554 349.6 2.2e-96 CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1475 332.3 3.3e-91 CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1473 331.8 4.5e-91 CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1454 327.7 9.1e-90 CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1427 321.8 5.5e-88 CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1373 310.0 2e-84 CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1110 252.4 4.4e-67 CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1088 247.5 1.2e-65 CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1068 243.2 2.6e-64 CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 916 209.9 2.9e-54 CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 865 198.7 6.6e-51 CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 864 198.5 7.7e-51 CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 831 191.3 1.2e-48 CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 825 189.9 2.9e-48 CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 818 188.4 8.4e-48 CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 816 188.0 1.3e-47 CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 712 165.1 7.2e-41 CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 666 155.0 7.1e-38 CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 653 152.3 6.5e-37 CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 651 151.8 8.9e-37 CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 653 152.6 1.3e-36 CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 626 146.3 3.3e-35 CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 349 85.4 4e-17 >>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa) initn: 2328 init1: 2328 opt: 2328 Z-score: 2759.9 bits: 519.2 E(32554): 2.1e-147 Smith-Waterman score: 2328; 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CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 PPELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRV : .: :::::: : :::::: :. ::::::::.::::.::::.. .:.:..:::::.:: CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDE :::::.::.:. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.::.: CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VNRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDA .::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::: . :.:::::: : :.::.: CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ..::.:.: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 310 320 330 340 350 >>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa) initn: 1688 init1: 1688 opt: 1688 Z-score: 2002.2 bits: 379.0 E(32554): 3.3e-105 Smith-Waterman score: 1688; 69.5% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG :: ::::: ..::: ....:.::..: :: ::::::::::::::::::::::::.:: CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP :: .:: ..:...:.:..:::.:::::: : ::..: . :::.::: :: : :::.: CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK :::. ::.:::.:::::::: :. :::::::::::::.:.::.. .:.:..:::::.::: CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV ::::.::.:. ::: :.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:. CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG ::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::::. :.::.::: :.:.:..:. CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ::. :: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::. CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY 310 320 330 340 350 >>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa) initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678 Z-score: 1990.3 bits: 376.8 E(32554): 1.5e-104 Smith-Waterman score: 1678; 69.5% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG :: ::::: ..::: ....:.::..: :. ::::::::::::::::::::::::. : CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP :: ::: ..::..:.:..:::.:::::: : ::... . :::.::: :: . ::: : CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK ::. ::.:::::.::::::.:. ::::::::.::::.:.::..:.:.:..:::::.::: CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV ::::.::.:. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:. CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG ::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::::: :.::.::: :.:.:..:. CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF ::. :: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 310 320 330 340 350 >>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa) initn: 1535 init1: 1206 opt: 1554 Z-score: 1844.1 bits: 349.6 E(32554): 2.1e-96 Smith-Waterman score: 1554; 71.2% identity (91.1% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 KELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSPEECLEF ::::::::::::::::::.:::: ::: .. CCDS54 MRGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEE-GTMPPELVEVIR .:..:.:..:::.::..:: .: ::.:.:: :::.::: :. . :: :..: .: ::: CCDS54 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETK ::: : :::::: :. ::::::::.::::.::::.. .:.:..:::::.:::::::.::. CCDS54 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 FSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH :. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.::.:.::::::.. 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CCDS63 MTEGVKTLGWTKQKGGCHWGRSEGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEE-GTMPPELVEVIR .:..:.:..:::.::..:: .: ::.:.:: :::.::: :. . :: :..: .: ::: CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETK ::: : :::::: :. ::::::::.::::.::::.. .:.:..:::::.:::::::.::. CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 FSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH :. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.::.:.::::::.. 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CCDS59 MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 AIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMPPELVEVIRRLWKDGGVQACFER :::::: : ::... . :::.::: :: . ::: : ::. ::.:::::.::::::.: CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 AAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVG . ::::::::.::::.:.::..:.:.:..:::::.:::::::.::.:. :::.:.::::: CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 GQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLHLFNSICNHKFFAAT ::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:.::::::..::.::::.:.:. : CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAGNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSH ::.::::::::::::::: :.::.::: :.:.:..:. ::. :: ::: :::.::::.: CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH 220 230 240 250 260 270 330 340 350 pF1KE3 MTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF .::::::.::.::::::::.:::.:::::::: CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF 280 290 300 354 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 03:07:58 2016 done: Mon Nov 7 03:07:58 2016 Total Scan time: 2.450 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]