FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1574, 683 aa 1>>>pF1KE1574 683 - 683 aa - 683 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8150+/-0.000431; mu= 16.5381+/- 0.027 mean_var=69.6963+/-13.469, 0's: 0 Z-trim(110.8): 35 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.153628 statistics sampled from 19175 (19208) to 19175 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16 Scan time: 10.400 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000349 (OMIM: 121820,121900,122200,601692,60208 ( 683) 4404 985.8 0 NP_001129407 (OMIM: 608777) periostin isoform 3 pr ( 781) 2000 453.0 1.9e-126 NP_001273594 (OMIM: 608777) periostin isoform 5 pr ( 809) 2000 453.0 2e-126 NP_001129408 (OMIM: 608777) periostin isoform 4 pr ( 751) 1996 452.1 3.4e-126 NP_001129406 (OMIM: 608777) periostin isoform 2 pr ( 779) 1996 452.1 3.5e-126 NP_001273596 (OMIM: 608777) periostin isoform 7 pr ( 721) 1992 451.2 6.1e-126 NP_001273595 (OMIM: 608777) periostin isoform 6 pr ( 749) 1992 451.3 6.3e-126 XP_005266289 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 806) 1992 451.3 6.7e-126 NP_001317446 (OMIM: 608777) periostin isoform 8 pr ( 808) 1992 451.3 6.7e-126 XP_016875845 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 812) 1992 451.3 6.8e-126 XP_016875844 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 817) 1992 451.3 6.8e-126 NP_006466 (OMIM: 608777) periostin isoform 1 precu ( 836) 1992 451.3 6.9e-126 XP_016861492 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2555) 176 48.9 0.00027 XP_016861491 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2565) 176 48.9 0.00027 XP_005265031 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2569) 176 48.9 0.00028 NP_055951 (OMIM: 608560) stabilin-1 precursor [Hom (2570) 176 48.9 0.00028 XP_016861490 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2583) 176 49.0 0.00028 XP_016861489 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2589) 176 49.0 0.00028 XP_016861488 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2590) 176 49.0 0.00028 XP_005265030 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2595) 176 49.0 0.00028 XP_016861487 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2615) 176 49.0 0.00028 XP_016861493 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (1819) 171 47.8 0.00044 XP_006713128 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (1619) 169 47.3 0.00053 XP_011536844 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1238) 159 45.1 0.002 XP_011536843 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1684) 159 45.1 0.0026 XP_011536841 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1994) 159 45.1 0.003 XP_011536840 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2242) 159 45.2 0.0033 XP_016875074 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2246) 159 45.2 0.0033 XP_011536839 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2283) 159 45.2 0.0034 NP_060034 (OMIM: 608561) stabilin-2 precursor [Hom (2551) 159 45.2 0.0037 >>NP_000349 (OMIM: 121820,121900,122200,601692,602082,60 (683 aa) initn: 4404 init1: 4404 opt: 4404 Z-score: 5271.6 bits: 985.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4404; 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NP_001 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF ::::: ::..::::::: ..:::.... .: :: : ::.. : . . :::::.:..: NP_001 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI .: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::. NP_001 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV .:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:. NP_001 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL :.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:. 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