FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1574, 683 aa 1>>>pF1KE1574 683 - 683 aa - 683 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5949+/-0.00106; mu= 17.5731+/- 0.063 mean_var=63.2610+/-12.273, 0's: 0 Z-trim(103.7): 26 B-trim: 252 in 1/50 Lambda= 0.161252 statistics sampled from 7531 (7543) to 7531 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16 Scan time: 3.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs108|chr5 ( 683) 4404 1033.7 0 CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 781) 2000 474.5 2.5e-133 CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 809) 2000 474.5 2.6e-133 CCDS45034.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 779) 1996 473.6 4.8e-133 CCDS66530.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 749) 1992 472.6 8.9e-133 CCDS81764.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 808) 1992 472.6 9.5e-133 CCDS9364.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 836) 1992 472.6 9.8e-133 >>CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs108|chr5 (683 aa) initn: 4404 init1: 4404 opt: 4404 Z-score: 5530.5 bits: 1033.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4404; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE1 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE1 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH ::::::::::::::::::::::: CCDS47 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH 670 680 >>CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 (781 aa) initn: 1425 init1: 1312 opt: 2000 Z-score: 2507.0 bits: 474.5 E(32554): 2.5e-133 Smith-Waterman score: 2000; 45.5% identity (76.2% similar) in 686 aa overlap (1-682:1-677) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK : :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..: CCDS53 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL ::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.:::: CCDS53 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV :.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:. 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CCDS45 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT :: .::.:: . :::.: .. :.:::::.:::::::...... :::::::.::.:.. : CCDS45 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP ..::..:: :: . ..:::. .: . : .:..::.:::::::::.: .:.::.:: CCDS45 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT : . :.. :::.. .:.:.:..: :::::.:.:.::.:: .:.:: ....:::... 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