Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6614, 432 aa
1>>>pF1KB6614 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8390+/-0.00136; mu= 2.3010+/- 0.081
mean_var=247.8459+/-49.584, 0's: 0 Z-trim(108.7): 112 B-trim: 286 in 2/50
Lambda= 0.081467
statistics sampled from 10303 (10414) to 10303 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 2737 335.1 8.1e-92
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1958 243.6 3.1e-64
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1843 230.1 3.7e-60
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1710 214.4 1.8e-55
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1635 205.5 7.5e-53
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1619 203.7 3e-52
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1616 203.3 3.6e-52
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1527 193.0 6.5e-49
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1466 185.8 8.3e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1376 175.2 1.2e-43
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1361 173.5 4.5e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1349 172.0 1.1e-42
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1327 169.4 6.6e-42
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1298 166.0 6.5e-41
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1290 165.0 1.3e-40
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1264 162.0 1.1e-39
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1236 158.8 1.3e-38
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1223 157.2 3.2e-38
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1216 156.3 5e-38
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1213 156.0 6.6e-38
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1211 155.7 7.6e-38
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1207 155.3 1.1e-37
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1201 154.6 1.8e-37
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1103 143.0 5.3e-34
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1091 141.6 1.4e-33
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1066 138.7 1.1e-32
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1060 138.0 1.8e-32
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1057 137.6 2.2e-32
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1058 137.8 2.3e-32
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 752 101.6 1e-21
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 689 94.4 2.3e-19
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 680 93.3 4.9e-19
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 686 94.3 5.1e-19
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 679 93.2 5.3e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 651 90.0 5.5e-18
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 649 89.7 6.7e-18
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 647 89.5 7.6e-18
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 638 88.5 1.8e-17
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 580 81.6 1.8e-15
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 575 81.0 2.7e-15
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 575 81.1 2.8e-15
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 569 80.3 4e-15
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 565 79.9 6.4e-15
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 561 79.7 1.5e-14
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 554 78.6 1.7e-14
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 552 78.3 1.8e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 546 77.6 2.8e-14
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 545 77.5 3.2e-14
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 546 77.7 3.4e-14
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 541 77.1 4.5e-14
>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 2737 init1: 2737 opt: 2737 Z-score: 1761.9 bits: 335.1 E(32554): 8.1e-92
Smith-Waterman score: 2737; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 ISSREQVHQTTR
::::::::::::
CCDS11 ISSREQVHQTTR
430
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 2242 init1: 1867 opt: 1958 Z-score: 1266.6 bits: 243.6 E(32554): 3.1e-64
Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-430:1-470)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA
::: ::::::::.::: .:.:::::: : :: .:::...: :..:.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB6 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ
: :::. ::. :: ::::: ::.:..:.: ::::.:.::.:::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT
::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::::::
CCDS11 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
:::::.:::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA
:::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..:
CCDS11 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
::..:::.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KB6 GEDAHLT--QYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
::::::. :... . ::. ::.:: : .:.::::.:..::: .:
CCDS11 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843 Z-score: 1193.5 bits: 230.1 E(32554): 3.7e-60
Smith-Waterman score: 1897; 70.1% identity (84.7% similar) in 445 aa overlap (2-410:2-445)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS
:: ::::::::.::: :.::: . : :.:. :..:::: :.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB6 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA
: :::. ::. .:: ::::: ::::...: : ::::.:.::.
CCDS11 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL
:::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM
.::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK
:::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG
::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR
.: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
:::::::::. : . . ..:.: :
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1626 init1: 1307 opt: 1710 Z-score: 1109.2 bits: 214.4 E(32554): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 1722; 62.1% identity (83.7% similar) in 454 aa overlap (1-426:1-454)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
:::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.::
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
:. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
CCDS11 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
::::::::::..:::::.::::.:.: .: :::::..:::::..::...:.::. ..:.
CCDS11 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
:::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
CCDS11 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK
::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: :::::
CCDS11 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ
:::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .:
CCDS11 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY
:.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::...
CCDS11 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB6 KKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
. ... . . ::: ::.:.::...
CCDS11 AIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
430 440 450
>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 (400 aa)
initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635 Z-score: 1062.3 bits: 205.5 E(32554): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 1635; 65.7% identity (87.7% similar) in 397 aa overlap (1-394:1-390)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-GSAGGLGSTLGGSSYS
::. : :: ...::. .:::::: :.. :.. . . :..:: : ..... .
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGS----VRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIR
: : :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: :::::::
CCDS11 SSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
::::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.:::::::::::::::::::::
CCDS11 DWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEI
:::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::..
CCDS11 ALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGK
.::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..
CCDS11 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 SEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
::...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
CCDS11 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 CEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQD
. :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
CCDS11 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
360 370 380 390 400
420 430
pF1KB6 GKVISSREQVHQTTR
>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa)
initn: 1547 init1: 1272 opt: 1619 Z-score: 1051.4 bits: 203.7 E(32554): 3e-52
Smith-Waterman score: 1640; 59.7% identity (81.3% similar) in 449 aa overlap (4-423:2-444)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
:.: .::.: : :.:::: :.:.:: :...: ::::: :. ..
CCDS11 MSLRLQSSSASYGG--GFGGGS----CQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
::.... :. : :::::...:: :: :::.:.:: ::::::
CCDS11 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
:::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
CCDS11 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
: ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
CCDS11 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
.:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
CCDS11 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
:.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
CCDS11 EEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
: :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
CCDS11 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
::.. . . .. : : .....: ..
CCDS11 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
420 430 440 450
>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa)
initn: 1546 init1: 1271 opt: 1616 Z-score: 1050.0 bits: 203.3 E(32554): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 1637; 62.9% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (4-397:2-418)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
:.: .::.: : :.::: ::.:.:: :...: ::::: :. ..
CCDS11 MSLRLQSSSASYGG--GFGGG----SCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
::.... :. : :::::...:: :: :::.:.:: ::::::
CCDS11 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
:::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
CCDS11 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
: ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
CCDS11 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
.:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
CCDS11 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
:.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
CCDS11 EEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
: :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
CCDS11 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
::. :
CCDS11 DAKKRQPP
420
>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa)
initn: 1473 init1: 1183 opt: 1527 Z-score: 991.6 bits: 193.0 E(32554): 6.5e-49
Smith-Waterman score: 1531; 63.4% identity (82.3% similar) in 407 aa overlap (8-391:52-456)
10 20 30
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLG--GGSSRTSCRLSGGL
:...: .:::: : :::: : ::.
CCDS11 GGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGL-GGF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70
pF1KB6 GAGSCRL--------GSAGGL--GSTLGGSSYSSCYSFGSGG--------GYGSSFGGVD
:.:: : :: ::. :...::.:... :::.:: :.:..:::
CCDS11 GGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGG-SFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDG
90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 GLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQA---PGPARDYSQY
:::.:.::.:::::::::::::::::::::.: ::: ::..::.... : ::::.:
CCDS11 GLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKY
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 YRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVL
:.::..:.:.::. :.:::::::::::::::::::: :.:.: ::: :::::::::::::
CCDS11 YKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVL
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 DELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILN
:::::..::::::::.: ::::::::::::::. ::. :..::::.:::::::...::
CCDS11 DELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLN
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 EMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIEL
.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..: ::::.::::..:::::::
CCDS11 NMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIEL
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 QSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVK
::::..: :::..:::::.::::::::::. :...:::: :.: : : :: ::. :::.:
CCDS11 QSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIK
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 TRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
:::.:: ::: :::::
CCDS11 IRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGY
440 450 460 470 480 490
>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 (494 aa)
initn: 1456 init1: 1109 opt: 1466 Z-score: 953.8 bits: 185.8 E(32554): 8.3e-47
Smith-Waterman score: 1521; 57.3% identity (79.2% similar) in 443 aa overlap (8-426:57-488)
10 20 30
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGA
:...: . .:::.::::. . ..:::::
CCDS11 IGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAASMFGSSSGFGGGSGSS---MAGGLGA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GSCRL---GSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDR
: : :: :::: .::: .::. : :. :::.:.:: ::::::::
CCDS11 GYGRALGGGSFGGLGMGFGGSP--------GGGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDR
90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPA----RDYSQYYRTIEELQNKILTATV
::::::::::::::::::: :::.::. .. : : :::.:: ::.:.:::..:..
CCDS11 LASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIEN
::..:::::::::::.::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS11 GNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIES
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKD
:.:::::.:::::.:....: ::..:::::::::::.:.::.:: ::: .::.::::
CCDS11 LNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKD
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 AEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAE
:: ::. :. :: .:..::.: .::.:::...:::..: :::::::::.:: ::: .:::
CCDS11 AEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 TENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEG
.:. ::.::::.: ::...: :: :.: . :.:: ... ::.::.::: :: ::::::.:
CCDS11 AEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDG
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430
pF1KB6 E-----------------DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
: .:. :. .:.:. ::...:.:.:. .:.:.::. :
CCDS11 EAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
440 450 460 470 480 490
>>CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 (467 aa)
initn: 1454 init1: 1278 opt: 1376 Z-score: 896.9 bits: 175.2 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 1420; 54.6% identity (75.7% similar) in 456 aa overlap (10-428:11-463)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTS-------CR---LSGGLGAGSCRLGSAGGLG
:..:::: : .:: ::.: :: :.:. : : .. .:::
CCDS11 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVGSCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 STLGGSSYSS-CYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEA
: : :: :: :.. : :. :. : .: . :.:: ::: ::::::.::.::: ::.
CCDS11 SCLPGSYLSSECHTSGFVGS-GGWF--CEGSFNGSEKETMQFLNDRLANYLEKVRQLERE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 NTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADD
:.::: .:..::. : : ::..:..:::..:.::: . .:: ..::::::.:::::
CCDS11 NAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQIDNAKLAADD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 FRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNA
::::.::: .:: ::::::::::.:::::: .:::: :.:.::::: ::::::::...
CCDS11 FRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVSV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVAT
:: :.: ..:::.:::: :::..::..:: ::: ..:.::.:.: :: ..:::::..:..
CCDS11 LRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQTEELNQQVVS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 NSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGS
.:: .: ..:: :::::..:::::::.: ::. :::..::::: :: ::.:.: ::..
CCDS11 SSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQLAQMQCLISN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHL------TQYKK--
:: ::...::..:.:::::..:::::.::: ::::::.:::::: .: : :
CCDS11 VEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQPCATACKPVI
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KB6 ------------------EPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
: . :.:::.::..:::::::::.:.
CCDS11 RVPSVPPVPCVPSVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQSRPL
420 430 440 450 460
432 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:34:58 2016 done: Sat Nov 5 11:34:58 2016
Total Scan time: 2.730 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]